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LECTURAS BÁSICAS

LA QUÍMICA DE LA VIDA

1. MATERIA, ELEMENTOS, ÁTOMOS

elemento, átomo, molécula, compuesto...son el orden de las estructuras

2. NÚMERO ATÓMICO, MASA ATÓMICA E ISÓTOPOS

Isótopos: Tiene igual número atómico, pero difieren en el número de neutrones.

N.º Atómico: # de protones

N.º Masa: Protones + neutrones

Unidades de masa atómica: uma

Masa atómica relativa: Promedio de las masas atómicas de los isótopos de una muestra.

Radioisótopos: Isótopos que liberan partículas subatómicas para lograr mayor estabilidad

Decaimineto: Proceso de liberación de partículas… puede cambiar identidad atómo C14 a N14
Proceso aleatorio pero exponencial hasta convertirse en prod diferente y más estable.

3. Enlaces

Enlaces ionicos: Sucede entre elementos con una alta diferencia de electronegatividad. En este tipo de
enlace los elementos quitan los eletrones para alcanzar el octeto y estabilizarse.

Enlaces covalentes polar: Sucede entre elementos con una diferencia de electronegatividad no muy alta,
en la que se comparten los electrones para lograr el octeto. Sucede un acoplamiento en el nivel de
energía y en el se moveran los e-. Dado que uno de los 2 elementos tiene mayor electronegatividad, los
e- tenderán a pasar más tiempo cerca de este formando una nube electronica. El hecho que los e- se
agrupen hacia uno de los atomos genera cargas parciales + o , dependiendo si estan alejados los e- o si
estan cerca.

Enlace covalente No polar: Sucede entre atomos del mismo elemento o entre atomos con una
distribución de e- similar. En este enlace sólo se comparten e- y la nube mantiene uniforme en ambas
partes.
4. Reacciones Químicas
Presentan equilibrio por tanto reflejan la ley de la conservación de la materia. Pueden ser reversibles o
irreversibles.

AGUA, ÁCIDOS Y BASES

1. Puentes de H en el agua
Gracias a la polaridad de la molecula se presentan varias propiedades.

Disolvente universal
Cohesión: Unión de varias moléculas de agua.
Adhesión: Unión de molécula de agua a otro tipo de molecula.
Alta capacidad calorifica y calor de vaporización
El hielo es menos densa que el agua líquida

Estas propiedades estan dadas por la capacidad de crear enlaces de H, que pueden ser debiles, peri
cuando aumenta su superficie puede ser tan fuerte comoun enlace covalente.

La polaridad esta dada por la capacidad del O de acaparar los e- de los H, con lo cual se estan
generando cargas parciales, además de las distancias que se crean por que se repelen los H.
De esta manera la molecula esta disponible para crear enlaces con otras moleculas = ó diferentes con
las secciones de cargas opuestas

2. Propiedades disolventes del agua.

H2O forma interacciones electrostáticas


H2O disuelve iones y moleculas polares...no disuelve las no polares (aceites)
° Polares: no tienen carga neta, pero si parciales

Capa de Hidratación:
En las disoluciones con mayor cantidad de soluto que solución, las moleculas de agua de distribuyen
uniformemente gracias a las cargas parciales. Las cargas + interactuan con el O y las – con los H.

3. Cohesión y Adhesión

Cohesión: Unión de varias moléculas de agua.


Adhesión: Unión de molécula de agua a otro tipo de molecula.
La cohesión es la causante de la Tensión Superficial. Esta tensión es una resistencia que oponen las
moléculas de H2O cuando están expuestas a una zona de aire donde no se unen a más H2O, tal
ausencia de enlaces causa que los ya existentes sean más fuertes
Capilaridad. Se da por las cohesión entre H2O y el tubo y la adhesión. Tal como sucede en los
meniscos de los tubos.

4. La Vida y las Propiedades del H2O

Rompimiento de los enlaces de H es causado por el movimiento [E. cinética]. El movimiento se da por
el calor del sistema. Cuando se rompen enlaces de H, algunas mol H2O quedan libres y escapan al
aire

Al bajar la T° no hay E. que pueda romp er los enlaces y por eso se mantienen + unidas
y sea menos densa que el H2O.
Durante el congelamiento los enlaces se separan y por tanto se expanden .

Capacidad calorífica del H2O: es la cantidad de calor para elevar la T° de un gramo en


un °C

Enfriamiento Evaporativo: Sucede cuando la E. cinética de una de las moléculas de H2O


contiene una alta E. cinética que causa el rompiemiento de los puentes de H y escapan al
aire. Cuando escapan la E. cinética prome de las mole que quedan disminuye y con la
vibración que hay entre ellas otra toma más E. que las demás rompiendo sus enlaces;
repitiendose el proceso se va perdiento E. cinética y por tanto disminuye la T°

Por qué es capaz de volar al aire y mantenerse ahí???

5. Ácidos y Bases, pH y Sol Amortiguadoras

En Sol acuosas los iones hidroxilo (OH-) pueden estar libres a pesar de tener cargas.
Por otra parte, los iones hidrogeno (H+) nunca estan libres porque se aparean con
moleculas de H2O para formar ión Hidronio (H3O)

mol: unidad para medir átomos y moléculas.


Molaridad (M): # de moles de un sto por L de sol.
# molar (# Avogadro: Igualar la masa de mol de elementos en gramos – a la masa de una
molecula de ese elem a und de masa atomica

pH: [ iones de H+] de una sln


pH= -log10 [h+]
Sol Amortiguadoras: Consisten en un par ácido-Base. La diferencia entre uno y otro es
la presencia o ausencia de un protón. Un mismo compuesto puede cumplir tal función,
entregando los H+ cuando la sol objetivo se torne muy básica o capturandolo cuando se
torne muy ácido.

PROPIEDADES DEL CARBONO

1. Carbono e Hidrocarburos

Carbono: Proteínas, ADN, ARN, azúcares, y grasas.

La posibilidad de formar 4 enlaces con otros Carbonos o con otras átomos, lo hacen
ideal para formar el esqueleto de las macro moléculas. Adicional, los enlaces covalentes
del C son fuertes

Hidrocarburos: Cadenas de C unidas sólo a H

2. Estructuras e Isómeros de Hidrocarburos

Isomeros: = formula química pero diferente en conformación espacial

Isomeros cis-trans: átomos unidos en mismo orden pero diferente en configuración de


átomos al rededor de enlaces. Só.lo en enlaces C-C sencillos. En enlaces = no porque no
pueden girar.

En dónde se pueden apreciar estas configuraciones?

Cis: En los ácidos grasos líquidos a T° ambiente se hallan enlaces = con configuración
CIS, las curvaturas evitan que se unan demasiado evitando que se solidifiquen. Ej:
Aceite de Oliva.

Trans: En los = la configuración no permite curvaturas por lo cual se mantienen rectos


compactandosen a T° ambiente y formando grasas sólidas.
Enantiómero: Igual estructura química con disposición tridimensional diferente de los
átomos que acompañan al C. Las dos estructuras diferentes es la D y la L. Las
diferencias radican en sus efectos y procedencias.

Grupos Funcionales
Son átomos que otorgan a las moléculas biológicas propuedades y reactividades
concisas sin importar dónde se encuentren.

Macromolecula tiene varios tipos de grupos funcionales. Ese conjunto de grupos dan las
características, formas, tipos de interacciones y tipos de rxns.

Grupos funcionales + comunes:


BIOMOLÉCULAS

1. Intro a las Macromoléculas:

Unión de Monomeros forma Polímeros

Carbohidratos, ácidos nucleicos y proteínas son Polimeros largos.


Por ser normalmente de gran tamaño se les llama Macromoléculas.

Lípidos No son macromoléculas, porque estan formadas por subunidades + pequeñas.

Cómo se forman los Polímeros?

Síntesis por Deshidratación. La unión entre dos monómeros se da cuando se pierde un


molécula de H2O y se unen en ese punto. Uno de los monómeros pierde un OH y el otro
un H.
La unión se da por enlace covalente.

Composición de macromoléculas, y monomeros que las componen:

ADN:
4 nucleótidos: A-G-T-C
20 aminoácidos

Proteínas:
20 aminoácidos

Carbohídratos:
Glucosa
* El almidón, el glucógeno y la celulosa también son carbohídratos compuestos por
monómeros de glucosa pero con diferencia en los enlaces y ramificación.

* Requiere energía para la unión

Cómo se separan los Polímeros?

Por Hidrólisis. Un enlace se rompe por el ingreso de una molécula de H2O. A un


monómero se adhiere un OH y al otro un H.

Libera E. durante la separación por rompimiento de enlaces


Hay enzimas que participan en la Hidrolisis que terminan en asa (lipasas en lípidos,
peptidasa en proteína)

2. Carbohidratos

Pueden ser: Glucosa, Galactosa y Fructosa.


Tienen la misma formula pero Se diferencian por la ubicación espacial de sus OH.
La Glucosa y la Galactosa son estereoisómeros enntre si. Átomos enlazados en el
mismo orden pero diferente organización alrededor del C similar.
La fructosa es un isomero estructural de la glucosa y la galactosa.

Se organizan en: Monosacaridos, Disacáridos y Polisacáridos.

Monosacárido: Es una unidad de glucosa C6H12O6. Su representación (y se pueden


presentar) puede ser abierta a en anular (anillo).

Pueden tener una configuración alfa o beta, según la ubicación del OH del
carbono en el que se forma el anillo. Alfa cuando el OH esta por debajo y Beta
cuando esta por encima.

Disacárido: Es la unión de 2 Glucosas o dos tipos diferentes de carbohídrato. La unión


es por un enlace glucosídico- covalente
Polisacárido: Es la unión de mas de 2 monómeros de glucosa. Son cadenas largas.
Ej princ: almidón, glucógeno, celulosa y quitina.

En las plantas se reservan como almidón y en los animales como glucógeno.

Almidón: Puede ser amilosa o amilopectina.


Amilosa: Son uniones de glucosa por enlaces 1-4 no ramificadas que
presentan una estructura casi lineal y helicoidal.

Amilopectina: Son uniones de glucosa 1-4 principalmente, pero también


se presentan uniones 1-6; lo cual hace que presenten
estructuras ramificadas y helicoidales.

Glucosa: Es un polímero de glucosa con más ramificaciones que la amilopectina de las


plantas. Se reserva en células hepáticas (hígado) y musculares.
Celulosa: Compuesto de enlaces de monosácaridos, es la estructura lineal que le da la
estructura y función a las paredes celulares de las plantas.

Quitina: Similar a la celulosa, pero los monómeros de glucosa tienen un grupo de


nitrógeno que da rigidez a la caparazón del exoesqueleto

3. Lípidos

Lípidos: están compuestas por 1 Glicerol y 3 colas de ácidos grasos. El Glicerol es una
molécula orgánica con tres grupos hidroxilo OH. Las colas de á.g son cadenas largas de
corbohidratos unidas a un grupo carboxilo. El Glicerol y las colas se unen por
deshidratación.

Trigliceridos: Son moléculas de grasa que se forman cuando Cada Uno de los grupos
hidroxilo del esqueleto del Glicerol reaccionan con las colas o ácidos grasos.
Deja como resultado tres colas de ácido graso unidas a una cabeza, Glicerol.
* Las cadenas de un triaglicero pueden variar en longitud, desde 4 hasta 36 C y en
saturación. Son hidrofobicas

Ácidos Grasos Saturados e Insaturados: Las diferencias entre una y otra radican por el
tipo de enlaces entre los carbonos de las colas.

Saturados: Presentan sólo enlaces sencillos. Son cadenas que estan saturadas porque
todos sus carbonos estan ocupados con enlaces de H (estan saturadas de H).Este tipo
de enlace favorece estructuras lineales casi rígidas que propician que las colas
mantengan rectas y unidas. Este tipo de grasa permanece sólido a T° ambiente.

Insaturados: Presentan enlaces dobles. Hay variaciones cuando en una cola hay 1 =
que es Monoinsaturado y cuando hay varios = que son Poliinsaturado. Cuando hay
enlaces dobles estos pueden presentar 2 configuraciones: Cis y Trans.

Cis: Los C que forman el = tienen en el mismo lado los H que los acompañan.
Esto provoca que la cadena tenga forme un quiebre que hace que las
grasas no se compacten y permanezcan líquidas a T° ambiente.

Trans: Los C que forman el doble enlace tienen en forma alterna los H que los
acompañan (uno abajo y otro arriba). Esto hace que la cola
permanezca rígida y la grasa este solida a T° ambiente.
No suelen encontrarse de forma natural, pero las producen facilmene de
con métodos industriales, por Hidrogenación. Este proceso realizado
lípidos que pueden tener enlaces = cis produce un efecto indeseado;
convierte varios de estos enlaces a trans.

Ácidos Grasos Omega

Hay 2 compuestos que producen los 2 tipos de á.g.o:

Ácido alfa-Linolénico (ALA): Precursor del Omega-3


Ácido Linoleico (LA): Precursor del omega-6, con
*Ambos tienen al menos 2 enlaces cis.

DHA: Derivado del ALA, presenta 6 enlaces cis-insaturados

Son ácidos esecenciales y por tanto se obtienen de la dieta

Ceras: Son cadenas largas de ácidos grasos unidas alcoholes por enlaces éster. Se suelen
encontrar como protección en la epidermis de las plantas y en las plumas de aves. Las
producidas por plantas también tienen carbohidratos sencillos o colas cortas

Fosfolípidos: A diferencia de los lípidos, en el glicerol una de las cadenas de ácidos


grasos esta sustituida por un fosforo; quedando con sólo 2 colas.
El grupo fosfato es un Modificador que indica la función en la célula.

Presentan arreglo de baja E. en el agua al crear micelas

Pedir Explicación al profesor???


“Una micela es una estructura ordenada, pero su formación en realidad aumenta la
entropía
(desorden o número de microestados) del sistema, en comparación con tener los
fosfolípidos
distribuidos entre las moléculas de agua. Esto se debe a que las colas de ácidos grasos
de los
fosfolípidos limitan el número de microestados disponibles para las moléculas de agua
con las que
están en contacto, de manera que estas deben formar una especie de cavidad alrededor
de las colas
de cada fosfolípido. El secuestro de las colas de ácidos grasos al interior de la micela
libera las moléculas de agua, lo que permite al sistema tomar un mayor número de
microestados (es decir, aumentar su entropía). 7,”
Esteroides: Son moléculas lipídicas diferentes a las mencionadas. Son anillos con una
cola corta (a.g) que componen las hormonas. Hidrofóbicas.

Colesterol: Precursores de los esteroides-hormonas sexuales. Es parte de la membrana y


de vitaminas no escenciales como la D.

4. Ácidos Nucleicos
Á.N= ADN, ARN
1 Azucar (Desoxiribosa) + G. Fosfato + Base Nitrogenada = Nucleotido para ADN
1 Azucar (ribosa) + G. Fosfato + Base Nitrogenada = Nucleotido para ARN

Las bases se denominan porque el N puede protonarse capturando H+

ADN: A-T-G-C
ARN: A-U-G-C

Cadena inicia 5’y termina en 3’. En 5’inicia con un G. fosfato y en 3’termina con un
hidroxilo (OH)

Doble Helice se

ADN ARN
Conservar la info genética: decir función Síntesis de Proteínas. Copiar,
cómo se deben construir proteínas Transcribir, Transportar, Regular,
Nucleotido: A-T-G-C Nucleotido: A-U-G-C
1 Azucar (Desoxiribosa) + G. 1 Azucar (ribosa) + G. Fosfato
Fosfato + Base Nitrogenada + Base Nitrogenada = Nucleotido
ADN ARNm, ARNr, tARN, ARN regulator
2 Cadenas 1 Cadena

ARNm mensajero
Gen que codífica proteína “x” se activa
ARNm va hasta el gen y hace una copia de la info del gen.
Sustituye la T por U
Lleva la info hasta un ribosoma y se asocian
Ribosoma va leyendo los nucleotidos de la copia en grupos de 3 nucleotidos [codones]
Para cada codón agrega un a.a
ARNr
Ayuda a que se vuelvan parceros el ARNm y el Ribosoma. Hace que se unan en el punto
exacto.
Ayudan a la unión de los a.a ...son ribozimas-catalizadoras

ARNt
Ayuda llevando a.a al ribosoma para la construcción de la proteínas.
Se aseguran que el a.a que indica la copia sea el que se va adicionar.

MiARN y siARN

No codifican proteínas
Interfieren al ARNm para desestabilizarlo e impedir que el ribosoma lo lea

6.Niveles de Proteínas

1ría
Son a.a consecutivos en cadenas polipeptídicas. Pueden ser 2 cadenas consecutivas Alfa
y Beta que se unen por enlaces según la proteína.

2ría

Consisten en interacciones entre el grupo carbonilo “O” y el grupo amino “NH” del
mismo polipeptido o de otra cadena polipeptidica.

Alfa: Es una sola cadena polipeptidica que se enrolla en si misma por los enlaces de H y
el O. Interacciones verticales.

beta: Son 2 cadenas polipeptidicas que se alinean paralelamente entre las que hay
interacciones H y O; en un orden estricto en direcciones contrarias. Las interacciones
son paralelas.

En ambos tipos hay ausencia de los enlaces del grupo R de los a.a.
Las proteínas 2rías pueden presentar alfa y beta en simultaneo o sólo alguna de las 2.

3ría

Compuesta por enlaces no covalentes que se dan por la atracción o repulsión de los
grupos R. El único enlace covalente es el disulfuro S-S siendo la más fuerte. Por las
características de los grupos R, se presentan zonas hidrofobicas e hidrofilicas; las zonas
fóbicas quedan al interior y las filicas al exterior
4ría
Se da por la combinación de cadenas polipeptidicas. Múltiples cadenas que pueden ser
beta y alfa se unen por enlaces no covalentes.

Desnaturalización

En la perdida de la estructura de las cadenas de orden superior, pero quedando el


polipeptido básico. Se da por cambios en T° y pH. Algunas Proteínasy bajo ciertas
condiciones se pueden reconfigurar nuevamente solas o con ayudas de proteínas
chaperonas.

ENERGÍA Y ENZIMAS

1. Metabolismo
Esta estructurado en una red de Rutas para producción de compuestos a partir de otros,
utilizando la adenonina trifosfato [ATP] como la molecula de intercambio entre una y
otra ruta.

La principal ruta es la usada por las plantas para convertir la energía química del sol en
E. cinética y E. termica [calor]. Ellas toman el CO2 + 6H2O + E. y producen glucosa
C6H12O6 + E.. El metabolismo implica ambas rutas la producción de glucosa y el
consumo para mantener las reacciones que le permiten mantenerla. Se representa en 2
tipos de metabolismos:

Anabolico: moleculas pqueñas + E. las utiliza para producir moléculas grandes y


complejas

Catabolico: Moleculas grandes son degradadas para producir moleculas que la célula
pueda usar. Da moleculas + pequeñas y libera E.

Ambos tipos de metabolismos estan intervenidos por enzimas.

2. Tipos de Energía

Cinetica: Elementos en movimiento


En química las moleculas que estan en movimiento por la T° representan esta E.

Potencial: Por la ubicación de los Objetos que dan una ventaja


Los enlaces químicos son la mejor representación

La transformación permite pasar de una a otra.


3. Leyes de la Termodinámica

1ra Ley: La E. no se destruye ni se crea…

2da Ley: La E. en forma de calor tiende a alterar el orden del sistema aumentando la
entropia.
La E. transferida se una parte sera utilizada y otra no [calor], la que no puede pasar a
trabajo se transferira como calor y aumentara la entropia. No siempre la E. puede ser
util: Cada Transferencia aumentara la entropia y disminuirá la E. utilizable disponible
para trabajo.

Incremento global de la Entropía por la constante inversión de E. en procesos


metabolicos simples y/o complejos. En donde se libera E. al mismo tiempo que se gasta
una parte de la disponible y otra pasa a calor.

4. Energía Libre
Indica el cambio en la E. entre reactivos y productos; o la energía utilizada del total de la
liberada. Se representa con:

!G= !H - ! T*!S

!H: indica la e. presente en los enlaces de los reactivos. Cuando es – se indica que
liberan e. al pasar a productos

!S: indica el desorden del sistema afectado por la T. Si es + indica que el sistema se
vuelve más desordenado.

T°: medida en K influye en la !S y !H

La actividad de las 3 variables determinarán si la rxn ocurre de manera espontanea o no


espontanea.

Espontanea: !H es negativo y !S es positivo. El 1ro libera e. de los enlaces y el 2do


implica que el movimiento de las moléculas es alto y por tanto hace + viable la reacción
por los choques.

No espontanea: !H es positivo y !S es negativo. El 1ro Indica que no hay sufucuente e.


en los enlaces y se requiere del medio externo. El 2do indica que el sistema esta en un
grado alto de orden y no sucedera sin adición de e. del medio externo.

Rxn Exergónica [!G < 0] : Cuando la e. libre de los reactivos es mayor que la de lso
productos sucederá espontaneaminete...No es necesario añadir e. LIBERA E.
rxn Endergónica [!G>0] : Cuando la e. libre de los productos es mayor que la de los
reactivos y or tanto es necesario añadir e. a los reactivos para que suceda la rnx. SE
CONSUME E.

Equilibrio Químico: Indica el punto en el que las rxn en ambos sentidos adquieren la
misma velocidad que esta definida por la [ ] de reactivos y productos y por tanto las
rxn ocurren en ambas direcciones. Con iguales [ ] la e. de los enlaces no variara y la e.
libre será menor. Si aumentan las moléculas en algunos de los lados, la e. libre
aumentará por los nuevos enlaces y sucederán rxn en el sentido contrario en busca de
equilibrio nuevamente.

¿Cómo es el equilibrio Q. En la celula?

La célula no necesita equilibrio químico porque si lo alcanza simplemente muere, no


habría e. libre para trabajar. Utiliza mecánismos para mantenerse activa:

Importa moleculas de reactivos


Exporta molécula de productos
Transfiere productos a otras rutas metabólicas

5. Reacciones Acopladas
Una rxn acoplada indica una 1ra rxn entre un ATP y un reactivo que produce un
producto [mol + Pi]. En ella se libera ADP y se da la asociación de un Pi a una molécula
que participara en una 2da rxn como reactivo, este Pi lo hace inestable y al liberarlo
propicia la unión con el otro reactivo para producir un producto final.
Un ejemplo es la Bomba Sodio/Potasio en donde:

Al interior hay Na y el exterior hay K


En el interior la proteína hidroliza un ATP y se une a ella un Pi y libera el ADP.
El Pi modifica la proteina y la abre uninendose a su interior 3 mol de Na+. Al tiempo la
abre al citoplasma liberando el sodio
En esa apertura se adhiere al interior el K que causa que libere el Pi y modifica la
estructura de la proteína y hace que se cierre y se abra al interior liberando el K.

6. Energía de Activación
e. miníma requerida para que se de una rxn

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