Ejercicios de command line:

Para evaluar su aprendizaje en cuanto al command line, tendrán que

resolver los siguientes ejercicios, los cuales como podrán observar,
en realidad son bastante sencillos. Por lo mismo, deberán indicar el o
los comandos que usaron para obtener cada una de las respuestas, así
como las respuestas de cada punto.
Lean bien las preguntas, lo que se les pide, y como parte de los
puntos extra que podemos otorgar, revisen la pregunta extra.
Archivo sequence_good.fasta
1. ¿Cuántas secuencias existen en el archivo?
Grep -c “<” secuence.fasta

1263

2. ¿Qué tipo de proteínas están almacenadas en dicho archivo?

Grep “protein” secuence.fasta
Terminasas

3.1 ¿Cuántas secuencias provienen de humano?

Grep -c “homosapiens” secuence.fasta

3.2 ¿Cuántas secuencias provienen de oveja común?

Grep -c “Ovis orientalis aries” secuence.fasta

3.3 ¿Cuántas provienen de panda?

Grep -c “ailuropoda” secuencie.fasta

0
 3. Además de lisozimas, existen otro tipo de proteínas en dicho
archivo?
Grep -b “terminase” secuence.fasta

Archivos de libros
1. Cual de los tres archivos es el más grande? En términos de:
1.1 Líneas
- wc -l Cien_anios_de_soledad 9509
- wc -l El_tunel 2544
- wc -l La_casa_de_los_espiritus 6148

1.2 Numero de palabras

-  wc -w Cien_anios_de_soledad 139207 Cien_anios_de_soledad

1.3 Numero de caracteres

- wc -m Cien_anios_de_soledad 817226

2. Cuantas veces ocurren las siguientes palabras en cada uno de los

libros?
2.1 López
- Grep -c “López” Cien_anios_de_soledad 0
- Grep -c “López” El_tunel 0
- Grep -c “López” La_casa_de_los_espejos 0
- Grep -c “López” Rayuela 5

2.2 García
- Grep -c “García” Cien_anios_de_soledad 0
- Grep -c “García” El_tunel 0
- Grep -c “García” La_casa_de_los_espejos 0
- Grep -c “García” Rayuela 4
 2.3 Pérez
- Grep -c “Pérez” Cien_anios_de_soledad 0
- Grep -c “Pérez” El_tunel 0
- Grep -c “Pérez” La_casa_de_los_espejos 0
- Grep -c “Pérez” Rayuela 8

2.4 Mora
- Grep -c “Mora ” Cien_anios_de_soledad 0
- Grep -c “Mora” El_tunel 0
- Grep -c “Mora” La_casa_de_los_espejos 0
- Grep -c “Mora” Rayuela 1

Pregunta extra (sequence_good.fasta):

Como pueden obtener un determinado rango en el archivo, es decir
ni las primeras secuencias ni las ultimas, sino solo algunas de las de
en medio? Pueden escoger el rango que quieran, indíquenlo en su
archivo