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BIOQUÍMICA AVANZADA

TEMA 4: AMINOÁCIDOS Y ENLACE PEPTÍDICO


Grupo #2:
- Jhuliana Campoverde
- Johanna Castillo
- Karla Loaiza
EJERCICIOS

4.2 Señale las interacciones no covalentes que se pueden establecer entre los aminoácidos Ser
y Asn en disolución acuosa a pH 7, realizando un esquema en el que se identifiquen los átomos
que participan en la interacción, su función concreta y el tipo de fuerzas que lo mantienen.

Resolución:
- Formación de puentes de hidrógeno: Las cadenas laterales del Ser y Asn pueden formar
interacciones no covalentes de este tipo pudiendo actuar como donadores o como aceptares de
hidrógeno.

- Interacciones electrostáticas: Entre la atracción de las cargas opuestas del Grupo carboxilo
ionizado del Ser y el grupo amino N-terminal protonado del Asn.

4.3 En el ejercicio anterior, ¿cambiarían las interacciones si la molécula se encuentra a pH 1


,5?

Resolución:

La Formación de puentes de hidrogeno no cambiarían porque aún en pH bajos no afecta en la


interacción entre los átomos de las cadenas laterales. En cambio, las interacciones
electroestáticas si, debido que las cadenas laterales de algunos aminoácidos presentan grupos
funcionales con carácter ácido o básico que, como consecuencia, pueden estar ionizados a
determinados valores de pH.

A un pH 1,5 el grupo Carboxilo se protona perdiendo su carga negativa por tal ya no hay esta
interacción electroestática entre los aminoácidos.
4.4 Calcule el estado de ionización y la carga del aminoácido Cys a los siguientes valores de
pH:
a) pH= 1
b) pH= 7
c) pH= 3

teniendo en cuenta que los valores de pka, de sus grupos funcionales son los siguientes:

pKa –COOH = 1.96


pKa –NH+3 = 10.28
pka –SH = 8.18
Resolución:

a) Estado de ionización pH= ácido, Carga neta = +1


b) Estado de ionización pH= 7, Carga neta = 0
c) Estado de ionización pH= básico, Carga neta = -2
4.5 Suponga que se hace pasar una disolución tamponada de pH 7 con diferentes aminoácidos
a través de una columna con un gel de una sustancia que contiene numerosos grupos sulfato
y se recogen e identifican los aminoácidos al salir de la columna. Si en la mezcla de
aminoácidos se encuentran Lys, Val y Leu, indique (de forma razonada) qué aminoácido
tardará más en salir de la columna.

Resolución:

El aminoácido que tarda más en salir es la Lisina (Lys) porque al tener una cadena lateral con
carga +1 establece más interacciones electrostáticas con los grupos sulfato con carga negativa
de la sustancia de la columna.

Sin embargo, la parte hidrofóbica de la cadena lateral de la Lys puede mantener


simultáneamente, interacciones con residuos apolares.

4.6 Tenemos dos soluciones A y B de aminoácidos que se diferencian por su capacidad de


absorción de luz de longitud de onda (A.) de 280 nm. Al medir la absorción en un
espectrofotómetro la solución A muestra una elevada absorción mientras que la solución B no
absorbe la luz a esa longitud de onda. ¿A qué puede deberse esta diferencia?

Resolución:

Es probable que dentro de la solución A que es la que absorbe a esa longitud de onda cuente
dentro de la solución con aminoácidos que contengan un anillo aromático como la Tirosina,
triptófano o fenilalanina.
4.7 A partir de la clasificación de la tabla 4-2 indique los aminoácidos que se pueden fosforilar
y los que se pueden o-glucosilar, realizando un esquema de los enlaces formados.

Resolución:

AMINOACIDO FOSFORILACIÓN GLUCOLISACIÓN


PREGUNTAS DE AUTOEVALUACIÓN

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