Introducción

Durante el desarrollo de farmacos, los compuestos potencialmente útiles se estudian en animales

para comprobar si estos producen los efectos deseados o si ocasionan toxicidad. Los compuestos
eficaces y seguros se convierten en candidatos para estudios en seres humanos.

Cuando un nuevo compuesto parece prometedor, su estructura generalmente se modifica muchas

veces para:

 1ro Optimizar su capacidad de dirigirse al sitio deseado ( con esto me refiero a la

selectividad) (La selectividad es el grado en que un fármaco actúa sobre un sitio
determinado con respecto a otros sitios.)
 2do Permanecer conectado al sitio (afinidad) (La acción farmacológica se ve afectada por
la cantidad de fármaco que alcanza el receptor y el grado de atracción (afinidad) entre el
fármaco y su receptor en la superficie celular. Una vez fijados a su receptor, la capacidad
de los fármacos varía en cuanto a producir un efecto.
 3ero tenemos Optimizar su fuerza (con esto me refiero a potencia, eficacia, efectividad)
(La potencia (fuerza) se refiere a la cantidad de fármaco que se necesita para producir un
efecto determinado.
La eficacia es la capacidad de un fármaco para producir un efecto.
La efectividad difiere de la eficacia en que tiene en cuenta cómo bien funciona un
fármaco en el mundo real. A menudo, un fármaco que es eficaz en los ensayos
clínicos no es muy eficaz en la práctica real. Por ejemplo, un fármaco puede tener
una alta eficacia, pero puede tener baja efectividad, ya que causa tantos efectos
secundarios. Por lo tanto, la efectividad tiende a ser menor que la eficacia)
 Por ultimo Optimizar de la seguridad (minimizar los efectos secundarios)
 
Observaciones

La mayoría de los medicamentos que están en uso clínico son el resultado de un proceso de
investigación muy complejo. Por lo mismo, es necesaria la unión de esfuerzos de diferentes
disciplinas científicas para descubrir y desarrollar medicamentos con efectos clínicos benéficos y
efectos secundarios mínimos. Aunque el descubrimiento y desarrollo de medicamentos se ha hecho
durante muchos años usando únicamente métodos experimentales, se espera que el proceso se
acelere gracias al uso de métodos de cómputo que permiten codificar con precisión modelos
teóricos y son capaces de procesar grandes cantidades de información. Además, en muchos
proyectos, la aplicación de estos modelos de cómputo contribuye a entender los mecanismos de
acción de los principios activos de los medicamentos o a mejorar las propiedades de los mismos. Un
ejemplo es la optimización de los fármacos de origen natural. En la actualidad se hacen esfuerzos
para mejorar las propiedades de estos medicamentos (como reducir efectos secundarios) o buscar
actividades biológicas potenciales de compuestos químicos aislados de fuentes naturales ( Medina-Franco,
2013
).

(Habla Laura)
En la búsqueda y desarrollo de un nuevo medicamento tenemos a:
Diseño de fármacos por métodos tradicionales
Se centran en el descubrimiento de nuevos compuestos considerados como líderes o cabezas de
serie, y su posterior variación estructural. En la búsqueda del cabeza de serie se pueden aplicar
varios métodos, como: el empleo de productos activos presentes en drogas utilizadas en la medicina
tradicional o el estudio de nuevos compuestos obtenidos por síntesis química o biotecnología. 
Diseño de fármacos asistido por computadoras
Existen numerosos métodos experimentales para determinar la estructura molecular de una
sustancia, donde predomina la difracción de rayos X y otras varias técnicas espectroscópicas. Con el
desarrollo alcanzado por la computación y la química computacional, la modelación de estructuras
moleculares constituye complemento de estos métodos, capaces de generar datos con una amplia
aplicación en la investigación experimental, tanto para la interpretación de los resultados obtenidos
como la planificación de futuros, así como para deducir información no asequible
experimentalmente.

Estrategias para identificar compuestos líderes

Hay diversas estrategias experimentales y/o computacionales para identificar compuestos activos
que se consideran líderes para implementar un programa de optimización:

 Optimización de fármacos ya aprobados para su uso clínico. La optimización puede

consistir en mejorar la eficacia del medicamento o reducir efectos secundarios.

 Ensayo biológico sistemático de colecciones de compuestos. Un caso típico son las pruebas
biológicas de alto rendimiento. En HTS se usan robots para evaluar en pocas horas
colecciones con miles o millones de moléculas.

 Uso de información biológica disponible. Por ejemplo, si se conoce el mecanismo de acción

de un sustrato se diseñan compuestos que se espera sigan el mismo mecanismo de acción.

 Diseño de fármacos asistido por computadora (DIFAC). Esta estrategia involucra una o
varias técnicas que se discuten en la siguiente sección.

Diseño de fármacos asistido por computadora

El diseño de fármacos asistido por computadora (DIFAC) tiene como objetivos el diseño,
optimización y selección de compuestos con actividad biológica. El DIFAC forma parte de un
esfuerzo multidisciplinario y tiene numerosas aplicaciones específicas durante el proceso de
desarrollo de fármacos. A la fecha ha tenido contribuciones significativas en el diseño de fármacos
que se encuentran en uso clínico. Es por esto que DIFAC cobra cada vez mayor importancia en la
investigación que se hace en la industria farmacéutica, en universidades y centros de investigación.

La DIFAC es un conjunto de técnicas que se pueden ver en el grafico.

Los objetivos del DIFAC pueden dividirse en 3:

 Diseño o identificación de nuevos compuestos. Esto es, diseñar nuevas estructuras con
efecto biológico en una categoría terapéutica deseada. Una alternativa es buscar dentro de
 colecciones de compuestos existentes moléculas que tengan una actividad biológica
específica.

 Seleccionar candidatos. Los métodos computacionales ayudan a distinguir las moléculas

sobre las cuales se deben enfocar primero las pruebas experimentales, por ejemplo, compra,
síntesis, y evaluación biológica. Sin embargo, los métodos de cómputo no reemplazan a los
experimentos.

 Optimizar líderes para mejorar las propiedades deseadas y disminuir los efectos adversos.