Usando R en Hidro-Meteorología

Un curso para SENAMHI (DZ-07)

Adrian Huerta
2020-06-01 (actualizado: 2020-07-27)
Acerca de mi

 Adrian Huerta (trabajos científicos)

 Adrian Huerta (trabajos científicos +)
 Not an ordinary trend (blog - no actualizado)
Flujo de tiempo en Adrian Huerta
 adrHuerta (códigos en R y otros)
 adrhuerta (¡preguntame algo!)

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Acerca de ustedes
Meteorología de Alta Montaña

 Dirección zonal 07 (Tacna y Moquegua-parte Sur)

 ¿Cuál es tu nombre? Rescate de Datos
 ¿Qué especialidad tienes?
 ¿En que temas estas envuelto ultimamente?
 ¿Sabes R y/o alguna vez lo has usado?
 ¿Has usado otro lenguaje (python, matlab, etc.)?

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Algunas reglas del curso
 Configura tu micrófono en modo silencio.
 Usa tu nombre real y una foto de perfil.
 Los participantes podran colaborar con sus compañeros (entre todos) en las tareas/trabajos.
 El curso se grabara y el video se adjuntara al final.

 Hay dos formas de hacer preguntas durante el curso:

-- El chat de Google Meet: para hacer preguntas/dudas relacionados al tema del momento de presentación
-- Correo electronico: para hacer preguntas/dudas relacionadas con el contenido general del curso
--- Al escribir el Correo electronico tener en cuenta el siguiente asunto: Curso de R - DZ07

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Requisitos
 Conocimiento previo
-- Conocimiento mínimo de R
-- Métodos estadísticos basicos aplicados a hidro-climatología
 Paquetes (librerias)
-- Muchas librerias seran utilizadas (principales: zoo, xts, raster, gstat, ggplot2)
-- Instalación a medida que se avanza
 Presentación (slides)
-- En formato .pdf
-- https://github.com/adrhuerta (repositorio privado a solicitud)
 Datos y scripts
-- En diferentes formatos: .txt, .csv, .nc, .shp
-- https://github.com/adrhuerta (repositorio privado a solicitud)

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Plan de trabajo (1)
Introducción Datos temporales
1. Vista general de R 1. Librerias para datos temporales
2. ¿Qué es R y porque usarlo? 2. Análisis básico de series de tiempo
3. Instalación en Windows/Linux 3. Operación con series diarias y mensuales
4. Introducción a RStudio como interfaz de desarrollo 4. Ejemplos aplicativos (3)
5. Buenas practicas de proyectos 5. Ejericicios (1)
6. Operaciones básicas
7. Estructura y tipo de datos
8. Estilos de código
9. Importación y exportación de datos
10. Bucles vs apply
11. Ejemplos Aplicativos (2)
12. Ejercicios (1)

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Plan de trabajo (2)
Datos espaciales
1. Librerias para datos espaciales
2. Tipo y manejo de datos espaciales.
3. Geo-procesos en R.
4. Introducción basica geo-estadística
5. Interpolación espacial.
6. Ejemplos aplicativos (3)
7. Ejercicios(1)
Trabajo final
1. Trends and variability of precipitation extremes in
the Peruvian Altiplano (1971–2013)
2. Performance Evaluation of Satellite- and Model-
based Precipitation Products over Varying Climate
and Complex Topography
3. Space–time variability of drought over Vietnam
4. Daily precipitation variability in the southern Alps
since the late 19th century
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Horario (potencial)

 4-7pm (3h de clase aproximadamente)

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Mi sesión de R
─ Session info ──────────────────────────────────────────────────────────
setting value
version R version 3.6.3 (2020-02-29)
os Ubuntu 18.04.2 LTS
system x86_64, linux gnu
ui X11
language en_US
collate en_US.UTF-8
ctype en_US.UTF-8
tz America/Lima
date 2020-07-27

─ Packages ──────────────────────────────────────────────────────────────
! package * version date lib source
R FALSE <NA> <NA> [?] <NA>

[1] /home/adrian/R/x86_64-pc linux gnu library/3.6

[2] /opt/R/3.6.3/lib/R/library

R ── Package was removed from disk.

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Parte I
Introducción a R
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¿Qué es R?

R es un lenguaje y entorno para computación estadística

y gráficos.
Es un proyecto GNU que es similar al lenguaje y
entorno S que fue desarrollado en los Laboratorios
Bell (anteriormente AT&T, ahora Lucent
Technologies) por John Chambers y sus colegas.
R puede considerarse como una implementación
diferente de S.
R proporciona una amplia variedad de técnicas
estadísticas (modelos lineales y no lineales,
pruebas estadísticas clásicas, análisis de series de
tiempo, clasificación, agrupamiento, ...) y gráficas, y
es altamente extensible.

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¿Por qué R?
Es gratuito, de código abierto y está disponible en
todas las plataformas principales. Como resultado,
si hace tu análisis en R, cualquiera puede replicarlo
fácilmente.
R tiene una comunidad diversa y acogedora.
Un conjunto masivo de paquetes para modelado
estadístico, aprendizaje automático, visualización e
importación y manipulación de datos, etc.
Probablemente algo que hayas querido hacer ya
esta hecho.
Potentes herramientas para comunicar los
resultados.
Herramientas de vanguardia. Nuevas
metodologias aplicando R. Acceso inmediato a las
últimas técnicas e implementaciones estadísticas.
Potentes herramientas para comunicar los
resultados.
... 12 / 176
Usando R en Hidrología
Una revisión de desarrollos recientes y direcciones futuras

 Slater et al. 2019

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Usando R en Climatología (Meterología)?
No existe (a la fecha) un paper que compila o revisa el estado de
arte de R en climatología (meteorología). Sin embargo...

 Czernecki et al. 2020

 Iturbide et al. 2018

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Descargando R
R debe ser instalado para ser utilizado. El programa es provisto por el Comprehensive R Archive Network (CRAN) - El
sustentador de R

En Windows (Mac OS X) se tiene instalaciones pre- En Linux se debe descargar R utilizado el

construidas. En Linux, usualmente se compila mecanismo de descarga del SO: apt-get(Ubuntu-
desde la fuente Debian), yum (Red Hat-Centos), etc. Esto construirá
En Windows: "Download R for Windows" - "base" - e instalará R.
"Download R 3.x.x for Windows" ¿32-64 bits y/o multiples versiones de R?

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El ambiente de R
R viene con una IDE (entorno de desarrollo interactivo - interfaz de usuario)
espartano en Windows y, en Linux no hay IDE, solo el terminal. Hay muchas
opciones de IDE, sin embargo, la mejor opción es RStudio.

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R y RStudio

R != RStudio

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RStudio

Diseñado para facilitar la escritura de scripts

Hace que sea conveniente ver e interactuar con los
objetos almacenados en el entorno
Facilita la configuración del directorio de trabajo y
el acceso a los archivos en la computadora.
Hace que los gráficos sean mucho más accesibles
para un usuario casual
Descarga (e instalación) similar a R: Download
RStudio
A partir de ahora solo abriremos RStudio,
entonces:
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Diseño general de RStudio
Vista (modificada) de RStudio

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Diseño general de RStudio
Vista (modificada) de RStudio + (ALT + SHIFT + K)

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RStudio projects
Caracteristica principal de RStudio: Proyectos

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RStudio projects
Caracteristica principal de RStudio: Proyectos

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RStudio projects
Caracteristica principal de RStudio: Proyectos

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RStudio projects
Caracteristica principal de RStudio: Proyectos

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RStudio projects
Caracteristica principal de RStudio: Proyectos

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RStudio tools
RStudio es altamente personalizable con muchas opciones

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RStudio tools
RStudio es altamente personalizable con muchas opciones

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Buenas practicas de proyectos en R
Como hacer que un proyecto (trabajo) sea reproducible
reproducible,, portátil y
autónomo

¡Organización y Orden!
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Buenas practicas de proyectos en R

Una primera aproximación:

- ./R_curso/

- ./R_curso/01_datos

- ./R_curso/02_scripts

- ./R_curso/03_resultados

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Operaciones basicas

Estructuras basicas: Estructuras avanzadas:

1. Matematica basica 1. Data.Frames

2. Variables 2. Listas

3. Tipos de datos 3. Matrices

4. Vectores 4. Arrays

5. Convocar funciones (librerias) 5. Pipes

6. Datos vacios 6. Funciones

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