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Informatica medica 1
18 de dic de 2014
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Salud y medicina
Introducción a la ofimática y a la bioinformática. Clase correspondiente a la materia Informática Médica del Instituto Universitario de Ciencias Biomédicas de Córdoba
(IUCBC)
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Alberto Diaz Anel

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Informatica medica 1
1. 1. CONCEPTOS BÁSICOS PARACONCEPTOS BÁSICOS PARA INFORMÁTICA EN CIENCIASINFORMÁTICA EN CIENCIAS BIOMÉDICASBIOMÉDICAS
Materia: Informática Médica - Unidad 9Materia: Informática Médica - Unidad 9 Profesor: Dr. Alberto Díaz AñelProfesor: Dr. Alberto Díaz Añel
2. 2. OFIMÁTICAOFIMÁTICA Conjunto de técnicas, aplicaciones y herramientas informáticas que seConjunto de técnicas, aplicaciones y herramientas informáticas que se
utilizan para optimizar, automatizar y mejorar los procedimientos o tareas.utilizan para optimizar, automatizar y mejorar los procedimientos o tareas. Las herramientas
ofimáticas permiten idear, crear, manipular, transmitir y/oLas herramientas ofimáticas permiten idear, crear, manipular, transmitir y/o almacenar la información. Las más
utilizadas son:almacenar la información. Las más utilizadas son: • Procesador de textos (Word).Procesador de textos (Word). • Hojas de cálculo (Excel).Hojas de cálculo
(Excel). • Herramientas de presentación multimedia (PowerPoint).Herramientas de presentación multimedia (PowerPoint). • Utilidades: agendas, calculadoras,
etc.Utilidades: agendas, calculadoras, etc. • Programas de correo electrónico, correo de voz, mensajeros.Programas de correo electrónico, correo de voz, mensajeros. •
Herramientas de reconocimiento y síntesis del habla.Herramientas de reconocimiento y síntesis del habla.
3. 3. Procesadores de textoProcesadores de texto •Brindan una amplia gama de funcionalidades, ya sean tipográficas,Brindan una amplia gama de funcionalidades, ya sean
tipográficas, idiomáticas u organizativas.idiomáticas u organizativas. •Como regla general, todos pueden trabajar con distintos tipos y tamañosComo regla general, todos
pueden trabajar con distintos tipos y tamaños de letra, formato de párrafo y efectos artísticos; además de brindar lade letra, formato de párrafo y efectos artísticos; además
de brindar la posibilidad de intercalar o superponer imágenes u otros objetos gráficos dentroposibilidad de intercalar o superponer imágenes u otros objetos gráficos dentro
del texto.del texto. •Como ocurre con la mayoría de las herramientas informáticas, los trabajosComo ocurre con la mayoría de las herramientas informáticas, los trabajos
realizados en un procesador de texto pueden ser guardados en formarealizados en un procesador de texto pueden ser guardados en forma de archivos (documentos), así
como impresos a través de diferentes medios.de archivos (documentos), así como impresos a través de diferentes medios.
4. 4. Procesadores de textoProcesadores de texto •La mayoría de los procesadores de texto más utilizados en la actualidad seLa mayoría de los procesadores de texto más
utilizados en la actualidad se basan en el concepto WYSIWYG (del inglésbasan en el concepto WYSIWYG (del inglés What You See Is What You GetWhat You See Is
What You Get,, “lo que ve es lo que obtiene”).“lo que ve es lo que obtiene”). •Los procesadores de texto incorporan correctores de ortografía y gramática,Los
procesadores de texto incorporan correctores de ortografía y gramática, así como diccionarios multilingües y de sinónimos que facilitan en granasí como diccionarios
multilingües y de sinónimos que facilitan en gran medida la labor de redacción.medida la labor de redacción.
5. 5. Procesadores de texto más utilizadosProcesadores de texto más utilizados ComercialesComerciales Microsoft Word (Windows y Mac)Microsoft Word (Windows y
Mac) Word Perfect (Windows)Word Perfect (Windows) Documents to Go (Android, iOS)Documents to Go (Android, iOS) GratuitosGratuitos Apache OpenOffice Writer
(Windows, Mac y Linux)Apache OpenOffice Writer (Windows, Mac y Linux) LibreOffice Writer (Windows , Mac y Linux)LibreOffice Writer (Windows , Mac y Linux)
En líneaEn línea Google Docs (Windows y Mac)Google Docs (Windows y Mac)
6. 6. Procesadores de textoProcesadores de texto ¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina?¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina? Trabajo de
investigación profesionalTrabajo de investigación profesional Seguimiento personal de pacientesSeguimiento personal de pacientes TesisTesis Redacción delRedacción
del curriculum vitaecurriculum vitae Informe científico y técnicoInforme científico y técnico Comunicación con colegas o institucionesComunicación con colegas o
instituciones Pedidos de informes, bibliografía, etc.Pedidos de informes, bibliografía, etc. Documentos legalesDocumentos legales Publicaciones en revistas
especializadasPublicaciones en revistas especializadas Notas de divulgaciónNotas de divulgación
7. 7. Microsoft WordMicrosoft Word Puntos a tener en cuenta para laPuntos a tener en cuenta para la redacción de documentosredacción de documentos Tipo y tamaño de
letraTipo y tamaño de letra Arial 11 (digital) Times 12 (impreso)
8. 8. Microsoft WordMicrosoft Word Puntos a tener en cuenta para laPuntos a tener en cuenta para la redacción de documentosredacción de documentos Espaciado
sencilloEspaciado sencillo Dejar un espacio luego de títulos,Dejar un espacio luego de títulos, subtítulos, secciones, etc.subtítulos, secciones, etc.
9. 9. Microsoft WordMicrosoft Word Puntos a tener en cuenta para laPuntos a tener en cuenta para la redacción de documentosredacción de documentos Utilizar márgenes
adecuadosUtilizar márgenes adecuados
10. 10. Microsoft WordMicrosoft Word Puntos a tener en cuenta para laPuntos a tener en cuenta para la redacción de documentosredacción de documentos Hacer uso
inserciones cuando seaHacer uso inserciones cuando sea necesario:necesario: EncabezadoEncabezado Pie de páginaPie de página Número de páginaNúmero de página
Cuadros de textoCuadros de texto TablasTablas ImágenesImágenes
11. 11. Microsoft WordMicrosoft Word Puntos a tener en cuenta para laPuntos a tener en cuenta para la redacción de documentosredacción de documentos ¡Revisar la
ortografía y la gramática!¡Revisar la ortografía y la gramática!
12. 12. Hojas de cálculoHojas de cálculo •Son un tipo de documentos que permitenSon un tipo de documentos que permiten manipular datos numéricos y alfanuméricos
dispuestos en forma demanipular datos numéricos y alfanuméricos dispuestos en forma de tablas, las cuales se componen detablas, las cuales se componen de celdasceldas
que se organizan en unaque se organizan en una matriz bidimensional dematriz bidimensional de filasfilas yy columnascolumnas.. •La celda es la unidad básica de
información en la hoja de cálculo,La celda es la unidad básica de información en la hoja de cálculo, donde se insertan los valores y las fórmulas que realizan losdonde se
insertan los valores y las fórmulas que realizan los cálculos.cálculos. •Es posible realizar cálculos complejos con fórmulas y funciones yEs posible realizar cálculos
complejos con fórmulas y funciones y crear distintos tipos de gráficos con los datos ingresados.crear distintos tipos de gráficos con los datos ingresados.
13. 13. Hojas de cálculo más utilizadasHojas de cálculo más utilizadas ComercialesComerciales Microsoft Excel (Windows y Mac)Microsoft Excel (Windows y Mac) Corel
Quattro Pro para Word Perfect (Windows)Corel Quattro Pro para Word Perfect (Windows) Documents to Go (Android, iOS)Documents to Go (Android, iOS)
GratuitasGratuitas Apache OpenOffice Calc (Windows, Mac y Linux)Apache OpenOffice Calc (Windows, Mac y Linux) LibreOffice Calc (Windows , Mac y
Linux)LibreOffice Calc (Windows , Mac y Linux) En líneaEn línea Google Docs (Windows y Mac)Google Docs (Windows y Mac)
14. 14. Hojas de cálculoHojas de cálculo ¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina?¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina? Trabajo de
investigación profesionalTrabajo de investigación profesional Seguimiento personal de pacientesSeguimiento personal de pacientes Análisis estadísticosAnálisis
estadísticos Realización de cálculos complejos de uso periódicoRealización de cálculos complejos de uso periódico Creación de gráficos a partir de grandes volúmenes de
datos para unaCreación de gráficos a partir de grandes volúmenes de datos para una mejor comprensión visualmejor comprensión visual
15. 15. Microsoft ExcelMicrosoft Excel CeldaCelda FilaFila ColumnaColumna
16. 16. Microsoft Excel (cálculos)Microsoft Excel (cálculos)
17. 17. Microsoft Excel (gráficos)Microsoft Excel (gráficos)
18. 18. Programas de presentaciónProgramas de presentación •Un programa de presentación es un paquete de software que seUn programa de presentación es un paquete de
software que se utiliza para mostrar información, a través de una serieutiliza para mostrar información, a través de una serie de diapositivas.de diapositivas. •Típicamente
incluye tres funciones principales: un editor queTípicamente incluye tres funciones principales: un editor que permite insertar un texto y darle formato, un método para
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gráficos, sonidos y videos, y un sistema para agregar a los contenidos efectos de animación.agregar a los contenidos efectos de animación.
19. 19. Programas de presentación más utilizadosProgramas de presentación más utilizados ComercialesComerciales Microsoft PowerPoint (Windows y Mac)Microsoft
PowerPoint (Windows y Mac) Documents to Go (Android, iOS)Documents to Go (Android, iOS) GratuitasGratuitas Apache OpenOffice Impress (Windows, Mac y
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línea Google Docs (Windows y Mac)Google Docs (Windows y Mac) Prezi (prezi.com)Prezi (prezi.com)
20. 20. Programas de presentaciónProgramas de presentación ¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina?¿A qué tipos de trabajos se pueden aplicar en medicina?
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21. 21. Microsoft PowerPointMicrosoft PowerPoint
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23. 23. 1.1. Tratar de que sean simples.Tratar de que sean simples. 2.2. De ser posible, usar un estilo personal y único.De ser posible, usar un estilo personal y único. 3.3. Las
presentaciones deben ser fáciles de ver y de leer, aun en pantallasLas presentaciones deben ser fáciles de ver y de leer, aun en pantallas pequeñas. Usar tipos de fuentes
que faciliten la lectura y no fatiguen alpequeñas. Usar tipos de fuentes que faciliten la lectura y no fatiguen al lector, elegir el tamaño adecuado para cada uso.lector, elegir
el tamaño adecuado para cada uso. 4.4. Cuando se pueda, usar siempre imágenes, fotografías y otros elementosCuando se pueda, usar siempre imágenes, fotografías y
otros elementos gráficos, los cuales son procesados más rápidamente por nuestro cerebrográficos, los cuales son procesados más rápidamente por nuestro cerebro que el
texto.que el texto. Consejos para las presentacionesConsejos para las presentaciones
24. 24. 5.5. Cuando sea necesario y lo requiera, usar audio, música y videos en lasCuando sea necesario y lo requiera, usar audio, música y videos en las presentaciones, le
agregarán valor.presentaciones, le agregarán valor. 6.6. Evitar las transiciones muy complicadas y sofisticadas.Evitar las transiciones muy complicadas y sofisticadas. 7.7.
Usar las páginas de notas para agregar información extra, pero necesariaUsar las páginas de notas para agregar información extra, pero necesaria en cada dispositiva.en
cada dispositiva. 8.8. Comprobar siempre la ortografía y la gramática.Comprobar siempre la ortografía y la gramática. Consejos para las presentacionesConsejos para las
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25. 25. La edición digital de imágenes se ocupa de la edición apoyada en programas La edición digital de imágenes se ocupa de la edición apoyada en programas de manejo
de imágenes digitales, en la mayoría de los casos fotos o de manejo de imágenes digitales, en la mayoría de los casos fotos o
documentos escaneados. Estas imágenes son modificadas para optimizarlas, documentos escaneados. Estas imágenes son modificadas para optimizarlas,
manipularlas, retocarlas, etc., para su posterior exposición o comunicación.manipularlas, retocarlas, etc., para su posterior exposición o comunicación.
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utilizan para concebir, programar, proyectar y cuales se utilizan para concebir, programar, proyectar y realizar comunicaciones visuales destinadas
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grupos, posibilitando la comunicación gráfica de ideas, hechos, investigaciones, etc.comunicación gráfica de ideas, hechos, investigaciones, etc. Editores de imágenes
científicasEditores de imágenes científicas
26. 26. Springer ImagesSpringer Images http://www.springerimages.com/http://www.springerimages.com/ Wellcome ImagesWellcome Images
http://wellcomeimages.org/http://wellcomeimages.org/ CompfightCompfight http://compfight.com/http://compfight.com/ Sitios que ofrecen imágenes relacionadas con la
medicinaSitios que ofrecen imágenes relacionadas con la medicina
27. 27. Características principalesCaracterísticas principales Formatos másFormatos más utilizadosutilizados •GIF: se utiliza para laGIF: se utiliza para la web. Menos colores
yweb. Menos colores y más pequeños.más pequeños. •JPEG: ideal paraJPEG: ideal para presentaciones. Sonpresentaciones. Son archivos comprimidosarchivos
comprimidos (pierden información).(pierden información). •TIFF: conservan todaTIFF: conservan toda la información de lala información de la imagen. Son
archivosimagen. Son archivos más grandes y pesados.más grandes y pesados.
28. 28. ImageJ (http://imagej.nih.gov/ij/)ImageJ (http://imagej.nih.gov/ij/) •Desarrollado por elDesarrollado por el NIHNIH •GratuitoGratuito •Permite agregarPermite
agregar “plugins” para“plugins” para procesar y analizarprocesar y analizar datosdatos •Es de programaciónEs de programación abiertaabierta Programas de edición de
imágenes más utilizadosProgramas de edición de imágenes más utilizados
29. 29. Fiji (http://fiji.sc/Fiji)Fiji (http://fiji.sc/Fiji) •Se originó a partirSe originó a partir del ImageJdel ImageJ •GratuitoGratuito •Posee mayorPosee mayor número denúmero
de “plugins” para“plugins” para procesar y analizarprocesar y analizar imágenesimágenes científicascientíficas (microscopía)(microscopía) •Es deEs de
programaciónprogramación abiertaabierta
30. 30. Adobe PhotoshopAdobe Photoshop •Ideal paraIdeal para edición de fotosedición de fotos y para diseñoy para diseño gráficográfico •Es pagoEs pago •Gran
variedadGran variedad de filtros yde filtros y efectosefectos •IncorporaIncorpora impresión 3Dimpresión 3D
31. 31. Corel DrawCorel Draw •Ideal paraIdeal para diseño gráficodiseño gráfico •Utiliza otroUtiliza otro programa paraprograma para edición de fotosedición de fotos (Corel
Photo(Corel Photo Paint)Paint) •Es pagoEs pago •Gran variedadGran variedad de filtros yde filtros y efectosefectos
32. 32. GIMP (http://www.gimp.org/)GIMP (http://www.gimp.org/) •Ideal paraIdeal para edición de fotosedición de fotos y para diseñoy para diseño gráficográfico •Similar
alSimilar al PhotoshopPhotoshop •GratuitoGratuito •Se incluye enSe incluye en muchosmuchos sistemas Linuxsistemas Linux
33. 33. Inkscape (http://www.inkscape.org/en/)Inkscape (http://www.inkscape.org/en/) •Ideal paraIdeal para diseño gráficodiseño gráfico •GratuitoGratuito •Es deEs de
programaciónprogramación abiertaabierta
34. 34. Photoscape (http://photoscape.com.es/)Photoscape (http://photoscape.com.es/) •Ideal paraIdeal para edición de fotosedición de fotos •GratuitoGratuito
35. 35. "La informática médica es la aplicación de la"La informática médica es la aplicación de la tecnología informática a todos los ámbitos de latecnología informática a
todos los ámbitos de la medicina - la atención médica, la enseñanza de lamedicina - la atención médica, la enseñanza de la medicina y la investigación“.medicina y la
investigación“. Morris F. Collen, 1977Morris F. Collen, 1977
36. 36. El término "informática" se refiere al tratamiento de la información, El término "informática" se refiere al tratamiento de la información,
y a los métodos y mecanismos para hacerlo. y a los métodos y mecanismos para hacerlo. La "informática médica" se ha definido como el campo científico La
"informática médica" se ha definido como el campo científico
que tiene que ver con la información, los datos y el conocimiento que tiene que ver con la información, los datos y el conocimiento
biomédicos, su almacenamiento, recuperación y su uso óptimo para biomédicos, su almacenamiento, recuperación y su uso óptimo para
resolver problemas y tomar decisiones.resolver problemas y tomar decisiones.
37. 37. Dominios de la Informática MédicaDominios de la Informática Médica El cuidado clínicoEl cuidado clínico: prestación de servicios al paciente: prestación de
servicios al paciente El sistema de saludEl sistema de salud: entorno de atención clínica, incluyendo educación e investigación: entorno de atención clínica, incluyendo
educación e investigación La información y la comunicaciónLa información y la comunicación: herramientas para captura, transmisión y uso de: herramientas para
captura, transmisión y uso de datos, información y conocimientodatos, información y conocimiento
38. 38. USOS MÉDICOS DE LA INFORMÁTICAUSOS MÉDICOS DE LA INFORMÁTICA • Historia clínica electrónicaHistoria clínica electrónica • Intercambio de
informaciónIntercambio de información • Sistemas para la administración de la atenciónSistemas para la administración de la atención médicamédica • Diseminación y
recuperación de informaciónDiseminación y recuperación de información • Sistemas de monitorización de los pacientesSistemas de monitorización de los pacientes •
Procesamiento electrónico de imágenesProcesamiento electrónico de imágenes • BioinformáticaBioinformática
39. 39. BioinformáticaBioinformática Es la investigación, desarrollo y/o aplicación de herramientasEs la investigación, desarrollo y/o aplicación de herramientas
computacionales para la expansión del uso de datos biológicos, médicos ocomputacionales para la expansión del uso de datos biológicos, médicos o conductuales,
incluyendo aquellas herramientas que sirvan para adquirir,conductuales, incluyendo aquellas herramientas que sirvan para adquirir, almacenar, organizar, analizar o
visualizar tales datos.almacenar, organizar, analizar o visualizar tales datos.
40. 40. BioinformáticaBioinformática Es el estudio de cómo la información se representa y transmite en losEs el estudio de cómo la información se representa y transmite en
los sistemas biológicos, empezando por el nivel molecular, incluyendosistemas biológicos, empezando por el nivel molecular, incluyendo información sobre secuencias
(ADN, proteínas), estructuras y vías deinformación sobre secuencias (ADN, proteínas), estructuras y vías de señalización biológicas.señalización biológicas. La
bioinformática se vincula con la informática médica en tanto queLa bioinformática se vincula con la informática médica en tanto que abarca las bases de datos sobre
bibliografía especializada, el genomaabarca las bases de datos sobre bibliografía especializada, el genoma humano, las enfermedades hereditarias a nivel molecular, las
víashumano, las enfermedades hereditarias a nivel molecular, las vías metabólicas y muchos otros datos de utilidad para los profesionales de lametabólicas y muchos otros
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41. 41. HISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICAHISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICA 1953: Watson y Crick proponen la estructura de doble hélice1953: Watson y Crick
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(insulina bovina).(insulina bovina). 1958: Jack Kilby construye el primer circuito integrado en los1958: Jack Kilby construye el primer circuito integrado en los
laboratorios de Texas Instruments.laboratorios de Texas Instruments. 1965:1965: Margaret Dayhoff, una de las pioneras de la bioinformática,Margaret Dayhoff, una de las
pioneras de la bioinformática, publica el primero de los Atlas de secuencias de proteínas.publica el primero de los Atlas de secuencias de proteínas. 1969:1969: Nace , que
enlaza computadoras de diferentes universidadesNace , que enlaza computadoras de diferentes universidades de los EE.UU., esbozo de lo que seríade los EE.UU., esbozo
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42. 42. HISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICAHISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICA 1970:1970: Se crea el algoritmo de Needleman-Wunsch para alineamientoSe crea
el algoritmo de Needleman-Wunsch para alineamiento de secuencias.de secuencias. 1972:1972: Paul Berg crea la primera molécula de ADN recombinante.Paul Berg crea
la primera molécula de ADN recombinante. 1977: Frederick Sanger comienza la secuenciación de ADN y el1977: Frederick Sanger comienza la secuenciación de ADN y
el desarrollo de software para analizarlo.desarrollo de software para analizarlo. 1978: Se publica la primera secuencia de genes completa de un1978: Se publica la primera
secuencia de genes completa de un organismo, el fago Φ-X174 (5.386 pares de basesorganismo, el fago Φ-X174 (5.386 pares de bases que codifican 9 proteínas).que
codifican 9 proteínas). 1982: Kurt Wüthrich publica el método de utilización de la RMN1982: Kurt Wüthrich publica el método de utilización de la RMN (Resonancia
Magnética Nuclear) para determinar estructuras de(Resonancia Magnética Nuclear) para determinar estructuras de proteínas.proteínas.
43. 43. HISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICAHISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICA 1981-1988: Aparecen importantes bases de datos biológicas (GenBank y1981-
1988: Aparecen importantes bases de datos biológicas (GenBank y SwissProt).SwissProt). 1983: Se descubre la PCR (Polymerase Chain Reaction, reacción en1983: Se
descubre la PCR (Polymerase Chain Reaction, reacción en cadena de la polimerasa), que permite la multiplicación de muestras decadena de la polimerasa), que permite la
multiplicación de muestras de ADN para su análisis.ADN para su análisis. 1988:1988: Arranca el Proyecto Genoma Humano.Arranca el Proyecto Genoma Humano.
1990:1990: Tim Berners-Lee crea la World Wide Web (protocolos de red eTim Berners-Lee crea la World Wide Web (protocolos de red e hipertextos).hipertextos). 1990:
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44. 44. HISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICAHISTORIA DE LA BIOINFORMÁTICA 1994:1994: Aparece el programa ClustalW para el alineamiento múltiple
deAparece el programa ClustalW para el alineamiento múltiple de secuencias.secuencias. 1995-1999: Se secuencian los primeros genomas de bacterias (1995),1995-1999:
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los primeros genomas de plantas e insectos.Se publican los primeros genomas de plantas e insectos. 2001:2001: Aparece publicado el genoma humano.Aparece publicado
el genoma humano. 2005:2005: Se completa el proyecto HapMap, que cataloga las variacionesSe completa el proyecto HapMap, que cataloga las variaciones genéticas en
el ser humano.genéticas en el ser humano. 2008:2008: Se presenta el primer borrador del proteoma humano.Se presenta el primer borrador del proteoma humano.
45. 45. ¡Muchas gracias!¡Muchas gracias!
Notas
Todas ellas pueden estar agrupadas en una Suite ofimática, que es un paquete de múltiples herramientas ofimáticas.
El cuidado clínico: como la prestación de servicios clínicos a un paciente individual.
El sistema de salud: es decir, las estructuras, procesos y los incentivos que dan forma al entorno de la atención clínica, en todos los niveles, desde la salud pública hasta la salud
individual, incluyendo la EDUCACIÓN y la investigación clínica.
La información y la comunicación: es decir, las herramientas que permiten la CAPTURA eficiente, la ENTREGA, la TRANSMISIÓN, y el USO de DATOS, INFORMACIÓN y
CONOCIMIENTO; y el conocimiento de cómo aplicar esas herramientas de manera eficaz.
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