AA = aminoácidos; pKa = magnitud que cuantifica la tendencia que tienen las moléculas a

disociarse en solución acuosa.

AMINOÁ CIDOS
 Unidades estructurales de las proteínas
 Intermediarios de rutas metabólicas
 Precursores de sustancias biológicas que contienen N (grupo hemo, nucleótidos,
coenzimas, hormonas y neurotransmisores).
 Moléculas neutras
 Polipéptidos +10aa; proteína +50 aa.
 Cuando el aminoácido esta ionizado, varía el grupo carboxilo (COO -) y el grupo
amino (H3N+), esto sucede ya que están disueltos en soluciones acuosas en el
cuerpo.

AA aromáticos: absorben frecuentemente la luz UV del espectro.

Grupo heterogéneo de moléculas que poseen características estructurales y funcionales

comunes.

Péptidos importantes:

 Glucation: tripeptido que participa en sistemas enzimáticos de oxido-reducción.

Contribuye a prevenir daños oxidativos.
 Hormonas o factores liberadores de hormonas: angiotensina, vasopresina,
oxitocina, glucagon, calcitonina.
 Encefalinas: producen analgesia al unirse a receptores específicos en células del
cerebro.
 Antibióticos.
 Sustancias toxicas producidas por microorganismos u hongos.

Átomo de C- que se une al grupo carboxilo (-COOH), un grupo amino (-NH2), un
átomo de hidrógeno y un radical a la cadena lateral (estructura diferencial).

Carbono asimétrico: presentan isomería óptica. Se pueden presentar en el espacio

orientados de dos formas diferentes que son imágenes especulares no superponibles,
denominados enantiómeros (D o L). Solo los AA de aminoácidos de configuración L son
incorporados a proteínas y son de interés.

Se unen mediante enlaces covalentes formando largas cadenas de combinaciones

especificas que producen un gran número de proteínas diferentes con tamaños variados.

Disposición lineal: secuencia primaria  determina su estructura tridimensional específica

(fundamental para determinar su función).

El enlace covalente hace que los grupo amino y carbono de los aa se vean modificados,
entonces la naturaleza química de la cadena lateral es la que va a condicionar su solubilidad
en el agua, su reactividad y el tipo de interacciones no covalente que pueden establecer.
AA = aminoácidos; pKa = magnitud que cuantifica la tendencia que tienen las moléculas a
disociarse en solución acuosa.

PROPIEDADES ÁCIDO-BASE

El grupo carboxilo se comporta como acido o dador de protones, mientras que el grupo
amino acepta protones, actuando como base.

 AA estrictamente hidrofóbicos
 AA polares sin carga: presencia de un grupo hidroxilo y de un grupo amida
(reactivos).
 AA ionizables a pH fisiológico: poseen un grupo carboxilo que se encuentra ionizado
y grupos funcionales de carácter básico por lo que pueden captar protones del
medio adquiriendo carga +.

Los aminoácidos son sustancias anfóteras ya que pueden actuar como ácidos o bases.

 Grupo amino: carácter básico (acepto de protones).

 Grupo carboxilo: carácter acido (dador de protones).

Los AA se encuentran en su forma de ion dipolar.

Electroforesis: migración por acción de un campo eléctrico en un pH que es acido o básico

con respecto al pHi.

Interacciones no covalentes: determinadas por las propiedades de las cadenas laterales.

 Hidrofobicidad
 Fuerzas de Van der Waals
 Puentes de H
 Interacciones electroestáticas o se pueden alterar por modificaciones del pH y por
la adición de sales.

Unión covalente:

 Proteínas + cationes divalentes (Mg, Ca, Zn)

 Proteínas + metales de transición (Fe, Cu, Ni)
 Permite la participación directa en ciertas reacciones químicas (transferencia de
electrones) o estabilizan su estructura tridimensional.

Los AA con cadenas laterales ionizables también pueden establecer interacciones

elementos metálicos por mediante interacciones no covalentes iónicas.

FORMACIÓN DE PUENTES DISULFURO

Estos enlaces estabilizan la estructura tridimensional de las proteínas que se mantienen

gracias a las interacciones no covalentes, haciéndolas menos susceptibles a la degradación.

La reacción requiere un ambiente oxidante, por lo que estos enlaces no son habituales en
las proteínas intracelulares que se encuentran en el ambiente reductor del citoplasma.

Pero sí son frecuentes en las proteínas extracelulares que son secretadas por las células.
AA = aminoácidos; pKa = magnitud que cuantifica la tendencia que tienen las moléculas a
disociarse en solución acuosa.

FOSFORILACIÓN

 Unión de un grupo hidroxilo (-OH) de una molécula de fosfato inorgánico.

 La formación de este tipo de enlaces esta catalizado por las quinasas.
 Es reversible y el P es eliminado por acción de fosfatasas.
 Se producen cambios morfológicos y se modifica su actividad.
 La Fosforilación puede inactivar enzimas.
 Se produce como respuesta a señales especificas.

GLUCOSILACIÓN: Los azucares se unen a las proteínas por enlaces glucosídicos.

El tamaño y la forma de las cadenas laterales condicionan el tipo de interacciones que

pueden darse con otros grupos funcionales.

El tamaño condiciona la situación de los residuos en la secuencia de AA.

En las cadenas alifáticas hacia el exterior va a influir sobre la hidrofobicidad general del
residuo.

Los átomos de cualquier cadena más larga que la Ala tienen la posibilidad de rotar los
enlaces: alterna y alineada.

MODIFICACIONES QUIMICAS DE LOS AMINOÁCIDOS

Luego de ser incorporados en la cadena peptídica se denominan AA no estándares.

Ej.: hidroxiprolina e hidroxilisina del colágeno (se les ha agregado un grupo hidroxilo); las
histonas que pueden tener grupos metilo, acetilo o fosfato específicos.

AA no presentes en las proteínas: algunos AA funcionan como mensajeros químicos

(neurotransmisores).

ENLACE PEPTÍDICO

Es la unidad primaria estructural de las cadenas polipeptídicas. Los AA se unen en

secuencias lineales durante la síntesis de proteínas mediante una reacción de condensación
ente el grupo carboxilo de un AA y el grupo amina del siguiente, que produce la formación
de un enlace amida.

Residuos: son los AA incorporados a la cadena polipeptídica por la pérdida de agua que se
produce en la reacción.

Solo el grupo amino terminal y el grupo carboxilo terminal tienen capacidad de ionización.
También pueden ionizarse las cadenas laterales de los AA ácidos y básicos, ya que estas no
participan en la formación del enlace peptídico.

Cada polipéptido tendrá una curva de titulación característica y un punto isoeléctrico

determinado por su secuencia.
AA = aminoácidos; pKa = magnitud que cuantifica la tendencia que tienen las moléculas a
disociarse en solución acuosa.
Un mismo grupo funcional puede tener mayor o menor tendencia a ionizarse, dependiendo
del entorno molecular.

*Los valores de pKa de los grupos laterales solo sirven de referencia para saber el intervalo
de pH en que se produce la ionización en el péptido, pero el valor exacto no puede
conocerse*

Características

 Tiene una estructura plana y rígida ya que existe resonancia entre los electrones del
grupo carbonilo entre los átomos de enlace O-C-N; que hace que el enlace que no
permite la rotación sobre su eje. Solo existen dos posiciones configuraciones
alrededor de éste enlace:
 Cis: con el átomo de H y el grupo carbonilo en el mismo lado del eje.
 Trans: ambos átomos en posiciones alternas. De esta forma se
encuentran en mayor cantidad.

 Si existe posibilidad de rotación alrededor de los enlaces N-C y C-C  la

conformación del polipéptido dependerá de los ángulos de torsión. Aunque el
enlace permita el giro, hay que tener en cuenta que no todas las posiciones son
posibles debido a las restricciones estéricas de los átomos del esqueleto
polipeptídico y de las cadenas laterales concretas de cada AA.

El enlace peptídico permite la formación de puentes de H:

Átomos electronegativos  estructura polar e hidrofílica

Pueden formar puentes de hidrógeno porque posee un grupo carbonilo con una alta
densidad de carga negativa que puede actuar como aceptor y un H que puede actuar como
donador y, al estar unido al N, más electronegativo.

PROTEÍNAS
Tienen estructuras tridimensionales características que son indispensables para sus
funciones.

En las condiciones celulares se encuentran en unas conformaciones limitadas que son las
más estables desde el punto de vista energético, se denominan conformaciones nativas. De
esta forma pueden desempeñar su función y manifiestas los cambios que se producen ante
la unión de determinadas moléculas.

Termodinámicamente, la configuración nativa de una proteína representa el estado de:

AA = aminoácidos; pKa = magnitud que cuantifica la tendencia que tienen las moléculas a
disociarse en solución acuosa.

CONFORMACIÓN

1. La estructura tridimensional está determinada por la identidad de los AA que la

componen y por el orden en que se disponen en la cadena, es decir, por su
secuencia que determina su estructura primaria. Se refiere al número e identidad
de los aminoácidos que componen la molécula y al ordenamiento o secuencia de
esas unidades en la cadena polipeptídica. La unión peptídica sólo
permite formar estructuras lineales; por ello, las cadenas no presentan
ramificaciones.

2. Algunas zonas de esta cadena adquieren una disposición espacial

concreta, denominada estructura secundaria que se debe a las
interacciones entre los residuos próximos en la secuencia de AA. Son
estructuras regulares caracterizadas por un valor concreto y repetido
de los ángulos.

3. Esta estructura, a su vez, puede plegarse en una disposición espacial

conocida como estructura terciara: las interacciones se pueden dar
entre residuos que están alejados en la estructura 1ria y que se
encuentran en diferentes estructuras 2darias.

4. Varias cadenas proteicas o subunidades iguales o diferentes se asocian

en complejos tridimensionales que componen la estructura
cuaternaria.

La unidad de repetición estructural en las proteínas cuaternarias se denomina

protómero. Una proteína formada por 2 subunidades se denomina dímero; 3,
trímero, etc. La asociación entre subunidades está estabilizada por fuerzas de
atracción no covalentes y puede incluir uniones disulfuro covalentes (como
inmunoglobulinas).

Los residuos hidrofóbicos de las proteínas se empaquetan densamente

formando un núcleo centrar de naturaleza apolar. Entonces, mientras que el
núcleo es hidrofóbico, el esqueleto peptídico tiene naturaleza polar  esto es
posible ya que se crean puentes de hidrogeno entre los átomos polares del
enlace peptídico de los residuos que quedan en el núcleo mediante la formación de
estructuras secundarias regulares.

ESTRUCTURA SECUNDARIA

 - hélice

 Se estabiliza por enlaces de puente de H intracatenarios de residuos próximos en las

secuencia.
 Se trata de una estructura helicoidal con un enrollamiento dextrógiro.
 Cada giro incluye 3,6 residuos por vuelta.
AA = aminoácidos; pKa = magnitud que cuantifica la tendencia que tienen las moléculas a
disociarse en solución acuosa.

 La naturaleza de las cadenas laterales de residuos adyacentes pueden

desestabilizarla. (igual carga/cadenas voluminosas).
 Es una estructura secundaria habitual tanto en proteínas globulares (ferritina) como
fibrosas (queratina).

Láminas 

 Son estructuras plegadas

 Surge de la interacción de algunas regiones de la cadena peptídica, las hebras , que
suelen tener una longitud de entre 5-10 residuos.
 Estas se disponen paralelas unas a otras de forma que se puedan establecer
puentes de H entre los grupos –C=O y –NH de cada hebra.
 Las hebras pueden pertenecer a cadenas polipeptídicas diferentes o pueden ser
partes diferentes de la misma cadena.

Giros 

 Está compuesta por 4 residuos

 Se disponen de tal forma que permiten que se produzca un cambio de dirección de
la cadena polipeptídica de 180°.
 La estructura queda estabilizada por la existencia de un puente de H entre el grupo
carbonilo del 1°AA y el grupo amino del 4°AA.
 Estructuras de conexión entre diferentes elementos de la estructura secundaria
 Forman sitios de unión de ligandos y de centros activos de las enzimas.

Globulares

 Forma esférica
 Solubles en medios acuosos
 Presentan diferentes estructuras secundarias en una misma molécula
 Formadoras de hormonas
 Llevan a cabo la gran mayoría de las funciones celulares
 Ovoalbúmina, inmunoglobulinas

Fibrosas

 Estructura secundaria única

 Formadas por una unidad repetitiva simple que se ensambla para formar fibras
 Insolubles en agua
 Proporcionan soporte mecánico
 Colágeno, elastina, actina, miosina.

DESNATURALIZACION

La pérdida de la estructura tridimensional de la proteína que conlleva a la pérdida de la

función. No implica un desplegamiento completo. Se puede dar por:
AA = aminoácidos; pKa = magnitud que cuantifica la tendencia que tienen las moléculas a
disociarse en solución acuosa.

 Calor: afecta a los enlaces puentes de H.

 Cambio de pH: modifica el estado de ionización de las cadenas laterales; puede
alterar las interacciones electroestáticas que participan en el mantenimiento de la
proteína.
 Presencia de sales/ion guanidinio: puede afectar a las interacciones electroestáticas
ya que los iones disueltos compiten a la hora de establecer interacciones de este
tipo.
 Urea: compite en la formación de enlaces puentes de H.
 Disolventes apolares/detergentes: pueden establecer interacciones hidrofóbicas n
los residuos.

Si se restablecen las condiciones fisiológicas, la proteína recupera su conformación nativa y

su función en un proceso denominado renaturalización.

PRINCIPALES FUNCIONES

 Estructural (colágeno)
 Transporte y almacenamiento (hemoglobina)
 Contracción muscular (miosina, actina)
 Defensa (anticuerpos)
 Recepción y transmisión de señales (neurotransmisores)
 Función catalítica (enzimas)

Estas funciones dependen de su interacción reversible con otras moléculas denominadas

ligandos (que se da en lugares específicos denominados sitios de fijación o unión que tienen
características y naturaleza química especial para que se produzca esta interacción).

Gracias a estas interacciones pueden producirse cambios en la estructura tridimensional de

la proteína de mayor o menor magnitud  puede desencadenar cambios fisiológicos
debido a que se producen modificaciones en la actividad de la proteína en cuestión.

SOLUBILIDAD

La gran parte de las proteínas son solubles en agua en soluciones acuosas, porque:

 Las partículas dispersas pueden interactuar con moléculas de solventes polares, que
forman una cubierta o aureola denominada capa de solvatación o de hidratación (si
el solvente es el agua).
AA = aminoácidos; pKa = magnitud que cuantifica la tendencia que tienen las moléculas a
disociarse en solución acuosa.
 La presencia de grupos funcionales ionizados y de otros grupos polares atrae
moléculas de agua, que se orientan a su alrededor, formando una capa de
hidratación.

 Diferencias de solubilidad entre las distintas proteínas: se deben a su grado de

hidratación, determinada por el número de grupos polares. Los grupos no polares
repelen el agua, por lo tanto también influyen.

 La carga eléctrica total de la molécula: si son de igual signo, origina fuerzas de

rechazo mutuo e impide su agrupamiento y precipitación; si es diferente para
distintas proteínas, interfiere en el grado de solubilidad.

 pH: en su punto isoeléctrico, la solubilidad de la proteína es mínima porque la carga

eléctrica es nula, las fuerzas de repulsión intermoleculares desaparecen y la
precipitación puede producirse directamente o luego de la adición de agentes que
actúen en la capa de solvatación.

 Concentraciones bajas de sales favorecen la solubilidad de muchas proteínas, ya

que los iones inorgánicos interaccionan con los grupos ionizados de las moléculas
proteínicas.

 El agregado de solventes poco polares a soluciones de proteínas disminuye su

solubilidad y produce precipitación cuando la concentración del solvente alcanza
ciertos valores, variantes según la proteína considerada.

COLÁGENO

 Es una proteína fibrosa

 Función estructural
 Molécula con estructura triple hélice dextrógira
 Las moléculas se disponen en líneas paralelas de forma
que las moléculas de filas contiguas están escalonadas porque se sitúan
desplazadas un cuarto de la longitud de la molécula.
 En las filas contiguas se establecen fuerzas de atracción no covalentes, dándole su
patrón característico.
 Entre las filas existen entrecruzamientos covalentes intermoleculares
 Síntesis: en fibroblastos y osteoblastos.

HEMOGLOBINA

 Proteína globular
 Estructura cuaternaria
 Transporte de O2
 También se encarga de transportar el CO2 y el H+ en dirección opuesta al O2
 Está compuesta por diferentes subunidades
 Presencia de un grupo prostético, el grupo hemo, de naturaleza no proteica
 Modificaciones estructurales ante la unión de un ligando (O2)
AA = aminoácidos; pKa = magnitud que cuantifica la tendencia que tienen las moléculas a
disociarse en solución acuosa.

 Conformada por 4 anillos con un átomo de hierro central unido por seis enlaces

INMUNOGLOBULINAS

 Producidas por los linfocitos

 Estructura proteica con múltiples dominios que permiten el reconocimiento y la
unión de moléculas ajenas al organismo, señalándolas para que sean destruidas por
las células encargadas de esta función.
 Las moléculas de anticuerpo son glucoproteínas compuestas por 2 cadenas que se
asocian formando una estructura de Y que se mantiene por fuerzas no covalentes y
puentes disulfuro intracatenarios.