Descripción de la Cuantificación del Covid 19 en Aguas Residuales como una

Herramienta de Control Epidemiológica para el Seguimiento y Monitoreo del Virus:

Una Revisión

Angela Yiceth Torres Corredor

Lineth Zulay Figueredo Acero

Universidad de Boyacá
Facultad de Ciencias e Ingeniería
Programa de Ingeniería Sanitaria
Tunja
2021
 Descripción de la Cuantificación del Covid 19 en Aguas Residuales como una
Herramienta de Control Epidemiológica para el Seguimiento y Monitoreo del Virus:
Una Revisión

Angela Yiceth Torres Corredor

Lineth Zulay Figueredo Acero

Trabajo de grado para optar al Título de Ingenieras Sanitarias

Asesora:
Yadi Johaira Ramos Parra
Ingeniera Sanitaria
Magister en Salud Publica

Universidad de Boyacá
Facultad de Ciencias e Ingeniería
Programa de Ingeniería Sanitaria
Tunja
2021
 Tabla de Contenido
pág.

TÍTULO 5

1. 1. PÁGINAS PRELIMINARES. 6

2. 2. INTRODUCCIÓN. 6

3. 3. METODOLOGÍA. 6

4. 4. CAPÍTULO I: EXPERIENCIAS RELACIONADAS CON LA REMOCIÓN DEL SARS COV-2 EN

SISTEMAS DE TRATAMIENTO DE AGUAS RESIDUALES INTERNACIONALMENTE. 6

5. 5. CAPÍTULO II: MÉTODOS Y PROCESOS UTILIZADOS ACTUALMENTE PARA EL MONITOREO Y

ELIMINACIÓN DEL SARS- COV 2 EN EL TRATAMIENTO DE AGUA RESIDUAL. 6

6. 6. CAPÍTULO III: ACCIONES PREVENTIVAS Y DE MITIGACIÓN PARA EL CONTROL Y MONITOREO

DEL VIRUS A NIVEL INTERNACIONAL EN EL TRATAMIENTO DE AGUA RESIDUAL. 6

7. 7. ANÁLISIS DE LOS EFECTOS EN LA SALUD HUMANA POR AGUA CONTAMINADA. 6

8. 8. CONCLUSIONES. 6

9. 9. RECOMENDACIONES. 6

10. 10. REFERENCIAS. 6

11. 11. ANEXOS. 6

 Título

Cuantificación del Covid 19 en aguas residuales como una herramienta de control

epidemiológica para el seguimiento y monitoreo del virus: una revisión.
 Introducción

El Covid-19 es una enfermedad ocasionada por una nueva cepa de coronavirus, “CO” hace
referencia a “corona”, “VI” a “virus” y “D” a disease (“enfermedad” en inglés) (Fondo de las
Naciones Unidas para la Infancia, 2020). El brote de enfermedad por coronavirus (Covid-19)
ha sido declarado emergencia de salud pública de importancia internacional debido a que el
virus se ha propagado a numerosos países y territorios. El 11 de febrero de 2020, el Grupo de
Estudio de Coronavirus (CSG) del Comité Internacional de Ttaxonomía de los Vvirus (ICTV)
propuso llamar al virus como SARS-CoV-2 y la Organización Mundial de la Salud (OMS)
nombró la enfermedad oficialmente como enfermedad de coronavirus 2019 (Covid-19) (Guo
et al., 2020); a partir de marzo la OMSquien , declaró la enfermedad como pandemia el 11 de
marzo de 2020.
El Covid-19 es una enfermedad ocasionada por una nueva cepa de coronavirus, “CO” hace
referencia a “corona”, “VI” a “virus” y “D” a disease (“enfermedad” en inglés) (Fondo de las
Naciones Unidas para la Infancia, 2020). Los síntomas de la infección por Covid-19 aparecen
después de un período de incubación de aproximadamente 5,2 días  (intervalo de confianza
[IC] del 95%, 4,1 a 7), la muerte de una persona infectada puede ocurrir en un lapso de 6 a 41
días con un promedio de 14 días (Li et al., 2020). El virus SARS-CoV-2, permanece hasta 18
días en el tracto respiratorio, 16 días en suero y hasta 22 días en las heces (Godin et al., 2021).
La enfermedad provocada por este virus afecta principalmente al sistema respiratorio, pero,
también puede ocasionar daños al tracto digestivo y otros órganos ; el virus se propaga de
persona a persona, se produce debido al contacto cercano con una persona infectada, expuesta
a la tos, estornudos, gotitas respiratorias o aerosoles, estos aerosoles logran penetrar los
pulmones al inhalarse por la nariz o la boca (Phan et al., 2020), de acuerdo con (Kopperi et al.,
(2021) varios investigadores afirman la replicación del SARS-CoV-2 en el tracto
gastrointestinal y la propagación prolongada de material viral a través de las heces durante y
después de las fases infecciosas del virus por lo que su eliminación fecal también se
infiereindican una posible propagación a través del agua residual (Phan et al., 2020)..
Con base en lo anterior la aparición de estos virus en el ambiente acuático nos lleva a
prestar especial atención al tratamiento que reciben las aguas residuales, a lo largo del tiempo,
a través del monitoreo y la vigilancia de las aguas residuales se han estudiado enfermedades
virales mediante la detección de material genético en aguas residuales, como lo son el virus de
hepatitis E zoonótica reemergente (Cuevas-Ferrando, Randazzo, Pérez-Cataluña, & Sánchez,
2020), el virus de la diarrea epidémica porcina (PEDV) y poliovirus, entre otros, hecho por el
cual el análisis microbiológico de aguas residuales para detectar patógenos tiene una larga
historia en materia de salud pública.
En este contexto, es posible que el virus se libere en las aguas residuales y desde allí
contamine otros cuerpos de agua (superficiales, marinos, subterráneos), en algunos
situacionesescenarios, las aguas residuales pueden propagar el SARS-CoV-2 a través de
gotitas de aire y fómites (Gormley et al., 2020), generando así aerosoles (Carducci et al.,
2020), la idea de que este virus pueda sobrevivir en superficies durante horas o días sugiere la
posibilidad de que el SARS-CoV-2 también pueda ser un patógeno capaz de ser transmisible a
través de aguas residuales no tratadas siendo una potencial vía de transmisión fecal-oral, s; se
ha comprobado la presencia de ácido ribonucleico (ARN) viral en las heces (excremento) de
algunas personas infectadas asintomáticos o sintomáticos; y su carga viral es notoria en aguas
residuales (Randazzo et al., 2020).
Actualmente, realizar el monitoreo y vigilancia de las aguas residuales es un método
estratégico exitoso para rastrear marcadores biológicos y químicos de la actividad humana
(Panchal et al., 2021). Es asi que, , lLla cuantificación, estudio y monitoreo del SARS-CoV-2
en las aguas residuales permite seguir evaluar la prevalencia de infecciones entre la población
a través de la epidemiología basada en aguas residuales (wastewater based epidemiology:
WBE)., es; eEstá metodología resulta ser eficiente y potencial para la alerta temprana en la
transmisión de brotes de enfermedades infecciosas, su finalidad es rastrear el origen del virus,
vigilar si su concentración aumenta o disminuye, identificar la ubicación de los posibles
portadores, proporcionar una alerta temprana y eficaz (Mao et al., 2020) y permitir una toma
de decisiones de las autoridades sanitarias en materia de prevención y mitigación de riesgos en
la salud pública de una población objeto, por lo que En consecuencia, el monitoreo de las
aguas residuales no tratadas en el alcantarillado y en las PTARsplantas de tratamiento de
aguas residuales municipales pueden proporcionar una alerta temprana de los brotes de SARS-
CoV-2 (Thompson et al., 2020).
Es asi que el objetivo de la presente revisión es describir la relevancia de la cuantificación
y los métodos de tratamiento que pueden ser aplicados en las aguas residuales para el control
de SARS CoV-2 y su utilidad como herramientas de control epidemiológico de la enfermedad
Covid-19, resolviendo las siguientes preguntas: ¿Qué información existe referente al
monitoreo del SARS-CoV-2 en aguas residuales?, ¿Qué consideraciones técnicas deben tener
las plantas de tratamiento de agua residual (PTAR) para la eliminación del SARS-CoV-2?, y,
finalmente ¿El conocimiento del estado de las aguas residuales permite hacer parte de
generarlas estrategias de salud pública para el monitoreo y control del SARS- CoV-2?.

Metodología

Mediante el uso del motor de búsqueda de Google académico, se consultó bases de datos
tales como Elseiver, Scielo, Science Direct y Redalyc. Se incluyó literatura previa sobre el
SARS-CoV-2, así como los hallazgos actuales relacionados con el tratamiento, vigilancia y
monitoreo en las aguas residuales publicados desde el año 2019 en adelante.

Capítulo I: Experiencias relacionadas con la remoción del SARS-CoV-2 en sistemas de

tratamiento de aguas residuales internacionalmente

Las plantas de tratamiento de aguas residuales convencionales consisten generalmente en

sedimentación primaria, tratamiento aeróbico secundario y cloración de efluentes antes de su
reutilización final o descarga en los cuerpos de agua superficiales (Saba et al., 2021). El
influente de las PTAR es uno de los puntos de muestreo más importantes para que
la WBE compruebe la prevalencia de virus en un área determinada puesto que según
Nemudryi et al., (2020) los pacientes infectados excretan el virus en las heces y la orina en los
sistemas de recolección de aguas residuales 5 a 8 días antes de la aparición de los síntomas
(Nemudryi et al., 2020). Ahora bien, los virus excretados a través de sistemas de alcantarillado
(escorrentía de agua de lluvia, aguas residuales domésticas y aguas residuales industriales)
llegan a las PTARs que eventualmente pueden ser vertidos en cuerpos de aguas utilizados
para el consumo, pesca, riego agrícola o recreación humana (Bosch, 1998), procesos
tales como tratamientos con carbón activado, lodos activados, lagunas de oxidación,
filtración y cloración remueven gran parte de los virus presentes en las aguas
residuales, aunque en muchas ocasiones, una carga viral significativa puede permanecer
en los efluentes logrando contaminar asi arroyos, ríos y otros cuerpos de agua (Cloete
et al., 1998).
 La remoción física de las partículas por procesos como la coagulación, floculación,
sedimentación y filtración, ayudan a la remoción de los virus en los efluentes de aguas
residuales (Templeton et al., 2005). Asi mismo, la remoción adicional de los
contaminantes biológicos puede ser realizada mediante desinfección con cloro, ácido
paracético, ozono o irradiación con luz ultravioleta (UV) (Mezzanotte et al., 2007), por
lo que la calidad microbiológica del agua generalmente está dada por la determinación
de la concentración de coliformes totales y fecales y por bacteriófagos (Montero, 2015).
Por otro lado, lLas aguas residuales municipales contienen más de 100 tipos de virus
patógenos de origen humano y animal (Qiu et al., 2015). Los virus se eliminan de las personas
en niveles que varían de 10 5 a 10 13 partículas de virus por gramo de heces y la mayoría de los
virus no son patógenos ( Bosch et al., 2008 ; Tu et al., 2008 ; Hewitt et al., 2011 ). Los
sistemas convencionales de tratamiento de aguas residuales no son lo suficientemente
eficientes para eliminar todos los microorganismos patógenos ( Simmons y Xagoraraki, 2011;
Zhang y Farahbakhsh, 2007). Se han detectado varios patógenos como Cryptosporidium
parvum , Giardia lamblia y una variedad de bacterias y virus entéricos en aguas residuales
convencionales con tratamiento secundario y sometidas a tratamiento terciario ( Zanetti et al.,
2006 ).

La epidemiología basada en aguas residuales es una herramienta de monitoreo, vigilancia y

control que permite la detección en los vertimientos mediante las excretas de una población
determinada residente un área de captación, ayudando a su detección temprana y evitando su
propagación. Con el poco tiempo que se lleva de la presencia de SARS-CoV-2, son algunos
los estudios que se han hecho a nivel internacional respecto a este y la incidencia en las aguas
residuales. En una minuciosa revisión se ratifica la presencia del virus en heces fecales,
hallazgo confirmado por PCR. La misma, no obstante, plantea la necesidad de profundizar al
respecto dado el reducido número de casos estudiados (Amarian, 2020, citado por Barreto,
2020).
Pese a la limitante mencionada, este resultado tiene un enorme valor para la comunidad
científica, porque por esa vía el destino final del agente causal es el ambiente y constituye una
alerta para el estudio de su prevalencia en este y la posibilidad de que constituya una nueva
fuente de contaminación, diferente a las reconocidas actualmente, como las gotículas de saliva
(Wu D, Wu T, Liu Q & Yang Z, 2020 citado por Barreto 2020).
Un estudio realizado en un hospital chino tuvo como objetivo monitorear la presencia
de SARS-Cov-2 entre las superficies del entorno hospitalario, las aguas residuales y el
equipo de protección personal (PPE) del personal en las salas de aislamiento del Primer
Hospital Afiliado de la Universidad de Zhejiang, China (Jie Wang, et al., 2020). Se
realizaron las limpiezas de aire, aguas residuales y objetos con cloro como de costumbre,
donde se tomaron diversas muestras de agua residual, muestras respiratorias y de heces
de los pacientes y del personal. Se utilizaron métodos cuantitativos de PCR con
transcripción inversa en tiempo real (qRT-PCR) para confirmar la existencia del ARN
del SARS-Cov-2. Igualmente, se realizó el cultivo viral para las muestras positivas para
ARN del SARS-Cov-2. Donde este estudio determinó que las muestras utilizadas después
de los procesos de desinfección fueron negativas y que las 5 muestras de aguas residuales
de varios puntos fueron negativas por cultivo viral de SARS-CoV-2 (Barreto, 2020).
En Oporto Portugal se hizo un estudio durante 25 semanas a dos plantas de
tratamiento de agua residual (Sobreiras y Freixo) con el objetivo de desarrollar un
protocolo de monitoreo del SARS-CoV-2 en aguas residuales que podría usarse para
modelar la circulación del virus, complementando la vigilancia clínica actual. Se
realizaron muestras compuestas y varios métodos para la detección del SARS-CoV-2.
Estas dos plantas de tratamiento trataron en promedio 33.000 m 3 y 24.000 m 3 de aguas
residuales por día, respectivamente y contaron con un tren de tratamiento
correspondiente a tratamiento preliminar (desgarrado y biorreactor para la remoción de
arenas y grasas), tres etapas de tratamiento de aguas residuales (primaria, secundaria y
terciaria) y desinfección operativa UV (Tomasino, et al., 2021).
Mediante este estudio se determinó que esto puede ser particularmente relevante en
contextos de disponibilidad limitada de pruebas clínicas o alta frecuencia de casos
asintomáticos. Después de analizar las muestras de agua tomada del efluente tratado no
hubo detección de ARN del SARS-CoV-2 tras el tratamiento terciario y desinfección UV
(Tomasino, et al., 2021).
Como recomendó recientemente la Comisión Europea, “La vigilancia del SARS-CoV-2 en
las aguas residuales puede proporcionar información complementaria e independiente
importante para el proceso de toma de decisiones de salud pública en el contexto de la
pandemia de COVID-19 en curso. Como consecuencia, el monitoreo de las aguas residuales
debe incluirse de manera más sistemática en las estrategias nacionales de prueba para la
detección del virus SARS-CoV-2 ” ( Comisión, 2021, como se citó en Tomasino, et al., 2021).
En París para el año 2020, se realizó un estudio a la entrada de tres plantas de tratamiento
de agua residual, independientes y distantes alrededor de París con sorprendentes similitudes,
es probable que el lapso en el que fue realizado el estudio sea un reflejo directo de la dinámica
del SARS-CoV-2 en los habitantes de París, ya que, se encuentran conectados mediante los
sistemas de alcantarillado a cada una de a estas PTARs, no obstante, los resultados fueron
dados mediante pruebas RT-qPCR. Este estudio sugiere que la contaminación de aguas
residuales crudas puede ocurrir antes de la aparición significativa de casos clínicos, donde la
importancia de este estudio radica en el tiempo de la evolución del estado de salud en una
población que comparte una red de alcantarillado. También sugiere la existencia de un banco
de muestras de aguas residuales locales, donde se pueda monitorear la circulación de
patógenos y garantizar su conservación a largo plazo. (Wurtzer, et al., 2020).
En Japón, se realizó un estudio para evaluar la presencia de ARN del SARS-CoV-2 en las
aguas residuales y el agua de los ríos en la prefectura de Yamanashi, Japón donde se usó el
método de membrana-vórtice electronegativo (EMV) y el método de extracción de ARN
directo por adsorción por membrana. Se recolectaron muestras en el afluente, así como, se
recolectó agua residual tratada de forma secundaria antes de la cloración, asimismo, se utilizó
un proceso convencional de lodo activado y tres muestras de agua de un río en la prefectura de
Yamanashi. Las aguas residuales con tratamiento secundario se trataron adicionalmente
mediante cloración antes de descargarlas al medio ambiente
(Eiji Haramoto, Bikash Malla, Ocean Thakali & Masaaki Kitajima, 2020).
Se determinó que después de que un paciente se recupera de los síntomas respiratorios, los
virus aún pueden excretarse en las heces durante varios días ( Wu et al., 2020, citado por
Haramoto, 2020). También se encontró que los desinfectantes a base de cloro son efectivos
para la inactivación del SARS-CoV-2  (Chin et al., 2020, citado por Haramoto, 2020), y que
los coronavirus son sensibles al cloro, de la mismas manera, se inactivan relativamente más
rápido en agua en comparación con los virus sin envoltura ( La Rosa et al., 2020, citado por
Haramoto, 2020).
 En las ciudades de Teherán, Qom y Anzali en Irán, se recolectaron muestras de agua
tratada y no tratada de tres PTARs diferentes, las cuales fueron Teherán (PTAR del sur de
Teherán), East Anzali (PTAR East Anzali) y Qom no. 3 (EDAR Qom no. 3). Donde se
identificó la presencia de ARN del SARS-CoV-2 en el afluente, así como se determinó que las
muestras en la salida fueron dos muestras positivas para la PTAR del sur de Teherán, negativo
para la PTAR de East Anzali y negativo para la PTAR de Qom No. 3. En la PTAR del sur de
Teherán. Se pudo concluir que la desinfección UV es más eficaz que la desinfección con
cloro; teniendo en cuenta que esta tiene numerosos beneficios, como la formación de
subproductos sin desinfección, un tiempo de retención corto, eficaz en una amplia gama de
virus resistentes y ausencia de residuo (Nasseri, et al., 2021).

Capítulo II: métodos y procesos utilizados actualmente para el monitoreo y eliminación

cuantificación del SARS-CoV-2 en el tratamiento de agua residual.

El agua residual contiene una gran diversidad de virus, parte de la misma, desconocida para
nosotros (Aw & Gin, 2010) por lo que la aparición de estos virus en el ambiente acuático nos
lleva a prestar especial atención al tratamiento que reciben las aguas residuales. A lo largo del
tiempo, a través del monitoreo y la vigilancia de las aguas residuales se han estudiado
enfermedades virales mediante la detección de material genético en aguas residuales, como lo
son el virus de hepatitis E zoonótica reemergente (Cuevas-Ferrando, Randazzo, Pérez-
Cataluña, & Sánchez, 2020), el virus de la diarrea epidémica porcina (PEDV) y poliovirus,
entre otros, hecho por el cual el análisis microbiológico de aguas residuales para detectar
patógenos tiene una larga historia en materia de salud pública. Con base en lo anterior, los
virus excretados en las heces, la orina y el vómito entran en los sistemas de alcantarillado
(escorrentía de agua de lluvia, aguas residuales domésticas y aguas residuales industriales),
por lo que la descarga a estos sistemas implica una transmisión aérea (aerosoles), en el caso de
existencia de estaciones de bombeo, o una contaminación de los sistemas subterráneos de
distribución de agua potable, recursos de superficie hídrica, suelo, etc. debido a fugas en
tuberías subterráneas de aguas residuales. No obstante, la exposición a través de aerosoles o
contacto directo se limita a los trabajadores profesionales, si no se encuentran debidamente
protegidos por elementos de protección personal.
 Ahora bien, estos vertimientos llegan a las plantas de tratamiento de aguas residuales
(PTAR) que eventualmente pueden ser vertidos en cuerpos de aguas utilizados para el
consumo, pesca, riego agrícola o recreación humana (Bosch, 1998). Procesos tales
como tratamientos con carbón activado, lodos activados, lagunas de oxidación,
filtración y cloración remueven gran parte de los virus presentes en las aguas
residuales, aunque en muchas ocasiones, una carga viral significativa puede permanecer
en los efluentes logrando contaminar asi arroyos, ríos y otros cuerpos de agua (Cloete
et al., 1998). La remoción física de las partículas por procesos como la coagulación,
floculación, sedimentación y filtración, ayudan a la remoción de los virus en los efluentes
de aguas residuales (Templeton et al., 2005). Asi mismo, la remoción adicional de los
contaminantes biológicos puede ser realizada mediante desinfección con cloro, ácido
paracético, ozono o irradiación con luz ultravioleta (UV) (Mezzanotte et al., 2007), por
lo que la calidad microbiológica del agua generalmente está dada por la determinación
de la concentración de coliformes totales y fecales y por bacteriófagos (Montero, 2015).
Actualmente no existe una metodología estandarizada para la concentración y detección del
SARS-CoV-2, por lo que investigadores adaptaron y utilizaron metodologías existentes
utilizadas en muestras con muy alta variabilidad, en términos de sólidos suspendidos,
contenido de materia orgánica y otros contaminantes (Solanet, 2020). Cabe destacar que la
obtención de una muestra representativa de la población a la cual se quiere analizar es de vital
importancia para conseguir un resultado eficiente, cada muestra de agua representa a una
determinada población, por lo que estimar el número de personas infectadas en un área de
captación de aguas residuales específica es posible si se conoce la concentración de virus en
las aguas residuales por día y la concentración de virus en las heces de una persona infectada
por día (Qu et al., 2020).
De acuerdo con el “Protocolo de Mejores Prácticas” validado por SCORE COST Action
ES 1307, el agua residual destinada al análisis químico debe ser muestreada como una muestra
compuesta de 24 horas (Castiglioni et al., 2014), una vez obtenida la muestra (generalmente
entre 50 y 500 ml) se procede a obtener la concentración viral para poder determinar
posteriormente la presencia de material genético de SARS-CoV-2 (Alygizakis et al., 2021). En
un estudio realizado por Rusiñol et al., (2020) las metodologías más utilizadas para la
concentración de virus a partir de estas muestras son: ultrafiltración centrifuga, ultrafiltración,
precipitación con polietilenglicol, floculación con hidróxido de aluminio, y adsorción sobre
partículas positivamente cargadas y posterior elución, una vez concentrada, se purifican los
ácidos nucleicos presentes, teniendo un foco especial en el ARN que constituye el material
genético del virus, actualmente se utilizan dos métodos principales de extracción de ARN
previo a la RT-PCR para la detección de SARS-CoV-2: la cromatografía de columna y la
aplicación de partículas magnéticas (Cuadra et al., 2021). Una estrategia es la extracción
química utilizando tiocianato de guanidinio-fenol-cloroformo, para lograr la extracción del
ARN en una fase acuosa que posteriormente se concentra por precipitación alcohólica, por
otro lado se pueden utilizar columnas de sílica, o partículas magnéticas, en las cuales el
ARN es absorbido en presencia de un agente caotrópico y posteriormente es eluído con agua o
distintos buffers, también se puede utilizar una combinación de ambos métodos, es
fundamental obtener el ARN con la mayor pureza posible para después detectarlo con la
sensibilidad y especificidad que se requiere, no obstante, en una revisión minuciosa de
estudios realizados hasta la fecha demostraron que una extracción de ARN con éxito podría
realizarse con kits comerciales, por el cual el Centro para el Control y Prevención de
Enfermedades de los Estados Unidos de América (CDC, por sus siglas en inglés), autoriza el
uso de diferentes kits y reporta pruebas que califican el desempeño de estos en la recuperación
ARN del virus a partir de las muestras y su utilidad en los ensayos moleculares subsecuentes,
se encuentran el mini kit QIAamp® Viral RNA (utilizado en mayoría de publicaciones),
QIAamp® DSP Viral RNA Mini Kit, EZ1® DSP Virus Kit and Buffer AVL, Roche MagNA
Pure™ Total Nucleic Acid Kit*, Roche MagNA Pure™ 96 DNA and Viral NA Small Volume
Kit (Cuadra et al., 2021), finalmente una vez obtenido el ARN puro se procede a la detección
específica y cuantificación del material genético del virus, la técnica comúnmente empleada es
la PCR en tiempo real (RT-qPCR), que tiene como blanco de la detección distintas regiones
del genoma viral, para lo que se siguen protocolos internacionalmente avalados (Solanet,
2020).
De acuerdo con el “Protocolo de Mejores Prácticas” validado por SCORE COST Action
ES 1307, el agua residual destinada al análisis químico debe ser muestreada como una muestra
compuesta de 24 horas (Alygizakis et al., 2021), una vez obtenida la muestra se procede a
obtener la concentración viral para poder determinar posteriormente la presencia de material
genético de SARS-CoV-2. En un estudio realizado por Rusiñol et al, las metodologías más
utilizadas para la concentración de virus a partir de estas muestras son: ultrafiltración
centrifuga, ultrafiltración, precipitación con polietilenglicol, floculación con hidróxido de
aluminio, y adsorción sobre partículas positivamente cargadas y posterior elución (Rusiñol
et al., 2020) .

Generalmente se tomase realizan muestras compuestas que oscilan entre 50 y 250 ml de la

muestra, una vez concentrada, se purifican los ácidos nucleicos presentes, teniendo un foco
especial en el ARN que constituye el material genético del virus. Actualmente se utilizan dos
métodos principales de extracción de ARN previo a la RT-PCR para la detección de SARS-
CoV-2: la cromatografía de columna y la aplicación de partículas magnéticas (Cuadra et al.,
2021). Una estrategia es la extracción química utilizando tiocianato de guanidinio-fenol-
cloroformo, para lograr la extracción del ARN en una fase acuosa que posteriormente se
concentra por precipitación alcohólica. De otra manera se pueden utilizar columnas de sílica, o
partículas magnéticas, en las cuales el ARN es absorbido en presencia de un agente caotrópico
y posteriormente es eluído con agua o distintos buffers. También se puede utilizar una
combinación de ambos métodos. Es fundamental obtener el ARN con la mayor pureza
posible para después detectarlo con la sensibilidad y especificidad que se requiere, finalmente
una vez obtenido el ARN puro se procede a la detección específica y cuantificación del
material genético del virus. La técnica comúnmente empleada es la PCR en tiempo real (RT-
qPCR), que tiene como blanco de la detección distintas regiones del genoma viral, para lo que
se siguen protocolos internacionalmente avalados (Barrag, 2020).
Los estudios realizados hasta la fecha demostraron que la extracción de ARN con éxito
podría realizarse con kits comerciales, el Centro para el Control y Prevención de
Enfermedades de los Estados Unidos de América (CDC, por sus siglas en inglés), autoriza el
uso de diferentes kits y reporta pruebas que califican el desempeño de estos en la recuperación
ARN del virus a partir de las muestras y su utilidad en los ensayos moleculares subsecuentes.
Se encuentran el mini kit QIAamp® Viral RNA (utilizado en mayoría de publicaciones),
QIAamp® DSP Viral RNA Mini Kit, EZ1® DSP Virus Kit and Buffer AVL, Roche MagNA
Pure™ Total Nucleic Acid Kit*, Roche MagNA Pure™ 96 DNA and Viral NA Small Volume
Kit.
Cabe destacar que también existen diferentes técnicas analíticas tales como: la reacción en
cadena de la polimerasa digital (ddPCR), PCR anidada, método de amplificación isotérmica
mediada por bucle (LAMP) y ensayos CRISPR (Repeticiones palindrómicas cortas agrupadas
regularmente interespaciadas), caracterizados por una alta sensibilidad y especificidad, con
resultados rápidos, con equipos fáciles de operar y precisos permitiendo ser herramientas para
su aplicación en la WBE (Kitajima et al., 2020).Finalmente, y basados en lo anterior se conoce
la importancia y aplicación de la ingeniería mediante el despliegue de estaciones de
monitorización en colectores, la vigilancia y monitorización de los afluentes en la PTAR,
segmentar varios puntos de monitoreo en las ciudades y asi llevar un debido control
epidemiológico del virus a través del tiempo. Ahora bien,

Por otro lado, las aguas residuales municipales contienen más de 100 tipos de virus patógenos
de origen humano y animal (Qiu et al., 2015). Los virus se eliminan de las personas en niveles
que varían de 10 5 a 10 13
partículas de virus por gramo de heces y la mayoría de los virus no
son patógenos ( Bosch et al., 2008 ; Tu et al., 2008 ; Hewitt et al., 2011 ).
Los sistemas convencionales de tratamiento de aguas residuales no son lo suficientemente
eficientes para eliminar todos los microorganismos patógenos ( Simmons y Xagoraraki, 2011 ;
Zhang y Farahbakhsh, 2007 ). Se han detectado varios patógenos como Cryptosporidium
parvum , Giardia lamblia y una variedad de bacterias y virus entéricos en aguas residuales
convencionales con tratamiento secundario y sometidas a tratamiento terciario ( Zanetti et al.,
2006 ).
.

Capítulo III: Acciones preventivas y de mitigación para el control y monitoreo del virus

a nivel internacional en el tratamiento de agua residual.

En las plantas de tratamiento de agua residual se tiene una constante exposición a riesgos
relacionados con agentes biológicos, dado que, el objetivo de estas plantas, es la depuración
de las aguas contaminadas, ya que estas son el medio de proliferación y vector de transmisión
de ymicroorganismos y los operarios se encuentran con una alta exposición a patógenos como
virus, bacterias, hongos y parásitos. El riesgo de contagio por SARS-CoV-2 en las PTARs es
dado por la exposición a aerosoles, sufriendo el contagio por las vías respiratorias. La mayor
incidencia se encuentra en el cribado, los reactores biológicos, la limpieza de decantadores y
digestores, y los desarenadores entre otros, también se debe contar con el r. Riesgo por la
exposición a las salpicaduras en las labores de limpieza, en los tamices rotativos y las tomas
de muestra, dado por el contacto directo con la piel y los ojos. Se debe evitar la entrada del
virus por las vías digestivas, ya que normalmente se tiende a llevarse las manos sucias a la
boca, a los y ojos y también se presenta el hecho de comer, beber o fumar en los puestos de
trabajo. (ASEPEYO, 2009). TESIS
Por lo expuesto anteriormente, cabe mencionar la importancia de evitar el mayor contacto
con agua contaminada, la utilización de todos los elementos de bioseguridad y protección
personal en las instalaciones de trabajo. Un equipo de investigadores en conjunto con
científicos de Pakistán, China y Estados Unidos, propusieron un modelo de rápida detección y
saneamiento del SARS-CoV-2 en aguas servidas, donde plantean que la aplicación de
nanomateriales mitigaríaa la contaminación biológica del agua, ya que esta es una herramienta
de detección temprana del virus presente en el agua, involucrando varios materiales a
nanoescala, algunos de estos materiales son plata (Ag), dióxido de titanio (TiO 2),
tetratiomolibdato de amonio (ATTM) y tetraetoxisilano (TEOS) mezclados con
poliacrilonitrilo (PAN), contando con alta eficiencia como nanometales, nanoadsorbentes,
fotocatalizadores y nanomembranas, en el quedonde se ha demostrado que el uso de
nanofibras, partículas y membranas compuestas erradican de manera eficaz los patógenos
como bacterias, protozoos y virus..

implementar una combinación de nanotecnología con epidemiología basada en

aguas residuales e inteligencia artificial para la detección del virus y la remediación
de aguas residuales a nivel comunitario . La aplicación de nanomateriales para mitigar la
contaminación biológica del agua ha sido un tema de sólida investigación y desarrollo durante varios
años. Las innovaciones recientes en nanotecnología han involucrado varios materiales a nanoescala
útiles para el tratamiento de aguas residuales, incluidos nanometales, nanoadsorbentes,
fotocatalizadores y nanomembrana
 El uso potencial de nanosensores para la detección temprana y el monitoreo de SARSCoV2
debe investigarse en condiciones específicas para cada área de desarrollo. El uso potencial de
nanosensores para la detección temprana y el monitoreo del SARS-CoV-2 debe explorarse en
condiciones específicas de cada región en desarrollo. Además, los usos de estas plataformas se
pueden combinar con técnicas rentables de epidemiología basada en aguas residuales sirven
es (WBE) [ 33 , 34] para monitorear eficazmente, la proliferación del virus en las
comunidades y predecir futuros brotes en regiones en desarrollo. Las aguas residuales no
tratadas contaminadas con SARS-CoV-2 podrían tratarse utilizando filtros con membranas
(Addel et al., 2021)nanotecnológicas.
Se ha desarrollado un método alternativo, correspondiente a un dispositivo de papel para
desarrollarque logra identificar la presencia d el material genético del SARS-CoV-2 presente
en las aguas residuales, siendo este, un dispositivo económico y fácil de usar. La importancia
de este tipo de alterativas ayuda al monitoreo de comunidades para la detección temprana del
virus, donde se pueden implementar intervenciones efectivas tan pronto como sea posible para
limitar el desplazamiento de poblaciones locales y trabajar para minimizar la propagación de
patógenos y amenazas a la salud pública. El papel analítico es una poderosa herramienta que
permite ensayos sensibles con alta precisión proporcionando diagnósticos de manera rápida y
eficaz (Mao et al., 2020).

para una vigilancia eficaz, así como la predicción de la transmisión comunitaria y posibles
brotes futuros en las regiones menos desarrolladas. Más recientemente, la tecnología basada
en WBE se ha implementado con éxito para el seguimiento de fuentes cercanas (NST), lo que
permite la detección de casos de infección individualmente existentes o agrupados en la
infraestructura de servicio de drenaje de aguas residuales. Posteriormente, se está utilizando
una combinación de NST y pruebas clínicas específicas para detener los brotes de
enfermedades en varios países, incluidos Francia, Turquía, Estonia, Singapur, EE. UU., Reino
Unido y Finlandia 
Por ejemplo, las aguas residuales no tratadas que albergan SARS-CoV-2 podrían tratarse
utilizando filtros / membranas compuestas de bajo costo y ampliamente desplegables que
contienen una gama de posibles nanomateriales.
Dada la presencia conocida de SARS-CoV-2 en las aguas residuales, es esencial investigar
cómo esto afecta la exposición humana en general y considerar e implementar estrategias que
puedan mitigar esta vía de propagación viral.

Análisis de los efectos en la salud humana por agua contaminada.

La Asociación Colombiana de Ingeniería Sanitaria y Ambiental (ACODAL, 2013),

expone que el 31% de las ciudades en Colombia cuentan con PTAR (tratamiento
primario el 29% y el 1% tratamiento terciario); donde se ha observado una incorrecta
selección de las tecnologías, altos costos de inversión, operación y bajos niveles de
aprovechamiento de lodos (aunque la inversión destinada al tratamiento de las aguas
residuales no alcanza el 1% de lo invertido o destinado en agua potable) y una poca
protección de las fuentes hídricas y aprovechamiento de lodos, lo cual pone en riesgo la
sostenibilidad ambiental..

Las enfermedades infecciosas presentan un gran riesgo, dado que Uuna gran variedad
de virus infecta tanto a hombres como animales y son excretados mediante las heces y la
orina a las aguas residuales. La exposición a estas aguas contaminadas puede causar
distintas enfermedades como meningitis, algunos tipos de parálisis, enfermedades
respiratorias, diarreas y vómitos, miocarditis, anomalías congénitas del corazón,
hepatitis e infecciones oculares. Se pude analizar que los virus son los principales
causantes de brotes relacionados con la contaminación del agua, no obstante, la
optimización de los tratamientos de depuración ha reducido en gran medida la
propagación de patógenos bacterianos.

Conclusiones
La importancia y aplicación de la ingeniería mediante el despliegue de estaciones de
monitorización en colectores, la vigilancia y monitorización de los afluentes en la PTAR,
segmentar varios puntos de monitoreo en las ciudades y así llevar un debido control
epidemiológico del virus a través del tiempo. La contaminación fecal de los sistemas de
agua son una vía importante de exposición, por lo tanto, es esencial resaltar aún más la
necesidad de una vigilancia activa del SARS-CoV-2 fortaleciendo e implementando el
monitoreo constante en las PTARs.
Mientras el SARS-CoV-2 siga siendo viable en condiciones que facilitan la infección por
la transmisión vía fecal-oral, es de vital importancia continuar con las investigaciones
que se han venido desarrollando acerca de esta vía de proliferación, como son las aguas
residuales; se deben primar las regiones que cuenta con un déficit en infraestructura de
saneamiento, ya que estas presentan mayor riesgo de contagio. Las heces en presencia
del virus pueden permanecer infecciosas durante 2 días a 20 ° C, pero durante 14 días a
4 ° C, lo que demuestra al sistema de alcantarillado como posible vía de transmisión,
teniendo en cuenta la importancia de la influencia que tiene la temperatura en la
actividad del virus, por lo tanto, la evaluación de riesgos y de procesos de saneamiento
ayudan a prevenir esta vía de transmisión y sus consecuencias a la salud pública. No
obstante, tras la investigación realizada, se pudo determinar que en las plantas de
tratamiento que cuenta con procesos primarios, secundarios y terciarios de depuración,
no presentan SARS-CoV-2 en su efluente.

Referencias

Addel, M., Farooq, T., Shakoor, N., Ahmar, S., Fiaz, S., White, J., Gardea-Torresdey, J.,
Mora-Poblete, F., & Rui Y. (2021). COVID-19 and Nanoscience in the Developing
World: Rapid Detection and Remediation in Wastewater. Nanomaterials, 11(4), 991.
https://www.mdpi.com/2079-4991/11/4/991/htm
Alygizakis, N., Markou, A. N., Rousis, N. I., Galani, A., Avgeris, M., Adamopoulos, P. G.,
Scorilas, A., Lianidou, E. S., Paraskevis, D., Tsiodras, S., Tsakris, A., Dimopoulos, M.
A., & Thomaidis, N. S. (2021). Analytical methodologies for the detection of SARS-
CoV-2 in wastewater: Protocols and future perspectives. TrAC - Trends in Analytical
Chemistry, 134, 116125. https://doi.org/10.1016/j.trac.2020.116125
Bosch, A. (1998). Human enteric viruses in the water environment: a minireview.
International Microbiology : The Official Journal of the Spanish Society for
Microbiology, 1(3), 191-196.
Castells, J. (2009). Guía de buenas prácticas preventivas en estaciones depuradoras de aguas
residuales. ASEPEYO.
Castiglioni, S., Thomas, K. V, Kasprzyk-Hordern, B., Vandam, L., & Griffiths, P. (2014).
Testing wastewater to detect illicit drugs: State of the art, potential and research needs.
Science of The Total Environment, 487, 613-620.
https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2013.10.034
Cloete, T. E., Da Silva, E., & Nel, L. H. (1998). Removal of waterborne human enteric viruses
and coliphages with oxidized coal. Current Microbiology, 37(1), 23-27.
https://doi.org/10.1007/s002849900331
Cuadra, T. E., Guadrón Meléndez, A. A., Cruz Aguilar, R. D. J., & Vásquez Rodriguez, E. A.
(2021). Factores relevantes sobre el ensayo RT-PCR para la detección de SARS-CoV-2,
virus causante del COVID-19. Alerta, Revista científica del Instituto Nacional de Salud,
4(1), 31-39. https://doi.org/10.5377/alerta.v4i1.10060
Fondo de las Naciones Unidas para la Infancia. (2020). COVID-19: Preguntas frecuentes.
https://www.unicef.org/es/coronavirus/lo-que-los-padres-deben-saber
Godin, B., Tejeda, L., & Arroyo, B. (2021). SARS-CoV-2: Un salto de las heces a los
ecosistemas acuáticos. Revista chilena de infectología, 38(2), 306-307.
https://doi.org/10.4067/s0716-10182021000200306
Gormley, M., Aspray, T. J., & Kelly, D. A. (2020). COVID-19: mitigating transmission via
wastewater plumbing systems. The Lancet Global Health, 8(5), e643.
https://doi.org/10.1016/S2214-109X(20)30112-1
Guo, Y.-R., Cao, Q.-D., Hong, Z.-S., Tan, Y.-Y., Chen, S.-D., Jin, H.-J., Tan, K.-S., Wang,
D.-Y., & Yan, Y. (2020). The origin, transmission and clinical therapies on coronavirus
disease 2019 (COVID-19) outbreak – an update on the status. Military Medical
Research, 7(1), 11. https://doi.org/10.1186/s40779-020-00240-0
Kitajima, M., Ahmed, W., Bibby, K., Carducci, A., Gerba, C. P., Hamilton, K. A., Haramoto,
E., & Rose, J. B. (2020). SARS-CoV-2 in wastewater: State of the knowledge and
research needs. Science of the Total Environment, 739, 139076.
 https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.139076
Kopperi, H., Tharak, A., Hemalatha, M., Kiran, U., Gokulan, C. G., Mishra, R. K., & Mohan,
S. V. (2021). Defining the methodological approach for wastewater-based
epidemiological studies—Surveillance of SARS-CoV-2. Environmental Technology and
Innovation, 23, 101696. https://doi.org/10.1016/j.eti.2021.101696
Li, Q., Guan, X., Wu, P., Wang, X., Zhou, L., Tong, Y., Ren, R., Leung, K. S. M., Lau, E. H.
Y., Wong, J. Y., Xing, X., Xiang, N., Wu, Y., Li, C., Chen, Q., Li, D., Liu, T., Zhao, J.,
Liu, M., … Feng, Z. (2020). Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel
Coronavirus–Infected Pneumonia. New England Journal of Medicine, 382(13), 1199-
1207. https://doi.org/10.1056/NEJMoa2001316
Mao, K., Zhang, H & Yang, Z. (2020). Can a Paper-Based Device Trace COVID-19 Sources
with Wastewater-Based Epidemiology? Environmental Science & Technology. 54, 3733-
3735. https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.est.0c01174.
Mao, K., Zhang, K., Du, W., Ali, W., Feng, X., & Zhang, H. (2020). The potential of
wastewater-based epidemiology as surveillance and early warning of infectious disease
outbreaks. Current Opinion in Environmental Science & Health, 17, 1-7.
https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.coesh.2020.04.006
Mezzanotte, V., Antonelli, M., Citterio, S., & Nurizzo, C. (2007). Wastewater disinfection
alternatives: chlorine, ozone, peracetic acid, and UV light. Water Environment
Research : A Research Publication of the Water Environment Federation, 79(12), 2373-
2379. https://doi.org/10.2175/106143007x183763
Montero, A. (2015). Detección , Cuantificación Y Caracterización Molecular De Astrovirus
Clásicos Y Emergentes. Universidad de la Reública de Uruguay, 1-122.
Nemudryi, A., Nemudraia, A., Wiegand, T., Surya, K., Buyukyoruk, M., Cicha, C.,
Vanderwood, K. K., Wilkinson, R., & Wiedenheft, B. (2020). Temporal Detection and
Phylogenetic Assessment of SARS-CoV-2 in Municipal Wastewater. Cell Reports
Medicine, 1(6), 100098. https://doi.org/10.1016/j.xcrm.2020.100098
Panchal, D., Tripathy, P., Prakash, O., Sharma, A., & Pal, S. (2021). SARS-CoV-2: Fate in
water environments and sewage surveillance as an early warning system. Water Science
and Technology, 84(1), 1-15. https://doi.org/10.2166/wst.2021.146
Phan, L. T., Nguyen, T. V, Luong, Q. C., Nguyen, T. V, Nguyen, H. T., Le, H. Q., Nguyen, T.
 T., Cao, T. M., & Pham, Q. D. (2020). Importation and Human-to-Human Transmission
of a Novel Coronavirus in Vietnam. New England Journal of Medicine, 382(9), 872-874.
https://doi.org/10.1056/NEJMc2001272
Qiu, Y., Lee, B. E., Neumann, N., Ashbolt, N., Craik, S., Maal-Bared, R., & Pang, X. L.
(2015). Assessment of human virus removal during municipal wastewater treatment in
Edmonton, Canada. Journal of Applied Microbiology, 119(6), 1729-1739.
https://doi.org/10.1111/jam.12971
Qu, G., Li, X., Hu, L., & Jiang, G. (2020). An Imperative Need for Research on the Role of
Environmental Factors in Transmission of Novel Coronavirus (COVID-19).
Environmental Science and Technology, 54(7), 3730-3732.
https://doi.org/10.1021/acs.est.0c01102
Randazzo, W., Cuevas-Ferrando, E., Sanjuan, R., Domingo-Calap, P., & Sanchez, G. (2020).
Metropolitan Wastewater Analysis for COVID-19 Epidemiological Surveillance.
medRxiv. https://doi.org/10.1101/2020.04.23.20076679
Rusiñol, M., Martínez-Puchol, S., Forés, E., Itarte, M., Girones, R., & Bofill-Mas, S. (2020).
Concentration methods for the quantification of coronavirus and other potentially
pandemic enveloped virus from wastewater. Current Opinion in Environmental Science
& Health, 17, 21-28. https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.coesh.2020.08.002
Saba, B., Hasan, S. W., Kjellerup, B. V., & Christy, A. D. (2021). Capacity of existing
wastewater treatment plants to treat SARS-CoV-2. A review. Bioresource Technology
Reports, 15(June), 100737. https://doi.org/10.1016/j.biteb.2021.100737
Solanet, M. A. (2020). Pandemia : los desafíos múltiples que en el presente le plantea al
porvenir. January.
Templeton, M. R., Andrews, R. C., & Hofmann, R. (2005). Inactivation of particle-associated
viral surrogates by ultraviolet light. Water Research, 39(15), 3487-3500.
https://doi.org/10.1016/j.watres.2005.06.010
Thompson, J. R., Nancharaiah, Y. V, Gu, X., Lee, W. L., Rajal, V. B., Haines, M. B., Girones,
R., Ng, L. C., Alm, E. J., & Wuertz, S. (2020). Making waves: Wastewater surveillance
of SARS-CoV-2 for population-based health management. Water Research, 184, 116181.
https://doi.org/https://doi.org/10.1016/j.watres.2020.116181
Anexos