BIORREMEDIACIN DE

SUELOS
Suelos Complemento Microbiologa
Alberto Uribe Jongbloed, Ph.D.

www.ean.edu.co

Texto preparado por: Paola Andrea Bautista Duarte, MSc

Editado por: Alberto Uribe Jongbloed, Ph.D.

Suelos
Aspectos de
Microbiologa
Biorremediacin de suelos
Contenido preparado por:
Paola Andrea Bautista Duarte M.Sc

Agregado de suelo: unidad estructural del suelo

Interfaces slido-lquido, slido- gas

MICROAMBIENTES

NATURALEZA DE LA MATERIA ORGNICA DEL SUELO

1) La materia orgnica de
naturaleza individual

Restos orgnicos de animales

y vegetales.
Productos de su descomposicin o
los productos de la actividad vital
de la poblacin viva (protenas y
aminocidos, hidratos de carbono
simples y compuestos, cidos
orgnicos de distinta naturaleza,
ceras, resinas, ligninas y otros).

Constituyen
aproximadamente el 10-15% de
la reserva total de materia
orgnica.

2) las sustancias hmicas

propiamente dichas.
Porcin de materia orgnica del
suelo que ha estado sometida a
una intensa transformacin
Constituye la porcin principal
de la parte orgnica del suelo,
85-95 % de la reserva es humus.

HUMUS
Polmero de composicin no especifica, estructura tridimensional
Absorbe agua, iones y molculas orgnicas de manera intercambiable
Une covalentemente otras sustancias a travs de sus grupos funcionales
Fase I: degradacin microbiana de los polmeros orgnicos dando fenoles, quinonas,
aminocidos, azcares.
Fase II: polimerizacin de los monmeros por reaccin qumica espontnea, autooxidacin,
oxidacin, catalizados por enzimas microbianas.
Equilibrio dinmico entre la sntesis y la mineralizacin gradual.

LA ATMSFERA DEL SUELO

Relativamente estable en su composicin, y depende del tipo de textura y
estructura.
La densidad del suelo es una medida
del empaquetamiento de las particulas
del suelo. Indica el espacio que puede
estar ocupado por aire.

Variacin de la cantidad de Oxigeno

y CO 2 en la atmsfera del suelo

% en la atmsfera del suelo

3

12

15

18

21

Profundidad del suelo

0
0,5

CO

Oxigeno

Zonas xicas y zonas anxicas.

La concentracin de CO2 en el suelo
puede ser 2x que en el aire.

1
1,5
2
2,5

* La proporcin de CO2 y O2 del suelo varia

tambin segn la poca del ao.
En las estaciones hmedas, el contenido de O2
desciende y el contenido de CO2 aumenta
ligeramente.

La concentracin de CO2 y el O2 del

suelo se ve afectada por la difusion de
los gases y respiracin microbiana:
Suelos deficientes en O2 pueden
contener CH4, SH2.

Comunidades microbianas del suelo

El suelo constituye un habitat favorable para el desarrollo de los
microorganismos.
El nmero de microorganismos suele ser mayor que en en habitat
acuticos (dulce-salado) ... 106 109 bacterias/g de suelo.
Sergei Winogradsky,
Autctonos:
fraccin de la comunidad que
puede utilizar las sustancia
hmicas refractarias.
Lenta actividad (Gram
negativos y actinomycetos).

Zimgenos:
oportunistas, no pueden asimilar los
compuestos hmicos.
Desarrollan gran actividad con rpido
crecimiento sobre sustratos fcilmente
asimilables: vegetal, restos de
animales muertos.
Activos por perodos en funcin de la
disponibilidad de
nutrientes:Pseudomonas, Bacillus,
Penicillum, Aspergillus.

Es difcil generalizar las propiedades de los

microorganismos autctonos de la microbiota del suelo
debido a los diferentes habitat.
Los parmetros abiticos
pueden restringir la diversidad
de poblaciones:
Los distintos habitat varan en
contenido de materia orgnica,
contenido de O2 ...
Y as pueden favorecer el
desarrollo de diferentes
poblaciones.

pH extremadamente
alcalinos / cidos.
Suelos polares que
permanecen la mayor parte
del ao congelados,
Desiertos ridos y calurosos
...
Microorganismos
Extremfilos.

Proporcin relativa de los gneros bacterianos aerbicos,

facultativos y anaerbicos comnmente encontrados en suelo
Gnero

Abundancia (%)

Arthrobacter

5-60

Bacillus

7-67

Pseudomonas

3-15

Agrobacterium

1-20

Alcaligenes

1-20

Flavobacterium

1-20

Corynebacterium

2-12

Micrococcus

2-10

Staphylococcus

<5

Xanthomonas

<5

Mycobacterium

<5
Alexander 1977

Grupo Actinomycetes
10-30% de las bacterias del suelo

The morphological characteristics of actinomycete

colonies on Hickey-Tresner agar medium after
incubation at 30C for 4 weeks

Gneros Streptomyces y Nocardia son los mas abundantes

Nocardia

Streptomyces

Streptomycesgriseussp.
griseus.

Resistentes a la
desecacin
Desarrollan bien en
suelos alcalinos o
neutros.

Las especies fijadoras de N2 son

factores limitantes en el suelo para la
actividad microbiana y el desarrollo de
las plantas superiores.
Grupo cianobacterias,
fotoauttrofos.
Gnero Azotobacter,
quimiohetertrofo fijador libre de N2
Gnero Clostridium, anaerbico,
algunas especies son fijadoras de N2
Gnero Rhizobium y
Bradyrhizobium fijan N2 dentro de los
ndulos de la raiz de ciertas plantas.

Microscopia de
contraste de fases
Gloeobacter sp. Autofluorescencia luego de
iluminar con luz verde

Cianobacterias

Formas
filamentosas que
forman
heterocistes

Los Alctonos pueden llegar al suelo por diferentes vias:

Aire - Hidrosfera - Asociados a plantas o a animales
Patgenos de plantas, llegan con material vegetal infectado:
Agrobacterium, Corynebacterium, Erwinia,
Pseudomonas y Xanthomonas
Patgenos de animales, llegan con aguas servidas:
E. coli, Salmonella,
Los alctonos rpidamente se eliminan del suelo, algunos pueden
permanecer tiempos ms largos debido a la capacidad de
desarrollar formas de resistencia. Pueden sobrevivir por largos
perodos en un estado de dormancia.

Los hongos constituyen una alta proporcin de la

biomasa microbiana.
Gran diversidad de gneros
Pueden desarrollar en formas libres o en
mycorrizas.
Predominan en los primeros 10 cm del suelo
y abundan en suelos bien aireados y de pH
cido.
La mayora son oportunistas (zimgenos)
Permanecen en dormancia activndose en
presencia de condiciones favorables.
Degradadores de lignina
Los gneros mas frecuentemente aislados:
Aspergillus, Geotrichum, Penicillum.
Las formas alctonas pueden desarrollar a
expensas de los nutrientes del suelo.

Gneros predominantes de levaduras

indgenas del suelo: Candida,
Rhodotorula Cryptococcus. Las formas
alctonas llegan con vegetales enfermos.

Interacciones entre bacterias y hongos

Fungistasis del suelo: efecto inhibitorio de
la germinacin de los hongos, ampliamente
distribuido en suelo.

Mycofagia

Depende de las propiedades fsicas, qumicas

y de la actividad microbiana del suelo.
i) Hipotesis de la privacin de nutrientes
ii) Hipotesis de la produccin de antibiticos.
Los hongos patgenos de plantas son
mas sensibles a la fungistasis.

Collimonas
fungivorans

Los protege de
germinar bajo
condiciones
desfavorables

Mecanismo de control
para hongos patgenos
de plantas

 Varios gneros de algas viven en el

suelo.

ALGAS

Pueden desarrollar en la superficie y en

los primeros mm de la superficie del
suelo,
106 / g.
La mayoria son pequeas y unicelulares.
Constituyen la microflora fotosinttica
dominante del suelo. Algunas pueden
utillizar compuestos preformados C/E
Son importantes en la colonizacion inicial
de las rocas, formacion y conservacion
del suelo.
Pueden desplazarse hacia la
subsuperficie del suelo transformndose
en alctonas y pueden ser consumidos
por los indgenas.

Cyanophyceae,
Chlorophyceae

Protozoos de vida libre en suelo

son de pequeo tamao y baja diversidad
comparado con el ambiente acutico.

PROTOZOOS

Predominan las formas flageladas, 104 105/g

Predominan cerca de la superficie, 15 cm.
Requieren relativamente alta concentracion de O2,
son importantes predadores de bacterias y algas.
Importante lugar en la cadena trfica como
predadores de algas unicelulares, bacteria y hongos.
Constituyen el alimento de los
microinvertebrados.
El rol ecolgico es la transferencia de la
produccin de algas y bacterias hacia los
sucesivos
niveles trficos.

Amoeba

Mastigophora,
(flagellates),Ciliata.

2015
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