Modelo por

Homologa
Es aplicable solo a un
tercio de todas las
secuencias proteicas
conocidas y esta cifra
aumenta un 4% cada
ao

Se determinan ms
estructuras
correspondientes a
nuevos plegamientos
por vas
experimentales

Que pasa con el resto?

Cuando la similitud
entre la secuencia
diana no se puede
aplicar con xito el
modelado por
homologa

En estos casos an
podemos obtener
informacin estructural
de la protena
empleando tcnicas
dethreading

Mtodos basados en plegado (threading)

Consiste en colocar la secuencia problema en diferentes

plegamientos conocidos y evaluar cmo se encuentra o cmo
encaja en cada uno de ellos. Por encajar se entienden segn el
programa dethreading: coincidencia de estructura secundaria,
residuos en ambientes parecidos a como se encuentran en la
base de datos

Muchas
protenas
comparten la
misma
estructura
aunque no
exista
similitud

Se desarrollo
mtodos
computacional
es para
predecir sin
importar la
similitud

Mtodo
de
threadi
ng

Mtodos de
perfil
Mtodos de
pares de
energa

Programas
libres
Mtodos
basados
en
plegado
(threading
)

Pares de
energa

Buscan en BD, mejor coincidencia y

alineacin
Interaccin de energa, clasificacin de est

De perfil

Perfil de protenas usando informacin

estadstica
Tiene probabilidad de ocurrencia de cada
20 a.a
Se obtiene informacin tipos de estructura
secundarias (compara con perfiles
conocidos)

Programas
libres

Existen gran variedad de programas para

prediccin
Son desarrollados por investigadores, para
sus investigaciones y lo ponen en
disposicin a la comunidad cientfica