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Biotecnología
INFORME
SIMULACIÓN DE ELECTROFORESIS EN
GEL DE AGAROSA UTILIZANDO EL PROGRAMA
SNAP GENE CON DATOS DEL ARTÍCULO CIENTÍFICO
“Aislamiento de bacterias con potencial biorremediador y
análisis de comunidades bacterianas de zona impactada por
derrame de petroleo en Condorcanqui – Amazonas – Perú”
24 DE SEPTIEMBRE
Docente
SOTO GONZALES Hebert Hernan
Estudiante
ANCACHI MAMANI Judith Nancy
2021
UNIVERSIDAD NACIONAL DE MOQUEGUA
ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL
ÍNDICE
1 INTRODUCCIÓN ................................................................................................... 3
2 OBJETIVOS .......................................................................................................... 4
2.1 Objetivo General ............................................................................................. 4
2.2 Objetivos Específicos ..................................................................................... 4
3 MARCO TEÓRICO ................................................................................................ 5
3.1 Características Clave del Software Snap Gene .............................................. 5
3.2 Electroforesis .................................................................................................. 5
3.3 Gel de Agarosa............................................................................................... 6
3.4 Centro Nacional para la Investigación Biotecnológica (NCBI) ......................... 7
3.5 GEN 16S ........................................................................................................ 7
3.6 ADN Y ARN .................................................................................................... 8
3.7 Secuenciación del ADN .................................................................................. 8
4 METODOLOGÍA .................................................................................................... 9
5 RESULTADOS .................................................................................................... 12
6 CONCLUSIÓN ..................................................................................................... 13
7 CUESTIONARIO ................................................................................................. 14
8 REFERENCIAS ................................................................................................... 19
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ESCUELA PROFESIONAL DE INGENIERÍA AMBIENTAL
1 INTRODUCCIÓN
2 OBJETIVOS
✓ Definir la electroforesis
3 MARCO TEÓRICO
3.2 Electroforesis
Antes de agregar las muestras de ADN, el gel debe colocarse en una cámara. Uno
de los extremos de la cámara se conecta a un electrodo positivo y el otro extremo
se conecta a un electrodo negativo. El cuerpo principal de la cámara, donde se
coloca el gel, se llena con solución amortiguadora con sales que puede conducir
la corriente. Aunque tal vez no puedas verlo en la imagen superior (gracias a mis
fabulosas habilidades artísticas), la solución amortiguadora llena la cámara hasta
un nivel en el que apenas cubre el gel.
El extremo del gel que tiene los pozos se coloca hacia el electrodo negativo. El
extremo sin pozos (hacia donde migrarán los fragmentos de ADN) se coloca hacia
el electrodo positivo.
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Se trata de un gen común a todas las bacterias y arqueas, y contiene las huellas
de la deriva filogenética en la evolución de las especies (permite reconocer la
distancia filogenética entre especies).
Los nucleótidos son las unidades y productos químicos que se unen para formar
los ácidos nucleicos, principalmente ARN y ADN. Ambos son largas cadenas de
nucleótidos repetidos. Hay una A, C, G y T en el ADN, y en el ARN hay los mismos
tres nucleótidos que en el ADN, pero la T se sustituye por un uracilo (U). Los
nucleótidos son el componente estructural básico de estas moléculas, que
esencialmente son ensamblados de uno en uno por la célula y después se encajan
juntos en el proceso de la replicación, en el caso del ADN, o en el que llamamos
proceso de transcripción o de producción del ARN.
Tal vez hayas oído que se están secuenciando genomas. Por ejemplo, el genoma
humano se finalizó en 2003 después de un esfuerzo internacional de muchos
años. Pero, ¿qué significa secuenciar un genoma o incluso un pequeño fragmento
de ADN?
4 METODOLOGÍA
Fuente:
❖ Para añadir las otras secuencias restantes clicamos en “tools”, luego en Simulate
Agarose Gel. Esto nos llevará a una nueva ventana donde agregaremos las
demás secuencias.
5 RESULTADOS
6 CONCLUSIÓN
El programa SnapGene fue fácil de manipular con las respectivas indicaciones. Con
una interfaz intuitiva el software nos permite la visualización de secuencias de ADN,
la anotación de secuencias, la edición de secuencias, la clonación, la visualización
de proteínas y la simulación de métodos de clonación comunes.
7 CUESTIONARIO
Se trata de un gen común a todas las bacterias y arqueas, y contiene las huellas
de la deriva filogenética en la evolución de las especies (permite reconocer la
distancia filogenética entre especies).
El gen 16S rRNA se utiliza para estudios filogenéticos ya que su secuencia está
altamente conservada entre las distintas especies de bacterias y arqueas. Carl
Woese fue pionero en esta aplicación del 16S rRNA.
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▪ Una vez finalizada la colocación del ADN en los pocillos, cubrir el tanque con
la tapa y conectar los cables correspondientes de los electrodos en la fuente
de poder.
❖ ¿Qué es la agarosa?
Los marcadores de peso molecular para ADN son una herramienta utilizada
durante la electroforesis para conocer el tamaño estimado de un fragmento y es
comúnmente usada en laboratorios de biología molecular, al igual que, en áreas
como la medicina, la agricultura, la industria, entre otras.
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8 REFERENCIAS
Virginia Robles. (s.f). En busca del gen 16S, la huella genética bacteriana.
https://www.elprobiotico.com/gen-huella-genetica-bacteriana/
SnapGene. https://support.snapgene.com/hc/en-us/
M. Gonzalo. (s.f). Marcadores moleculares: Qué son, como se obtiene y para que
valen. http://www.encuentros.uma.es/encuentros49/marcadores.html
V.G. Fabiola, C.H. Ramón, V. Enrique & V.A. Francisco. (2015). El gen ARNr 16S
en el estudio de comunidades microbianas marinas.
National Cancer Institute (NIH) Center for Cancer Researh (s.f). SnapGene.
https://ostr.ccr.cancer.gov/bioinformatics/software/snapgene/