6.

Repaso clases anteriores

Repaso de las clases de DNA, RNA y proteínas.
En esta clase habla más que nada de lo que va a preguntar en la prueba.
1. Clase estructura y propiedades del DNA
- Saber la diferencia entre un nucleótido (base+ azúcar + fosfato) y un nucleósido (base+ azúcar), en el
primero hay fosfato y en el segundo no.
- Diferencia entre DNA y RNA que radica en la azúcar, la cual en el caso del DNA en vez de tener un OH en
carbono 2’ de su azúcar, tiene un H, por eso se llama desoxirribosa en vez de ribosa.
- Aprenderse los números de los carbonos, en el 2’ se encuentra el OH que puede estar o no dependiendo si
es RNA o DNA, en el carbono 5’ se encuentra unido el Fosfato, por eso se llama Fosfato 5’, y por otro lado
está el carbono OH 3’ que es importante porque es el que se va a unir con el fosfato 5’ para formar el en
lace fosfodiester en los nucleótidos.
- ¿qué es el enlace fosfodiester? ¿cómo se forma? ¿qué carbono con que carbono se unen?, en realidad no
es que se unan los carbonos si no que se unen los OH con los Fosfatos.
- Recordar la dirección, ¿Cuál es la dirección de la formación del enlace fosfodiester? 3’  5’, porque se une
al OH libre que se encuentra en el extremo 3’ con un fosfato que viene llegando, pero la dirección de
replicación de DNA ocurre en la dirección de 5´ 3’ y por qué, porque cada nucleótido nuevo que se va a
agregando se une en el extremo 3’, o sea al OH libre.
- Recordar los tipos de DNA y el más importante que es el que está en todos lados, y es el de tipo B, el cual
tiene un surco mayor y un surco menor y un giro hacia la derecha, o sea dextrógiro.
- También recordar la diferencia entre DNA y RNA, además de la azúcar, es que en la bases, en vez de
timina, en el RNA hay uracilo, y que en el DNA es una doble hebra y el RNA una sola, aunque ese RNA
también puede aparearse consigo misma como se ve en el caso del tRNA el cual tiene sitios unidos, pero
sigue siendo una sola hebra.
- Purinas: adenina, guanina (mnemotecnia: AGUA PURA), pirimidinas: timina, citosina y uracilo.
- Recordar cómo se formaba el enlace fosfodiester, llegaba un dATP que tiene los 3 fosfatos, el fosfato γ y β
se van a eliminar y quedará el fosfato α que se unirá al OH.
- La forma de un cromosoma, las puntas se llaman telómeros y en la replicación se acortan y la encargada
de alargarlos es la enzima Telomerasa. La actividad de esta enzima va disminuyendo a lo largo de la vida,
excepto en las células progenitoras y tumorales, por lo q en las células que se ven afectadas los telómeros
se van haciendo cada vez más cortos a medida que el organismo va envejeciendo.
- Lo que fijo va son los grados de compactación del DNA,
- primero un collar de perlas que está formado por nucleosomas, los cuales son complejos de proteínas
(histonas) con DNA,
- luego esto se compacta aún más formando la fibra de 30nm,
- luego más se forma el bucle,
- después se compacta más y se forma esa estructura que parece fideos chinos,
- y finalmente se compacta, al punto de formar el cromosoma.
La pregunta va a consistir en ordenar de menor a mayor grado de compactación o viceversa.
- Recordar que hay ciertas proteínas que quieren acceder al DNA y no pueden hacerlo si es que hay
histonas, por lo que estas últimas tienen que modificarse de alguna manera y se hace de una forma
química, por ejemplo la acetilación, de esta manera se abre esta zona, haciendo mucho más accesible al
DNA para que interactúe con otras proteínas.
2. Clase Replicación

- La polimerasa nunca va a empezar a actuar en un DNA de doble hebra o un DNA de simple hebra, ¿qué
necesita?, para que la polimerasa reconozca necesita un primer o cebador, existen varias formas de
sintetizarlo, la principal es que se genera un primer de naturaleza RNA y luego se empieza a sintetizar el
DNA, este primer es sintetizado por la Primasa y lo elimina la DNA polimerasa I.
- Recordar que cuando se replican los plasmidios que son DNA circulares de las bacterias, se replican a partir
de una burbuja de replicación y puede ser en dos direcciones, si es una dirección solo habrá una horquilla y
si es en las dos direcciones van a haber dos horquillas, si es en una dirección el término de la replicación,
generalmente va a ser en el mismo lugar donde se inició, pero si es en ambas será en el lugar opuesto,
esos es lo q hay q saber en relación a la replicación en procariontes.
- En el caso de eucariontes hay muchas burbujas de replicación que hacen que el proceso sea un poco más
rápido, aunque recordar que pese a que acá hay muchas burbujas de replicación es mucho más lento que
en procariontes, ya que en el DNA de eucariontes tenemos histonas, y estas deben desempacarse,
replicarse y volver a empacarse, en cambio en procariontes al carecer de estas proteínas, el DNA se replica
sin problemas.
- Importante saber que para que se inicie la replicación, tiene que haber un primer y también tienen que
haber metilaciones o acetilaciones para que las histonas se abran y de esta manera se pueda iniciar el
proceso. Las metilaciones se producen en ambas hebras y cuando termina este proceso, se detiene la
replicación, entonces nuevamente llega una enzima que se llama Transmetilasa, que metila nuevamente
para que se vuelva a replicar.
- Aprenderse la función de cada una de las proteínas de la replicación y sus componentes, por ejemplo, de
partida la replicación siempre va a ser de 5’ a 3’, por tanto va a haber una hebra que va de 3’ a 5’, la hebra
continua, y antes de que se empiece a replicar se va a formar un primer por la Primasa y posteriormente se
sigue sintetizando el DNA por la DNA Polimerasa III de 5’ a 3’, algo diferente ocurre en la hebra
discontinua, que va de 5’ a 3’, al estar en esa dirección, y como la hebra nueva y opuesta no se puede
replicar de 3’ a 5’, se van a ir sintetizando “pedacitos” de RNA, denominados Fragmentos de Okasaki, los
cuales al igual que el cebador son sintetizados por la Primasa, y ambos tienen que ser eliminados por la
DNA Polimerasa I, en el caso de la hebra discontinua antes de que se eliminen, los fragmentos de Okasaki
deben ser ligados y esta tarea la lleva a cabo la Ligasa.
- Antes de ser replicado el DNA tiene que desenrollarse y esa tarea la lleva a cabo la Toposiomerasa, luego
se tienen que romper los puentes de hidrógeno, y eso lo lleva a cabo la Helicasa, las proteínas SSB los
mantienen estabilizado/abierto.
- Diferencias entre procariontes y eucariontes:

Procariontes Eucariontes
No hay histonas Hay histonas
Tamaño DNA mucho más pequeño Tamaño DNA mayor
Solo una burbuja de replicación Muchas burbujas de replicación
Fragmentos de Okasaki de menor Fragmentos de Okasaki más grande
tamaño
Replicación rápida Replicación mucho más lenta
3. Clase Transcripción
- Diferencias entre células procariotas y eucariotas

- Recordar el splicing, donde se cortan los intrones y quedan solo los exones y la adhesión del cap y la cola
de poli A al RNAm eucarionte.
- Importante saber que la RNA polimerasa en procariontes, es una proteína compuesta de muchas
subunidades, en cambio la RNA polimerasa de eucariontes, en este caso la II, que es la encargada de la
transcripción, es una subunidad y muchos factores de transcripción unidos.
- La transcripción, también siempre es de 5’ a 3’.
- Lo del DNA no templado, el DNA templado y el RNA transcrito siempre lo pregunta

Puede hacer identificar la hebra de RNA transcrito a partir del DNA no templado por ejemplo, que en cuyo
caso será igual solo que en vez de timina será uracilo, o puede preguntar cuál es el DNA no templado a
partir de la hebra de RNA trascrito que será lo mismo pero en vez de uracilo tendrá timina. * El templado
es el que se ocupa de molde para el RNA transcrito.

- ¿Cómo se comanda la expresión de un gen? ¿cómo saben dónde tiene que transcribirse? Los genes tienen
secuencias que están un poco antes del gen que se llaman promotores y son los que determinan si el gen
se tiene que transcribir o no, estos promotores pueden estar en distintas células, ya sea pancreáticas,
musculares, etc. Pero estos promotores se van a activar con “cosas” que están, por ej. En el páncreas y no
en el hueso, y que determinarán, siguiendo con el ej. Del páncreas que se produzca insulina en aquí y no
en otra célula.
- Menciona la estructura del RNAm cuyo codón de inicio es siempre el AUG, luego le siguen otros codones
que formarán una secuencia de aá determinarán la estructura primaria de una proteína.
- La diferencia entre procariontes y eucariontes, es que en procariontes existen unas secuencias largas que
se llaman operones donde en toooda esa región de DNA se codifican varios genes que actúan en lo
mismo, por ej un operón que codifica para tres enzimas, betagalactosidasa, permeasa y transacetilasa,
todas estas son distintas, pero participan en una misma actividad. Lo otro es que estos operones pueden
ser activados y reprimidos , muchas veces este represor está codificado en el mismo lugar, o sea es un gen
que va actuar sobre este operón y va a detener la transcripción y siguiendo con el ejemplo, puede llegar un
 “activador” como la lactosa q se va a unir al represor, este represor va a salir y la transcripción va a
comenzar; en eucariontes es diferente, recordar que acá hay distintos genes que codifican para distintas
cosas (o sea un gen para cada cosa) por lo q se obtendrán distintos mensajeros los cuales se traducirán por
separado, en cambio en procariontes en un solo RNAm largo común están las distintas secuencias que
codifican para las proteínas, pero esto no significa que se forma una proteína gigante, si no que cada
proteína dentro de este mismo RNAm largo tiene su codón de inicio y su codón de término, o sea el
ribosoma es capaz de traducir cada una de las proteínas contenidas en ese código del RNAm, a diferencia
de lo q ocurre en eucariontes, en que cada RNAm va a codificar para una proteína.
- También recordar que en el caso del RNAm de eucariotas existen los intrones los cuales se tienen que
quitar, luego se juntan los exones que quedan (corte y empalme o splicing), luego se le agrega una
molécula de cap y finalmente una cola de poli A, de estas manera están maduros y listos para ser
traducidos (a diferencia de RNAm de procariotas en que queda listo altiro), además tienen dos
particularidades, dentro de su secuencia codificante (después del cap y antes de la cola de poli A que son
para evitar su degradación cuando salga del núcleo hacia el citoplasma) tienen un codón de inicio, AUG, y
un codón de termino, que puede ser UAG, UAA y UGA, todo este proceso ocurre en el núcleo. O sea
reiterar que RNAm eucarionte requiere maduración antes de salir al citoplasma y ser traducido, a
diferencia del RNAm de los procariontes
- Hay ciertos fármacos que se ocupan, como antibióticos, que inhiben la transcripción, como rifampicina y
actinomicina, aunque esta última es letal ya q además de procariontes inhibe la trancripcion en
eucariontes, también existen antibióticos que actúan inhibiendo la traducción.
- Recordar que la transcripción siempre es de 5’ a 3’ y que cap se sintetiza en el extremo 5’ y la cola de poli A
en el extremo 3’ siempre!

4. Clase Traducción
- Recordar que en caso de procariontes existe un RNA polimerasa, en cambio en eucariontes existen 3, RNA
polimerasa II  codifica RNAm
- RNA de trasferencia (tRNA), al igual que el RNAm, este también se transcribe a partir de una secuencia de
DNA dando origen a su estructura “media doblada como un trébol”. NO SE TRADUCE (el q se traduce el
mRNA), si no q va a formar parte de la estructura que va ayudar a la formación de los enlaces peptídicos.
¿Cómo funciona? El tRNA va a tener una secuencia denominada anticodón, que va a reconocer el codón
del mRNA, cada anticodón va a tener asociado un aá, en este caso la metionina, va a tener un anticodón
UAC q es complementario al codón de inicio AUG (metionina).
- Enzimas importantes en la traducción, Aminoacil tRNA sintetasa, recordar la estructura en forma de trébol
del tRNA al cual viene unido a un aá, este aá es unido por esta enzima, o sea gracias a esta, se termina de
formar la estructura completa del RNA de transferencia, este aá va ir unido en la dirección 3’ .
La amioacil tRNA sintetasa no sintetiza al tRNA, si no que le agrega un aá en el extremo 3’ de este, de esta
manera el tRNA puede llevar a cabo su función, ayudando a la traducción del mRNA.
- RNA ribosomal (rRNA), este RNA es netamente estructural, tampoco se va a traducir, y forma parte del
ribosoma, o sea un ribosoma es una estructura formada por dos subunidades q a su vez están compuestas
por proteínas ribosomales y RNA ribosomales.
- El ribosoma es capaz de leer un RNAm y con ayuda del tRNA lo va transformando en proteína.
- El complejo ribosomal va a tener un sitio P y un sitio A, el aá1 SIEMPRE va a ser METIONINA (AUG) por
tanto el anticodón será UAC, entonces llega este tRNA que codifica para el aá metionina y se une al sitio P,
luego llega un segundo tRNA al stio A y se forma un enlace peptídico entre el sitio P y el sitio A, por la
enzima peptidil transferasa, pero luego el primer tRNA se va a soltar del primer aá que tenía pegado, el
 sitio P va a quedar libre, entonces el tRNA 2 unido al aá2 que además está unido al aá1 se va a mover hacia
el sitio P y va dejar libre el sitio A para que llegue el aá3, se va a forma otro enlace peptídico, y así
sucesivamente se va ir corriendo. Cada tRNA que va llegando con su aá nuevo pegadito en su extremo 3’
va ir agregando su aá respectivo y va ir formando la cadena polipeptídica, la cual puede variar de unos
pocos a muchos aá, lo que si tiene que haber siempre es un codón de término, el cual como se dijo tiene
ser UAG, UAA o UGA, los cuales no codifican ningún aá solo es una señal de que se paró la traducción.
- En procariontes lo q ocurre es q para q el proceso sea más eficiente, si tengo un mensajero en vez de que
venga un ribosoma y lo lea y saque una proteína y luego llegue otro y saque otra proteína, se puede hacer
al mismo tiempo por un poliribosoma ya que recordar q en procariotas 1 RNAm codificaba para varias
proteínas, y para hacer el proceso mas rápido existe este complejo.
- Existen antibioticos q inhiben la traducción, tales como tetraciclina, estreptomicina, cloranfenicol,
cicloheximida, o sea por más q la celula replique y transcriba su DNA si no se traduce la información no
sirve de nada ya q la proteína es la q va a tener la función, la célula se muere.

5. Clase Lesiones y Reparación del DNA

- ¿Cómo se produce daño en el DNA? Existen dos tipos de producción de daño del DNA, endógeno y
exógeno, el endógeno es aquel daño que puede ser producido por los mismos componentes que produce
la célula, el más común son los radicales libres, que son generados por las diferentes reacciones que
ocurren dentro de la célula, como por ejemplo la respiración celular. Los radicales son moléculas muy
inestables que pueden reaccionar fácilmente con otro compuesto, y ese otro compuesto puede ser el DNA.
- Daño exógeno, es por componentes externos, uno de los más conocidos es la luz UV, la cual desencadena
procesos metabólicos que terminan dañando el DNA.
- El daño del DNA produce mutaciones, que pueden ser malas o buenas, ya que gracias a estas es que hay
evolución, el gen puede cambiar para bien o para mal.
- Aquí se hace énfasis en que el daño tiene que reparase, y para esto tienen que haber enzimas.
- Un daño químico del DNA como por ejemplo las alquilaciones, puede ser producido tanto por agentes
endógenos como exógenos.
- Muchas veces, los rayos UV producen una falla muy común, los dímeros de timina, y si esta falla no puede
repararse se produce xeroderma pigmentosum, estas personas tienen mutadas las proteínas q permiten la
reparación de este daño. Lo que pasa es que si esa mutación no se repara, la célula se replica y por tanto la
mutación, y se empieza acumular generando daño.
- Daños más comunes, el más común es el quiebre de una hebra
simple, al ser el más común es fácil de reparar.
- Mejor ver la clase correspondiente, en esta no enfatizó mucho, pero
dice que hay que aprenderse que es daño exógeno y daño endógeno
y los daños más comunes.  faltó agregar los tipos de reparación,
eso es muy importante ✌