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Dialnet BiomoleculasEnNanotecnologia 6057638
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Biomoléculas en nanotecnología
Biomolecules in nanotechnology
Resumen
Las propiedades de reconocimiento molecular y autoensamble intrínseco de las biomoléculas han fascinado a
la nanotecnología. Su incursión está revolucionando la forma de fabricar nanomateriales. En este trabajo revisa-
mos un número de publicaciones que emplean biomoléculas en la fabricación de Nanomateriales.
Abstract
Molecular recognition and intrinsic self-assembly of biomolecules are the properties that have fascinated nano-
technology. The technology involved in the elaboration of nanomaterial revolutionized when those properties
were explored. In the present work, we review a set of selected publications referring to the use of biomol-
ecules in nanomaterials fabrication.
Forma sugerida de citar: Rodríguez Galván, José. 2011. Biomoléculas en nanotecnología. La Granja. Vol.13(1): 3-12.
ISSN: 1390-3799.
Propiedad NN Aplicación NN
Proceso N N
Estructura N0
Combinación
Estructura N1
de
Estructura NN propiedades
Nuevos
materiales
comenzado a explotar el autoensamble como herra- léculas para proveer diferentes funciones tales como
mienta para la fabricación de nuevas nanoestructuras. soporte mecánico y además de tener la habilidad de
Semejante a las estrategias de construcción que per- controlar algunos procesos bioquímicos, esta habili-
mitieron a los mayas construir maravillosas pirámides dad resulta de gran utilidad en la síntesis de nanoalam-
como la de KuKulKan uniendo solamente ladrillos, los bres metálicos (Buehler, 2009).
bionanotecnólogos emplean ladrillos naturales como Todas las biomoléculas tienen propiedades real-
DNA, proteínas, nucleótidos y péptidos para cons- mente interesantes (ya que han sido optimizadas a tra-
truir nanoestructuras como nanotubos para deposi- vés de millones de años) y su empleo en nanociencias
tar metales, nanovesículas para encapsular fármacos y no se restringe a un nivel de organización. En la Figura
nanofibras soporte para estimular el crecimiento de 1, se busca representar esta idea. Se pueden emplear
tejidos y minerales (Zhang, 2003). desde aminoácidos y nucleótidos hasta complejos mo-
Las biomoléculas resultan interesantes ya que leculares como cápsides virales para sintetizar nuevos
además de sus propiedades de reconocimiento mo- materiales. El ciclo inicia en el proceso (N0), el cual se
lecular intrínseco se caracterizan por ser robustas, refiere únicamente a la síntesis (trascripción y traduc-
tener adaptabilidad y multifuncionalidad. La robustez ción) que producirá una proteína con una estructura
se puede definir como el grado de separación entre (N0) que tendrá ciertas propiedades (N0), las cuales
funcionalidad y fallo de una biomolécula, por ejemplo, pueden ser explotadas para algunas aplicaciones (N0)
algunas enzimas no dejan de ser funcionales, a pesar en particular. Después si las propiedades de (N0) le
de tener algunas mutaciones que alteran su estructura permiten escalar al siguiente nivel jerárquico (N1), en
terciaria, esta característica resulta de utilidad debido otras palabras si le permiten asociarse con proteínas
a que las biomoléculas al interactuar con materiales semejantes o diferentes formarán la estructura N1
inorgánicos pueden sufrir cambios conformaciona- que contendrá las propiedades N1 y podrá emplearse
les. La adaptabilidad se refiere a la habilidad de una en algunas aplicaciones N1. El ciclo continuará a través
biomolécula para ajustarse a los cambios ambientales, de diferentes niveles jerárquicos N0 = 0 a n. La escala
modificando su arreglo estructural con la finalidad de sería la única limitante en los niveles jerárquicos del
ajustarse a las nuevas condiciones. Por último la mul- biomaterial en una aplicación, pues en su definición la
tifuncionalidad se refiere a la habilidad de las biomo- nanociencia plantea restricciones de escala. De igual
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6 Reseña bibliográfica / Review José Rodríguez Galván
forma existe la posibilidad de combinar diferentes La proteína ferritina fue uno de las primeras bio-
propiedades (niveles) para generar materiales com- moléculas que mostraron pueden ser explotadas para
plejos, por ejemplo, un número de investigaciones han sintetizar nanopartículas inorgánicas (Masaki, 2009).
mostrado que se pueden fabricar fotosistemas com- Las ferritinas son una clase de proteínas que se en-
plejos que captan fotones y los convierten directa- cuentran en todos los dominios de la vida, su prin-
mente en electrones, empleando complejos fotosin- cipal función es almacenar y secuestrar hierro. Éstas
téticos de plantas verdes y péptidos sintéticos como se componen de 24 monómeros que se ensamblan
detergentes (Zhang, 2005). para formar una caja con 12 nm de diámetro externo
y con una cavidad de 8 nm de diámetro interno en la
cual óxido de hierro puede ser capturado ver Figura
2(a). La composición de aminoácidos en la superficie
3. Aprovechando los materiales nativos de la cavidad le permite anclar iones metálicos, los
cuales formarán núcleos y partículas metálicas con un
Las biomoléculas que denominamos nativas ocurren tamaño controlable por el diámetro interior de la caja.
en sistemas biológicos a través del autoensamble de Siguiendo esta estrategia la proteína ferritina ha sido
moléculas cuya estructura es codificada por el geno- empleada para sintetizar partículas metálicas y magné-
ma de un organismo, por ejemplo; actina, tubulina, co- ticas de óxido de cobalto, óxido de hierro y óxido de
lágeno, fibras amiloideas, DNA, proteínas globulares, magnesio solo por mencionar algunos ejemplos, ver
cápsides de virus y fagos, entre otros. Esas biomolé- Figura 2(b). Por otro lado la proteína ferritina también
culas solo requieren ser aisladas y purificadas para se han empleado para decorar con partículas metáli-
usarse en combinación con moléculas orgánicas o in- cas la superficie externa de carbono de capa simple
orgánicas para fabricar nuevos materiales. En ocasio- (Whyburn, 2006).
nes la funcionalidad del material puede ser modificada De igual forma se han empleado plásmidos para
a través de la expresión específica de secuencia de anclar y organizar partículas metálicas. Un plásmido
aminoácidos por ingeniería genética pero, en general, es una molécula de DNA circular extracromosomal
la arquitectura del material queda intacta en gran me- capaz de replicarse independientemente en una bac-
dida. De igual forma se pueden fabricar estructuras teria huésped. Estas biomoléculas pueden ser sinteti-
(esféricas, tubulares y anillos) expresando proteínas zadas en grandes cantidades y adoptar una variedad
específicas, por ejemplo; la cápside icosaédrica de los de topologías como: relajadas, enrolladas lineales y
rotavirus se compone de las proteínas VP2, VP6,VP7 y circulares (toroidal), dependiendo de algunas condi-
VP4, sin embargo, si se expresa la proteína VP6 única- ciones químicas, como: temperatura, pH y fuerza ió-
mente, puede formar tubos o esferas con diámetros nica. Recientemente la topología circular (toroidal) ha
homogéneos (Rodríguez-Galván, 2008). sido empleada para formar nanopartículas de diferen-
El uso de fibras, tubos y anillos autoensambla- tes metales en forma de discos, Figura 2(c y d). La
dos de biomoléculas como plantillas para anclar y metodología que siguieron es realmente interesante.
organizar nanopartículas semiconductoras, metálicas, En resumen: se incubaron los plásmidos con sales de
magnéticas y cristales, para construir nanoalambres cobalto, níquel y oro. Para formar las partículas la so-
y arreglos es de particular interés en la industria de lución fue irradiada con luz UV. Con esta estrategia se
electrónicos. Las plantillas suaves han acaparado fuer- logró sintetizar partículas con forma de discos de di-
temente la atención ya que técnicas convencionales mensiones que corresponden con el diámetro interno
como la litografía se acercan a sus límites tanto teó- y altura de los plásmidos (Samson, 2009).
ricos como prácticos (McMillan, 2002). Esa aproxima- Uno de los primeros trabajos que mostraron
ción para construir nanoalambres y arreglos puede autoensambles de proteínas pueden servir para or-
arrojar dos productos, una vez que la plantilla orgánica ganizar nanopartículas metálicas fue el realizado por
ha sido removida un alambre / arreglo de partículas Andrew Mcmillan y colaboradores en 2002, quienes
inmovilizadas en una superficie puede ser obtenido. emplearon una plantilla cristalina de proteínas gené-
Por otro lado, se ha demostrado algunos materiales ticamente modificadas para organizar nanopartículas
híbridos, biomolécula-nanopartícula tienen nuevas metálicas y semiconductoras preformadas (Qds). Ellos
propiedades, pues se combinan ambas, las de las nano- emplearon la proteína TF55B, la cual se ensambla es-
partículas y las de la plantilla biológica y esto provoca pontáneamente en una estructura con forma de barril
tengan respuestas totalmente diferentes ya sea a uno llamada chaperonina, esta proteína resultó muy inte-
u otro material solo, lo cual incrementa su rango de resante, porque puede autoensamblarse en arreglos
aplicaciones (Tseng, 2006). cristalinos bidimensionales (2D). En primera instancia
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Biomoléculas en nanotecnología 7
a c e g
b d f h
Figura 2. Biomateriales empleados en bionanotecnología, a,b) ferritina, c,d) plásmido, e,f) chaperona, y g,h) virus M13. Imágenes
tomadas de Whyburn, 2008, Samson, 2009, McMillan, 2005, Nam, 2006 respectivamente.
Mcmillan y colaboradores modificaron genéticamente nocristales de oro. Sin embargo las cápsides virales
la proteína para incrementar su afinidad por partícu- han mostrado una superioridad sobre otros sistemas
las metálicas, esto lo lograron agregando residuos de (Whyburn, 2006). Por ejemplo, las cápsides del bacte-
cisteína que se proyectaban hacia el interior del barril riófago M13 resultaron ideales como plantillas para
y formaban una superficie rica en tioles, ver Figura organizar nanopartículas metálicas y magnéticas, ade-
2(e). Después incubaban los barriles modificados con más, su fácil modificación genética lo hace un sistema
partículas metálicas de oro o zinc. Lo que encontra- versátil para depositar cualquier clase de materiales
ron es que en la cavidad de los barriles se anclaban las orgánicos e inorgánicos. Actualmente con este siste-
partículas metálicas y además podían formar arreglos ma se ha dado un gran salto en el desarrollo de méto-
de partículas metálicas bien definidos y de grandes ex- dos de síntesis ambientalmente amigables, por ejemplo
tensiones, Figura 2(f). En trabajos posteriores repor- con el empleo de la luz ambiental como agente reduc-
taron que en los arreglos de chaperonina pueden nu- tor se han podido fabricar nanoalambres de plata. Este
clear y crecer partículas metálicas de níquel y cobalto. método imita el proceso de biomineralización donde
En general sus trabajos han demostrado que las pro- sistemas biológicos pueden sintetizar desde peque-
teínas pueden ayudar a generar arreglos de partículas ñas estructuras de silicio hasta complejos ecosistemas
metálicas los cuales son de gran valor para la industria como arrecifes coralinos. El equipo de la Dra. Ángela
de electrotécnicos (McMillan, 2002 y McMillan, 2005). Belcher son el grupo punta en la síntesis de nanoalam-
Diversos tubos o fibras se han explorado para bres. Por ejemplo ellos han sintetizado nanoalambres
formar nanoalambres, por ejemplo microtubulos, de cobalto, oro y un híbrido oro-cobalto, Figura 2 (g,
DNA, colágeno, cápsides virales, la región N-terminal h). Ellos toman ventaja de aminoácidos que tienen una
y región media de levadura (saccharomyces cerevisiae mayor afinidad por cobalto/oro y los expresan en las
Sup35p). Por ejemplo Thomas Scheibel y colabora- subunidades que forman la cápside del bacteriófago
dores emplearon fibras amiloideas (fibras insolubles M13, con esto incrementan la afinidad y la superficie
de proteína que son características de enfermedades efectiva donde se crecerán las partículas. La idea de
neurodegenerativas) como plantillas para alienar na- expresar aminoácidos con una afinidad por materiales
inorgánicos ha permitido anclar nanopartículas mag- diferentes partículas y se pueda tener un control so-
néticas, conductoras y semiconductoras a la superficie bre la relación.
de biomoléculas, esta estrategia ha permitido formar
una gran variedad de nanoalambres con un alto grado
de organización (Yoo, 2006, Nam, 2006, Nam, 2008).
Desde hace 10 años el trabajo seminal de T. Dou-
4. Diseñando materiales sintéticos
glas y colaboradores mostraron el virus del mosaico La formación de biomoléculas sintéticas ocurre in vi-
del tabaco podía ser empleado para anclar y organizar tro, a través del autoensamble de moléculas cuya es-
partículas metálicas (Masaki, 2007 y Evans, 2008). Ac- tructura (secuencia) es diseñada y programada por el
tualmente la fabricación de nanoalambres es un área hombre. Explotando el autoensamble intrínseco de
muy activa y cuenta con avances significativos, des- bases nitrogenadas y péptidos hoy en día se pueden
afortunadamente, hay muchos obstáculos por atrave- construir estructuras sintéticas, este tipo de arquitec-
sar para fabricar dispositivos electrónicos que utilicen turas son resultado de la convergencia de la nanotec-
los nanolambres. Por ejemplo, primero se requieren nología y biotecnología. Las estructuras se construyen
alambres homogéneos en sus propiedades electróni- programando la secuencia de los ladrillos, nucleótidos
cas, además que sean monodispersos y además se o aminoácidos. El DNA es una de las biomoléculas
debe contar con técnicas para ordenar los alambres más prometedores para generar patrones y arquitec-
en un arreglo deseado (circuitos electrónicos), por turas debido a su simplicidad (cuatro bases), su pre-
otro lado se debe contar con técnicas que permitan ciso reconocimiento molecular (A-T y G-C), gran ri-
decorar las plantillas biológicas con combinaciones de
Azulejo
b c d
Figura 3. Nanotecnología de DNA, (a) ensamblando azulejos, (b) se han podido generar estructuras como cubos, (c) tetraedros, y (d)
tubulares. Imágenes tomadas de Seeman, 2003; Goodman, 2005 y Aldaye, 2008, respectivamente.
gidez mecánica, una relativa estabilidad fisicoquímica, consiste de seis cadenas simples que se aparean para
síntesis sencilla y económica (Goodman, 2005). El ori- formar hélices dobles en cada eje, cada hélice forma
gen de esta aproximación data de inicios de los años una cara cuando se aparea con cuatro cadenas vecinas,
setenta, cuando la manipulación genética permitió for- por ejemplo, la cadena roja está unida a las cadenas
mar y unir moléculas de DNA con brazos adhesivos, verde, azul cielo, azul fuerte y rosa, e indirectamente
comúnmente denominadas azulejos (Seeman, 2003). unida a la amarilla, los bordes del cubo se forman por
Un brazo adhesivo es una cadena sencilla que sobre- hélices dobles (Seeman, 2003). Recientemente se ha
sale y sin aparear de un extremo de una doble hélice, generado un tetraedro de síntesis extremadamente
que puede aparearse con un extremo complementa- simple. El tetraedro consiste de triángulos rígidos de
rio de otros azulejos de DNA y formar un complejo hélices de DNA, unidos de forma covalente en los
molecular ver Figura 3(a). De gran importancia resulta vértices y bordes. Este se ensambla de cuatro cade-
que los extremos son programables, lo cual ofrece un nas cortas de DNA (Figura 4). Seis pares de dominios
control predecible de las asociaciones intermolecula- complementarios (se pueden identificar por los co-
res y geometría en el punto de cohesión, además las lores rojo, amarillo, azul, verde, negro y rosa) hibridan
bases otorgan una gran diversidad de combinaciones para formar los seis ejes de hélices dobles. En contras-
(Seeman, 2003). Algunas fascinantes nanoestructuras te a los métodos de síntesis de cubos y octaedros, la
2D/3D han sido creadas, por ejemplo enrejados 2D, síntesis es sencilla. Las cuatro cadenas son combinadas
y poliedros 2D y 3D. Interesantes revisiones se han en cantidades equimolares, la solución se calienta y
escrito sobre estas estructuras (Aldaye, 2008). enfría, después con enzimas se unen las cadenas en
Por otro lado se han sintetizado tubos, cubos, oc- los grupos fosfato. Este método de producción tiene
taedros y tetraedros empleando diferentes estrategias una eficiencia ~ 95%, mientras que en la estrategia que
ver Figura 3. Por ejemplo; cadenas sencillas son ligadas se empleó en la formación de cubos fue del ~ 1%, por
y forman anillos que se interconectan para crear es- lo cual hay una eficiencia superior en la estrategia del
tructuras parecidas a un cubo, ver Figura 3(b). El cubo tetraedro (Goodman, 2005).
a Cadenas de DNA
1 2 3 4
Calentar/Enfriar
Unión de extremos
Figura 4. (a) Representación del diseño de un tetraedro de DNA. (b) Imágenes de topografía de los tetraedros por microscopía de fuerza
atómica. Tomadas de Goodman, 2005.
Además del DNA los péptidos son biomolécu- II la secuencia es --++--++; en el módulo III, ---+++, y
las con un gran potencial en bionanotecnología. Los módulo IV, ----++++, de igual forma se pueden combi-
péptidos son secuencias de aminoácidos que consis- nar los módulos. Si se colocan aminoácidos con car-
ten de dos o tres a cientos de aminoácidos unidos gas complementarias a las mostradas en los módulos,
covalentemente. Resultan biomoléculas interesantes estos por complementaridad de carga podrán unirse,
debido a su simplicidad, diversa funcionalidad y ade- y controlando la interacción entre éstos se puede
más son fáciles de designar y sintetizar (Fung, 2004). obtener diversos materiales: se han podido formar
Actualmente el empleo de péptidos cortos (de 8 a nanofibras que, a su vez se organizan y forman hidro-
32 aminoácidos) ha permitido formar diversas ar- geles muy porosos con un alto contenido de agua,
quitecturas. Se han diseñado diferentes motivos superior al 99,5%, esos geles son muy parecidos a los
(Se denomina motivo a una secuencia particular de de agarosa y otros hidrogeles (Zhao y Zhang, 2006).
aminoácidos polares con carga positiva o negativa o Uno de los motivos más interesantes tiene la estruc-
no polares en un péptido) los cuales han permiti- tura como un lípido, ver Figura 5(b), este tiene una
do formar diferentes materiales, por ejemplo, fibras, cola hidrofóbica y una cabeza hidrofílica, por ejemplo,
tubos y esferas. Uno de los primeros péptidos en Vauthey y colaboradores (Fung, 2004) sintetizaron un
sintetizarse es el denominado “péptido lego” (Zhao y péptido de siete y ocho aminoácidos con una cola hi-
Zhang, 2006), ver Figura 5(a), el cual se ensambla por drofóbica conteniendo alanina, valina o leucina, y una
interacciones intermoleculares. La estructura es sim- cabeza hidrofóbica con ácido aspártico, ellos encon-
ple; se alternan varios aminoácidos para tener una traron que esos péptidos pueden ensamblarse en na-
cara hidrofílica y otra hidrofóbica, y en la cara hidro- notubos y nanovesículas de diámetros homogéneos,
fílica se alternan aminoácidos con carga positiva o de igual forma se han generado vesículas de múltiples
negativa. Se conocen diferentes formas de distribuir capas cambiando los aminoácidos del motivo. Esos
los aminoácidos cargados, a cada una se le denomina sistemas tienen el potencial para usarse como libe-
módulo, por ejemplo, módulo I, II, III, IV, etcétera, en radores de genes y fármacos además de ayudar en
el módulo uno la carga se distribuye alternando una el estudio de evolución molecular y en ingeniería de
carga negativa y una positiva, -+-+-+-+; en el módulo tejidos (Fung, 2004).
5 nm
2 nm
Figura 5. Motivos de péptidos, (a) péptido lego y (b) péptido como lípido. Imágenes tomadas de Zhang, 2003 y Zhao X. y Zhang S. 2006.
Litmus 28i
Inserto Transformación
Infección
Helper
Phage
Digestión Amplificación
Cultivo
Figura 6. Esquema que muestra la replicación in Vivo de nanoestructuras de DNA. Imagen tomada de Lina, 2008.
Evans, D.J. 2008. The bionanoscience of plant vi- Nam, K.T., Lee, Y.J., Krauland, E.M., Kottmann, S.T., Bel-
ruses: Templates and synthons for new cher, A.M. 2008. Peptide-mediated reduc-
materials. Journal of Materials Chemistry. 18 tion of silver ions on engineered biolo-
gical scaffolds. ACS Nano. 2 (7), 1480-1486.
(32), 3746-3754.
Rodríguez-Galván A., Heredia, A., Plascencia-Villa, G.,
Fung, S. Y., Hong, Y., Dhadwar, S. S., Zhao, X., Chen, P.
Ramírez, O. T., Palomares, L.A. y Basiuk, V. A.
2004. Handbook of Nanostructured Bio-
2008. Scanning Tunneling Microscopy of
materials and Their Applications en Na-
VP6 Viral Protein Self-Assembly into
nobiotechnology. Nalwa, H. S., Ed.; American
Nanotubes and Nanospheres. J. Scann.
Scientific Publishers: Stevenson Ranch, CA USA.
Probe. Microsc. 3, 25–31.
Goodman, R. P., Schaap, I. A.T.,Tardin, C. F. 2005. Rapid
Samson, J., Alessandro Varotto, Patrick C. Nahirney, Al-
Chiral Assembly of Rigid DNA Building
fredo Toschi, Irene Piscopo, y Charles Michael
Blocks for Molecular Nanofabrication.
Drain. 2009. Fabrication of Metal Nano-
Science. 310, 1661-1664.
particles Using Toroidal Plasmid DNA as
a Sacrificial Mold. ACS Nano. 3 (2), 339-344.
Lina, C., Rinkera, S., Xing Wangb, Yan Liua, Nadrian C.
Seeman, y Hao Y. 2008. In vivo cloning of ar- Seeman N. C. 2003. DNA in a material world. Na-
tificial DNA nanostructures. PNAS. 105 ture. 421,427-431.
(46),17626–17631.
Tseng, R. J.,Tsai, C., Ma, L., Ouyang, J., Ozkan, C., S., y Yang
Lindquist, S. 2003. Presentation at the Third Mul- Y. 2006. Digital memory device based on
tidisciplinary Workshop: Self-assembly of tobaco mosaic virus conjugated with na-
Peptides, Proteins in Biology Engineering noparticles. Nature nanotechnology. 1, 72-77.
and Medicine, Crete, Greece, August, 1–5.
Yoo, P.J., Nam, K.T., Qi, J., Lee, S.-K., Park, J., Belcher, A.M.,
Masaki Uchida, Michael T. Klem, Mark Allen, Peter Suci, Hammond, P.T. 2006. Spontaneous assembly
Michelle Flenniken, Eric Gillitzer, Zachary Varp- of viruses on multilayered polymer surfa-
ness, Lars O. Liepold, Mark Young, y Trevor D. ces. Nature Materials. 5 (3), 234-240.
2007. Biological Containers: Protein Ca-
ges as Multifunctional Nanoplatforms. Zhang S. 2005. Designing novel materials and
Adv. Mater. 19, 1025–1042. molecular machines, eJOURNAL USA,
Economic Perspectives. 22-26.
McMillan, R. A., Paavola, C. D., Howard, J., Chan, S. L.,
Zaluzec, N.J., Trent, J. D. 2002. Ordered na- Zhang S. 2003. Fabrication of novel biomaterials
noparticle arrays formed on engineered through molecular self-assembly. Nature
chaperonin protein templates. Nature Biotechnology. 21,1171-1178.
Materials. 1 (4), 247-252.
Zhao X. y Zhang S. 2006. Molecular designer self-
McMillan, R.A., Howard, J., Zaluzec, N.J., Kagawa, H.K., assembling peptides. Chem. Soc. Rev. 35,
Mogul, R., Li, Y.-F., Paavola, C.D., Trent, J. D. A. 1105–1110.