UNIVERSIDAD ESTATAL DE MILAGRO

INGENIERÍA EN SOFTWARE

AGROMATICA Y BIOINFORMATICA
AUTOR:
DAYRA DE LA TORRE
TAREA:
SQL Y EL ANALISIS DE DATOS BIOLOGICOS
DOCENTE:
ING. CRUZ RUIZ VICTOR HUGO

FECHA DE ENTREAGA:
16-09-2021
Elaborar una investigación sobre
La aplicación de SQL en el análisis de datos biológicos
SQL

Los usos de SQL incluyen la modificación de las estructuras de índices y tablas de

la base de datos; agregar, actualizar y eliminar filas de datos; y recuperar
subconjuntos de información desde dentro de una base de datos para aplicaciones
de análisis y procesamiento de transacciones. Las consultas y otras operaciones
SQL toman la forma de comandos escritos como declaraciones; las declaraciones
SQL comúnmente utilizadas incluyen seleccionar, agregar, insertar, actualizar,
eliminar, crear, modificar y truncar.

SQL se convirtió en el lenguaje de programación estándar de facto para bases de

datos relacionales después de su aparición a fines de la década de 1970 y principios
de la de 1980. También conocidos como bases de datos SQL, los sistemas
relacionales comprenden un conjunto de tablas que contienen datos en filas y
columnas. Cada columna de una tabla corresponde a una categoría de datos, por
ejemplo, el nombre o la dirección del cliente, mientras que cada fila contiene un
valor de datos para la columna de intersección. (Sirkin, s.f)

En Bioinformática, tanto PostgreSQL como MySQL se han vuelto muy populares

esto es debido a que pueden ser instalados en prácticamente cualquier plataforma
hardware sin ningún coste adicional (la licencia de uso es gratuíta) (González, 2004)

hay muchas aplicaciones para trabajar con la bioinformática como es biopython,

Rosalind, HTML, BioJavaScript, BioPERL entre otras, pero para implementar la
parte del servidor y la base de datos se da uso de sql. Como aquí un ejemplo en
donde se utiliza de PSS-SQL como un lenguaje de consulta estructurado, pues la
representación de la estructura secundaria de las proteínas que proporcionan
información importante sobre su construcción y forma general de las proteínas. Esta
representación se utiliza a menudo en la búsqueda de similitudes de proteínas.
Dado que los sistemas de gestión de bases de datos comerciales existentes no
ofrecen métodos de exploración integrados para datos biológicos, por ejemplo, a
nivel del lenguaje SQL, la búsqueda de similitudes estructurales se realiza
normalmente mediante herramientas externas.Por este motivo Sql trabaja con
herramientas externas para poder aportar a la bioinformática. (Mrozek, Wieczorek,
Malysiak-Mrozek, & Kozielski, 2010)

Bibliografía
González, J. M. (s.f de s.f de 2004). Bases de Datos Relacionales. Obtenido de Bases de Datos
Relacionales:
http://www.pdg.cnb.uam.es/cursos/Complutense/Complutense2004/pages/14_RelDbSQL
/BBDD-CursoVeranoUCM2004.pdf

Mrozek, D., Wieczorek, D., Malysiak-Mrozek, B., & Kozielski, S. (s.f de agosto de 2010). PSS-SQL:
Protein secondary structure - Structured query language. Obtenido de PSS-SQL: Protein
secondary structure - Structured query language:
https://www.researchgate.net/publication/49627749_PSS-
SQL_Protein_secondary_structure_-_Structured_query_language

Sirkin, J. (s.f de s.f de s.f). SQL (lenguaje de consulta estructurado). Obtenido de SQL (lenguaje de
consulta estructurado): earchdatamanagement.techtarget.com/definition/SQL