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La Bioinformática es una interdisciplina que conjunta a las ciencias de la computación, estadística y ciencias biológicas, que permite obtener información biológica
relevante a partir de los datos de secuenciación.
Seleccione una:
Verdadero
Falso
Las lecturas o “reads” (generados por el secuenciador) se presentan al usuario como archivos:
b. De texto plano que contienen letras, números y en general, símbolos del código ASCII
La respuesta correcta es: De texto plano que contienen letras, números y en general, símbolos del código ASCII
a. Menos información
Pregunta 4 Incorrecta Se puntúa 0,00 sobre 1,00
El tamaño del cromosoma de Salmonella spp. es de aproximadamente 5,000,000 pb. Como se mencionó en el módulo 7, la secuenciación masiva requiere fragmentar el
material genético. Las longitudes de las lecturas generadas por un secuenciador más comunes son:
a. 100,000 pb y 500,000 pb
b. 2,000 pb y 3,000 pb
c. 75 pb y 300 pb
En una lectura en archivo FASTQ, cada base de una secuencia: Adenina (A), Timina (T), Guanina (G) y Citosina (C) se asocia a un valor de calidad en escala PHRED. Este
refleja la probabilidad de que la base reconocida por el secuenciador sea __________.
a. Correcta
b. Incorrecta
c. Encontrada
Respuesta incorrecta.
La respuesta correcta es: FastQC → Generar reporte de calidad de las secuencias, SPADES → Generar ensambles a partir de las lecturas, Trimmomatic → Limpieza de lecturas
Un contig es la representación de un conjunto de lecturas que se superponen y constituyen el consenso de una región de ADN secuenciada. Los contigs resultan del
proceso de:
a. Limpieza
b. Fragmentación
c. Ensamble
Pregunta 8 Correcta Se puntúa 1,00 sobre 1,00
Dos métricas que permiten evaluar la calidad de un ensamble son: profundidad y cobertura.
Seleccione una:
Verdadero
Falso
La Tipificación Multilocus de Secuencia, MLST (del inglés Multilocus Sequence Typing) se emplea para la identificación taxonómica de un aislado bacteriano a partir de las
variantes que presenta para cada uno de los _______ genes del esquema. La combinación particular de las variantes que presenta el aislado secuenciado se asocia a una
“secuencia tipo”.
a. 7
b. 2500
c. 5,000,000
a. Dependiendo de la conexión a internet con que se cuente, puede resultar lento el cargado de los archivos
b. Se depende de la disponibilidad del servidor que atiende las solicitudes de diversas partes del mundo