GENÉTICA

M.Sc Vanessa Abad

Genética
Máster en Genética y Genómica Humana

2018
Identificación de la base genética
de las enfermedades humanas

• Análisis de ligamiento
• Análisis de asociación
• Secuenciación directa
 Análisis de ligamiento
Para qué?

Seguir la herencia de una enfermedad a lo largo de

generaciones  buscando una herencia consistente y
repetida de una región concreta del genoma siempre
que se transmite la enfermedad en la familia.
Ligamiento
• Asociación de genes que se encuentran en el mismo
cromosoma, en general no presentan recombinación
independiente según la segunda ley de Mendel.
Tendencia de alelos a transmitirse juntos

• El medio por el cual se recombinan

los alelos de un mismo cromosoma es
el entrecruzamiento (crossing-over)

Recombinación homóloga en la meiosis

Distribución independiente de alelos en
distintos cromosomas

recombinante
no
Los alelos en los loci de diferentes cromosomas
se distribuyen de forma independiente
50% 50%
Recombinación de genes ligados
Los genes situados en el mismo cromosoma se denominan sinténicos

50%

50%

Los alelos en loci de un mismo cromosoma se distribuyen independientemente si

ocurre al menos un entrecruzamiento entre ellos en cada meiosis
Crossing over
• El entrecruzamiento se realiza entre cromátides “no
hermanas” por rotura y reunión de las cadenas de ADN
en la profase I de la meiosis (paquiteno).

• El grado de crossing over entre dos locus en un mismo

cromosoma es proporcional a la distancia entre ellos
(Distancia interlocus).

• Esta correlación sirve de base para la construcción de

mapas cromosómicos, los cuales indican la posición
relativa de los genes en los cromosomas.
Conformaciones cis y trans
a+ b+

cis

Los alelos que se encuentran en el mismo a b

cromosoma homólogo

a b+
trans

a+ b
Los alelos que se encuentran cromosoma
homólogo diferentes
La frecuencia de recombinación como medida de la distancia
entre dos loci
Lejanos Cercanos

Cuanto menor es la
frecuencia de
recombinación
(FR,ɵ), más cerca
están los dos loci

FR / ɵ= 0 (ninguna recombinación)
0,5 (distribución independiente)
FRECUENCIA DE RECOMBINACIÓN
Análisis de ligamiento
Medición de ɵ (frecuencia de recombinación )

Determinación del cociente de

probabilidades o LOD score (Z)

•Mapas genéticos -ligamiento

•Mapas físicos – d real en pb

Se mide en centiMorgans (cM) - Distancia genética entre dos loci

- Orden
Mapa de ligamiento

Mapa genético de un
cromosoma en 1913
Unidad de Mapa (u.m) - centiMorgans (cM)
Thomas Morgan

• Es la distancia entre genes en la que se observa recombinación

en el 1% de las meiosis.
•1 cM = 0.01 FR = 1% recombinación

>entrecruzamiento>distancia
• Entre más cercanos estén 2 genes más
difícil será que se recombinen y
viceversa

• Existen diferencias significativas de ɵ=fracción de recombinación

recombinación entre hombres y
mujeres
distanciamujeres>distanciahombres
Mapeo en diploides
Unidad de Mapa - centiMorgans (cM)

dA-H = dA-B + dB-C + dC-D + dD-E + dE-F + dF-G + dG-H

Ejem.: Cromosoma humano 1 es el más largo en distancia física (283 Mb), y

también tiene la mayor distancia genética, 270 cM (0,95 cM/ Mb).
Recombinación entre tres genes
Cruzamiento de tres factores
Cruzamiento de tres factores
Ejercicio
• Se han estudiado tres pares de genes en experimentos de
dos puntos y éstas son las distancias entre ellos (los
genes se comparten entre experimentos):

A-B = 12
B-C = 7
A-C = 5

¿Cuál es el orden de los genes? Las distancias deben ser

aditivas y consistentes entre sí
Interferencia
• Generalmente se observa que un entrecruzamiento
interfiere en la realización de otro entrecruzamiento, no
son eventos independientes. El grado en el que interfiere
se conoce como interferencia.

• Se utilizan los doble cruzamientos para determinar esto.

Interferencia
• Interferencia (I)= 1-(C.O.C)

• Si, I=0  no existe interferencia entre los

entrecruzamientos

• Si, I=1  existe una interferencia total

• Cualquier dato entre 0 y 1 indicará algún grado

de interferencia
Ejemplo:

R//: Se ha dado un 19.6% menos

de dobles recombinantes de los
esperados
Función de mapeo
• Relaciona la frecuencia de recombinanción con
la distancia en el mapa

• Intenta calcular el número medio de entrecruces

que ocurren en un segmento por meiosis (m)

• Se deduce de la distribución de Poisson (no se

toma en cuenta la ‘I’)
 Reduce el número de
cromátides
recombinadas

Fracción de cero
entrecruzamientos
1
% observado FR  (1  e  m ) x 100
de 2
recombinación

Proporción de meiosis con 1

o + entrecruzamientos

Y m/2 para corregir el efecto de que solo 2 cromátidas se entrecruzan

Función de mapeo
La ausencia de intercambios tiene un impacto significativo