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PROTEÍNAS II
- FUNCIONES-
Atracción de
moléculas
cargadas +
-
- -
• B) Alteración en la reactividad de los aminoácidos
polares vecinos:
• Activar grupos laterales normalmente no reactivos (como CH2OH de la serina)
Superhélice
Dominio SH2 reconoce Proteínas reguladoras Es la más común y la más
un asa fosforilada de de genes: Cremallera de fuerte.
otra proteína. leucina. Ejemplo: enzima y sustrato
FUNCIÓN DE DEFENSA
ANTICUERPOS
ESTRUCTURA DE LOS ANTICUERPOS
La hexocinasa: Posee una kM baja para la glucosa por lo tanto se satura a muy
bajas concentraciones de glucosa. Está presente en todas las células.
La glucocinasa: Es más abundante en el hígado. Tiene un kM elevado, lo cual nos
indica que esta enzima se satura recién a muy altas concentraciones de glucosa.
ABZIMAS
Son anticuerpos con capacidad catalítica (Ejm: los
anticuerpos monoclonales o catmab)
TIPOS DE CATÁLISIS
Túneles
moleculares
Los túneles conectan dos o
más sitio activos
Carbamil fosfato sintetasa
Las enzimas se
pueden inhibir por el
producto final
Regulación
enzimática II
Vías metabólicas
enlazadas e inhibidas
por productos finales
Regulación positiva generada por el
acoplamiento conformacional entre dos lugares
de unión distante.
Regulación negativa generada por el
acoplamiento conformacional entre dos lugares
de unión distantes entre sí.
Transición
cooperativa
alostérica en una
enzima compuesta
por dos subunidades
idénticas
ACTIVACIÓN E INACTIVACIÓN
DE PROTEINAS
• POR FOSFORILACION A PARTIR DEL ATP
• POR INTERCAMBIO GDP POR GTP
I. FOSFORILACIÓN DE PROTEINAS
• ENZIMAS QUE FOSFORILAN: QUINASAS
• ENZIMAS QUE DESFOSFORILAN: FOSFATASAS
• Ocurre en: serina, treonina o tirosina --- 1000: 100: 1
• Es reversible y puede activar o inactivar.
• La fosforilación:
– Carga negativamente a la proteína (añade 2 cargas negativas).
– Sirve de reconocimiento por otras proteínas (SH2 reconoce cadenas
laterales tirosina fosforiladas).
PROTEIN QUINASA
• Familia de proteínas
relacionadas.
• Sitio activo posee dos
lugares:
– Unión al ATP
– Unión al péptido a fosforilar
• Asas en su superficie:
interactuar con ligandos.
Evolución de las proteinquinasas
Quinasas importantes (I)
• QUINASAS CDK
• Son serina/treonina
quinasas.
• Participan en la división
celular.
Y
• Se activa en 3 pasos:
– Unión a una ciclina T
– Fosforilación en
treonina
– Desfosforilación en
tirosina
Quinasas importantes (II)
QUINASA TIPO Src
• Son tirosin quinasas.
• Provienen por evolución de las
serinas/treoninas quinasas.
• Están ancladas a la membrana celular.
• Activan en 3 pasos:
– Eliminación del (P) de tirosina 527 (pollo) y
530 (humano) en el extremo C-terminal.
– Unión de SH3 a proteína activadora
– Autofosforilación (P) en residuo tirosina
416 (pollo) y 419 (humanos) de su dominio
quinasa (SH1)
Activación de la quinasa Src
Activación de la quinasa Src
Activación de la quinasa Src
Resumen PROTEIN QUINASAS
SERIN/TREONIN TIROSIN
QUINASAS QUINASAS
Dominio quinasa (SH1) = Dominio quinasa (SH1)
Usan ATP = Usan ATP
Bucles de regulación ubicados Dominios de regulación
en la superficie SH2 y SH3
Ubicadas en el citosol/núcleo Ubicadas en la membrana
celular
Primeras en aparecer Evolutivamente son más
recientes
Ejemplos: Cdk Ejemplos: Src
Src
en el cáncer
FAMILIA Src
La proteína Src es una tirosin
quinasa (usa ATP).
Está unida a la membrana
celular por acilación en su Exterior
extremo N-terminal.
Señaliza a nivel de la
membrana celular.
Es un protooncogen (2 -
5 % de todos
los cánceres humano).
Src es una proteína quinasa
Src Normal y mutante
II. ACTIVACIÓN POR GTP: Proteínas G
• Son proteínas que unen e hidrolizan GTP: Son GTP asas.
– Proteína unida a GTP: activa
– Proteína unida a GDP: inactiva
• Para activarse realizan intercambio de GDP por GTP.
• REGULACIÓN:
– Son inactivadas por GAP: Proteína activadora de GTP asa. Induce a
hidrolizar el GTP unido a GDP + Pi.
– Son activadas por GEF: Factor intercambiador de nucleótidos de
Guanina: Induce la liberación de GDP y acoplamiento de GTP.
PROTEINA G TRIMÉRICA
Se sitúan en la membrana plasmática.
Se activan por interacción con receptores específicos.
PROTEINA G MONOMÉRICA
-Son pequeñas son
GTPasas que
señalizan hacia el
citosol.
-Actúan como
reguladoras de
procesos claves,
como:
Proliferación celular
(p. ej. Ras)
Tráfico de vesículas
(p. ej. Raf)
Estructura del
citoesqueleto (p. ej.
Rho).
Proteina ras
Otras familias GTP asas:
Proteína EF-Tu o EF-1
• Factor de elongación en la
síntesis proteica: Carga cada
molécula de aminoacil- t
RNA.
• Se forma un complejo: tRNA
y EF –Tu unido a GTP: Si el
aminoácido unido al RNA
está colocado de forma
incorrecta para la síntesis
proteica, no se hidroliza GTP.
• Al hidrolizar el GTP: tRNA
recién transfiere su
aminoácido.
Proteína EF-Tu o EF-1
Resumen PROTEINAS GTP asas
MONOMÉRICAS TRIMÉRICAS
Activación con GEF = Activación con GEF
Inactivación con GAP = Inactivación con GAP
Usan GTP = Usan GTP
Una sola subunidad Tres subunidades: , y
Señalización hacia en el citosol Señalización a nivel de la
membrana celular
Ejemplos: Ras (proliferación Ejemplos: Proteínas G
celular), Rab (tráfico vesicular), estimuladoras (Gs y Gq) y
Rho (citoesqueleto) las proteínas G inhibitorias (Gi)
Subfamilia de las GTPasa Función
Replicación ADN
• Helicasa
• PCNA
MOVIMIENTO DE LAS PROTEINAS
PROTEÍNAS
TRANSPORTADORAS
PROTEÍNAS TRANSPORTADORAS
• Los transportadores ABC (del inglés ATP binding cassette)
son proteínas en su mayoría especializadas en el transporte
activo de sustancias a través de la membrana celular.
– PROCARIOTAS: Importa nutrientes esenciales
– EUCARIOTAS; Exporta moléculas hidrofóbicas y tóxicas.
Estructura del transportador ABC
Otras bombas ATPasa
SISTEMA CHAPERONAS-
UBIQUITINA-PROTEOSOMAS
Plegamiento cotraduccional
Ovillo
aleatorio
Estado nativo
FORMAS TRANSITORIAS: Glóbulo
fundido
TIPOS DE CHAPERONAS
Hsp 70
Actúan durante la síntesis proteica (ETAPA TEMPRANA)
Dna K en E. coli.
Se une a aa hidrofóbicos. Son ayudada por la cochaperona Hsp40
(Dna J en E. coli).
Ciclo de la Hsp 70
• La cochaperona Hsp40 «recluta» a la proteína mal plegada hacia la Hsp 70.
• Hsp 70 unido a ATP adoptan una forma abierta.
• La hidrólisis del ATP hasta ADP hace que la Hsp 70 se cierre plegando a la
proteína diana.
• El intercambio ADP por ATP libera a la proteína diana.
TIPOS DE CHAPERONAS
Hsp 60
Actúan después de la síntesis proteica (ETAPA TARDIA).
Reconoce aa hidrofóbicos. Forma de barril. Llamada chaperoninas.
Ayudadas por sus cochaperoninas (cubiertas).
CHAPERONINAS: .
Mitocondria (Hsp60), R.E. (BIP), Citosol (TCP1), Bacterias (GroEL).
Cochaperonina
(cubierta)
Chaperonina
(barril)
Ciclo de la Hsp 60
• Las proteínas mal plegadas son captadas (por interacciones hidrofóbicas) por el
barril (Hsp 60 o GroEL).
• La unión de ATP y la cochaperonina (Hsp 10 o Groes) aumenta el diámetro del
barril empezando el plegamiento de la proteína.
• La hidrólisis del ATP debilita el sistema y el ingreso de otro ATP permite liberar a
la proteína diana.
o Hsp 10
• Figure | Chaperones and protein folding
Part (a) shows the basic mechanism of the Escherichia coli Hsp70 system which comprises
DnaK (Hsp70), DnaJ (Hsp40), and GrpE. DnaJ presents an unfolded protein (U) DnaK, which
holds onto it until folding to the native state (N) can occur, provided that all structural
elements necessary for folding are available. Part (b) shows how the E. coli chaperonin
system (GroEL–GroES; shown in cross section) contains an unfolded protein in an enclosed
cage to allow it to fold. When the protein has folded into the native state, it is then released.
Modified with permission from Teter, S. & Hartl, F. U. Protein folding in vivo. in Encyclopedia
of Life Sciences (Nature Publishing Group, London, 2001) © Macmillian Magazines Ltd.
Resumen Diferencias entre CHAPERONAS
CHAPERONAS CHAPERONINAS
Acción temprana Acción tardía
Forma globular Forma de barril
Filamento de
entrecruzamientos beta
Conversión de PrP en PrP* resistente a la proteólisis
UBIQUITINACIÓN
UBIQUITINA:
• Polipéptido ubicuo encontrado en
eucariotas.
• Consta de 76 aminoácidos con un
PM = 8.5 kDa
• Presenta 7 residuos de lisina (K)
y una de glicina C-terminal.
• Posee alto grado de conservación
en eucariotas.
48
MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG
“El beso de la muerte”
Participan tres enzimas:
•E1: Activadora
•E2: Conjugadora
•E3: Ligasa
PROCESO DE UBIQUITINACIÓN
• 1. ACTIVACIÓN DE LA UBIQUITINA: Por la enzima activadora
de ubiquitina (E1) con la formación de un enlace tioéster de
alta energía y consumo de ATP.
Producto intermedio adenilil-ubiquitina (AMP ubiquitina).
• 2. Transferencia de la ubiquitina: De la E1 a la enzima
conjugadora de Ubiquitina (E2) mediante un proceso de
transtioesterificación.
• 3. Formación de un enlace isopeptídico: Entre la lisina de la
proteína diana y la glicina de la ubiquitina.
Existen tres clases principales de E3s: RING (Really Interesting New Gen), HECT
(Homology to E6-Associated Carboxyl-Terminus) y la de tipo caja U. Las de tipo U-box
actúan de forma similar a las de tipo RING
Cada G de la ubiquitina (extremo carboxilo terminal) se une a un
residuo de lisina (K) de la ubiquitina anterior generando una
cadena lineal de conjugados ubiquitina-ubiquitina: señal que
reconocerá el proteosoma.
Estructura de la ubiquitin ligasa SCF
Formada por 5
subunidades
proteicas, la
mayor de ellas
es una proteína
armazón
(cullina)
Complejo
ubiquitin ligasa:
E2-E3
Mecanismo de ubiquitinación
¿Para qué se ubiquitiniza?
• Apoptosis
• Ciclo celular y división
• Respuesta inmune e
inflamación
• Biogénesis ribosómica
• Modulación de
receptores de la
superficie celular,
canales iónicos y vías
de secreción
• Infección viral
Significado de la ubiquitinación
Lys 48 Lys 63
SEÑAL PARA DIRIGIR AL PROTEOSOMA: Poliubiquitinación por lo menos con
cuatro residuos de lisinas unidas mediante residuos de K48
SUMOILACION
Las SUMO (small ubiquitin related modifier) son una serie de
proteínas pequeñas (~100 aa) con una similitud del 20% con la
ubiquitina
PROTEOSOMA
Maquinaria proteolítica que compite con las chaperonas por las
proteínas mal plegadas. Constituye el 1% de la proteína celular.
• ESTRUCTURA:
• COMPLEJO 20S (Core)
– Cilindro central hueco
– 4 anillos heptaméricos (2,2)
– Centros activos hacia el interior
• COMPLEJO 19S (Capuchón)
– Extremos del cilindro
– 1 anillo hexamérico por cubierta.
– Dos dominios: Lid (tapa) y base.
– En inmunoproteosomas: 11S.
19S
20S
19S