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EJEMPLO EJERCICIO ENSEMBL DEL AV

En este ejercicio, deberás acceder a la información de la base de datos ENSEMBL para el


transcrito asignado (cuyo enlace/nombre tienes que conservar para realizar, a lo largo de los
próximos días, la Tarea adicional a la actividad de hoy) y completar en los huecos lo que se pide:

EJEMPLO: transcrito CDK6-202.

- Número de nucleótidos del exón 3 del transcrito: 136


- Número de aminoácidos de la proteína original codificada por este transcrito: 326
- Tamaño del producto de la traducción del transcrito generado por splicing alternativo del
original tras la eliminación del exón 3 (número de aminoácidos): 79
- Cuáles son los 6 últimos aminoácidos (es decir, los del extremo carboxilo terminal) de esta
nueva proteína: PNVVRI

Para la secuencia de aminoácidos, emplea el código de 1 letra,


y expresa los números (nucleótidos, aminoácidos) en cifras.

Puedes generar un archivo Word para trabajar en él, si lo necesitas, y acceder tanto al sitio web
de Ensembl como al de Translate de Expasy, pero no puedes emplear más recursos (apuntes,
etc) en la resolución de este ejercicio.
No obstante, si a lo largo de esta actividad del AV de la sesión de aula ya te descargas las
secuencias de los exones (y resto, en formato RTF) de tu transcrito o recoges alguna información
sobre él (tamaño, proteína que codifica, etc), te recomendamos que conserves el archivo para
trabajar posteriormente sobre él cuando tengas que completar el ejercicio propuesto como Tarea.

Recuerda apuntar o grabar el nombre de tu transcrito de Ensembl, puesto que NO SE


PROPORCIONARÁ ESTA INFORMACIÓN después de la sesión de AV.

Departamento de Bioquímica y Biología Molecular B e Inmunología

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