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Semana 3

Tema: Modelo obtenido por HADDOCK que muestra


la interaccin entre una modelo en 3D la

Biomolculas y Macromolculas protena CagA de H.pylori (obtenido in


silico) y la proteina Src.
CagA 01-3133 (blue), EPIYA zone (pink),
EPIYA-A (yellow), EPIYA-B (light blue),
EPIYA-C (red), Src (orange), Interation
resdidues Src (cyan)
Semana 3

TEMAS DE LA MAGISTRAL
De los bioelementos a las biomolculas
Macromolculas destacadas en biologa
Propiedades y funciones de las macromolculas
De las biomolculas a la vida

TEMA DE LA TUTORIA
Ya se encuentra habilitada la tutora virtual 2
De los bioelementos a
las biomolculas
Los principales elementos que componen los seres vivos
(bioelementos):C, H, O, N, P y S. Estos elementos
combinados en diferentes proporciones conforman
biomolculas.

Existen otros elementos importantes para los seres vivos, entre ellos: el Na+ ,
el K+, el Cl-, el Fe++) y el Mg++ , que participan en funciones importantes como
la conduccin nerviosa, el movimiento muscular voluntario, el transporte de
oxgeno y la fotosntesis. Qu diferencia a estos de los primeros?
http://biomoleculasxd.blogspot.com.co/2011/05/biomoleculas-organicas-e-inorganicas.html
Estructura y Funcin molecular
Las molculas, en general, poseen una estructura que puede
ser: Primaria, Secundaria y 3D (terciaria o estructura
tridimensional o nativa). Esta ltima por lo general asociada
a la funcin biolgica

Estructuras diferentes

Funciones diferentes

http://4.bp.blogspot.com/-bxNHPJb43Tc/UyXdi9fF-PI/AAAAAAAAB44/uIUNYHiXSaU/s1600/ssvv_isomeria.
Estructura y Funcin molecular

La estructura de una molcula puede cambiar ?

Qu pasa si se pierde/cambia la
estructura de una molcula? Puede
explicar mediante un ejemplo.

http://superfund.pharmacy.arizona.edu/toxamb/c1-1-1-2.html
Biomolculas (BM)
Las biomolculas, segn su naturaleza pueden ser:
Inorgnicas. Por lo general molculas de bajo peso molecular
como el agua, CO2, C0, NH4.
Orgnicas. Basadas en esqueletos largos de C, se encuentran en
los seres vivos como macromolculas. Qu quiere decir esto ?

En este curso vamos a centrarnos en las BM orgnicas, en razn a su


importancia a nivel celular.
http://xiribio.wordpress.com/2008/10/14/material-de-refuerzo-las-
Biomolculas Orgnicas
Son polmeros largos o molculas de gran tamao
(macromolculas).
Este tipo de molculas, resultan de la unin (por lo

biomoleculas/
general) covalente de monmeros.
Pueden ser lineales o ramificadas y se caracterizan
por participar en procesos biolgicos
importantes.

Miremos como se forman y algunos detalles


importantes de estas
En detalle
Macromolculas biolgicas

Biopolmeros Monmeros Frmulas

Carbohidratos Monosacridos H-C-OH


(azcares)

Protenas Aminocidos N-C-C

cidos Nuclecos Nucletidos


(ADN, ARN)

Lpidos/ Unidades lipdicas


(Di o Triglicridos) (glicerol+cidos grasos)
Esteroides
Los esteroides son un grupo grande de lpidos, con poco
o ningn parecido a los cidos grasos, pero son lpidos.

http://www.maph49.galeon.com/biomol2/steroids.html Anillos unidos


Condensacin / Hidrlisis
Procesos relacionados con la formacin y
rompimiento de molculas.
La formacin de biomolculas El proceso inverso se denomina
(sntesis), da lugar a la liberacin hidrlisis (romper una molcula
de molculas de agua
mediante la adicin de agua).
(deshidratacin/condensacin).

Sntesis por condensacin. Ejemplo


con dos aminocidos
Tomado de hipertextos del rea de biologa . UNNE
Animacin tomada de
http://fai.unne.edu.ar/biologia/macromoleculas/biomoleculas.htm
Funciones Macromolculas(MM) Biolgicas
MM Funcin Funciones secundarias
Principal
Carbohidratos Energtica (Glucosa) Estructural
Informativa
Responsables antignicos de grupos sanguneos
Comunicacin Celular

Protenas Variadas: Aunque su


funcin primaria, no es
almacenar energa,
pueden ser sustitutos
energticos.
cidos Nucleicos Como macromolculas Como monomeros tienen otras funciones
su funcin es
informativa

Lpidos/ Energtica Estructural (membranas)


Regulatoria (sealizacin)
Ayudan a mantienen reservas corporales de agua
(camellos) y a mantener calor (osos hibernacin).

Cuadro 1.
Biomolculas orgnicas: Biopolmeros

Biopolmeros Monmeros Frmulas

Carbohidratos Monosacridos H-C-OH


(azcares)

Protenas Aminocidos N-C-C

cidos Nuclecos Nucletidos


(ADN, ARN)

Lpidos/ Unidades lipdicas


(Di o Triglicridos) (glicerol+cidos grasos)
Funciones Macromolculas(MM) Biolgicas
MM Funcin Funciones secundarias
Principal
Carbohidratos Energtica (Glucosa) Estructural
Informativa
Responsables antignicos de grupos sanguneos
Comunicacin celular

Protenas Variadas: Aunque su


funcin primaria, no es
almacenar energa,
pueden ser sustitutos
energticos.
cidos Nucleicos Como macromolculas Como monomeros tienen otras funciones
su funcin es
informativa

Lpidos/ Energtica Estructural (membranas)


Regulatoria (sealizacin)
Ayudan a mantienen reservas corporales de agua
(camellos) y a mantener calor (osos hibernacin).

Cuadro 1.
Cadenas polipeptdicas/protenas
Estructura: N-C-C -N-C-C -
Funciones:

Ribonucleasa

Colgeno

Hemoglobina

http://www.maph49.galeon.com/biomol2/proteins.html
La biomolculas: Biopolmeros

Biopolmeros Monmeros Frmulas

Carbohidratos Monosacridos H-C-OH


(azcares)

Protenas Aminocidos N-C-C

cidos Nuclecos Nucletidos


(ADN, ARN)

Lpidos/ Unidades lipdicas


(Di o Triglicridos) (glicerol+cidos grasos)
Funciones Macromolculas(MM) Biolgicas
MM Funcin Principal Funciones secundarias

Carbohidratos Energtica (Glucosa) Estructural


Informativa
Responsables antignicos de grupos
sanguneos
Comunicacin celular
Protenas Variadas: Aunque su funcin
primaria, no es almacenar
energa, pueden ser sustitutos
energticos.

cidos Nucleicos Como macromolculas su Como monmeros tienen otras funciones ej el


funcin es informativa ATP o Adenosn trifosfato, es un nucletido
(transmisin de informacin fundamental y la principal fuente de energa
gentica entre generaciones) para la mayora de las funciones celulares.
Lpidos/ Energtica Estructural (membranas)
} Regulatoria (sealizacin)
Ayudan a mantienen reservas corporales de
agua (camellos) y a mantener calor (osos
hibernacin).
Cuadro 1.
La biomolculas: Biopolmeros

Biopolmeros Monmeros Frmulas

Carbohidratos Monosacridos H-C-OH


(azcares)

Protenas Aminocidos N-C-C

cidos Nuclecos Nucletidos


(ADN, ARN)

Lpidos/ Unidades lipdicas


(Di o Triglicridos) (glicerol+cidos grasos)
Lpidos funciones

hthttp://www.ehu.es/biomoleculas/LIP/LIPID2.htm#RE
Energtica
Estructural (membranas)
Informativa y regulatoria (Sealizacin)
Mantienen reservas corporales de agua (camellos)
Produccin de calor (osos hibernacin ).
Monosacridos y Biopolmeros
del tipo carbohidratos
Carbohidratos C6H12O6

http://www.juntadeandalucia.es/averroes/recursos_informaticos/conc
urso1998/accesit6/glucidos.html#GlossC

Funciones: Ver el cuadro 1

Categoras importantes
Mono, di, oligo y polisacridos (sntesis)

Su degradacin puede darse en:


Respiracin (aerbica) o Fermentacin (anaerbica)
Azcares importantes 1

Glucosa Fructosa

A. C 6 H 12 O 6 B

Ismeros: misma frmula qumica y diferente estructura fsica


A. Estructurales y B. enantimeros
Importantes por ser fuente primaria de energa a nivel celular
http://www.juntadeandalucia.es/averroes/recursos_informaticos/concurso1998/accesit6/glucidos.html#GlossC
http://www2.ufp.pt/~pedros/qo2000/isomeria.htm
Azcares importantes 2

http://www.juntadeandalucia.es/averroes/recursos_informaticos/concurso1998/accesit6/glucidos.html#GlossC

Importantes por formar parte de la estructura de los cidos nucleicos


Polisacridos
Almidn: Reserva energtica en
plantas
Glucgeno : Reserva energtica
en animales
Celulosa: Polmero insoluble
producido por las plantas y usado
como material de construccin.

Importantes por constituir reservas energticas a nivel celular


Aminocidos y Biopolmeros
del tipo protenas
Aminocidos, Polipptidos y
Protenas
Los aminocidos(aa):
monmeros de protenas Estructura:

Pptidos: Unin de cierto nmero de aa


N-C-C
mediante enlaces peptdicos.

Oligopptidos:
C
Menos de 10aa.
Poliptidos: Entre 10 y 99 aa.
Protenas: Ms de 100aa.
Aminocidos propiedades

Los radicales confieren a los


aminocidos propiedades
diferentes

http://www.maph49.galeon.com/biomol2/polarity.html
Hlices
Estructura de las
Protenas

Lminas

http://www.lourdes-luengo.es/unidadesbio/proteinas/proteinas.htm

http://www.maph49.galeon.com/biomol2/folding.html

Hemoglobina
Interacciones que estabilizan la
estructura terciaria

La organizacin en 3D o conformacin
tridimensional de una protena es por lo
general, la responsable de su actividad
biolgica.
Nucletidos individuales y
Biopolmeros del tipo cidos nuclecos
Acidos nuclecos resultado de la unin
entre nucletidos

Nucletidos
Azcar de 5 carbonos
Uno o ms grupos fosfato
Bases Nitrogenadas
(purinas y pirimidinas) ADN y ARN polmeros

http://recursos.cnice.mec.es/biosfera/al
umno/2bachillerato/biomol/imagenes/nu
cleico/animaestruc.gif
http://fai.unne.edu.ar/biologia/macromoleculas/biomoleculas.htm
Los azcares en los cidos nucleicos

http://www.juntadeandalucia.es/averroes/recursos_informaticos/concurso1998/accesit6/glucidos.html#GlossC
Bases nitrogenadas en
los cidos Nucleicos

PUAG2
Comparndo el ADN y ARN
En general, ds En general, ss

ADN ARN
T U

Deoxiribosa Ribosa

Principales Clases de RNA


mRNA
rRNA
tRNA

http://fai.unne.edu.ar/biologia/macromoleculas/biomoleculas.htm
Estructuras del ARN Lugar para
portar un aa

Secuencia de 3 nucletidos
Triplete en el tRNA)
Unidades lpdicas y lpidos
En detalle
Macromolculas biolgicas

Biopolmeros Monmeros Frmulas

Carbohidratos Monosacridos H-C-OH


(azcares)

Protenas Aminocidos N-C-C

cidos Nuclecos Nucletidos


(ADN, ARN)

Lpidos/ Unidades lipdicas


(Di o Triglicridos) (glicerol+cidos grasos)
Lpidos: HC modificados
Las clulas, por
ejemplo eucariontes,
usan HC modificados
con un grupo
carboxilo (COOH) en
uno de los extremos:
cidos grasos
http://www.maph49.galeon.com/biomol2/saturate.htmlhttp://w
ww.ehu.es/biomoleculas/lipidos/lipid31.htm

Saturados e insaturados
Di y Triglicridos:
2 y 3 cidos grasos +glicerol

Los lpidos ms comunes. Di y triglicridos, son los principales


ingredientes del tejido adiposo y estn almacenados en gotas de grasa
en las clulas adiposas

http://www.maph49.galeon.com/biomol2/glycerol.html
Fosfolpidos
Cabeza
Regin hidroflica
Algunos diglicridos tienen
un grupo fosfato
(unido a un radical) que
reacciona con el tercer
grupo OH Colas
del glicerol, Regin
conformando fosfolpidos. hidrofbica

http://www.maph49.galeon.com/biomol2/phospho.html

http://www.infinitefractal.com/movabletype/blogs/my_blog/lip/Diapositiva04.jpg
Fosfolpidos y membranas celulares

http://www.educa.aragob.es/iescarin/depart/biogeo/varios/BiologiaCurtis/Seccion%20
1/1%20-%20Capitulo%203.htm
Video: http://biologiamundo.blogspot.com/2009_07_01_archive.html
http://kingyammbcdc.blogspot.com/2010_08_01_archive.html
Macromolculas
Resumen y ejercicios
tiles para quiz o parcial

Puntos para repasar y profundizar en el tema


De los elementos a las molculas

Retomemos lo visto la clase anterior...

Los enlaces qumicos entre elementos, permiten la


conformacin de molculas.
http://concurso.cnice.mec.es/cnice2005/93_iniciacion_interactiva_materia/curso/materiales/enlaces/ionico.htm
Respecto a los Carbohidratos
Bono en casa ( valor 0,25) para P1.
Los seres vivos usan esencialmente
los monmeros (ejemplo glucosa),
pero no almacenan estos como
unidades individuales,
sino como compuestos del tipo
polmeros. Si quiere participar
escriba un correo a la profesora
hacindolo evidente. Investigue y
explique porqu de forma oral en la
clase (3 minutos).

http://www.educa.madrid.org/web/cc.nsdelasabiduria.madrid/Ejercicios/2b/Biologia/glucidos_2b/glucogeno.htm
Aminocidos, enlaces peptdicos
y protenas
El proceso mediante el cual se da lugar a pptidos es: la condensacin
o la hidrlisis?.
Qu tipo de enlace se da entre un aminocido y otro?

Inicio de cadena

Final de cadena

http://www.unizar.es/departamentos/bioquimica_biologia/docencia/Biofvirtual/Tema-Vis/Diapositiva1.gif
Estructuras 1ria y 2ria de los aminocidos
Para dar lugar a la
Y para dar lugar a la
estructura primaria, qu
tipo de enlaces se estructura secundaria ?
generan ?

Secuencia de aminocidos de la Insulina humana. Tomada


de:http://www.ucm.es/info/genetica/grupod/Genenzima/Genenzima.htm http://www.maph49.galeon.com/biomol2/second.html
Plegamiento y estructura de
las protenas
Estructura:
http://biomodel.uah.
es/biomodel-
misc/anim/prot/estr
uc.html

Plegamiento:
http://biomodel.uah.
es/biomodel-
misc/anim/prot/pleg
am.html

Las chaperonas participan


en el proceso de
plegamiento
Denaturacin y Renaturacin
Native structure

Denaturacon: Prdida de la estructura


tridimensional (nativa) y por ende del
plegamiento, a causa de agentes
denaturantes:T, pH, Urea

Renaturacin: Recuperacin de la
Estructura nativa, por ejemplo por
retiro de agentes denaturantes
presentes.

https://extras.csc.fi/chem/courses/gmx2004/exercises/online/prot-unfld.htm
Native structure
Degradacin

Se habla de degradacin
si hay prdida de la
estructura, sin posibilidad
de que esta se recupere y
por lo tanto hay prdida de la
actividad proteica.

https://extras.csc.fi/chem/courses/gmx2004/exercises/online/prot-unfld.htm
Nucletidos pueden funcionar de
individualmente y cumplir funciones como:

Transferencias de energa
ATP ADP + Pi

AMP, ATP y GTP

Procesos de xido-reduccin
NAD y FAD (Ciclo de Krebs)

Reguladores de procesos metablicos


NADP (Reacciones donde participan
hormonas)

http://www.nyu.edu/pages/mathmol/library/dna/, http://www.life.uiuc.edu/crofts/bioph354/nad.htm y
http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/3/36/NADP-3D-balls.png/552px-NADP-3D-balls.png
Acidos nuclecos: ADN y ARN
polmeros de nucletidos
3DNA MODEL on
3dvia

http://www.3dvia.com/3DPJO/models/D8D0FCCEE0F2C4D6
En los seres vivos , los lpidos
Son ________________ compuestas principalmente
por unidades lipdicas.
Las unidades que las componen son esencialmente:
_________ y _________
Son insolubles en agua, es decir _______________.

Recordar . Aunque son el resultado de unir unidades


sencillas (monmeros), los enlaces entre estas pueden
ser no covalentes.
Esteroides

Los esteroides son un grupo grande de lpidos, con poco


o ningn parecido a los cidos grasos, pero son lpidos.

http://www.maph49.galeon.com/biomol2/steroids.html Anillos unidos


Qu tipo de compuestos son ?
http://www.youtube.com/watch?v=YeujZ4YWnOU&feature=relat
ed
https://mix.office.com/watch/djp5rl02u6uf
https://mix.office.com/watch/wxi4sak16mqm

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