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Capitulo #07
Capitulo #07
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La estructura del lipopolisacarido (LPS) varía de una bacteria a otra, e incluso entre
diferentes cepas, pero se presenta en todas las bacterias gram negativas.
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Las bacterias gran positivas no tienen LPS, pero pueden presentar ácidos teicoicos
asociados a la mureína. Se trata de polímeros del glicerol o del ribitol unidos por
enlaces fosfodiéster y con uno o más aminoácidos como sustituyentes.
Las grasas, específicamente los triglicéridos, son ésteres que se forman en la reacción
de glicerol y ácidos grasos. Como de este modo los microorganismos no pueden
utilizarlas para nutrirse, excretan una enzima llamada lipasa. Esta enzima no es muy
selectiva e hidroliza el enlace éster. Esta reacción libera glicerol y ácidos grasos sin
diferenciar el largo de la cadena.
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Figura N0 7.3. Hidrólisis de Triacilgliceroles.
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Por otra parte los fosfolípidos son hidrolizados por otras enzimas específicas llamadas
fosfolipasas.
Como existen varias, se les añade una letra como designación del enlace éster que
desdoblan.
Las fosfolipasas A y B liberan ácidos grasos y se parecen por tanto a las lipasas.
Las fosfolipasas C y D rompen enlaces éster del fosfato y en consecuencia son
un tipo de enzima muy diferente.
Los ácidos grasos y glicerol son atacados tanto anaeróbica como aeróbicamente por
diferentes microorganismos.
Una vez roto el enlace éster, los ácidos grasos libres pueden ser degradados para
obtener carbono, energía o ambas cosas, o bien ser reutilizados en la biosíntesis
de diversos lípidos, incluso de la clase a la que pertenecían antes de su liberación.
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Figura N0 7.5. Conversión de la hidrólisis del Glicerol a D-Gliceraldehído 3-
fosfato.
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7.1.3. Activación de los Ácidos Grasos
El Acil CoA es un metabolito que surge de la unión de un ácido graso con la CoA. Esa
unión se produce entre el grupo carboxilo del ácido (-COOH) y el grupo sulfhidrilo de la
coenzima (-SH) liberando agua.
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Figura N0 7.6. Proceso de Activación del ácido graso formando Tioéster de la
Coenzima A.
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Figura N0 7.7. Energía libre para la Activación de ácidos grasos.
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Fuente: (J. Koolman y K–H Röhm, 2004).
Los ácidos grasos se degradan a grupos acetilo (C2) los cuales alimentan el ciclo de
Krebs adiciónandose a intermediarios C4 para producir C6. Durante el ciclo, el C2
adicionado se pierde como CO2 y se produce C4. Sobre todo, no ocurre ningún
incremento en el número de moléculas intermediarias del ciclo. Por lo tanto si los
ácidos grasos son la única fuente de carbono los intermediarios del ciclo de Krebs no
pueden ser removidos sin que el ciclo se interrumpa. Figura N0 7.8.
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Los átomos de carbono del ácido graso se numeran a partir del carboxilo.
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descarboxilado para dar un nuevo ácido graso con un Cβ no sustituido; el resto de la
molécula sigue degradándose vía β oxidación. Figura N0 7.10.
La acumulación de este metabolito, como una deficiencia genética se conoce como la
enfermedad de Refsum o síndrome del almacenamiento de ácido fitánico (dificultades
neurológicas: temblores, caminar tembloroso, y pobre visión nocturna), se debe a la
poca actividad de α hidroxilación, lo cual puede ser atenuado con una dieta baja de
alimentos que contengan ácido fitánico.
C
(a) estructura general de los diéteres (izquierda) y tetraéteres (derecha); (b) cadenas típicas de
hidrocarburo: gitano (en diéteres), y bifitano y sus derivados pentacíclicos (en tetraéteres); (c)
supuesto ordenamiento de tetraéteres para formar una membrana monocapa. X puede ser H o
cualquiera de una variedad de derivados sacáridos o fosfato.
Fuente: (Pares I.F. y A. Juárez, 1997).
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Figura N0 7.10. Alfa-Oxidación de ácidos grasos.
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secuencial de los fragmentos de dos carbonos desde el extremo carboxilo. Durante
este proceso se rompe el enlace alfa-beta y se forma acetil-CoA. Y se le conoce como
beta-oxidación porque se oxida el carbono beta de los acidos grasos, que es el que se
encuentra separado dos carbonos del grupo carboxilo.
ETAPAS
A. Activación de Acidos Grasos Saturados
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Estas dos reacciones se hacen irreversible porque la pirofofatasa hidroliza el
pirofosfato (PP1) a fosfato inorgánico. Se requieren iones magnesio.
La formación del tioéster del ácido graso (acil-CoA) también puede tener lugar
directamente, por transferencia del coenzima A, a partir de otro acil-CoA, que puede
ser el producto final de la oxidación del ácido graso inicial:
Durante este proceso, la cadena de ácidos grasos experimenta una degradación cíclica
en 4 fases:
Deshidrogenación,
Hidratación,
Deshidrogenación
y Fraccinamiento.
Estas 4 fases de la oxidación se repiten hasta que el ácido graso está completamente
degradado a acetil-CoA.
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Se conocen por lo menos dos formas de este enzima, ambas metaloproteínas. El
grupo prostético es el FAD. Hay una E (Cu)-FAD que ataca los ácidos grasos de
cadena corta y otra E (Fe)-FAD para los de cadena más larga.
La siguiente reacción es la hidratación del doble enlace entre los carbonos 2 y 3. Se
lleva a cabo por acción de la crotonasa:
No parece intervenir ningún coenzima y sólo produce los L-isómeros a partir del enlace
2 2,
trans- . Este enzima también actúa sobre el doble enlace cis- pero entonces sólo
produce D-isómero. La crotonasa (acil-CoA hidratasa) proporciona asimismo un medio
3 2
reversible de conversión de los ácidos β-γ-insaturados ( ) a α-β insaturados ( ), a
través del β -hidróxido común:
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La reacción de la β tiolasa forma un nuevo tioéster con una cadena de dos átomos de
carbono menos que la original y una molecula de acetil CoA.
El acil-CoA acortado puede seguir oxidándose partiendo de la reacción de la acil-CoA
deshidrogenasa. Figura N0 7.11.
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7.3.2. Beta Oxidación de Acidos Grasos Insaturados
2. Polinsaturados:
La enzima Δ3Δ2- Enoil- CoA isomerasa transforma un enlace cis ۵3 en un trans ۵2.
Requiere además otra enzima: 2-4-dienoil CoA reductasa (peroxisomal) que permite la
hidrogenación de los carbonos 2 y 5, convierte dos enlaces conjugados (trans ۵2 cis۵4)
en un doble enlace trans. ۵3 Figura N0 7.13.
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Figura N0 7.13. Oxidación del ácido graso poliinsaturado Linoleil CoA.
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Fuente: (Nelson D.L., M.M. Cox y C.M. Cuchillo 2005).
Los ácidos grasos que contienen un número par de átomos de carbono y que tienen la
composición general C2n-1H4n-2COOG, pueden producir n moléculas de acetil-CoA. Los
de número impar de fórmula C2n-1H4n+1COOG, proporcionarán una molécula propionil-
CoA y n – 1 de acetil-CoA.
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El propionil-CoA puede metabolizarse de dos maneras para su ulterior oxidación. Por
una carboxilación inicial a metil malonil-CoA que luego se convertirá en succinil-CoA, el
cual puede incorporarse al CAT:
Figura N0 7.14. Etapa final de la oxidación de los ácidos grasos de número impar
de átomos de carbono que muestra la transformación del propionil-coa en
succinil-coA.
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Figura N0 7.15. Productos finales del Metabolismo de Acidos grasos Impares
O bien, tal como sucede en E. coli, el propionato se condensa con el glioxilato para dar
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El destino ulterior del lactato es desconocido en este caso.
Algunas bacterias acumulan acetil fosfato, aparentemente como reserva energética. El
aceti fosfato se convierte fácilmente en acetil-CoA mediante la fosfotransacetilasa:
Por otra parte, como ya ha sido comentado anteriormente, puede producir ATP y
acetato.
Otra ruta minoritaria para la oxidación de ácidos grasos es la ω-oxidación, que tiene
lugar en el retículo endoplasmático de muchos tejidos; se produce una hidroxilación
sobre el carbono metílico (–CH3) en el extremo de la molécula opuesto al
grupo carboxilo (–COOH). Utiliza el tipo de reacción de la oxidasa de función mixta y
requiere citocromo P450, O2 y NADPH. Luego, el ácido graso hidroxilado se oxida en
el citosol a un ácido dicarboxílico (un grupo carboxilo en cada extremo de la molécula);
este proceso se da principalmente en ácidos grasos de mediana longitud.
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Figura N0 7.17. Oxidación simultánea por β y ω oxidación en especies de
Pseudomonas
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La enzima es una oxidasa de función mixta y la reacción ocurre en el Retículo
endoplasmático.
2. Oxidación
El siguiente paso es la oxidación del grupo hidroxilo a aldehído por el NAD+. La
enzima es la alcohol deshidrogenasa y la reacción ocurre en el citosol.
3. Oxidación
El tercer paso es la oxidación del grupo aldehído a un ácido carboxílico por el
NAD+. El producto es un ácido graso con un grupocarboxilo en cada extremo
(ácido dicarboxílico). La enzima es la alcohol deshidrogenasa y la reacción
ocurre en el citosol.
Tras estos tres pasos, cualquiera de los extremos del ácido graso puede unirse
al coenzima A para formar un acil-CoA graso que puede sufrir la β-oxidación para
producir ácidos de cadena más corta como el ácido succínico (C4), que puede ingresar
en el ciclo de Krebs, y el ácido adípico (C6); este proceso tiene lugar principalmente en
los peroxisomas.
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7.6. CICLO DEL ACIDO GLIOXILICO
Las bacterias utilizan el ciclo del glioxilato (Figura N0 7.18), es una modificación del
Ciclo de Krebs en el cual se saltan los pasos enzimáticos en los cuales dos moléculas
de CO2 son removidas de los intermediarios de C6. El intermediario C6 se convierte en
dos compuestos C4 (ambos componentes del ciclo). Por lo tanto por cada grupo acetilo
(de los ácidos grasos) un intermediario adicional del ciclo se produce. La ruta del
glioxilato generalmente no se encuentra en células animales, ya que se utilizan ácidos
grasos preformados y presentes en los alimentos.
Figura N0 7.18. Modificación del Ciclo Krebs que lleva a la formación de glucosa a
partir de Acetil CoA.
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7.6.1. Características principales
Esta vía implica dos enzimas: la isocitrato liasa y la malato sintasa. Comprende una
condensación de acetil – CoA con ácido glioxílico que de ácido málico con intervención
del enzima malato sintasa. El malato es subsiguiente oxidado a oxalacetato.
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El glioxilato condensa entonces con acetil – CoA para formar Malato:
Figura N0 7.19. Esquema detallado del Ciclo del Glioxilato y sus enzimas
representativas.
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Fuente: (M.T. Madigan, J.M. Martinko y J. Parker., 2002).
El ciclo del glioxilato regula el drenaje del CAT y adicionalmente proporciona una
fuente de ácido pirúvico para la glucogénesis como consecuencia de la oxidación de
ácidos C4. Figura N0 7.20.
Los enzimas del ciclo se sintetizan durante el crecimiento sobre acetato o sus
precursores metabólicos inmediatos. La mineralización tiene lugar cuando el isocitrato
sigue el ciclo del CAT y no es el sustrato de la isocitrato liasa.
El funcionamiento del ciclo del ácido glioxílico se halla sujeto a un control muy estricto,
tanto a nivel de actividad como a nivel de síntesis de sus enzimas. Los trabajos ya
clásicos de Kornberg han demostrado que le control fino de la actividad se localiza en
el isocitrato liasa, siendo ésta inhibida totalmente por bajos niveles PEP. La síntesis de
este enzima se reprime a nivel de transcripción pudiendo ser el correpresor el PEP, el
piruvato o uno de sus derivados metabólicos.
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Figura N° 7.20. Ciclo del ácido glioxílico. Se generan moléculas C4 a partir de
acetil – CoA.
La condensación de oxalacetato con acetil – CoA sigue algunas reacciones del ciclo de
Krebs. La isocitrato liasa desdobla el isocitrato, produciendo succinil – CoA, que se
transforma en oxalacetato siguiendo las reacciones del CAT. Por su parte, el glioxilato
condensa con una segunda molécula de acetil – CoA, generando malato. El resultado
del proceso es la transformación neta de dos moléculas de acetil – CoA en una de
oxalacetato, que queda disponible para finalidades biosintéticas. En trazo continuo se
representan las reacciones del CAT, y en trazo discontinuo las del ciclo glioxilato.
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