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Trabajando con secuencias de DNA

Descontaminando una secuencia de


DNA

 Secuenciar un fragmento de DNA implica haberlo


purificado antes, y para esto se hace necesario clonar
este dentro de un vector, amplificarlo en un huésped.
Durante este proceso es un problema muy común,
que la secuencia obtenida inevitablemente incluye
también segmentos derivados desde otros vectores,
por lo menos en los extremos. Y usted puede
detectarlos y removerlos de su secuencia de una
manera muy simple ejecutando una simple
herramienta Bioinformática.
Descontaminando una secuencia de
DNA

 Dos cosas pueden pasar, una es que su secuencia no


encuentra vectores similares, eso es un indicativo que
realizo un buen clonado y puede proceder con sus
siguientes experimentos, pero si no es así y muestra
presencia de vectores eso es una mala noticia, y la
presencia de ese vector es el mismo que usted utilizo en su
experimento, solo deberá remover esa parte de la
secuencia, pero si usted no reconoce ese vector eso le
indica que el contaminante viene de otra parte, en ese caso
debe eliminar esa muestra y repetir su trabajo.
Verificando mapas de restricción.
Diseñando Primers para PCR
Estableciendo el contenido G + C en
su secuencia
Encontrando regiones de codificación de proteínas.
Encontrando los ORFs
Analizando su secuencia con GeneMark
¿Qué puede hacer la bioinformática
por mi?

 Deberá respetar el siguiente formato de estilo:


 Times New Roman # 12
 Espacio y medio de interlineado
 Una pulgada de margen
 Referencias bibliográficas y otras
 Se calificará bajo los siguientes criterios:
 Habilidad de síntesis y análisis (1 punto)
 Originalidad e innovación (1 punto)
 Redacción del documento (1 punto)
 Modo y tiempo de entrega: Vía CAMPUS VIRTUAL hasta el Martes 03 de Abril a las
23:59 hrs.

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