Bayern Múnich
Guerrero jugando con el Bayern Múnich.
El 6 de septiembre de 2002, Bayern de Múnich de Alemania anuncia su incorporación al
segundo equipo.38 Esta contratación derivó en un conflicto entre Alianza y el Bayern. El caso
fue elevado hasta la FIFA, la cual decidió que el club alemán pague por derechos de formación
ya que, si bien Guerrero tenía contrato formal con Alianza, este no era de carácter profesional.
Una vez solucionado el problema, Guerrero empezó a jugar con el Bayern de Múnich II en la
Regionalliga Sur, que en ese entonces era la tercera división del fútbol alemán. El 30 de mayo
de 2004 se coronó campeón con esta categoría.39
A nivel de equipos, disputó su primer partido con el equipo profesional del Bayern el 23 de
octubre de 2004 ante el Hansa Rostock,33 con el dorsal "33", mientras que su primer gol en la
Bundesliga lo anotó ante el Hannover 96. En total, Guerrero se mantuvo cuatro temporadas en
el Bayern Múnich, alternando las dos últimas en el primer equipo, el mismo con el que llegó a
anotar diez tantos en Bundesliga y dos en la Liga de Campeones de la UEFA.