TROPONINA (TNNT2)

La troponina T es una de las proteínas que forma parte del complejo de la troponina. Se

une a la tropomiosina en las fibras musculares manteniéndola unida entre la actina y
la miosina.
Existen tres subtipos principales de la troponina T, localizados en diferentes tejidos:

 La isoforma troponina T en el músculo liso de contracción lenta,

denominada TNNT1 
 La isoforma troponina T cardíaca, denominada TNNT2 
 La isoforma troponina T en el músculo liso de contracción rápida,
denominada TNNT3 

Para el análisis se utilizará la troponina T (TNNT2)

La troponina T del músculo cardíaco (cTnT) es una proteína que en los seres humanos está

codificada por el gen TNNT2

TNNT2:
>NM_001001431.3 Homo sapiens troponin T2, cardiac type (TNNT2),
transcript variant 3, mRNA
AGTCCCCGCTGAGACTGAGCAGACGCCTCCAGGATCTGTCGGCAGCTGCTGTTCTGAGGGAGAGCAGAGA
CCATGTCTGACATAGAAGAGGTGGTGGAAGAGTACGAGGAGGAGGAGCAGGAAGAAGCAGCTGTTGAAGA
GCAGGAGGAGGCAGCGGAAGAGGATGCTGAAGCAGAGGCTGAGACCGAGGAGACCAGGGCAGAAGAAGAT
GAAGAAGAAGAGGAAGCAAAGGAGGCTGAAGATGGCCCAATGGAGGAGTCCAAACCAAAGCCCAGGTCGT
TCATGCCCAACTTGGTGCCTCCCAAGATCCCCGATGGAGAGAGAGTGGACTTTGATGACATCCACCGGAA
GCGCATGGAGAAGGACCTGAATGAGTTGCAGGCGCTGATCGAGGCTCACTTTGAGAACAGGAAGAAAGAG
GAGGAGGAGCTCGTTTCTCTCAAAGACAGGATCGAGAGACGTCGGGCAGAGCGGGCCGAGCAGCAGCGCA
TCCGGAATGAGCGGGAGAAGGAGCGGCAGAACCGCCTGGCTGAAGAGAGGGCTCGACGAGAGGAGGAGGA
GAACAGGAGGAAGGCTGAGGATGAGGCCCGGAAGAAGAAGGCTTTGTCCAACATGATGCATTTTGGGGGT
TACATCCAGAAGACAGAGCGGAAAAGTGGGAAGAGGCAGACTGAGCGGGAAAAGAAGAAGAAGATTCTGG
CTGAGAGGAGGAAGGTGCTGGCCATTGACCACCTGAATGAAGATCAGCTGAGGGAGAAGGCCAAGGAGCT
GTGGCAGAGCATCTATAACTTGGAGGCAGAGAAGTTCGACCTGCAGGAGAAGTTCAAGCAGCAGAAATAT
GAGATCAATGTTCTCCGAAACAGGATCAACGATAACCAGAAAGTCTCCAAGACCCGCGGGAAGGCTAAAG
TCACCGGGCGCTGGAAATAGAGCCTGGCCTCCTTCACCAAAGATCTGCTCCTCGCTCGCACCTGCCTCCG
GCCTGCACTCCCCCAGTTCCCGGGCCCTCCTGGGCACCCCAGGCAGCTCCTGTTTGGAAATGGGGAGCTG
GCCTAGGTGGGAGCCACCACTCCTGCCTGCCCCCACACCCACTCCACACCAGTAATAAAAAGCCACCACA
CACTGA
Especie seleccionada Homo Sapiens
Par de primer Autodimero heterrodimero
Hairipi Maximo Delta g Maximo Delta g
n T  ( C) delta g
m
o
delta g
Forward 11 -39.5 3.61 -39.56 -7.91
AGACAGAGCGGAAAAGTGG kcal/mol kcal/mole kcal/mol kcal/mole
Reverse e (2pares de e (5 pares de
TGAAGGAGGCCAGGCTCTA bases) bases)
T
Forward 28.5 -38.66 -9.49 -39.5 -6.31
AGAGGAGGAGGAGCTCGTT kcal/mol kcal/mole ( kcal/mol kcal/mole
Reverse e 6 pares de e (4 pares de
CCCACTTTTCCGCTCTGTCT bases) bases)
Forward 27.4 -36.66 -5.38 -39.5 -7.91
AGGGAGAGCAGAGACCATT kcal/mol kcal/mole kcal/mol kcal/mole (5
Reverse e (4 pares d e pares de
CCCACTTTTCCGCTCTGTCT bases) bases)
Forward 11 -39.5  -3.61 -39.76 -5.49
AGACAGAGCGGAAAAGTGG kcal/mol kcal/mole  kcal/mol kcal/mole 
Reverse e ( 2 pares e (4 pares de
CGAGCGAGGAGCAGATCTT de bases) bases)

Forward 26.7 -37.46 -4.74 -39.56   -7.91

CTGCTGTTCTGAGGGAGAC kcal/mol kcal/mole kcal/mol kcal/mole
Reverse e (3 pares e ( 5 pares de
TGAAGGAGGCCAGGCTCTT de bases) enlaces)

Forward 23.5 -37.46 -3.17 -39.56 -4.77

GCTGCTGTTCTGAGGGAGG kcal/mol kcal/mole  kcal/mol kcal/mole
Reverse e 3 pares de e (4 pares de
TGAAGGAGGCCAGGCTCTT bases) bases)
Forward 23.5 -37.46 -3.17 -39.48 -7.71
GCTGCTGTTCTGAGGGAGG kcal/mol kcal/mole kcal/mol kcal/mole (4
Reverse e (3 pares e pares de
TCCCACTTTTCCGCTCTGTC de bases) bases)
Forward 23.6 -39.25 -9.75 -39.5 -10.2
TGATGACATCCACCGGAAC kcal/mol kcal/mole kcal/mol kcal/mole (5
Reverse e (4 pares e pares de
CCCACTTTTCCGCTCTGTCT de bases) bases)
Forward 11 -39.5 -3.61 -39.5 -5.49
AGACAGAGCGGAAAAGTGG kcal/mol kcal/mole kcal/mol kcal/mole (4
G e (2 pares e pares de)
Reverse de bases)
Especies Seleccionadas (Mus musculus, Rattus norvegicus)

Par de primer Autodimero heterrodimero

Hairipin Maximo Delta g Maximo Delta g
T  ( C)
m
o
delta g delta g
Forward 23.2 -39.25 -6.76 -41.69 -8.16
GCCATCGACCACCTGAATGA kcal/mol kcal/mole kcal/mol kcal/mole
Reverse e (4 pares e (4 pares
TTGGCCTTCCCACGAGTTTT de de bases)
bases)
Forward 20.04 -38.79 -9.28 -42.25 -6.21
GAGAGAGAAGGCCAAGGAGC kcal/mol kcal/mole kcal/mol kcal/mole
Reverse e (4 pares e (3 pares
CTATTTCCAACGCCCGGTGA de de bases)
bases)

Análisis: En el análisis de primers observamos que existen diversas características que deben
cumplir para que sean funcionales, como por ejemplo la temperatura de melting, la cual nos brida
información que nos ayuda a identificar cual primer correcto para tomarlo en cuenta, además el
valor máximo de delta de g nos da información para saber la cantidad de energía necesaria.

Arbol Filogenético:

Análisis: El árbol filogenético está relacionado con la filogenia, es decir con sus
antepasados y además que relación genética tienen estos con especies actuales.
En este podemos observar el proceso de evolución, si tienen cierto parentesco, si hubo una
cierta evolución sin implicar un cambio, etc.
En la parte delantera encontramos las especies antepasadas y conforme el árbol filogenético
fluyendo observamos las especies más actuales.