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SITIO ACTIVO Y ESPECIFICIDAD: El Sitio activo es un hoyo o hendidura ubicado en el interior hidrofóbico
de la apoenzima y constituye la parte de la enzima que tiene afinidad por el sustrato y que entra en contacto íntimo
con él. Es una entidad tridimensional que representa una porción relativamente pequeña del volumen total de la
enzima (contiene un pequeño número de aminoácidos); en donde hay Aas estructurales que le dan su forma
tridimensional (Prescindibles), Aas de unión que unen sustrato y Aas catalíticos que promueven su transformación
química en producto (Imprescindibles). Los grupor R de estos aminoácidos están espacialmente ordenados e
interactúan con el sustrato reteniéndolo por interacciones débiles o no covalentes como interacciones hidrofóbicas,
puentes de hidrógeno y puentes salinos, o eventualmente por enlaces covalentes transitorios.
El sitio activo es donde ocurre la catálisis y es el responsable de la especificidad enzimàtica, ya que la cadena
lateral de los aminoácidos que constituyen dicho sitio sólo permiten el acoplamiento de compuestos con
determinadas características estructurales.
Especificidad absoluta: Es la que presentan las enzimas que se unen a un solo sustrato. Se le llama también
especificidad de sustrato y se explica con el modelo de Emil Fisher (Modelo llave-cerradura), el cual postula que el
sitio activo de la enzima es rígido y el sustrato debe tener una estructura determinada para poder encajar en la suya.
Especificidad relativa: La presentan las enzimas que se unen a dos o más sustratos que son análogos químicos. Se
le llama también especificidad de grupo y se explica con el modelo de Daniel Koshland (Ajuste o acomodo
inducido). Según este modelo el sustrato se une al centro activo induciendo cambios conformacionales no
covalentes y transitorios en su estructura flexible y así la enzima se amolda al sustrato.
Especificidad de función:Se refiere a que un mismo compuesto puede ser sustrato de varias enzimas. En este caso
la especificidad no depende de la unión E-S, sino de la acción catalítica de la enzima. Así, una misma sustancia
puede transformarse en diferentes productos dependiendo de si sobre ella actúa una u otra enzima.
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El estado de transición reside en la cima de energía que separa al sustrato del producto La cantidad de
energía libre mínima necesaria para alcanzar el estado de transición se conoce como energía de activación. Los
catalizadores descienden o disminuyen la energía de activación de las moléculas de manera que el sustrato alcanza
más rápidamente el estado de transición y por tanto la velocidad de la reacción aumenta.
El poder catalítico de las enzimas radica en que son capaces de formar o romper enlaces químicos
desestabilizando la estructura del sustrato aumentando su entropía. (grado de desorden molecular y fuerza
inductora de los procesos bioquímicos). Cuando la enzima se une al sustrato se forma el complejo E-S mediante la
formación de algunas interacciones débiles entre ellos obteniéndose la energía conocida como energía de fijación
que permite disminuir la energía de activación acelerando entonces la velocidad de la reacción. Una vez
modificado el sustrato, éste se separa manteniéndose la enzima inalterada. Se denomina número de recambio al
número de moléculas de sustrato transformadas por unidad de tiempo por una molécula de enzima.
Las enzimas aceleran las reacciones termodinámicamente posibles, aumentando la velocidad sin modificar
el estado inicial ni el estado final de la misma, así como tampoco afectan la concentración inicial o del sustrato (S)
ni la concentración final o del producto (P). Por tanto puede decirse que las enzimas no modifican ni el ∆G0 de la
reacción ni su constante de equilibrio (Keq). Es decir, que las enzimas no modifican el equilibrio final pero este se
alcanza más rápido. La variación de energía libre (∆G0) es la diferencia entre la energía final de la reacción y la
energía inicial de la reacción. Si ∆G0 es negativo la reacción es exergónica y espontànea y se favorece en el sentido
de S a P. Si ∆G0 es positivo la reacción es endergónica y se favorece en el sentido contrario de P a S. Las enzimas
no modifican el ∆G0 de la reacción y por tanto no influyen en la dirección de la misma, sólo en su velocidad.
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1.- Clase 1,- OXIDOREDUCTASAS: Catalizan reacciones de oxido reducción de todo tipo
Subclases:
Deshidrogenasas: sustraen átomos de H o electrones.
Reductasas: fijan H. Oxidasas: usan el oxígeno como aceptor de electrones.
Oxigenasas: Transfieren oxígeno.
Catalasas y Peroxidasas: Reducen el peróxido de hidrógeno (H2O2) hasta 2 H2O.
2.- Clase 2.- TRANFERASAS: Catalizan la transferencia de un grupo de átomos de una molécula a otra.
(Transferencia de grupos químicos de un sustrato dador a otro aceptor)
Subclases: Metiltransferasas, glucosiltransferasas, aciltranferasas, aminotranfersas, fosforiltransferasas, quinasas.
3.- Clase 3.- HIDROLASAS: Catalizan la ruptura de enlaces covalente simple por introducción de agua. (Provoca
la ruptura de una molécula adicionando a los productos el H y el OH del agua).
Subclases: Esterasas, Gucosidadas, Peptidasas, fosfatasas.
4.- Clase 4.- LIASAS: Catalizan la ruptura de enlaces químicos entre dos moléculas por mecanismos diferentes a
la hidrólisis, generalmente causando rompimientos de enlaces C-C, C-O, C-N adicionando un grupo a un doble
enlace doble. Incluyen también reacciones en las que se eliminan grupos para formar enlaces dobles.
Subclases: Descarboxilasas, Aldolasas, Cetolasas, Hidratasas, Deshidratasas.
5.- Clase 5.- ISOMERASAS: Catalizan la interconversión de diversos isómeros por rearreglo interno de los
átomos componentes de una sola molécula).
Subclases: Racemasas, Epimerasas, Mutasas
6.- Clase 6.- LIGASAS: Catalizan el enlace de dos moléculas a expensas de la ruptura de una tercera molécula, por
Ej. el ATP (Se unen 2 moléculas por enlace covalente simple, utilizando la energía proveniente de la ruptura de un
enlace de alta energía). Forman enlaces C-O, C-S, C-N, C-C.
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Subclases: Sintetasas (Síntesis dependiente de ATP), Sintasas (síntesis independiente de ATP)
Temp óptimo
pH óptimo
Temp. / pH
[S]
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Otros factores que pueden modificar la velocidad de las reacciones enzimáticas son:
-La presencia de Inhibidores que impiden que se realice a velocidad adecuada por interferir con la formación del
complejo enzima sustrato o con su disocación
-La oxidación porque algunos grupos químicos de las enzimas son afectados por el oxígeno produciéndose
cambios conformacionales,
-La radiaciones de longitud de onda corta (luz ultravioleta o rayos X) porque provocan perdida de la actividad de la
enzima por efectos sobre los genes que las codifican
CINETICA ENZIMATICA
La cinética es el estudio de la velocidad de las reacciones. El orden cinético de una reacción enzimática se refiere a
la relación que existe entre la velocidad inicial (Vo) ó (Vi) y la concentración de sustrato. En enzimas
monosustratos se habla de reacción de primer orden cuando la velocidad es directamente proporcional a la
concentración de sustrato. Vo = [ S ]. Y si la Vo es independiente de la concentración de sustrato, se dice que tiene
cinética de orden cero y esta se alcanza cuando la enzima se ha saturado de sustrato. En ese momento no hay
enzima libre y la Vo permanece constante aunque se aumente la cantidad o concentración sustrato, por lo cual se
alcanza la Vmax.
La primera corresponde a la formación de un complejo Enzima-Sustrato (E-S) según una reacción reversible. La
segunda está constituía por la descomposición de este complejo en enzima libre (E) y en producto de reacción (P).
La velocidad de la reacción depende de la velocidad a la cual se desdobla el complejo E-S en E + P y por eso se
considera su etapa limitante. Se dice que el sistema alcanza el estado estacionario cuando la [ES] permanece
constante. Es decir, que la velocidad de formación de ES es igual a su desaparición. A baja [S] la mayor parte de la
enzima estará libre y por tanto la V0 se hace proporcional a la [S] porque a medida que aumenta la [S] se forma
mas complejo ES y esto acelera la reacción. Cuando toda la enzima está unida al sustrato solo hay complejo ES no
hay enzima libre, la V0 se hace constante y se alcanza la Vmax.
En esta gráfica hiperbólica de Michaellis y Menten (M-M) resulta difícil e impreciso determinar la Km y la
Vmax de una enzima. Con el fín de poder determinarlas de manera más precisa se realizó una transformación de
ésta en la gráfica de Lineweaver-Burk (L-B), calculando el recíproco de la ecuación de M-M, obteniéndose una
ecuación comparable con la ecuación de la recta. Esta gràfica se ha denominado por tanto de doble recìproca. Se
grafican los inversos de la V0 (1/V0) y los inversos de la [S] (1/[S]) sobre un eje de coordenadas y se obtiene una
recta llamada cuya pendiente es Km/Vmax, con ella se pueden calcular los valores de Km y V max. En la gràfica
lineal de L-B el punto de intersección de la recta con el eje de las ordenadas (eje Y) corresponde a 1/Vmax y el
punto de intersección con el eje de las abcisas (eje X) corresponde a – 1/Km.
INHIBIDORES ENZIMATICOS
Existen 2 tipos de inhibidores: Reversiles e Irreversibles
Los inhibidores irreversibles reaccionan con la enzima formando un enlace covalente estable con ella
modificando en forma permanente su estructura, de manera que inhiben su capacidad catalítica. Los inhibidores
irreversibles no pueden separarse de la enzima por métodos físicos. Ej: Venenos: Organo fosforados ,
Ferricianuro, Iodoacetato, Medicamentos: Aspirina (inhibe a la ciclooxigenasa), Penicilina (Inhibe transpeptidasa
de la síntesis de la pared celular bacteriana)
Los inhibidores reversibles se fijan de manera reversible a la enzima y pueden ser Competitivos y No
Competitivos.
Se denomina inhibidor competitivo a una sustancia que se une a una enzima en lugar de su verdadero
sustrato, por ser análogo a éste, es decir, que compite con el sustrato por el sitio activo de la enzima. Este tipo de
inhibición se hace reversible aumentando la cantidad del sustrato que participe en la reacción. En la inhibición
competitiva, el inhibidor y el sustrato no pueden unirse simultáneamente a la enzima de manera que se forman
complejos ES y EI. Con un inhibidor competitivo la Vmax no varía pero la enzima pierde afinidad por su sustrato y
esto se refleja en un aumento del Km. Se puede decir que el inhibidor competitivo tiene un efecto en la pendiente
de la gráfica de L-B (la aumenta), pero no en la intersección con el eje Y.
Ejemplos: Malonato, (inhibidor de la succínico deshidrogenada del Ciclo de Krebs), Sulfanilamida
(análogo del anillo PABA del ácido fólico) Metrotexato (quimioterápico análogo del acido fólico), Indol (análogo
del triptófano) Enalapril y Captopril (Inhibidores de la Enzima Convertidora de Angiotensina), Lovastatina
( Inhibe a la HMG-CoA reductasa)
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El inhibidor no competitivo se fija a un sitio diferente del sitio de fijación del sustrato, modificando la estructura
de la enzima en forma parcial, reversible y no covalente restándole actividad catalítica, y por tanto se modifica la
Vmax y no el Km porque la afinidad de la enzima por su sustrato no es modificada. Se puede formar un complejo
ESI y la modificación de la conformación que resulta, disminuye el poder catalítico haciendo más difícil los
intercambios electrónicos en el complejo ES. En este caso, en la gráfica de L-B la línea que representa al complejo
ESI no competitivo también aumenta la pendiente pero tiene menor Vmax e igual Km que la línea del complejo ES
sin inhibidor. (Tiene el mismo punto en el eje de las X y diferente en Y). Ej: EDTA
Otro caso que se describe como un diagrama especial, es aquel en que el inhibidor no actúa sino después de
la formación del complejo ES. Se denomina este tipo de inhibición “acompetitiva”. En este caso Vmax y Km están
disminuídas, de modo que las curvas de inhibición son paralelas a las obtenidas en ausencia de inhibidor.
INHIBIDOR COMPETITIVO
Reacción: E + S + I ES + EI P + E + EI
INHIBIDOR NO COMPETITIVO
CINÉTICA DE LAS ENZIMAS ALOSTÉRICAS: Las enzimas alostéricas no muestran la clásica relación
cinética de Michaelis-Menten entre [S], Vmax y Km, porque su comportamiento cinético está muy alterado por las
variaciones de concentración del modulador alostérico. Al relacionar gráficamente la velocidad inicial con la
concentración de sustrato en lugar de la hipérbole de M-M muestran una curva sigmoide., que es reflejo de
interacciones cooperativas entre las subunidades proteicas. La curva sigmoidal implica que la unión de la primera
molécula de sustrato con la enzima altera su conformación e intensifica la unión de las moléculas de sustrato
subsiguientes. Tal relación sigmoidal constituye un ejemplo de cooperativismo positivo.
En este caso también hay una [S] en que Vo = Vmax/2 pero no se denomina Km, porque no siguen la
relación hiperbólica de M-M, en su lugar se utiliza el término Km aparente y el símbolo K0,5. Un modulador
positivo disminuye el K0,5 de la enzima ) , mientras que el modulador negativo lo aumenta.
La cinética alostérica se explica mediante dos modelos:
a) Modelo concertado o simétrico: Según este modelo, cada monómero puede existir en dos estados
conformacionales en equilibrio, uno tenso (T), incapaz de unir al S y otro relajado (R), con alta afinidad por el
sustrato. Si todas las subunidades están en forma T, cambian a forma R al captarse la primera molécula de sustrato
y esto facilita la unión del resto de las moléculas de sustrato.
b) Modelo secuencial o asimétrico: Este modelo supone que las subunidades pueden cambiar su conformación
terciaria, una cada vez, en respuesta a la unión del sustrato lo cual implica estados intermedios entre la forma T y la
forma R.
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Gráfica de la Cinética de
Enzimas Alostéricas
SISTEMAS MULTIENZIMATICOS
Son sistemas altamente organizados que consisten en asociaciones de enzimas en una ruta metabólica,
organizadas para actuar en forma ordenada, de manera que el producto de una enzima sea el sustrato de la
siguiente. En el sistema por lo menos una enzima es reguladora y es la encargada de regular el flujo de toda la ruta.
Generalmente esta enzima reguladora se encuentra al inicio de la vía.
Se clasifican en:
-Sistemas Disociados o No Asociados (sistemas solubles), donde las enzimas se encuentran disueltas en la célula
de manera dispersa (Sistemas solubles) y se utilizan para sustratos polares. Ej: Glucólisis
- Sistemas Asociados o No disociados (complejos enzimáticos), donde las enzimas se encuentran unidas
covalentemente formando complejos y son utilizados para sustratos no polares. Ej: Complejo Acido graso Sintasa.
- Sistemas unidos a membranas donde las enzimas son proteínas integrales de la membrana celular. Ej: Cadena
respiratoria.
ISOENZIMAS
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Otro tipo de regulación de la actividad metabólica tiene lugar mediante la participación de Isoenzimas, que
son enzimas que tienen varias formas estructurales distintas pero todas son activas y catalizan la misma reacción
con el mismo sustrato. (Tienen la misma función pero diferentes características físico-químicas)
Las diferentes isoenzimas de una enzima son codificadas por genes distintos y por tanto tienen distinta
secuencia de aminoácidos. Tiene el mismo número de cadenas pero con diferente composición de aminoácidos y
por tanto tienen diferente punto isoeléctrico pudiéndose separar por electroforesis para conocer la concentración de
cada isoenzima.
Desde el punto de vista cinético, presentan diferentes valores de Km y Vmax para un mismo sustrato y esto
permite distinguirlas en una gráfica cinética. Además tienen diferente distribución en los tejidos y presentan
predilección por un tejido especial.
Las isoenzimas son marcadores fisiológicos de un tejido porque aquel tejido que tenga la isoenzima de menor
Km metaboliza al sustrato a baja concentración y depende de él, en cambio si el tejido tiene una isoenzima de alto
Km para el sustrato, indica que no depende de él pues solo lo utiliza cuando hay muy alta concentración del
mismo. Un ejemplo clásico es la Lactico deshidrogenada (LDH), que convierte el piruvato en lactato en ausencia
de oxígeno, y tiene 5 diferentes isoenzimas, con diferentes cadenas tipo M y H. LDH1(H4) en Miocardio; LDH2
(H3M) en cerebro, riñón y eritrocito; LDH3 (H2M2) en cerebro y leucocitos; LDH4 (HM3) y LDH5 (M4) en músculo
esquelético e hígado.
La H4 tiene alto Km para el ácido pirúvico y la M4 tiene bajo Km para este mismo sustrato. Esto significa
que el músculo esquelético está capacitado para soportar hipoxia o anaerobiosis transformando el piruvato en
lactato y en cambio el músculo cardíaco solo realiza la gucólisis en aerobiosis transformando el piruvato a CO2 y
H2O, en vez de lactato.