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INVESTIGACIÓN
AUTOR:
ASESOR
JURADO:
LIMA-PERÚ
2020
Título
Método alternativo basado en un Sistema Inteligente para identificar enfermedades de la
piel.
Autor
Asesor
Área de Investigación
i
DEDICATORIA
Al niño soñador
Que con sus sueños creo mundos, utopías,
Creo al hombre que es hoy
Soñador, Realista, Imaginativo, Amante
Buscando y luchando, para que este mundo sea mejor.
ii
AGRADECIMIENTO
Amazonia Peruana (UNAP) desde el año 2016, quien me proporciono facilidades para
colaboración en las ideas dadas y a los bachilleres, Angela Milagros Núñez Satalaya y
mi tesis doctoral.
iii
INDICE
DEDICATORIA .................................................................................................... ii
AGRADECIMIENTO .......................................................................................... iii
INDICE .................................................................................................................. iv
RESUMEN ........................................................................................................... vii
ABSTRACT ........................................................................................................ viii
CAPITULO I: INTRODUCCION ....................................................................... 1
1.1. Planteamiento del problema.......................................................................... 2
3.5. Procedimientos............................................................................................ 40
iv
3.7. Consideraciones éticas ................................................................................ 41
v
INDICE DE TABLAS
Tabla 12. Resumen del Cálculo del Índice de Sensibilidad y Especificidad para el
Impétigo. ......................................................................................................................... 53
Tabla 13. Resumen del Cálculo del Índice de Sensibilidad y Especificidad para la
Psoriasis. ......................................................................................................................... 53
Tabla 14. Resumen del Cálculo del Índice de Sensibilidad y Especificidad para las dos
enfermedades de la piel .................................................................................................. 54
INDICE DE FIGURAS
vi
RESUMEN
los cuales se puede comentar que son resultados aceptables, en ambos casos son valores
Iquitos.
de Imágenes.
vii
ABSTRACT
The purpose of this research work was to generate an alternative methodology for
detecting skin diseases from the use of a technological tool based on Artificial
Intelligence. In this experience, 2 diseases such as "Impetigo" and "Psoriasis" have been
prioritized. In addition, convolutional neural network algorithms have been used, along
bank consisting of 228 (102 images of "Impetigo" and 126 images of "Psoriasis") has
been used. The type of research is Applied, with an Explanatory level of research. The
Specificity index of 93%, to conclude that the recognition software or alternative method
is an effective tool, taking us to comment that they are acceptable results, since in both
cases they are expected values in this thesis. In this way the Research Hypothesis to be
accepted is: The use of an alternative method, based on an intelligent system, will enable
the effective identification of skin diseases for the population in the city of Iquitos.
viii
CAPITULO I: INTRODUCCION
(por diversas causas entre ellas vergüenza, hasta negligencias de los propios pacientes),
o se tratan con remedios caseros que suelen agravar la condición del paciente, lo que
del cuerpo, el tipo y color de la piel, por lo que también su reconocimiento requiere un
exámenes de laboratorio, que según el Manual MSD (2020), pueden ser: raspado, biopsia,
cultivo, entre otros, que involucran el contacto directo con la zona afectada (piel), lo que
Es importante recordar que la piel es el órgano del cuerpo más extenso y expuesto
(2020), por lo que necesita especial cuidado, considerando que se vuelve más vulnerable
con el pasar de los años al estar en constante interacción con el exterior (insectos,
Cuando no existe una adecuada atención a la piel, aumenta el riesgo de contraer alguna
afección y/o enfermedad dermatológica, que suele ser evidente en las fases más críticas
con la presencia de ronchas, erupciones, picazón u otros signos visibles, que en la mayoría
de los casos requieren atención clínica y cosmética, y de no ser tratadas a tiempo pueden
1
Considerando que existe una lista muy variada de enfermedades dermatológicas,
destacar que las regiones tropicales de la Amazonía peruana, entre ellas la región Loreto,
representan el hábitat de miles de insectos, hongos, parásitos, bacterias y virus, que son
sumado a la dificultad del acceso a los servicios de salud y la escasez de centros médicos
controlarlas y erradicarlas.
Así mismo, las empresas vienen innovando en nuevos productos que contienen
al sol y rayos UV, ello considerando que el cambio climático es un factor externo que
tiene como consecuencia más afectados por Cáncer de piel y otras lesiones
salud pública, el presente trabajo presenta una alternativa tecnológica para apoyar al
cuarto lugar como causa de discapacidad que se desarrolla a lo largo de la vida de una
persona.
Existe una variada lista de enfermedades que afectan la piel, como la Dermatitis
2
Cáncer de piel, la gran mayoría de estas enfermedades se desarrollan debido a factores
Así mismo para el caso del Perú, según datos del Ministerio de Salud al menos
1200 nuevos casos de Cáncer de la piel son detectadas a nivel nacional, ello sin contar el
número de casos de otras enfermedades de la piel que afectan tanto a niños como adultos.
y adulta del Perú, se tiene al Impétigo, Varicela y Psoriasis, sin embargo, existen otras
(2019), se tiene una gran cifra de 400,000 personas padeciendo de Psoriasis en el Perú,
considerando que a nivel mundial afecta a más de 125 millones de personas. Cabe decir,
que la Psoriasis es considerada por la Organización mundial de la Salud (2015) como una
enfermedad muy dolorosa, desfigurante e incapacitante. Por otro lado, según el boletín
enfermedades o lesiones a la piel, cómo lo indica el portal del Diario La Región (2012),
a su vez que se ha promovido campañas de salud para la atención del cuidado de la piel
regiones del Perú, está relacionado a las limitaciones de equipamiento y personal médico
del sector salud (2019), sumado al reducido número de atenciones que se da a los males
de la piel y la escasa cultura que posee la población respecto a visitar a los médicos en
los centros de salud. Algunas personas no asisten a los centros de salud por temor a los
3
costos e incluso por temor a las interacciones por el personal médico en el proceso de
dermatológica.
desde hace más de una década se encuentra en los últimos lugares respecto al índice de
de vida de la población.
Entre los problemas más complejos asociados a la calidad del servicio de salud se
tiene lo siguiente:
enfermedades de piel.
salud.
médicos.
Por otro lado, existen una serie de limitaciones propias del sector salud en la
Amazonía, que no podrán ser abordados por la presente tesis, sin embargo, son importante
• En todo el Perú, por temas del cambio climático vienen incrementándose casos
• Problema General
• Problemas Específicos
5
• ¿El uso de un método alternativo permitirá alcanzar apropiados Índices de
1.4. Antecedentes
como resultado que los médicos de las clínicas, sin la necesidad de ser un
6
Contribución: Desarrollo de un sistema de prediagnóstico para cáncer de piel, que
melanomas).
previamente a la red con radiografías que presenten escoliosis, las mismas que
7
del paciente; este sistema al no ser manual evita la subjetividad de localizar la
reduce considerablemente.
adquisición de imágenes de rayos x de tórax con alto kilo voltaje, las mismas
problemas pulmonares.
8
Componentes de la Contribución: Software libre con librerías especializadas en
indican que:
clasificación de cáncer de piel melanoma tipo cáncer más mortal, usando la red
neuronal VGG-16.
net, con bloques residuales y con regiones más rápidas para la detección de
9
un FROC del 78 %, lo cual muestra que nuestra propuesta está en el camino
• Haddad & Hameed (2018), en el artículo titulado “Image Analysis Model For Skin
Clasificador SVM.
10
En este trabajo, se muestra la aplicación de Tensorflow en el diagnóstico de
piel como: vitíligo, acné y Psoriasis; a partir del entrenamiento con un banco de
del riesgo que uno de ellos representa. En este trabajo se presenta un método
11
• Coronado (2018), en la tesis titulada “Reconocimiento de patrones en imágenes no
piel para así lograr identificar lesiones malignas en imágenes no- dermatoscópicas
12
Este artículo describe el diseño, la implementación y los resultados de la última
Algoritmo.
Algoritmo.
13
está disponible en skincheckup online, en el que los usuarios pueden verificar
autodiagnóstico.
Conjunto de datos.
Conjunto de datos.
menciona que:
Contribución: Se llevó a cabo un amplio estudio del estado del arte de los Diversos
14
Componentes de la Contribución: Redes neuronales profundas (DNNs), Redes
recurrentes (RNNs).
• Liao & Luo (2016), en el artículo titulado “Skin Disease Classification versus Skin
convolucionales (CNNs).
15
En este documento, se presenta un modelo automático de detección de eccema
permite que tanto pacientes como médicos tengan precisión al evaluar la piel
afectada.
medición de la gravedad del eccema, en la que los pacientes solo pueden tomar una
Algoritmo informático.
Algoritmo informático.
16
procedimientos de procesamiento de imágenes para mejorar las propiedades de
17
Hispano, Matosinhos. Los resultados obtenidos muestran tasas de rendimiento
aceptables, una precisión del 90%, sensibilidad del 85% y especificidad del
92.22%.
18
Contribución: En este artículo, se propone un método basado en redes neuronales
convolucionales.
19
Ideas Reusables en mi Proyecto: Redes neuronales artificiales (RNA).
imágenes.
imágenes.
20
1.5. Justificación de la investigación
procesos también podrían realizarse por los ciudadanos en sus hogares a través de los
bacterias, insectos, falta de acceso a agua potable, uso de agua contaminada en ríos,
incluso los rayos solares (rayos ultravioletas). Entre las enfermedades más comunes
social de este proyecto lo constituyen aproximadamente 550 mil personas que comprende
la población de Iquitos.
piel, que siempre debe ser complementado por otras pruebas utilizadas
21
• En este trabajo no se intenta crear o modificar algún algoritmo, pero si
Artificial.
enfermedades.
de Iquitos.
• Objetivos Específicos:
22
1.8. Hipótesis
• Hipótesis General:
Iquitos.
• Hipótesis Específicas:
23
CAPITULO II: MARCO TEÓRICO
Por ejemplo, una aplicación para juegos podría escribirse para aprovechar el
de Nokia o BlackBerry años atrás. Los móviles de esa época contaban con
pantallas reducidas y muchas veces no táctiles, y son los que ahora llamamos
24
b. Procesamiento de imágenes
imágenes y hacer más evidentes en ellas ciertos detalles que se desean hacer
notar. La imagen puede haber sido generada de muchas maneras, por ejemplo,
actividades principales:
25
d. Reconocimiento
esperados.
e. Neurocomputación
las dos últimas décadas, los avances en este campo han sido espectaculares;
Originalmente, los trabajos en RNA surgen de la idea de que para que las
Von Neumann. Sin embargo, el auge en estos sistemas se debe más al éxito
26
obtenido en aplicaciones reales (reconocimiento de patrones, optimización,
f. Neurona Biológica
active.
Las dendritas y los axones pueden ser vistos como cadenas de comunicación
funcionan actualmente.
transmitir todo su potencial por medio del axón. Se estima que el cerebro
humano contiene más de cien mil millones de neuronas y que hay más de
27
g. Neurona Artificial
podrían recibir dos tipos de estímulos de otras unidades o del exterior. Con
computables.,
𝑛𝑛
(1)
𝑦𝑦 = θ �� 𝑤𝑤𝑗𝑗 , 𝑥𝑥𝑗𝑗 − 𝜇𝜇 �
𝑗𝑗=1
Donde
θ (es una función de paso de unidad en 0), y 𝑤𝑤𝑗𝑗 es el peso de la sinapsis asociado
con la j-esima entrada. Por simplicidad podemos considerar el umbral µ como otro
negativos a inhibidoras.
son nodos y las hojas dirigidas y ponderadas son conexiones entre las salidas y
28
h. Redes Neuronales Convolucionales
de cada una de las clases sobre cada uno de los pixeles de la imagen de
entrada.
i. Inception v3
datos de 1,000 clases (Vea la lista de clases aquí) del conjunto de datos
29
Szegedy, Ioffe, Shlens (2016), señalan que:
5.6% de error de top-5 para evaluación de un solo cuadro utilizando una red
j. Imagen
El término imagen proviene del latín imago que a su vez nos remite a imitari
30
representación de una cosa” y por extensión como “representación mental de
alguna cosa percibida por los sentidos”. Frente a la palabra y la razón que han
k. Patrón
Smartick (2020):
recurrencia.
l. Diagnóstico
31
El diagnóstico es el objetivo central del acto médico, entendido este como
paraclínico.
m. Enfermedades de la piel
que:
Son las enfermedades que irritan, obstruyen o inflaman la piel y que pueden
través de manchas, pequeños bultos del tamaño de un grano, a veces con pus,
n. Piel
32
externo. La piel: Lo protege contra las bacterias y virus que pueden causar
La piel, del latín pellis, es señalado como el órgano más grande en los
La piel se define, no sin razón, como el mayor órgano funcional del cuerpo
largo de la vida, las tareas que tiene que realizar son enormemente variadas,
entre ellas, proteger el medio interno de los efectos destructivos del medio
o. Población
“Son las estimaciones del volumen de población de un área geográfica o país, para
más habitual, la palabra hace referencia al grupo formado por las personas
33
DeConceptos.com (DeConceptos.com, s.f.), indica que:
acto poblacional que significa dotar de personas a un lugar. Cada país o región
tiene una población característica que aumenta por los nacimientos y las
p. Psoriasis
de la piel por otras que crecen en las capas más profundas de la dermis, y el
34
q. Impétigo
diferentes.
35
CAPITULO III: MÉTODO
correcto de la aplicación).
Explicativa: Los resultados del estudio serán analizados y explicados a partir del
efecto del uso del sistema inteligente, como un método alternativo eficiente para el
resultados.
la piel.
36
3.2. Población y Muestra
3.2.1. Universo.
El universo está compuesto por los 550 mil habitantes de la ciudad de Iquitos,
3.2.2. Muestra.
validar un software existe bibliografía que indica como número mínimo a 5, según
Tabla 1
Variables e Indicadores
VARIABLES INDICADORES
1. Independiente: • Presencia-Ausencia
Método alternativo basado en
sistema inteligente.
2. Dependiente:
Identificación de enfermedades de • Índice de Efectividad
la piel de la población en la ciudad • Coeficiente de Especificidad.
de Iquitos. • Coeficiente de Sensibilidad.
Fuente: Elaboración Propia
Conceptualización:
37
Tabla 2
Indicador que muestra Variable Independiente
Indicador Descripción
• Presencia-Ausencia • Cuando es No, es porque no existe Método
alternativo basado en sistema inteligente en la
ciudad de Iquitos, y aún nos encontramos en la
situación actual del problema.
• Cuando es Sí, es cuando se aplicó la solución
(Método alternativo basado en sistema inteligente)
y se espera obtener mejores resultados.
Tabla 3
Descripción de Indicadores de la Variable Dependiente
Indicador Descripción
• Índice de Efectividad • Índice que comprende a los casos de pacientes
que cuya presencia o ausencia fue
correctamente identificada por el método
alternativo.
• Índice de • Comprende el cálculo de un coeficiente
Sensibilidad. orientado a diagnosticar como enfermos a
pacientes que efectivamente están enfermos.
• Índice de • Comprende el cálculo de un coeficiente
Especificidad. orientado a diagnosticar como sanos a pacientes
que efectivamente están sanos.
Fuente: Elaboración Propia
inteligente.
38
Tabla 4
Indicador e Índice de la Variable Independiente
Indicador Índice
• Presencia-Ausencia • No, Sí.
Tabla 5
Indicador e Índice de la Variable Dependiente
Unidad de Unidad de
Indicador Índice Formula
Medida Observación
Efectividad = EISI /
EDMT * 100%
Donde: EISI es
• Índice de Porciento. Registro Enfermedad Identificada
[ 0..100% ]
Efectividad Manual. por Sistema Inteligente y
EDMT es Enfermedad
Detectada por el Método
Tradicional.
Especificidad = VN / VN
+ FP
• Índice de Porciento. Registro Donde:
[ 0..100% ]
Especificidad Manual. VN es verdaderos
negativos y FP falsos
positivos.
Sensibilidad = VP / VP +
FN
• Índice de Porciento. Registro Donde:
[ 0..100% ]
Sensibilidad Manual. VP es verdaderos
positivos y FN falsos
negativos.
Fuente: Elaboración Propia
39
3.4. Instrumentos
• Fotografías
• Cuestionarios
• Entrevistas
• Filmaciones
• Formatos de Observación
• Fotografías
• Libreta de apuntes
• Encuestas a pacientes
3.5. Procedimientos
procedimientos:
• Procesamiento de la información
40
• Análisis e interpretación de la información
• Sustentación de la tesis.
y concientizar a los afectados y de ser el caso a los padres de familia sobre la importancia
seres humanos, por lo que es pertinente considerar los siguientes códigos de ética:
41
investigaciones o acciones que involucran trabajos relacionados a la salud de
42
CAPITULO IV: RESULTADOS
4.1. Ejecución
uso. Teniendo en cuenta que el banco de imágenes estuvo compuesto por 228
Tabla 6
Presentación desagregada del banco de imágenes
Total Imágenes de Imágenes de Total de Imágenes Imágenes Total
Imágenes de Impétigo para Impétigo Imágenes de de de Psoriasis banco de
la entrenamiento para pruebas la Psoriasis para imágenes
enfermedad de uso enfermedad para pruebas de
Impétigo Psoriasis entrenami uso
ento
102 78 24 126 93 33 228
aprendizaje del software a partir de muestras o ejemplos (en este caso a partir
de las imágenes). Según lo expuesto en las Tablas N°06 son dos enfermedades
de la piel que trata la presente tesis doctoral, la cual se pasará a presentar los
resultados obtenidos.
43
con especialidad en Dermatología realizó la validación visual. El
como Aceptable.
44
Tabla 7
Tabla de entrenamiento de la Red Neuronal para la enfermedad Impétigo
45
4.1.1.2. Entrenamiento con imágenes de la enfermedad Psoriasis.
46
Tabla 8.
Tabla de entrenamiento de la Red Neuronal para la enfermedad Psoriasis
47
4.1.2. Pruebas de uso de software
muestras o ejemplos (en este caso a partir de las imágenes). Según lo expuesto
imágenes del Impétigo fueron reconocidas como tal, por lo que el Índice
48
Tabla 9.
Tabla de Pruebas de Uso de Software para la enfermedad Impétigo.
Índice de Sensibilidad
• Excelente = 100% (24) Índice de Especificidad
• Aceptable= Entre 80%-99% (Entre 19-23) • Excelente = 100% (33)
• No Aceptable= Menor de 80% (Menor de 19) • Aceptable= Entre 80%-99% (Entre 26-32)
• No Aceptable= Menor de 80% (Menor de 26)
49
4.1.2.2. Pruebas de uso de software con imágenes de la Psoriasis
50
Tabla 10.
Tabla de Pruebas de Uso para la enfermedad Psoriasis.
51
Tabla 11.
Tabla de Resultado de diagnóstico por Método Tradicional vs Sistema Inteligente.
Índice de Efectividad
• Excelente = 100% (228)
• Aceptable= Entre 80%-99% (Entre 182-227)
• No Aceptable= Menor de 80% (Menor de 182)
Aceptable según los índices establecidos en la presente tesis, con lo cual se da respuesta
52
Así mismo, con los resultados obtenidos al evaluar el índice de Especificidad en
presenta los promedios obtenidos de cada una de ellas y los valores totales
Tabla 12.
Resumen del Cálculo del Índice de Sensibilidad y Especificidad para el Impétigo.
Sensibilidad 94 88 91%
Especificidad 94 94 94%
Tabla 13.
Resumen del Cálculo del Índice de Sensibilidad y Especificidad para la Psoriasis.
Prueba de
Índices Entrenamiento Total
Uso
Sensibilidad 94 94 94 %
Especificidad
94 88 91 %
(%)
53
Si los resultados de las dos enfermedades lo resumimos en un solo cuadro,
cuales se puede comentar que en ambos casos es Aceptable, y son valores esperados
Iquitos.”
Tabla 14.
Resumen del Cálculo del Índice de Sensibilidad y Especificidad para las dos
enfermedades de la piel
54
CAPITULO V: DISCUSIÓN DE RESULTADOS
pruebas de uso, podemos afirmar favorablemente la hipótesis que señala que el uso de un
generación propia y apoyo en fuentes secundarias como internet, debido a las dificultades
de tiempo, costo, logística y contexto; es importante recalcar que las imágenes son el
actualmente (en promedio 1000 imágenes), para mejorar los Índices de Efectividad,
Venegas (2019), Suárez et al. (2018), Coronado (2018) y Alam et al. (2016),
piel, e incluso fueron sometidas a pruebas de uso en usuarios finales (médicos y pacientes)
55
internet y redes sociales como Instagram; y en el caso de Alam et al. (2016), detectaban
(2016), que sólo alcanzaron porcentajes entre 82% y 91%, en cuyo caso se puede
Así mismo, es importante señalar, que este trabajo tuvo en cuenta los criterios y
Abdulrasoul (2017), Castillo y Díaz (2016); y el tipo de imágenes (en algunos casos se
utilizaron imágenes de Rayos X o 3D), como los trabajos de Maldonado & Beltrán (2019)
la Dermatología.
56
CAPÍTULO VI: CONCLUSIONES
siguiente:
b. Respecto a la Hipótesis
Iquitos. Con resultado de 93% como índice de Efectividad, que indica un resultado
57
Objetivo Específico II: Se ha logrado alcanzar apropiados índices de
ciudad de Iquitos. Con resultado de 93% como índice de Sensibilidad, que indica
ciudad de Iquitos. Con resultado de 93% como índice de Especificidad, que indica
58
CAPÍTULO VII: RECOMENDACIONES
enfermedades del Perú, y a partir de ello crear sistemas inteligentes que ayuden
en el diagnóstico de enfermedades.
comparación del uso de redes neuronales convolucionales con las otras técnicas
59
CAPITULO VIII: REFERENCIAS
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65
CAPITULO IX: ANEXOS
Título: “Método alternativo basado en un Sistema Inteligente para identificar enfermedades de la piel”
PROBLEMA PRINCIPAL OBJETIVO GENERAL HIPÓTESIS VARIABLES INDICADOR METODOLOGIA
Problema General Objetivo General Hipótesis General TIPO DE INVESTIGACIÓN
¿De qué manera, mediante un método Generar un método alternativo basado en un El uso de un método alternativo, basado en un sistema Variable Aplicada
alternativo, es posible mejorar los sistema inteligente para identificar inteligente permitirá la identificación de Independiente:
procedimientos de identificación de enfermedades de la piel en la población de la enfermedades de la piel en la población de la ciudad
enfermedades de la piel en la población de ciudad de Iquitos. de Iquitos. Método alternativo Presencia-Ausencia NIVEL DE LA INVEST.
la ciudad de Iquitos? basado en sistema Explicativa
inteligente.
Problemas Específicos Objetivos Específicos Hipótesis Específicas
Problema específico 1: ¿El uso de un DISEÑO DE LA INVEST.
Objetivo Especifico 1: Alanzar apropiados Hipótesis Específica 1: El uso de un método Experimental
método alternativo permitirá alcanzar índices de efectividad en la identificación de alternativo, basado en un sistema inteligente,
apropiados Índices de Efectividad para la enfermedades de la piel en la población de la alcanzará apropiados índices de efectividad en la
identificación de enfermedades de la piel en ciudad de Iquitos. identificación de enfermedades de la piel en la
la población de la ciudad de Iquitos?
población de la ciudad de Iquitos.
Problema específico 2: ¿El uso de un Objetivo Especifico 2: Alcanzar apropiados • Índice de Efectividad. UNIVERSO:
Hipótesis Especifica 2: El uso de un método • Índice de N = 550 mil Habitantes de
método alternativo permitirá alcanzar índices de Sensibilidad en la identificación
alternativo, basado en un sistema inteligente, Variable Dependiente: Iquitos
apropiados Índices de Especificidad en la de enfermedades de la piel en la población Especificidad.
alcanzará apropiados índices de Sensibilidad en la
identificación de enfermedades de la piel, de la ciudad de Iquitos. • Índice de Sensibilidad.
identificación de enfermedades de la piel en la
en la población de la ciudad de Iquitos?
población de la ciudad de Iquitos. MUESTRA:
N = 20 pacientes.
Problema específico 3: ¿El uso de un Objetivo Especifico 3: Alcanzar
método alternativo permitirá alcanzar apropiados índices de Especificidad en la Hipótesis Especifica 3: El uso de un método
apropiados Índices de Sensibilidad en la identificación de enfermedades de la piel en alternativo, basado en un sistema inteligente,
identificación de enfermedades de la piel, Identificación de
la población de la ciudad de Iquitos. alcanzará apropiados índices de Especificidad en la
en la población de la ciudad de Iquitos? enfermedades de la piel
identificación de enfermedades de la piel en la
en la población de la
población de la ciudad de Iquitos.
ciudad de Iquitos.
…Continuación
66
UNIDADES DE
VARIABLES INDICADORES ÍNDICES
OBSERVACIÓN/ANÁLISIS
Variable Independiente:
Método alternativo basado Observación • Presencia-Ausencia No, Sí
en sistema inteligente.
Variable Dependiente: Registro Manual [ 0...100%]
• Índice de Efectividad
Identificación de
enfermedades de la piel en la Registro Manual • Índice de Especificidad. [ 0...100%]
población de la ciudad de
Registro Manual • Índice de Sensibilidad. [ 0...100%]
Iquitos
67
9.2. Ficha de Observación Nro. 1
Evaluación del reconocimiento del diagnóstico de enfermedades de piel (Método Tradicional vs Sistema Inteligente)
Indicación: Marque con un aspa el casillero, en el ítem que corresponda, según indique la respuesta del experto o el software de
reconocimiento.
68
19 Train X X 70 Train X X
20 Train X X 71 Train X X
21 Train X X 72 Train X X
22 Train X X 73 Train X X
23 Train X X 74 Train X X
24 Train X X 75 Train X X
25 Train X X 76 Train X X
26 Train X X 77 Train X X
27 Train X X 78 Train X X
28 Train X X 79 Pruebas de Uso X X
29 Train X X 80 Pruebas de Uso X X
30 Train X X 81 Pruebas de Uso X X
31 Train X X 82 Pruebas de Uso X X
32 Train X X 83 Pruebas de Uso X X
33 Train X X 84 Pruebas de Uso X X
34 Train X X 85 Pruebas de Uso X X
35 Train X X 86 Pruebas de Uso X X
36 Train X X 87 Pruebas de Uso X X
37 Train X X 88 Pruebas de Uso X X
38 Train X X 89 Pruebas de Uso X X
39 Train X X 90 Pruebas de Uso X X
40 Train X X 91 Pruebas de Uso X X
41 Train X X 92 Pruebas de Uso X X
42 Train X X 93 Pruebas de Uso X X
43 Train X X 94 Pruebas de Uso X X
44 Train X X 95 Pruebas de Uso X X
45 Train X X 96 Pruebas de Uso X X
46 Train X X 97 Pruebas de Uso X X
47 Train X X 98 Pruebas de Uso X X
48 Train X X 99 Pruebas de Uso X X
49 Train X X 100 Pruebas de Uso X X
69
50 Train X X 101 Pruebas de Uso X X
51 Train X X 102 Pruebas de Uso X X
70
24 Train X X 87 Train X X
25 Train X X 88 Train X X
26 Train X X 89 Train X X
27 Train X X 90 Train X X
28 Train X X 91 Train X X
29 Train X X 92 Train X X
30 Train X X 93 Train X X
31 Train X X 94 Pruebas de Uso X X
32 Train X X 95 Pruebas de Uso X X
33 Train X X 96 Pruebas de Uso X X
34 Train X X 97 Pruebas de Uso X X
35 Train X X 98 Pruebas de Uso X X
36 Train X X 99 Pruebas de Uso X X
37 Train X X 100 Pruebas de Uso X X
38 Train X X 101 Pruebas de Uso X X
39 Train X X 102 Pruebas de Uso X X
40 Train X X 103 Pruebas de Uso X X
41 Train X X 104 Pruebas de Uso X X
42 Train X X 105 Pruebas de Uso X X
43 Train X X 106 Pruebas de Uso X X
44 Train X X 107 Pruebas de Uso X X
45 Train X X 108 Pruebas de Uso X X
46 Train X X 109 Pruebas de Uso X X
47 Train X X 110 Pruebas de Uso X X
48 Train X X 111 Pruebas de Uso X X
49 Train X X 112 Pruebas de Uso X X
50 Train X X 113 Pruebas de Uso X X
51 Train X X 114 Pruebas de Uso X X
52 Train X X 115 Pruebas de Uso X X
53 Train X X 116 Pruebas de Uso X X
54 Train X X 117 Pruebas de Uso X X
71
55 Train X X 118 Pruebas de Uso X X
56 Train X X 119 Pruebas de Uso X X
57 Train X X 120 Pruebas de Uso X X
58 Train X X 121 Pruebas de Uso X X
59 Train X X 122 Pruebas de Uso X X
60 Train X X 123 Pruebas de Uso X X
61 Train X X 124 Pruebas de Uso X X
62 Train X X 125 Pruebas de Uso X X
63 Train X X 126 Pruebas de Uso X X
72
9.3. Ficha de Observación Nro. 2
Observador: ………………………………………………………………………………………………………………………….
Fecha: …../…../……….
Indicación: Basado en los resultados de la Ficha de Observación N°1, indique el número de diagnósticos confirmados para cada enfermedad,
según el método.
MÉTODO TRADICIONAL MÉTODO ALTERNATIVO
E-1 E-2 TOTAL Índice de E-1 E-2 TOTAL Índice de
Efectividad (%) Efectividad (%)
N° de diagnósticos N° de diagnósticos
confirmados confirmados
Leyenda: Leyenda:
E-1: Enfermedad de la piel “Impétigo” E-1: Enfermedad de la piel “Impétigo”
E-2: Enfermedad de la piel “Psoriasis” E-2: Enfermedad de la piel “Psoriasis”
73
9.4. Ficha de Observación Nro. 3
Especificidad y Sensibilidad
Observador: ……………………………………………………………………
Indicación: Complete los siguientes cuadros, según los resultados obtenidos del
Formato de Observación Nº1.
Train
Reconocidas No
Índice de Índice de
como reconocidas
Imágenes Total Sensibilidad Especificidad
imágenes de como
Parcial Parcial
“Impétigo” “Impétigo”
Imágenes de
“Impétigo”
Imágenes que
no son
“Impétigo”
Total
Reconocidas No
Índice de Índice de
como reconocidas
Imágenes Total Sensibilidad Especificidad
imágenes de como
Parcial Parcial
“Psoriasis” “Psoriasis”
Imágenes de
“Psoriasis”
Imágenes que
no son
“Psoriasis”
Total
Leyenda: Train
Índice de Sensibilidad Parcial
• Excelente = 100% del Total
• Aceptable= Entre 80%-99% del Total
• No Aceptable= Menor de 80% del Total
74
Test
Reconocidas No
Índice de Índice de
como reconocidas
Imágenes Total Sensibilidad Especificidad
imágenes de como
Parcial Parcial
“Psoriasis” “Psoriasis”
Imágenes de
“Psoriasis”
Imágenes que
no son
“Psoriasis”
Total
Reconocidas No
Índice de Índice de
como reconocidas
Imágenes Total Sensibilidad Especificidad
imágenes de como
Parcial Parcial
“Impetigo” “Impetigo”
Imágenes de
“Impetigo”
Imágenes que
no son
“Impetigo”
Total
Leyenda: Test
Índice de Sensibilidad Parcial
• Excelente = 100% del Total
• Aceptable= Entre 80%-99% del Total
• No Aceptable= Menor de 80%del Total
75
Resumen Especificidad y Sensibilidad
• Resumen de las imágenes reconocidas correctamente según la enfermedad que
corresponde (según la Aplicación) – Sensibilidad Parcial
Si es Si es Total Sensibilidad
“Impetigo” “Psoriasis” imágenes (%)
Entrenamiento
Validación
Test
No es No es Total Especificidad
“Impetigo” “Psoriasis” imágenes (%)
Entrenamiento
Validación
Test
General
76
9.5. Carta de Presentación
Señor(a)(ita):
………………………………………………………………………………………
Presente
Es muy grato para mi comunicarme con usted para expresarle mis saludos y así mismo,
hacer de su conocimiento que, siendo estudiantes de post grado (Doctorado), de la
Universidad Nacional Federico Villareal, requiero validar los instrumentos con los cuales
obtendré la información necesaria para poder desarrollar mi investigación y con la cual
optaremos el grado de Magister.
……………………………….
Firma
Alejandro Reategui Pezo
DNI: 06182363
77
9.6. Validez del Instrumento de Investigación
JUICIO DE EXPERTO
Puntaje:
• De 18 a 20: Válido, Aplicar
• De 15 a 17: Válido, Mejorar
• De 12 a 14: No válido, Modificar
• De 4 a 11: No válido, Reformular
Apellidos y Nombres:
78
9.7. Validez del Instrumento de Investigación
JUICIO DE EXPERTO
Puntaje:
• De 18 a 20: Válido, Aplicar
• De 15 a 17: Válido, Mejorar
• De 12 a 14: No válido, Modificar
• De 4 a 11: No válido, Reformular
Apellidos y Nombres:
79
9.8. Validez del Instrumento de Investigación
JUICIO DE EXPERTO
Puntaje:
• De 18 a 20: Válido, Aplicar
• De 15 a 17: Válido, Mejorar
• De 12 a 14: No válido, Modificar
• De 4 a 11: No válido, Reformular
Apellidos y Nombres:
80
9.9. Resultados del Sistema Inteligente de diagnóstico de enfermedades de la piel
a. Resultado de “Impétigo”
b. Resultado de “Psoriasis”
81
9.10. Código Fuente
a. Código de Entrenamiento
Todo algoritmo de red neuronal requiere la importación de un conjunto
determinado de librerías, que ayudarán a construir y configurar el entorno
necesario para ejecutar el código de entrenamiento. Para este caso, se muestra la
siguiente lista de librerías importadas:
82
Se fijan las dimensiones de entrada de la imagen, antes del procesamiento de la
red neuronal en el entrenamiento, que será de 299 px de alto x 299 px de ancho.
Y se establece que para el conjunto total de datos se procesarán en lotes de 32
imágenes.
83
Se determina el número de épocas y lote en que se procesará el conjunto de
datos:
84
9.11. Manual de Usuario
85
PRESENTACIÓN
86
SISTEMA INTELIGENTE PARA IDENTIFICAR ENFERMEDADES DE LA
PIEL
Por defecto, al cargar por primera vez la página del sistema, se visualiza el
contenido de la opción “INICIO”. El sistema permite interactuar con otros
contenidos como “PROTOCOLO” y “APLICACIÓN”, los cuáles se describirán
en el desarrollo del manual.
a. Opción “Inicio”.
Esta opción se muestra por defecto como vista principal del Sistema
Inteligente, y muestra contenido para que el usuario comprenda el contexto en
que se enmarca la funcionalidad del sistema.
En el “Menú lateral” se describe brevemente detalles del sistema:
88
En la “Vista de contenido” se muestran datos informativos y cifras actuales
acerca de las enfermedades de la piel y la problemática que busca resolver el
sistema.
89
b. Opción “PROTOCOLO”
Esta opción señala un conjunto de aspectos y consideraciones que el usuario
debe seguir para tomar una fotografía que cumpla con el estándar para realizar
el reconocimiento automático de cualquiera de los 2 tipos de enfermedades de
la piel (Impétigo y Psoriasis), en el sistema.
90
Además, se muestra ejemplos que señalan los errores que deben evitarse para
tomar una foto que se utilizará para el reconocimiento.
c. Opción “Aplicación”
Si se desea realizar el reconocimiento de enfermedades de la piel en el sistema,
a partir de una imagen (que cumple con el protocolo indicado en el apartado
anterior), el usuario debe realizar el siguiente procedimiento:
91
2. Se carga en la “Vista de contenido” la opción para cargar una imagen. Se
visualiza lo siguiente:
92
9.12. Explicación de algoritmo
93
A continuación, se explica la estructura de una red neuronal convolucional en base
a la Figura 3.
Existe una gran variedad de redes neuronales convolucionales, entre las más
conocidas están el “VGG-16”, “ResNet”, “Xception”, “AlexNet”. Para este
trabajo de tesis, se ha definido el uso de otro algoritmo conocido, “Inception V3”,
cuya estructura se indica a continuación:
94
Figura 4. Arquitectura de la red neuronal convolucional “Inception V3”
Esta red neuronal trabaja con imágenes de dimensiones 299 x 299. Tiene 48 capas
profundas. A diferencia de otras redes neuronales, en este caso como base se
compone de 3 módulos (A, B y C), que comprenden un conjunto de capas, y se
encuentran apilados uno detrás de otro, y permite que el procesamiento de las
imágenes se realice a la vez en tres diferentes filtros.
Se tiene:
95
- Capa Dropout: Comprende la técnica que desactiva algunas neuronas para
disminuir algunos valores que puedan sobreajustar la red neuronal convolucional.
- Capa Fully Connected: Comprende al conjunto de valores resultantes del
proceso de entrenamiento. Muestra un vector de valores, que servirán para la
clasificación.
- Capa Softmax: Comprende la representación de probabilidades basado en la
misma cantidad de neuronas de la “Capa Fully Connected”, los valores se
mantienen entre 0 a 1, a cada probabilidad corresponde una clase.
96