23/9/2019 D. Esfingolípidos E. Esteroides IV. COMPUESTOS CON NITRÓGENO A.

Aminoácidos

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64 SECCIÓN II ■ FUNDAMENTOS QUÍMICOS Y BIOLÓGICOS DE LA BIOQUÍMICA

O O

O CH 2 jefe R1 O CH 2 jefe R1

R2 C O CH O R2 C O CH O
CH 3
+
CH 2 OP O CH 2 CH 2 norte CH 3 CH 2 OP O-
CH 3 O-
O-
Colina
Fosfatidilcolina Ácido fosfatídico

HIGO. 5.19. Fosfoacilgliceroles. Los fosfolípidos que se encuentran en las membranas, como la fosfatidilcolina, tienen un grupo polar unido al fosfato.

D. esfingolípidos
Los esfingolípidos no tienen un esqueleto de glicerol; están formados por esfingosina
(Fig. 5.20). Sphingos ine se deriva de Ser ine y un ácido graso específico, palmitato.
Las amidas de cer son amidas formadas a partir de esfingosina uniendo un ácido graso al
grupo amino Varios esfingolípidos se forman uniendo diferentes grupos
Fosforilcolina
al grupo hidroxilo en ceramida. Como se refleja en los nombres de cerebr osides y
O
CH 3 Gangli ósidos , estos esfingolípidos contienen azúcares unidos al grupo hidroxilo de
+
Ceramida OP OCH 2 CH 2 norte CH 3 ceramida a través de enlaces glucosídicos. Son glucolípidos (más específicamente, gluco-
O-
CH 3 esfingolípidos). La esfingomielina , que contiene un grupo fosforilcolina unido a
ceramida, es un componente de las membranas celulares y la vaina de mielina alrededor de las neuronas.
Esfingomielina
E. esteroides

Galactosa
Los esteroides contienen una estructura de cuatro anillos llamada núcleo de esteroides (Fig. 5.21).
El colesterol es el precursor de esteroides en las células humanas de las cuales todos los esteroides
Ceramida Chica, muchacha, moza, niña, amiguita, criada, galón
Las hormonas se sintetizan mediante modificaciones en el anillo o la cadena lateral C-20. A pesar de que
Galactocerebrosida el colesterol no es muy soluble en agua, se convierte en soluble en agua anfipático
sales biliares como el ácido cólico. Las sales biliares recubren las superficies de las gotas de lípidos llamadas
micelas en la luz del intestino, donde mantienen las gotas emulsionadas en
Oligosacárido
El ambiente acuoso.
Ceramida Glc Gal GalNAc
El colesterol es uno de los compuestos sintetizados en el ser humano a partir de ramificados.
NANA unidades de cinco carbonos con un doble enlace llamado unidad de isoprenilo (ver Fig. 5.1A).
Las unidades de isoprenilo se combinan en largas cadenas para formar otras estructuras, como el
Gangliósido
cadenas laterales de coenzima Q en humanos y vitamina A en plantas. Se forman unidades de isopreno
polímeros para generar grupos gerenilo (10 carbonos) y grupos farnesilo (15 carbonos)
Sitio de azúcar agregada
(ver Capítulo 34). Los grupos gerenilo y farnesilo, debido a su alta hidrofobia
CH 2 OH
naturaleza, a menudo se unen covalentemente a las proteínas para permitir que las proteínas se asocien
HC NUEVA HAMPSHIRE
con membranas celulares
HC OH C O

CH (CH 2 ) n
IV. Compuestos que contienen nitrógeno
CH CH 3 El nitrógeno , como se describe en la Sección IB2, es un átomo electronegativo con dos
electrones no compartidos en su capa exterior de valencia. A pH neutro, el nitrógeno en
(CH 2 ) 12
Los grupos amino generalmente están unidos a otros cuatro átomos y tienen una carga positiva.
CH 3
Sin embargo, la presencia de un átomo de nitrógeno en un compuesto orgánico aumentará su
Ceramida solubilidad en agua, ya sea que el nitrógeno esté cargado o no.
HIGO. 5.20. Esfingolípidos, derivados de
A. aminoácidos
ceramida Se muestra la estructura de la ceramida.
en la parte inferior de la figura. La porción de Los aminoácidos son compuestos que contienen un grupo amino y un ácido carboxílico.
La ceramida que se muestra en rojo es la esfingosina. los grupo. En las proteínas, los aminoácidos son siempre L -aminoácidos (el grupo amino)
MNH y MOH fueron aportados por serina. está unido al carbono en la configuración L ) (Fig. 5.22). Estos mismos amino
Se añaden diferentes grupos al hidroxilo. los ácidos también sirven como precursores de compuestos que contienen nitrógeno en el cuerpo, como
grupo de ceramida para formar esfingomielina,
como fosfatidilcolina (ver Fig. 5.19) y son la base de la mayoría de los aminoácidos humanos
galactocerebrósidos y gangliósidos. NANA ,
Ácido N- acetilneuramínico, también llamado siálico metabolismo. Sin embargo, nuestras reacciones metabólicas ocasionalmente producen un amino.
ácido ; Glc , glucosa; Gal , galactosa; GalNAc , ácido que tiene un grupo - o -amino, como el neurotransmisor -aminobutírico
N- acetilgalactosamina. ácido (ver Fig. 5.22). Sin embargo, solo los L -aminoácidos se incorporan en

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CAPÍTULO 5 ■ ESTRUCTURAS DE LOS PRINCIPALES COMPUESTOS DEL CUERPO sesenta y cinco

21 22 24 26
CH 3 CH 2 CH 2 CH 3

20
CH 23
CH 2 CH
25
CH 3
CH 3 27 COO -
18 años
12 17
HO OH
11 13 dieciséis
C re
CH 3 14 15
19
1 99 C re C re
2 10 8
UNA si
3 55 77
44 66
UNA si UNA si
HO
HO OH HO

Colesterol Ácido cólico 17 -Estradiol

HIGO. 5.21 El colesterol y sus derivados. El núcleo de esteroides se muestra en el cuadro verde . La sal biliar, el ácido cólico y la hormona esteroide.
El 17-estradiol se deriva del colesterol y contiene la estructura del anillo de esteroides.

Qué características estructurales tienen en cuenta

proteínas Aunque los D- aminoácidos no suelen incorporarse a las proteínas en la vida
por las diferencias en la solubilidad
En organismos, cumplen muchas otras funciones en bacterias, como la síntesis de
de chole esterol , estra diol, y chol ic
enlaces cruzados en las paredes celulares.
ácido en el cuerpo? (Ver Fig. 5.21.)
B. Estructuras de anillo que contienen nitrógeno
1. PURINAS, PIRIMIDINAS Y PIRIDINAS

El nitrógeno también es un componente de las estructuras de anillo denominadas anillos heterocíclicos o

bases nitrogenadas Los tres tipos más comunes de anillos que contienen nitrógeno en el
cuerpo son pur ines (por ejemplo, aden ine ), pirimid ines (por ejemplo, thym ine ), y pirid ines (por ejemplo, la
vitaminas Nicot en ácido ic, también llamado niacina, y pyridox ine , también llamada vitamina B 6 )
(Fig. 5.23). El sufijo "-ine" denota la presencia de nitrógeno ( amina ) en el anillo. los
el uracilo de pirimidina es una excepción a este tipo general de nomenclatura. La utilidad de
Estas estructuras de anillo que contienen nitrógeno radica en la capacidad del nitrógeno para formar hidro-
gene enlaces y para aceptar y donar electrones mientras todavía forma parte del anillo. En contraste, el
anillo de benceno aromático no sustituido, en el que los electrones se distribuyen equitativamente entre
los seis carbonos (ver Fig. 5.1) son no polares, hidrófobos y relativamente poco reactivos.

2. NUCLEOSIDOS Y NUCLEOTIDOS

Las bases nitrogenadas forman nucleósidos y nucleótidos. Un nucleósido consiste en La gota de Lotta Topaigne es causada por

una base nitrogenada unida a un azúcar, generalmente ribosa o desoxirribosa, a través de un deposiciones de urato monosódico

Enlace N- glucosídico (ver Fig. 5.16). Si los grupos fosfato están unidos al azúcar, el cristales en la articulación de su dedo gordo. A

compuesto se convierte en un nucleótido. En nombre del nucleótido ATP, la adición de un pH de la sangre de 7.4, todo el ácido úrico tiene

la ribosa se indica mediante el cambio de nombre de adenina a aden osina (para la glicemia socia un protón para formar urato, que no es

c enlace osídico ). Se agrega monofosfato, difosfato o trifosfato al nombre para muy soluble en agua y forma cristales de

indica la presencia de uno, dos o tres grupos fosfato en el nucleótido. los Na + sal. En la orina más ácida generada

Se discuten las estructuras de los nucleótidos que sirven como precursores de ADN y ARN por el riñón, la forma ácida, ácido úrico, puede

con más detalle en la Sección 3 del Capítulo 12. precipitar para formar cálculos renales.

C O-

O O CH 2

CO - CO - CH 2
+ +
H3N CH H C NH 3 CH 2

+
CH 3 CH 3 NH 3

L-alanina D-alanina

HIGO. 5.22. La estructura de la alanina -aminoácida (tanto la configuración D como la L ), y

el -aminoácido -aminobutirato.

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66 SECCIÓN II ■ FUNDAMENTOS QUÍMICOS Y BIOLÓGICOS DE LA BIOQUÍMICA

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Purinas Pirimidina Piridina

NH 2 O O O
C norte C norte C C
66 44
norte
1 5 5C
77 HN C HN 3 5 5C CH 3
8 CH
OH
CH
2 44 99 2 66
HC 3 C C C C 1 CH +
norte H2N norte O
norte norte norte norte
H H
H H
Adenina (A) Guanina (G) Timina (T) Ácido nicotínico

HIGO. 5.23 Las bases nitrogenadas.

El colesterol está compuesto casi 3. TAUTOMEROS

enteramente de grupos MCH 2 y es
En muchos de los anillos que contienen nitrógeno, el hidrógeno puede cambiar para producir un
por lo tanto insoluble en agua. Estradiol
tautómero, un compuesto en el que el hidrógeno y los dobles enlaces han cambiado
también es relativamente insoluble en agua. Sin embargo,
posición (es decir, MNFCMOH → MNHMCFO) (Fig. 5.24). Los tautómeros son contra
el ácido cólico contiene un carboxilo hidrofílico
echó a un lado el mismo compuesto, y la estructura puede representarse de cualquier manera.
grupo y tres grupos hidroxilo. Como se muestra
En general, una forma tautomérica es más reactiva que la otra. Por ejemplo, en
las líneas discontinuas , los tres grupos hidroxilo todos
Las dos formas tautoméricas de ácido úrico, un protón puede disociarse de la forma enólica
acostarse en un lado de la molécula, creando así un
para producir urato.
superficie hidrofílica

V. RADICALES GRATUITOS
Compuestos que no pueden ser oxidados Los radicales son compuestos que tienen un solo electrón, generalmente en un orbital externo. Gratis
como los combustibles en el ser humano son a menudo
Los radicales son radicales que existen independientemente en solución o en un entorno lipídico.
excretado en la orina. Modificación química Aunque muchas enzimas generan radicales como intermedios en las reacciones, estas son
Las infecciones a menudo ocurren en el hígado, los riñones u otros
No suele liberarse en la célula para convertirse en radicales libres.
tejidos que inactivan o desintoxican los químicos, Muchos de los compuestos en el cuerpo pueden convertirse en radios libres
hacerlos más solubles en agua, o de otro modo alquitranado Cal por eventos naturales que eliminan uno de sus electrones, o por radiación. Radiación,
obtener tales moléculas para su excreción. Ácido úrico, el por ejemplo, disocia el agua en el átomo de hidrógeno y el radical hidroxilo:
base del dolor de Lotta Topaigne , se excreta en el
H 2 O ↔ H • + OH •
orina (ver Fig. 5.24). A juzgar por la similitud en
estructura, ¿crees que se deriva de la deg- En contraste, el agua normalmente se disocia en un protón y la carga negativa
radación de purinas, pirimidinas o piridinas? ion hidroxilo El radical hidroxilo forma radicales orgánicos al tomar un electrón
(como H •) de un compuesto como un lípido de membrana insaturado, que luego tiene un
solo electrón no apareado y es un nuevo radical.
Los radicales libres no son solo esotéricos Los compuestos que son radicales pueden escribirse con o sin el radical
reactivos ellos son los agentes de demostración. Por ejemplo, dióxido de nitrógeno, un potente, reactivo, tóxico radical pres-
muerte celular y destrucción. Son ent en el smog y el humo del cigarrillo, pueden designarse en literatura médica y literaria
involucrado en todos los estados de enfermedad crónica (por ejemplo, coro- NO 2 en lugar de NO 2 •. Superóxido , un radical producido en la célula y que
tura como
enfermedad de la arteria naria, diabetes mellitus, artritis, es la fuente de mucha destrucción, está escrito correctamente como el anión superóxido,
J
y enfisema), así como lesiones agudas (p. ej., O 2 . Sin embargo, para enfatizar su naturaleza de radicales libres, el mismo compuesto es
radiación, derrames cerebrales, infarto de miocardio y espiga tiempos escritos como O J •. Si un compuesto se designa como radical en la medicina
2
lesión del cordón nal). A través de la defensa de los radicales libres
literatura, puede estar seguro de que es un radical reactivo y de que es radical
mecanismos en nuestras células, a menudo podemos restringir elLa naturaleza es importante para la fisiopatología en discusión. Oxígeno reactivo
daño atribuido al proceso de envejecimiento "normal". y los radicales libres que contienen nitrógeno se analizan con más detalle en el Capítulo 24.

O OH OH
H p K 5.4
C norte C norte C norte
H+
HN C norte C norte C
CO CO H CO -
CO C HO C C HO C C
norte norte norte norte norte norte
H H H H

Ácido úrico Ácido úrico Urate

(forma ceto) (forma enol)

HIGO. 5.24. Tautómeros de ácido úrico. La forma tautomérica afecta la reactividad. La forma enol disocia un protón para formar urato.

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CAPÍTULO 5 ■ ESTRUCTURAS DE LOS PRINCIPALES COMPUESTOS DEL CUERPO 67

El ácido úrico contiene dos anillos y

COMENTARIOS CLINICOS
es similar a las purinas adenina
Dianne Abietes. La gravedad de los signos y síntomas clínicos en y guanina (la adenina se muestra en
Fig. 5.23). De hecho, es la excreción urinaria.
pacientes con cetoacidosis diabética (CAD), como Di Abietes , son correctos
producto formado por la oxidación de estos dos
relacionado directamente con la concentración de cuerpos cetónicos en la sangre. Directo
bases de purina No es muy soluble en agua.
los métodos cuantitativos para medir acetoacetato y -hidroxibutirato no son
particularmente si el pH está cerca del p K a de su ácido
rutinariamente disponible. Como resultado, los médicos suelen confiar en reactivos semicuantitativos

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tiras (Ketostix; Bayer Diagnostics, Mishawaka, Indiana) o tabletas (Acetest; Bayer Grupo MOH. Si está presente en cantidades excesivas,
el urato de sodio tiende a precipitar en las articulaciones,
Diagnostics, Mishawaka, Indiana) para estimar el nivel de acetoacetato en la sangre
causando el dolor severo de gota experimentado
y la orina El nitroprusiato en las tiras y en las tabletas reacciona con ace-
por la Sra . Topaigne .
toacetato y en menor grado con acetona (los cuales tienen grupos cetona)
pero no reacciona con -hidroxibutirato (que no tiene un grupo cetona).
- El hidroxibutirato es el cuerpo de cetona predominante presente en la sangre de un paciente.
en DKA, y su concentración podría disminuir a un ritmo desproporcionadamente rápido La prueba de reducción de azúcar. los

comparado con el de acetoacetato y acetona. Por lo tanto, las pruebas que emplean el nitroprus- prueba de azúcar reductora se utilizó para

La reacción secundaria para controlar el éxito de la terapia en un paciente así puede ser engañosa. detección de azúcar en la orina por mucho tiempo
antes de ensayos enzimáticos específicos para glucosa
En contraste con la dificultad de las mediciones corporales de cetonas, los pacientes diabéticos pueden
autocontrol de los niveles de glucosa en sangre en el hogar, lo que disminuye notablemente el tiempoyyla galactosa se hizo disponible. En esta prueba
gasto de las muchas determinaciones de glucosa en sangre que necesitan. Sangre obtenida de el grupo aldehído de azúcar se oxida como

Se coloca un pinchazo en la almohadilla de una tira de plástico. La tira ha sido impregnada dona electrones al cobre; el cobre

con una enzima (generalmente la enzima bacteriana glucosa oxidasa) que específicamente con- se reduce y produce un color azul.

vierte la glucosa en la sangre a un compuesto oxidado (gluconato) y reducido En solución alcalina, azúcares ceto (p. Ej., Fructosa)

(peróxido de hidrógeno, H 2 O 2 ). El H 2 O 2 reacciona con un colorante para producir un color. los también reaccionan en esta prueba porque forman tau-
intensidad del color, que es directamente proporcional a la concentración de glucosa Tomers que son aldehídos. Estructuras de anillo de

en la sangre del paciente, se lee en un instrumento llamado monitor de glucosa en sangre . los azúcares también reaccionan pero solo si el anillo puede abrirse
(es decir, no está unido a otro compuesto
Lotta Topaigne. La Sra. Topaigne tiene artritis gotosa aguda (podagra) a través de un enlace glucosídico). Hasta una prueba específica
para que la fructosa esté disponible, un congénito
involucrando su dedo gordo del pie derecho. Microscopía de luz polarizada del líquido aspirado.
ed desde el espacio articular mostró cristales de urato monosódico fagocitados enfermedad que resulta en la presencia de fructosa

por glóbulos blancos. La presencia de los cristales de urato relativamente insolubles dentro del en la orina está indicado por una reducción positiva

El espacio articular activa una cascada inflamatoria que conduce a los componentes clásicos de prueba de azúcar y resultados negativos en el específico

inflamación articular (dolor, enrojecimiento, calor, hinchazón y limitación del movimiento articular). Ensayos enzimáticos para glucosa o galactosa.

COMENTARIOS BIOQUIMICOS

Hidrocarburo Aromático Clorado Ambiental

Toxinas Como resultado del esfuerzo humano, los compuestos tóxicos que contienen clo-
Los anillos de benceno rinados se han distribuido ampliamente en el medio ambiente. los
pesticida DDT (dicloro-difenil-tricloroetano) y la clase de químicos llamados
Las dioxinas proporcionan ejemplos de hidrocarburos aromáticos clorados y relacionados estructuralmente.
compuestos que son muy hidrófobos y poco biodegradables (Fig. 5.25). Como una
secuencia de su persistencia y lipofilia, estos productos químicos se concentran en el
tejido adiposo de peces, aves que se alimentan de peces y mamíferos carnívoros, incluidos los humanos.
El DDT, un bifenilo clorado, fue ampliamente utilizado en los Estados Unidos como una hierba.
cide entre las décadas de 1940 y 1960 (ver Fig. 5.25). Aunque no se ha utilizado en
Este país desde 1972, los anillos de benceno clorados son resistentes a la biodegradación
ción, y el suelo y el agua de EE. UU. todavía están contaminados con pequeñas cantidades. DDT sigue siendo
utilizado en otras partes del mundo. Porque esta molécula altamente lipofílica se almacena
en la grasa de los animales, los organismos acumulan cantidades progresivamente mayores de DDT
en cada etapa sucesiva de la cadena alimentaria. Aves que comen peces, uno de los organismos
en la parte superior de la cadena alimentaria, han disminuido en la población debido al efecto de
DDT en el grosor de sus cáscaras de huevo. El DDT no es tan tóxico en los humanos,
aunque la exposición a largo plazo o la exposición a dosis altas pueden causar neutrones reversibles
síntomas rológicos, efectos hepatotóxicos o cáncer.

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68 SECCIÓN II ■ FUNDAMENTOS QUÍMICOS Y BIOLÓGICOS DE LA BIOQUÍMICA

Las dioxinas, específicamente las clorodibenzo- p -dioxinas (CDD), constituyen otra clase
H
de toxinas ambientales que actualmente son de gran preocupación (ver Fig. 5.25). Ellos
Cl C Cl
se han medido a lo que se denomina niveles de fondo en la sangre, el tejido adiposo
CCl 3 demandar y la leche materna de todos los humanos probados. Los CDD se forman como un subproducto durante
DDT
la producción de otros compuestos clorados y herbicidas, y de la cloración
proceso de blanqueo por vía utilizada por fábricas de pulpa y papel. Se lanzan durante el
incineración de residuos industriales, municipales y domésticos y durante la combustión
Cl
O
Cl de combustibles fósiles y se encuentran en el humo del cigarrillo y el escape de los motores, que
quemar gasolina y diesel. También se pueden formar a partir de la combustión de
Cl
O
Cl materia orgánica durante incendios forestales. Entran en la atmósfera como partículas,
Chlorodibenzo- p dioxina
se vaporizan y pueden extenderse grandes distancias para ingresar al suelo y al agua.
Como humanos en la parte superior de la cadena alimentaria, hemos adquirido nuestro nivel de fondo.
HIGO. 5.25 Toxinas ambientales. Dicloro
de dioxinas principalmente a través del consumo de alimentos, principalmente carne, lácteos
diphenyl-trichloroethane (DDT) es miembro
productos y pescado. Una vez en el cuerpo humano, las dioxinas se almacenan en la grasa humana y
de una clase de hidrocarburos aromáticos que con-
contiene dos anillos de benceno (fenilo) clorados tejido adiposo y tienen una vida media promedio de aproximadamente 5 a 15 años. Ellos
unidos por una molécula de etano clorado. no reaccionan, se degradan poco y no se convierten fácilmente en más solubles en agua

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Los clorodibenzo- p -dioxinas (CDD) están relacionados
clase de más de 75 hidrocarburos clorados
que todos contienen un dibenzo- p -dioxin (DD) mol-
ecule que comprende dos anillos de benceno unidos a través de
dos puentes de oxígeno en carbonos adyacentes en cada
de los anillos de benceno El compuesto 2,3,7,8-
tetraclorodibenzo- p- dioxina, mostrada anteriormente,
es uno de los más tóxicos y más extensos
estudió. Los dibenzofuranos clorados (CDF) son
estructural y toxicológicamente relacionados.
La acumulación de DDT en adi-
pose tejido puede ser protector en el
humano porque disminuye la
cantidad de DDT disponible para pasar a través de
membranas lipídicas polares para llegar a las neuronas en el
cerebro o pasar a través de las membranas placentarias para
llegar al feto Finalmente, convertimos DDT a
más metabolitos polares que se excretan en el
orina. Sin embargo, algunos pueden pasar con lípidos a
La leche materna de las madres lactantes.
La mayor parte de lo que se sabe sobre el
toxicidad de dioxinas en el ser humano
proviene de individuos expuestos
incidental o crónicamente a niveles más altos
(por ejemplo, accidentes industriales o presencia en áreas
rociado con Agente Naranja u otros herbicidas
compuestos que pueden excretarse en la orina. Se excretan lentamente en la bilis.
y las heces, y junto con los lípidos ingresan a la leche materna de las madres lactantes.
Conceptos clave
• Los carbohidratos, comúnmente conocidos como azúcares, se pueden clasificar por varios criterios:
Tipo de grupo carbonilo (azúcares aldo o ceto)
Número de carbonos (pentosas [cinco carbonos], hexosas [seis carbonos])
Posiciones de grupos hidroxilo en átomos de carbono asimétricos ( configuración D o L , estereoisómeros,
epímeros)
Sustituyentes (amino azúcares)
Número de monosacáridos unidos mediante enlaces glucosídicos (disacáridos, oligosacáridos,
polisacáridos)
• Los lípidos son compuestos estructuralmente diversos que no son muy solubles en agua (es decir, son
hidrofóbico).
Los principales lípidos son los ácidos grasos.
El triacilglicerol (triglicéridos) consta de tres ácidos grasos esterificados con el carbohidrato glicerol.
Los fosfoacilgliceroles (fosfoglicéridos o fosfolípidos) son similares al triacilglicerol pero
contienen un fosfato en lugar de un ácido graso.
Los esfingolípidos se basan en la esfingosina.
El colesterol es un componente de las membranas y un precursor de las moléculas que contienen el esteroide.
núcleo, como sales biliares y hormonas esteroides.
• El nitrógeno se encuentra en varios compuestos además de los azúcares amino.
Los aminoácidos y los anillos heterocíclicos contienen nitrógenos, que tienen una carga positiva a pH neutro.
Los aminoácidos contienen un grupo carboxilo, un grupo amino y una cadena lateral unida a una central
carbón.
Las proteínas consisten en una cadena lineal de aminoácidos.
Las purinas, pirimidinas y piridinas tienen estructuras de anillo que contienen nitrógeno heterocíclico.
Los nucleósidos consisten en un anillo heterocíclico unido a un azúcar.
Un nucleósido más fosfato es un nucleótido.
• Las glicoproteínas y los proteoglicanos tienen azúcares unidos a los componentes proteicos.
• Las enfermedades discutidas en este capítulo se resumen en la Tabla 5.1.
Tabla 5.1 Enfermedades discutidas en el Capítulo 5

contaminado con dioxinas). La dosis más baja Trastorno o Genética o

los efectos probablemente están asociados con el timo Condición Ambiental Comentarios

atrofia y disminución de la respuesta inmune,
cloracne y lesiones cutáneas relacionadas, y neo-
Plasia (cáncer). Las dioxinas pueden cruzar al
placenta para causar desarrollo y reproducción
efectos ductivos, disminución del crecimiento prenatal,
y mortalidad prenatal.
Gota Ambos Puede deberse a mutaciones en proteínas específicas, o
Hábitos dietéticos. Conduce a una acumulación de ácido úrico en
la sangre.
Diabetes tipo 1 Ambos El manejo apropiado de la diabetes tipo 1 requiere
inyecciones de insulina y monitoreo frecuente de sangre
niveles de glucosa a lo largo del día. Sin tal
monitoreo cuidadoso, los cuerpos cetónicos pueden ser
producido inapropiadamente.

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CAPÍTULO 5 ■ ESTRUCTURAS DE LOS PRINCIPALES COMPUESTOS DEL CUERPO 69

PREGUNTAS DE REVISIÓN — CAPÍTULO 5

Seleccione la mejor respuesta para cada una de las siguientes preguntas:
iones Base sus respuestas en su conocimiento de la nomenclatura.
No necesita reconocer ninguna de las estructuras que se muestran para responder A. A través de múltiples enlaces de hidrógeno entre dos
las preguntas.
1. ¿Cuál de las siguientes es una característica universal de
compuestos orgánicos solubles en agua?
A. Están compuestos de átomos de carbono e hidrógeno.
B. Deben contener un grupo que tenga un total negativo
cargar.
C. Deben contener un grupo que tenga un total positivo
cargar.
D. Contienen grupos polares que pueden formar enlaces de hidrógeno.
con agua.
E. Contienen grupos aromáticos.
2. Un paciente fue ingresado en la sala de emergencias del hospital.
En coma. Las pruebas de laboratorio encontraron altos niveles de
libra que se muestra a continuación en su sangre:
CH 2 OHMCH 2 MCH 2 MCOO J
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que se describe mejor como un enlace formado a través de cuál de los
¿siguiendo?
moléculas de azúcar
B. Entre el carbono anomérico de un azúcar y un
OMH (o N) de otra molécula
C. Entre dos carbonos anoméricos en polisacáridos.
D. Formación de enlaces internos entre los anoméricos.
carbono de un monosacárido y su propio quinto carbono
Grupo hidroxilo
E. Entre el carbono que contiene el aldol o ceto
grupo y el -carbon del azucar
4. Un paciente fue diagnosticado con una hipertrigliceridemia. Esta
esta condición se llama así por los altos niveles de lípidos en la sangre
¿Cuál de las siguientes plantea?
A. Tres grupos acilo grasos unidos a un glicerol
columna vertebral
B. Un lípido de glicerol que contiene un grupo fosforilcolina.
C. Un esfingolípido que contiene tres grupos acilo grasos.
D. Tres restos de glicerol unidos a un ácido graso
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23/9/2019 D. Esfingolípidos E. Esteroides IV. COMPUESTOS CON NITRÓGENO A. Aminoácidos
Sobre la base de su estructura (y su conocimiento de la
nomenclatura de grupos funcionales), identifica la comunidad
libra como cuál de los siguientes?
A. Metanol (alcohol de madera)
B. Etanol (alcohol)
C. Etilenglicol (anticongelante)
D.-Hidroxibutirato (un cuerpo de cetona)
E. -Hidroxibutirato (la droga de "violación de fecha")
3. Un paciente fue diagnosticado con una deficiencia del liso.
enzima somal-glucosidasa. El nombre del deficiente.
enzima sugiere que hidroliza un enlace glucosídico,
Página 7
6 aminoácidos en proteínas
El código genético es la secuencia.
de tres bases (nucleótidos) en el ADN
que contiene la información para el
secuencia lineal de aminoácidos en un polipéptido
cadena de mareas (su estructura primaria). Un gen es el
porción de ADN que codifica un producto funcional
uct, como una cadena de polipéptidos. Mutaciones ,
que son cambios en los nucleótidos en un
gen, resulta en un cambio en los productos de ese
gen que puede ser heredado. La enfermedad heredada
aliviar la anemia de células falciformes, por ejemplo, es causada
por una mutación en el gen que codifica uno de
Las subunidades de la hemoglobina. La hemoglobina es el
proteína presente en los glóbulos rojos que revierte
Se une de manera flexible al O 2 y lo transporta a los tejidos. los
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E. Tres restos de gluceraldehído unidos a un ácido graso
5. Un paciente fue diagnosticado con uno de los tipos de esfinge
golipidosis, que son enfermedades congénitas que involucran
incapacidad para degradar los esfingolípidos. Todos los esfingolípidos tienen
en común, ¿cuál de los siguientes?
A. Una columna vertebral de glicerol
B. ceramida
C. Fosforilcolina
D. Ácido N- acetilneuramínico (NANA)
E. Una estructura de anillo de esteroides en la que se encuentra la esfingosina.
adjunto
Las proteínas tienen muchas funciones en el cuerpo. Sirven como transportadores de hidro-
compuestos fóbicos en la sangre, como moléculas de adhesión celular que unen las células a
entre sí y hacia la matriz extracelular, como hormonas que transportan señales de
un grupo de células a otro, como canales iónicos a través de las membranas lipídicas, y
como enzimas que aumentan la velocidad de las reacciones bioquímicas. La característica única
Las características de una proteína están dictadas por su secuencia lineal de aminoácidos, denominada
Su estructura primaria . La estructura primaria de una proteína determina cómo puede
pliegue y cómo interactúa con otras moléculas en la célula para realizar su función.
Las estructuras primarias de todas las diversas proteínas humanas se sintetizan a partir de
20 aminoácidos dispuestos en una secuencia lineal determinada por el código genético.
Propiedades generales de los aminoácidos. Cada uno de los aminoácidos utilizados para
La síntesis de proteínas tiene la misma estructura general (Fig. 6.1A). Contiene
un grupo de ácido carboxílico , un grupo amino unido al carbono en un
L- configuración , un átomo de hidrógeno y un grupo químico llamado cadena lateral
eso es diferente para cada aminoácido. En solución, a pH fisiológico, el libre
los aminoácidos existen como zwitteriones , iones en los que el grupo amino es positivamente
cargado, y el grupo carboxilato está cargado negativamente (ver Fig. 6.1B). En
proteínas, estos aminoácidos se unen en polímeros lineales llamados polipéptidos
cadenas a través de enlaces peptídicos entre el grupo ácido carboxílico de uno
aminoácido y el grupo amino del siguiente aminoácido.
Clasificación de los aminoácidos según las propiedades químicas de
Cadenas laterales . Las propiedades químicas de la cadena lateral determinan los tipos.
de enlaces e interacciones que cada aminoácido en una cadena de polipéptidos puede hacer
con otras moléculas Por lo tanto, los aminoácidos a menudo se agrupan por la polaridad de la
6/14
23/9/2019 D. Esfingolípidos E. Esteroides IV. COMPUESTOS CON NITRÓGENO A. Aminoácidos
La proteína de hemoglobina adulta (HbA) comprende cuatro
cadenas de polipéptidos, 2 y 2. El y
Las subunidades difieren en la estructura primaria (es decir,
tener diferentes secuencias de aminoácidos y
están codificados por diferentes genes). Célula falciforme
la anemia es causada por un solo nucleótido muta-
ción en el ADN que cambia solo un aminoácido
en las cadenas de hemoglobina de un glutámico
ácido a una valina.
70
cadena lateral ( cargada , no polar hidrofóbica o polar sin carga ) o por estructura
características turales ( alifáticas , cíclicas o aromáticas ). Las cadenas laterales de lo no polar
aminoácidos hidrofóbicos (alanina, valina, leucina, isoleucina, fenilalanina,
y metionina) se agrupan para excluir el agua en el efecto hidrofóbico .
Los aminoácidos polares no cargados (serina, treonina, tirosina, asparagina,
y glutamina) participan en enlaces de hidrógeno .
La cisteína, que contiene un grupo sulfhidrilo, forma enlaces disulfuro . los
cargadas negativamente ácidos aminoácidos (aspartato y glutamato) forma iónica
( electrostática ) se une con moléculas cargadas positivamente, como el amino básico
ácidos (lisina, arginina e histidina). La carga en el aminoácido en un par-
El pH ticular está determinado por el pK a de cada grupo que tiene un protón disociable.
Sustituciones de aminoácidos en la estructura primaria. Mutaciones en el
El código genético da como resultado proteínas con una estructura primaria alterada . Mutaciones
resultando en sustituciones de aminoácidos individuales puede afectar el funcionamiento de un pro-
Tein o puede conferir una ventaja específica a un tejido o un conjunto de circunstancias.
Muchas proteínas, como la hemoglobina , existen en la población humana como
polimorfismos (variaciones genéticamente determinadas en la estructura primaria).
Dentro del mismo individuo, la estructura primaria de muchas proteínas varía
con la etapa de desarrollo y está presente en las isoformas fetales y adultas , como
como hemoglobina fetal (HbF) y hemoglobina adulta (HbA). La estructura primaria
La duración de algunas proteínas, como la creatina quinasa (CK), también puede variar entre

Página 8

CAPÍTULO 6 ■ AMINOÁCIDOS EN PROTEÍNAS 71

UNA
tejidos ( isoenzimas específicas de tejido ) o entre ubicaciones intracelulares en el Carboxilo
COO -
mismo tejido La separación electroforética de isoenzimas específicas de tejido ha sido grupo
Aminado +
útil en medicina como un medio para identificar el sitio del tejido de la lesión. grupo
H3N C H
Aminoácidos modificados. Además de los aminoácidos codificados por el ADN que -Carbón
R
forman la estructura primaria de las proteínas, muchas proteínas contienen aminoácidos específicos
Lado
ácidos que han sido modificados por fosforilación , oxidación , carboxilación o cadena
Otras reacciones. Cuando estas reacciones son catalizadas por enzimas, se refieren
como modificaciones postraduccionales .

si
COOH
+
H3N C H

LA SALA DE ESPERA pK 2 H+
˜
Will Sichel es un niño de 17 años que acudió a la sala de emergencias del hospital. COO -
con dolor severo en la parte baja de la espalda, el abdomen y las piernas, que comenzó después de +
H3N C H
Una historia de 2 días de náuseas y vómitos causados por gastroenteritis. Él era
diagnosticado con anemia de células falciformes a la edad de 3 años y había sido admitido R

al hospital en numerosas ocasiones por crisis similares de células falciformes vasooclusivas.

Al ingreso, el nivel de hemoglobina del paciente en sangre venosa periférica fue pK 9-10 H+

7.8 g / dL (rango de referencia 12 a 16 g / dL). El hematocrito o volumen celular empaquetado

˜
COO -
(el porcentaje del volumen total de sangre formado por glóbulos rojos) fue
23.4% (rango de referencia 41% a 53%). Su nivel de bilirrubina total en suero (un pigmento H2N C H

derivado de la degradación de la hemoglobina) fue de 2.3 mg / dL (rango de referencia 0.2 a 1.0 R

mg / dL). Una radiografía de su abdomen mostraba cálculos radioopacos en su vesícula biliar.
HIGO. 6.1. A. Estructura general del amino.
Con la hemólisis crónica (destrucción de glóbulos rojos), la cantidad de hemo se degrada
ácidos encontrados en proteínas. B. Disociación de
A la bilirrubina se aumenta. Estas piedras son el resultado de la excreción crónica de los grupos -carboxilo y -amino de amino
cantidades excesivas de bilirrubina desde el hígado hacia la bilis, lo que lleva a bilirrubinato ácidos A pH fisiológico (7), una forma en la que
Deposición de cristales en la luz de la vesícula biliar. los grupos -carboxilo y -amino son
predomina la carga. Algunos aminoácidos también
tienen grupos ionizables en sus cadenas laterales.
Cal Kulis es un niño de 18 años que fue llevado al hospital por su
madre debido a la aparición repentina de dolor severo en el costado izquierdo, radiante
ing alrededor de su lado izquierdo hacia su área púbica. Su orina era de color marrón rojizo.
El término cálculo se usa para describir
en color, y un análisis de orina mostró la presencia de muchos glóbulos rojos. Cuando su
cualquier concreción anormal (concreto-
la orina se acidificó con ácido acético, grupos de cristales planos hexagonales transparentes de
como precipitado) de sales minerales.
Se notó cistina. Una radiografía de su abdomen mostró cálculos radiopacos (cálculos)
Estos casi siempre se forman dentro de la cavidad de
en ambos riñones No hubo antecedentes familiares de enfermedad de cálculos renales.
un órgano hueco, como el riñón (riñón o
cálculos renales) o la luz de un conducto (p. ej.
Di Abietes , que tiene diabetes mellitus tipo 1, se estaba subcutando
piedras del conducto biliar).
inyecciones neosas de insulina (insulina regular / NPH de res) varias veces al día

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23/9/2019 D. Esfingolípidos E. Esteroides IV. COMPUESTOS CON NITRÓGENO A. Aminoácidos
después de que se diagnosticara su enfermedad por primera vez (véanse los capítulos 4 y 5). Después,
su médico la cambió a insulina humana sintética. En esta visita, su médico
cambió su terapia de insulina y escribió una receta para Humalog mix 75/25 (Eli El término angina describe un flechazo

Lilly, Indianápolis, Indiana), una mezcla de Humalog en suspensión de protamina y ing o dolor compresivo. El termino

insulina unida Humalog (25%). la angina de pecho se usa cuando esto

el dolor se encuentra en el centro del cofre o

Ann Jeina es una mujer de 54 años que mide 68 y pesa 198 lb. región pectoral, a menudo irradiando al cuello o

Tiene antecedentes de hipertensión arterial y colesterol sérico elevado. brazos. El mecanismo más común para el

niveles. Después de una acalorada discusión con un vecino, la Sra. Jeina experimentó El último síntoma es una disminución del suministro de oxi

una "banda de dolor apretada como presión" en su pecho, asociada con la falta de gen al músculo cardíaco causado por el ateroscle-

respiración, sudoración y sensación de mareo. enfermedad de la arteria coronaria rotativa, que resulta en
obstrucción de los vasos que irrigan arterias
Después de 5 horas de dolor intermitente en el pecho, fue al departamento de emergencias del hospital.
ment, donde su electrocardiograma mostró cambios consistentes con un infarto agudo sangre al músculo cardíaco.

Página 9

72 SECCIÓN II ■ FUNDAMENTOS QUÍMICOS Y BIOLÓGICOS DE LA BIOQUÍMICA

de la pared anterior de su corazón. Fue ingresada en la unidad de cuidados cardíacos. La sangre era
enviado al laboratorio para diversas pruebas, incluido el nivel total de creatina quinasa (CK),
troponina T cardíaca (TnT) y la fracción MB (“músculo-cerebro”) de CK en la sangre.

I. ESTRUCTURA GENERAL DE LOS AMINOÁCIDOS

La bilirrubina es un producto de degradación.
de hemoglobina, y sus niveles son
elevado en Will Sichel . Bilirrubina
puede estar presente en suero conjugado a
ácido glucurónico (que está determinado por el
medición directa) o gratuita (que es muy
hidrofóbico, y está determinado por la indirecta
medición). Medición de bilirrubina en
el suero depende de la reacción de la bilirrubina
con un ácido sulfónico diazotizado, que genera
Ates, después de los tratamientos apropiados, un azo azul
bilirrubina La intensidad del color azul puede ser
determinado espectrofotométricamente a 600 nm.
La bilirrubina total se mide en presencia de
benzoato de cafeína, que separa el hidro-
bilirrubina no conjugada fóbica de su unión
socios. Se realiza una segunda medición en el
ausencia de cafeína-benzoato, que solo
determinar las formas solubles conjugadas de bili-
rubin (la medida directa). Sin conjugar
La bilirrubina se calcula determinando la
diferencia en los valores obtenidos en presencia
y ausencia de cafeína-benzoato (el indi
medición directa). Recientemente, un transcutano
Nuestro dispositivo ha sido desarrollado para determinar
niveles de bilirrubina en recién nacidos. El instrumento
Veinte aminoácidos diferentes se encuentran comúnmente en las proteínas. Ellos son todos
-aminoácidos, aminoácidos en los que el grupo amino está unido al carbono
(el átomo de carbono al lado del grupo carboxilato) (ver Fig. 6.1A). El carbono tiene
dos sustituyentes adicionales: un átomo de hidrógeno y un grupo químico adicional
llamado cadena lateral (–R). La cadena lateral es diferente para cada aminoácido.
A un pH fisiológico de 7.4, el grupo amino en estos aminoácidos lleva un
carga positiva y el grupo de ácido carboxílico está cargado negativamente (ver Fig. 6.1B).
La p K a de los grupos de ácido carboxílico primario para todos los aminoácidos es aproximadamente
mately 2 (1.8 a 2.4). A valores de pH mucho más bajos que el p K a (mayor ión hidrógeno
concentraciones), todos los grupos de ácido carboxílico están protonados. En la p K a , 50%
de las moléculas se disocian en aniones y protones de carboxilato, y a un pH de
7.4, más del 99% de las moléculas están disociadas (ver Capítulo 4). El p K a para
todos los grupos amino son aproximadamente 9.5 (8.8 a 11.0), de modo que a un pH más bajo
de 7.4, la mayoría de los grupos amino están completamente protonados y tienen una carga positiva.
La forma de un aminoácido que tiene carga positiva y negativa se llama
zwitterion . Debido a que estos grupos químicos cargados pueden formar enlaces de hidrógeno con
moléculas de agua, todos estos aminoácidos son solubles en agua a pH fisiológico.
En todos los aminoácidos, excepto la glicina, el -carbono es un vehículo asimétrico-
átomo de bon que tiene cuatro sustituyentes diferentes y puede existir en el D - o
Configuración L (Fig. 6.2). Los aminoácidos en las proteínas de mamíferos son todos L -amino
ácidos representados con el grupo amino a la izquierda si el grupo carboxilo está en el
parte superior de la estructura. Estos mismos aminoácidos sirven como precursores del nitrógeno.
que contienen compuestos que se sintetizan en el cuerpo y, por lo tanto, en aminoácidos humanos
El metabolismo también se centra en los L- aminoácidos. El aminoácido glicina no es ni
D ni L porque el átomo de carbono contiene dos átomos de hidrógeno.
COO - COO -
+ +
H3N C H H C NH 3

se presiona contra la frente del bebé y

se transmite luz a varias longitudes de onda R R
a través de la frente, generando un reflejo
Ácido L-amino D-aminoácido
espectro de longitud de onda múltiple. Análisis de la
espectro permite que el instrumento determine
O O
los niveles de bilirrubina, hemoglobina y melanina
H C CH
en la piel del infante.

HO C H H C OH

CH 2 OH CH 2 OH

L-gluceraldehído D-gluceraldehído

HIGO. 6.2. L - y D - aminoácidos. Las formas L son las únicas que se encuentran en las proteínas humanas. Cautiverio

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23/9/2019 D. Esfingolípidos E. Esteroides IV. COMPUESTOS CON NITRÓGENO A. Aminoácidos
saliendo del papel se muestran con flechas negras ; los que entran, con flechas sombreadas . los
-amino grupos y átomos de H vienen hacia el lector, y las cadenas laterales -carboxilo y van
lejos. Las formas L y D son imágenes especulares que no pueden superponerse girando el lunar.
cule La referencia para las formas L y D son los estereoisómeros de gluceraldehído (ver Fig. 5.10A).

Página 10

CAPÍTULO 6 ■ AMINOÁCIDOS EN PROTEÍNAS 73

Las propiedades químicas de los aminoácidos le dan a cada proteína su característica única.
Teristics. Las proteínas están compuestas por una o más cadenas de polipéptidos lineales que contienen HO R2O
cientos de aminoácidos La secuencia de aminoácidos, denominada primaria +
H 3 N CC O - + H 3 N CC
+
O-
estructura , está determinada por el código genético de la proteína. En el polipéptido
R1 H
cadenas, los aminoácidos se unen mediante enlaces peptídicos entre el ácido carboxílico
de un aminoácido y el grupo amino del aminoácido adyacente (Fig. 6.3, ver también H2O
Fig. 1.5). Por lo tanto, el grupo amino, los grupos -carbono y carboxilo forman el grupo
esqueleto peptídico, y las cadenas laterales de los aminoácidos se extienden hacia afuera desde este H O R2 O
columna vertebral. Las cadenas laterales interactúan con el esqueleto peptídico de otras regiones de +
H 3 N CC norteCCO -
la cadena o con las cadenas laterales de otros aminoácidos en la proteína para formar hidro-
regiones fóbicas, enlaces electrostáticos, enlaces de hidrógeno o enlaces disulfuro. Estas R1 H H

Las interacciones dictan el patrón de plegamiento de la molécula. El tridimensional

HIGO. 6.3. Enlaces peptídicos. Aminoácidos en un
el plegamiento de la proteína forma regiones distintas llamadas sitios de unión que están revestidos con
cadena de polipéptidos se unen a través de péptidos
cadenas laterales de aminoácidos que interactúan específicamente con otra molécula denominada enlaces entre el grupo carboxilo de uno
ligando (como el hemo en la hemoglobina). Por lo tanto, las propiedades químicas del lado aminoácido y el grupo amino de la siguiente
las cadenas determinan cómo se pliega la proteína, cómo se une a ligandos específicos y cómo aminoácido en la secuencia.
interactúa con su entorno (como el medio acuoso del citoplasma).

II CLASIFICACIÓN DE LAS CADENAS LATERALES DE AMINOÁCIDOS

En la Figura 6.4, los 20 aminoácidos utilizados para la síntesis de proteínas se agrupan en
diferentes clasificaciones según la polaridad y las características estructurales del lateral
cadenas Estas agrupaciones pueden ser útiles para describir roles funcionales comunes o
vías metabólicas de los aminoácidos. Sin embargo, algunas cadenas laterales de aminoácidos
encajan en varias clasificaciones diferentes y, por lo tanto, se agrupan de manera diferente en
diferentes libros de texto Dos de las características de la cadena lateral que son útiles.
para la clasificación son su p K a y su índice hidropático, que se muestran en la Tabla 6.1. los
El índice hidropático es una escala utilizada para denotar la hidrofobicidad de la cadena lateral; el
cuanto más positivo es el índice hidropático, mayor es la tendencia a agruparse con otros
moléculas no polares y excluyen el agua en el efecto hidrofóbico. Cuanto más nega-
Dado el índice hidropático de un aminoácido, más hidrofílica es su cadena lateral.
Los nombres de los diferentes aminoácidos han recibido tres letras y uno.
abreviaturas de letras (ver Fig. 6.4). Las abreviaturas de tres letras usan los dos primeros
letras en el nombre más la tercera letra del nombre o la letra de una característica
sonido, como "trp" para triptófano. Las abreviaturas de una letra usan la primera
letra del nombre del aminoácido más frecuente en proteínas (como una "A" para
alanina). Si la primera letra ya ha sido asignada, la letra de una característica
se utiliza sonido (como una "R" para arginina). Las abreviaturas de una letra generalmente son
usado para denotar los aminoácidos en una secuencia de polipéptidos.

A. Aminoácidos alifáticos no polares

La glicina es el aminoácido más simple, y realmente no encaja bien en ninguna clasificación.
porque su cadena lateral es solo un átomo de hidrógeno. Alanina y el amino de cadena ramificada
los ácidos (valina, leucina e isoleucina) tienen cadenas laterales alifáticas voluminosas, no polares. los
se denota alto grado de hidrofobicidad de las cadenas laterales de aminoácidos de cadena ramificada
por su alto índice hidropático (ver Tabla 6.1). Los electrones se comparten por igual entre
los átomos de carbono e hidrógeno en estas cadenas laterales, para que no puedan hidrógeno
enlace con agua. Dentro de las proteínas, estas cadenas laterales de aminoácidos se agruparán para formar
forman núcleos hidrofóbicos. Su asociación también es promovida por las fuerzas de van der Waals.
entre el núcleo con carga positiva de un átomo y la nube de electrones de otro.
Esta fuerza es efectiva en distancias cortas cuando muchos átomos se juntan entre sí.
Los roles de la prolina y la glicina en la estructura de aminoácidos difieren de los de La enzima digestiva proteolítica.

aminoácidos no polares. El aminoácido prolina contiene un anillo que involucra su carbono la quimotripsina corta el pep-

y su grupo amino, que son parte del esqueleto peptídico. Este anillo rígido causa enlaces de marea formados por el carboxilo

un pliegue en el esqueleto del péptido que evita que forme su configuración habitual. grupos de aminoácidos grandes, voluminosos y sin carga.

Debido a que la cadena lateral de la glicina es tan pequeña en comparación con la de otros aminoácidos, ¿Qué aminoácidos entran en esta categoría?

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Página 11

74 SECCIÓN II ■ FUNDAMENTOS QUÍMICOS Y BIOLÓGICOS DE LA BIOQUÍMICA

No polar, alifático

Cíclico
COO - COO - COO - Aromático
+ +
C H
H3N CH H3N CH + No polar Más polar
H2N CH 2
H CH 3 COO - COO - COO -
H2C CH 2 + + +
H3N CH H3N CH H3N CH
Glicina Alanina Prolina
CH 2 CH 2 CH 2
(gly, G) (ala, A) (pro, P)
C CH

De cadena ramificada NUEVA HAMPSHIRE

COO - COO -
+ +
COO - H3N H3N OH
CH CH
+
H3N CH CH 2 H C CH 3
CH CH CH 2 Fenilalanina Tirosina Triptófano
CH 3 CH 3 (phe, F) (tyr, Y) (trp, W)
CH 3 CH 3 CH 3

Valina Leucina Isoleucina

(val, V) (leu, L) (ile, l)

Polar, sin carga Que contiene azufre

COO - COO - COO - COO - COO - COO -

+ + + + + +
H3N CH H3N CH H3N CH H3N CH H3N CH H3N CH

CH 2 CH 2 CH 2 OH H C OH CH 2 CH 2

C CH 2 CH 3 CH 2 SH

H2N O C S

H2N O CH 3

Asparagina Glutamina Serina Treonina Metionina Cisteína

(asn, N) (gln, Q) (ser, S) (thr, T) (se reunió, M) (cys, C)

Cargado

Negativo (ácido) Positivo (Básico)

COO - COO - COO - COO - COO -

+ + + + +
H3N C H H3N C H H3N C H H3N C H H3N C H

CH 2 CH 2 CH 2 CH 2 CH 2

COO - CH 2 CH 2 CH 2 C NUEVA HAMPSHIRE

COO - CH 2 CH 2 CH

NUEVA HAMPSHIRE CH 2 C norte

Aspartato Glutamato + +
H
(asp, D) (pegamento) C NH 2 NH 3

NH 2

Arginina Lisina Histidina

(arg, R) (lys, K) (el suyo, H)

HIGO. 6.4. Las cadenas laterales de los aminoácidos. Las cadenas laterales están resaltadas. Los aminoácidos están agrupados por polaridad y estructura.
características de sus cadenas laterales. Sin embargo, estas agrupaciones no son absolutas. Tirosina y triptófano, a menudo listados con los aminoácidos no polares,
son más polares que otros aminoácidos aromáticos debido a sus anillos fenólicos e indólicos, respectivamente. Los códigos de una y tres letras son
también indicado para cada aminoácido.

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CAPÍTULO 6 ■ AMINOÁCIDOS EN PROTEÍNAS 75

Tabla 6.1 Propiedades de los aminoácidos comunes La mayor actividad de quimotripsina es

p K a1 una p K a2 p K aR Hidropatía hacia enlaces peptídicos formados por el
Aminoácidos (Carboxilo) (Aminado) (Grupo R) Índice b grupos carboxilo de amino aromático
Alifático no polar ácidos (fenilalanina, tirosina, triptófano).
Glicina 2,4 9,8 0.4 0.4 Las cadenas laterales de estos aminoácidos son todas
Prolina 2,0 11,0 1.6
Grande y sin carga. Una de las quimotripsinas
Alanina 2.3 9,7 1,8
Leucina 2,4 9.6 3.8 las isoenzimas también exhiben actividad hacia la leucina
Valina 2.3 9.6 4.2 4.2 y metionina, que son similares en polaridad.
Isoleucina 2,4 9,7 4.5 4.5

Aromático
Fenilalanina 1,8 9.1 2.8
Tirosina 2.2 2.2 9.1 10,5 1.3
Triptófano 2,4 9.4 0.9

Polar sin carga

Treonina 2.1 9.6 13,6 0.7
Serina 2.2 2.2 9.2 13,6 0.8
Asparagina 2,0 8.8 3.5
Glutamina 2.2 2.2 9.1 3.5

Que contiene azufre

Cisteína 2,0 10,3 8.4 2.5
Metionina 2.3 9.2 1.9

Cargado negativo
Aspartato 1.9 9.6 3.9 3.5 A. interacción hidrofóbica
Glutamato 2.2 2.2 9,7 4.1 3.5 Péptido

Cargado positivo columna vertebral

Histidina 1,8 9.3 6.0 3.2
Lisina 2.2 2.2 9.0 10,5 3.9 CH 2
Arginina 2.2 2.2 9.0 12,5 4.5 4.5 CH 2
Promedio 2.2 2.2 9.5

Fenilalanina
a Cuando estos aminoácidos residen en proteínas, la p K a para las cadenas laterales puede variar en cierta medida de
el valor para el aminoácido libre, dependiendo del entorno local del aminoácido en los tres
cadenas laterales
estructura dimensional de la proteína.
b El índice de hidropatía es una medida de la hidrofobicidad del aminoácido (cuanto mayor es el número, más

más hidrofóbico). B. enlaces de hidrógeno

Valores basados en Kyte J, Doolittle RF. Un método simple para mostrar el carácter hidropático de una proteína.
J Mol Biol. 1982; 157 (1): 105-132. Péptido Lado
columna vertebral cadenas

CO H O R
causa la menor cantidad de impedimento estérico en una proteína (es decir, no significa norte H O R
puede afectar al espacio ocupado por otros átomos o grupos químicos). Por lo tanto, H
La glicina a menudo se encuentra en las curvas o en las cadenas apretadas de proteínas fibrosas.
HIGO. 6.5. Enlaces hidrofóbicos y de hidrógeno.
B. Aminoácidos aromáticos A. Interacciones hidrofóbicas fuertes ocurren con
el apilamiento de grupos aromáticos en fenil-
Los aminoácidos aromáticos se han agrupado porque todos contienen anillo
Cadenas laterales de alanina. B. Ejemplos de hidrógeno.
estructuras con propiedades similares, pero sus polaridades difieren mucho. El aro enlaces en los que se comparte un átomo de hidrógeno
el anillo matic es un anillo de carbono e hidrógeno de seis miembros con tres dobles conjugados por un nitrógeno en el esqueleto peptídico y un
enlaces (el anillo de benceno o el grupo fenilo). Los sustituyentes en este anillo determinan átomo de oxígeno en una cadena lateral de aminoácidos o
si la cadena lateral de aminoácidos participa en interacciones polares o hidrófobas. En entre un oxígeno en el esqueleto peptídico
y un oxígeno en una cadena lateral de aminoácidos.
el aminoácido fenilalanina, el anillo no contiene sustituyentes y los electrones
se comparten por igual entre los carbonos en el anillo, lo que resulta en un muy no polar
Estructura hidrofóbica en la que los anillos pueden apilarse unos sobre otros (Fig. 6.5). En
tirosina, un grupo hidroxilo en el anillo de fenilo se une a enlaces de hidrógeno, y el
Will Sichel tiene anemia falciforme
La cadena lateral es, por lo tanto, más polar y más hidrófila. El anillo más complejo
causado por una mutación puntual en su
La estructura en triptófano es un anillo de indol con nitrógeno que puede participar en el hidrógeno.
ADN que cambia el sexto amino
cautiverio. El triptófano es, por lo tanto, también más polar que la fenilalanina.
ácido en la cadena -globina de la hemoglobina de
C.Aminoácidos alifáticos, polares, sin carga glutamato a valina. Que diferencia seria

Aminoácidos con cadenas laterales que contienen un grupo amida (asparagina y glu- esperas encontrar en los enlaces químicos

tamina) o un grupo hidroxilo (serina y treonina) pueden clasificarse como alifáticos, formado por estos dos aminoácidos?

Página 13

76 SECCIÓN II ■ FUNDAMENTOS QUÍMICOS Y BIOLÓGICOS DE LA BIOQUÍMICA

El glutamato tiene una carga negativa aminoácidos polares sin carga. La asparagina y la glutamina son amidas del amino
en su cadena lateral a pH fisiológico
ácidos aspartato y glutamato. Los grupos hidroxilo y los grupos amida en el
y así puede participar en enlaces iónicos
las cadenas laterales permiten que estos aminoácidos formen enlaces de hidrógeno con agua, con cada
o enlaces de hidrógeno con agua u otro lado
otro y el esqueleto peptídico, o con otros compuestos polares en la unión
cadenas La valina es un aminoácido hidrofóbico y
sitios de las proteínas (ver Fig. 6.5). Como consecuencia de su hidrofilia, estos

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por lo tanto tiende a interactuar con otras hidro- los aminoácidos se encuentran frecuentemente en la superficie de las proteínas globulares solubles en agua.
cadenas laterales fóbicas para excluir el agua.
La cisteína, que a veces se incluye en esta clase de aminoácidos, se ha separado
clasificado en la clase de aminoácidos que contienen azufre.

D. Aminoácidos que contienen azufre

Cisteína
+ Tanto la cisteína como la metionina contienen azufre. La cadena lateral de cisteína contiene un
H3N CH COO -
grupo sulfhidrilo que tiene una ap K a de aproximadamente 8.4 para la disociación de su hidro-
CH 2 gen, por lo que la cisteína es predominantemente no disociada y sin carga a nivel fisiológico
SH
pH de 7.4. La molécula de cisteína libre en solución puede formar un enlace disulfuro covalente
Sulfhidrilo con otra molécula de cisteína a través de la oxidación espontánea (no enzimática) de
grupos
SH sus grupos sulfhidrilo El aminoácido resultante, la cistina, está presente en la sangre y
CH 2 tejidos y no es muy soluble en agua. En las proteínas, la formación de una cistina disuelve
+ enlace fide entre dos grupos cisteína sulfhidrilo colocados apropiadamente a menudo
H3N CH COO -
juega un papel importante en la celebración de dos cadenas de polipéptidos o dos regiones diferentes
Cisteína
de una cadena juntos (Fig. 6.6). La metionina , aunque contiene un grupo azufre, es
un aminoácido no polar con una gran cadena lateral voluminosa que es hidrófoba. Lo hace
Reducción Oxidación no contiene un grupo sulfhidrilo y no puede formar enlaces disulfuro. Es importante y
El papel central en el metabolismo está relacionado con su capacidad, cuando se activa adecuadamente, para
+
H3N CH COO - transferir el grupo metilo unido al átomo de azufre a otros compuestos.
CH 2
E. Los aminoácidos ácidos y básicos.
S
Disulfuro Los aminoácidos aspartato y glutamato tienen grupos de ácido carboxílico que llevan un
S carga negativa a pH fisiológico (ver Fig. 6.4). Los aminoácidos básicos histidina,
CH 2 la lisina y la arginina tienen cadenas laterales que contienen nitrógeno que pueden ser protonadas y
+
H 3 N CH COO - cargado positivamente a valores fisiológicos y de pH más bajos. La histidina tiene un nitrógeno
que contiene anillo de imidazol para una cadena lateral; la lisina tiene un grupo amino primario en el
Cistina
-carbono (de la secuencia,,,); y la arginina tiene un grupo guanidinio.
HIGO. 6.6. Un enlace disulfuro. Disulfuro covalente
La carga positiva en los aminoácidos básicos les permite formar enlaces iónicos.
se pueden formar enlaces entre dos moléculas
(enlaces electrostáticos) con grupos cargados negativamente, como las cadenas laterales de
de cisteína o entre dos residuos de cisteína en
una proteina El compuesto disulfuro se llama cys-
aminoácidos ácidos o los grupos fosfato de las coenzimas (Fig. 6.7). Adicionalmente,
púa. Los hidrógenos de la cisteína sulfhidrilo. Las cadenas laterales de lisina y arginina a menudo forman enlaces iónicos con compuestos cargados negativamente
Los grupos se eliminan durante la oxidación. libras unidas a los sitios de unión a proteínas, como los grupos fosfato en adenosina
trifosfato (ATP). Las cadenas laterales de aminoácidos ácidos y básicos también participan
en enlaces de hidrógeno y la formación de puentes salinos (como la unión de un
ion inorgánico tal como Na entre dos grupos parcial o totalmente cargados negativamente).
Cal Kulis pasó un cálculo renal La carga de estos aminoácidos a pH fisiológico es una función de su p K a
poco después de la admisión, que inmediatamente para la disociación de protones de los grupos de ácido -carboxílico, los grupos -amino,
diariamente alivió su dolor. Su mayor y las cadenas laterales. La curva de titulación de histidina ilustra los cambios en amino
componente fue identificado como cistina. Normalmente, la estructura ácida que ocurre cuando el pH de la solución cambia de 1 a 14 por el
los aminoácidos se filtran por capilar glomerular adición de iones hidróxido (Fig. 6.8). A pH bajo, todos los grupos llevan protones; aminado
ies en la orina tubular pero son casi enteramente los grupos tienen carga positiva y los grupos de ácido carboxílico tienen carga cero. Como el
reabsorbido de este fluido de regreso a la sangre El pH se incrementa mediante la adición de álcali (OH), el protón se disocia del
a través de proteínas de transporte en el tubular proximal grupo de ácido carboxílico, y su carga cambia de cero a negativo con ap K a
Células. Cal Kulis tiene cistinuria, un hereditario de aproximadamente 2, el pH al que se ha disociado el 50% de los protones.
sustitución de aminoácidos en la proteína de transporte La cadena lateral de histidina es un anillo de imidazol con una ap K a de aproximadamente 6 que
que reabsorbe cistina, arginina y lisina. cambia de un anillo predominantemente protonado con carga positiva a un sin carga
Por lo tanto, su orina contenía grandes cantidades. sonar a este pH. El grupo amino en los titratos de carbono a un pH mucho más alto
de estos aminoácidos Cistina, que es menos (entre 9 y 10), y la carga cambia de positivo a cero a medida que
soluble que otros aminoácidos, precipita en El pH aumenta. El pH al cual la carga neta en las moléculas en solución es cero es
la orina para formar cálculos renales (cálculos). llamado el punto isoeléctrico (pI). A este pH, las moléculas no migrarán en un

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CAPÍTULO 6 ■ AMINOÁCIDOS EN PROTEÍNAS 77

campo eléctrico hacia un polo positivo (cátodo) o un polo negativo (ánodo),

porque el número de cargas negativas en cada molécula es igual al número CH 2

de cargas positivas. CH 2
Las cadenas laterales de aminoácidos cambian de sin carga a carga negativa, o posi- CH 2
cargadas de forma activa a sin carga cuando liberan protones (Fig. 6.9). El amino ácido
CH 2
los ácidos pierden un protón de sus cadenas laterales de ácido carboxílico a un pH de aproximadamente 4 y +

por lo tanto están cargados negativamente a pH 7,4. La cisteína y la tirosina pierden protones en su NH 3

p K a (8.4 y 10.5, respectivamente), por lo que sus cadenas laterales no están cargadas a nivel fisiológico
pH Las cadenas laterales de histidina, lisina y arginina cambian de carga positiva a
neutral en su p K a . Las cadenas laterales de los dos aminoácidos básicos, arginina y O-
lisina, tiene valores de p K a 10, por lo que la forma cargada positivamente siempre predomina C O
a pH fisiológico La cadena lateral de histidina (p K a 6.0) se disocia cerca del fisio
CH 2
pH ológico, por lo que solo una parte de las cadenas laterales de histidina llevan una carga positiva
(ver Fig. 6.8).

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23/9/2019 D. Esfingolípidos E. Esteroides IV. COMPUESTOS CON NITRÓGENO A. Aminoácidos
En las proteínas, solo las cadenas laterales de aminoácidos, el grupo amino en el término amino- HIGO. 6.7. Interacción electrostática entre
nal, y el grupo carboxilo en el terminal carboxilo tiene protones disociables. Todo la cadena lateral cargada positivamente de lisina y
La cadena lateral de aspartato cargada negativamente.
los otros grupos ácido carboxílico y amino en los carbonos se unen en péptido
enlaces que no tienen protones disociables. Las cadenas laterales de aminoácidos podrían tener
p muy diferentes K unos valores que los de los aminoácidos libres si están involucrados en
enlaces iónicos o de hidrógeno con otras cadenas laterales de aminoácidos. La p K a de la imidaz-
El grupo ole de histidina, por ejemplo, a menudo se desplaza a un valor más alto entre 6 y
7 para que agregue y libere un protón en el rango de pH fisiológico.
La electroforesis es una técnica utilizada para separar las proteínas en función de la carga.
que ha sido extremadamente útil en medicina para identificar proteínas con diferentes aminoácidos Es la sustitución de un glutamato por un

composiciones ácidas La carga neta en una proteína a cierto pH es una suma de todos valina en hemoglobina falciforme

de las cargas positivas y negativas en todas las cadenas laterales de aminoácidos ionizables reemplazo servo? Qué pasa

más los grupos carboxilo N-terminal amino y C-terminal. Teóricamente, la red ¿La sustitución de un aspartato por un glutamato?

14

+
12
p K a3 (NH 3 ) = 9.3

10

8 p K a2 (grupo R) = 6.0
Pi
pH
66

44 p K a1 (COOH) = 1.8

00 0.5 0.5 1.0 1,5 2,0 2.5 3.0

Equivalentes de OH -

COOH COO - COO - COO -

+ p K a1 + p K a2 + p K a3
H 3 N CH H 3 N CH H 3 N CH H 2 N CH

CH 2 CH 2 CH 2 CH 2

NH + NH + norte norte
HN HN HN HN

Abajo Entre Entre Encima

pH 1.8 pH 1.8 y 6.0 pH 6.0 y 9.3 pH 9.3

Especies predominantes

HIGO. 6.8. Curva de titulación de histidina. La especie iónica que predomina en cada región se muestra debajo del gráfico. pI es el punto isoeléctrico
(el pH al cual no hay carga neta en la molécula).

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78 SECCIÓN II ■ FUNDAMENTOS QUÍMICOS Y BIOLÓGICOS DE LA BIOQUÍMICA

Forma que predomina pKa Forma que predomina

debajo de la p K a por encima de la p K a

3.9
Aspartato CH 2 COOH CH 2 COO - + H+

4.1
Glutamato CH 2 CH 2 COOH CH 2 CH 2 COO - + H+

HN + 6.0 norte
Histidina CH 2 CH 2 + H+
NUEVA HAMPSHIRE NUEVA HAMPSHIRE

8.4
Cisteína CH 2 SH CH 2 S - + H+

10,5
Tirosina CH 2 OH CH 2 O- + H+

+ 10,5
Lisina CH 2 CH 2 CH 2 CH 2 NH 3 CH 2 CH 2 CH 2 CH 2 NH 2 + H+

+
NH 2 12,5 NUEVA HAMPSHIRE
Arginina CH 2 CH 2 CH 2 NH C CH 2 CH 2 CH 2 NH C + H+
NH 2 NH 2

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HIGO. 6.9. Disociación de las cadenas laterales de los aminoácidos. A medida que aumenta el pH, la carga en la cadena lateral va de 0 a - o de a
0. El p K a es el pH al que la mitad de las moléculas de un aminoácido en solución tienen cadenas laterales que están cargadas. La mitad no tiene carga.
La sustitución de un glutamato por un
la valina es un sustituto no conservador
ment porque una carga negativa
el aminoácido se sustituye por un hidrófobo
aminoácido alifático de cadena ramificada. Sin embargo,
la sustitución de un aspartato por un glutamato
es un reemplazo conservador porque los dos
los aminoácidos tienen la misma polaridad y casi
el mismo tamaño.
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la carga de una proteína a cualquier pH puede determinarse a partir de su composición de aminoácidos
calculando la concentración de grupos con carga positiva y negativa de
la ecuación de Henderson-Hasselbalch (ver Capítulo 4). Sin embargo, los enlaces de hidrógeno
y enlaces iónicos entre las cadenas laterales de aminoácidos en la proteína, que pueden alterar p K a
valores, haga este cálculo poco realista.
III. VARIACIONES EN LA ESTRUCTURA PRIMARIA
La estructura primaria de una proteína es su secuencia lineal de aminoácidos. A pesar de que
Casi todos los aminoácidos en la estructura primaria de una proteína contribuyen a su
conformación (estructura tridimensional), la estructura primaria de una proteína puede
variar hasta cierto punto entre las especies. Incluso dentro de la especie humana, el amino
la secuencia ácida de una proteína funcional normal puede variar algo entre individuos
als, tejidos del mismo individuo y la etapa de desarrollo. Estas variaciones
en la estructura primaria de una proteína funcional se toleran si se limitan a
regiones no críticas (llamadas regiones variantes), si son sustituciones conservadoras
(reemplace un aminoácido con uno de estructura similar), o si confieren un avance
tage Si se toleran muchos residuos de aminoácidos diferentes en una posición, la región es
llamado hipervariable . En contraste, las regiones que forman sitios de unión o son críticas
para formar una estructura tridimensional funcional suelen ser regiones invariantes
que tienen exactamente la misma secuencia de aminoácidos de tejido individual a individual
al tejido, o de especie a especie.
A. Polimorfismo en la estructura de la proteína.
Dentro de la población humana, la estructura primaria de una proteína puede variar ligeramente
entre individuos. Las variaciones generalmente surgen de mutaciones en el ADN que son
pasó a la próxima generación. Las mutaciones pueden resultar de la sustitución de
una base para otra en la secuencia de ADN de nucleótidos (una mutación puntual), de
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