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2da Clase Bioq. II (Tercer Bloque) Dr. Moreno
2da Clase Bioq. II (Tercer Bloque) Dr. Moreno
Los dímeros que se pueden formar que son importante para el ensamblaje del
nucleosoma.
Hay un tetrámero que son repeticiones de 2 proteínas H4 y H3, luego hay un dímero de 2
proteínas H2.
¿Cómo se forman?
1. El ADN arropa a este tetrámero
2. Acepta el dímero para formar verdaderamente el nucleosoma.
El autor representa las cabezas catiónicas porque eso le da dinamismo al nucleosoma.
HISTONA H1
Une dos distintas regiones de ADN:
1. Conector del ADN en un extremo del nucleosoma.
2. Centro del ADN que arropa al nucleosoma.
La presencia de la histona H1 produce un ADN NUCLEOSOMAL
mucho más compacto, (grado de compactación: 5). La presencia de
H1 presenta un DNA mucho más compacto y lógicamente eso
produce una compactación adicional.
Y ahora a partir del nucleosoma vamos hablar del grado de compactación hasta llegar a la
formación del cromosoma ¿Qué es lo primero que se hace? Cuando tenemos los nucleosomas,
la proteína histona en presencia de un estado intracelular característico, es decir, que haya una
elevada concentración de sal, que hace que las proteinas H1 se acomplejen y formen estructuras
de esta configuración. Y entonces al acomplejarse las 6 H1 forman como un anillo que tiene 6
nucleosomas, entonces se agregan, haciendo que las fibras de 10 nanometros se arrollen para
dar una concentración más condensada, que es la configuración de solenoide.
CLASE 2 Bioquímica genética
Dr. MORENO YANES
19 - Febrero - 20
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Hemos hablado de las proteínas histonas, pero el segundo paso de compactación también
es garantizado mediante la utilización de otras proteínas, porque este solenoide se enrolla a
través de un eje proteínico (que las mencionamos ayer) entonces forma bucles o asas y eso
representa una compactación muchísimo mayor. Entonces ya tenemos un tercer grado o nivel
de compactación.
Entonces, hemos visto que el grado de compactación en la forma del solenoide, luego se
enrolla a través de un eje proteínico, donde no solamente las histonas intervienen, sino también
proteínas de alta movilidad no histonas, ¿sirven de base para qué? Para que los solenoides se
vayan enrollando y se vaya condensando. Donde se está formando un grado de condensación que
llega hasta 50.000 con respecto al iniciado.
Pero no solamente esto, porque está es eucromatina; todavía estamos en una cosa que
no está muy muy compactada. Pero sí se enrolla, por lógica, tenemos muchísima mayor
compactación y entonces originamos la heterocromatina ¿y cuál es la diferencia fundamental
entre la heterocromatina y la eucromatina?
La heterocromatina NO es activa. No hay expresión genética. El grado de condensación
es fundamental. Porque ese grado de condensación implica que pueda utilizarse en la expresión
genética o que no pueda utilizarse. Porque la ADN polimerasa necesita sitios donde colocarse ella
y donde colocar todos los factores que utiliza para activarla, entonces si todo está junto a mí me
parece que la ADN polimerasa no tiene ningún sentido de transcripción.
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codificable es mínima todo lo demás para muchos autores es ADN basura. Pero resulta que eso
cada día es menos cierto. Y lo que pasa es que no conocemos la cosa y es bonito descartarlo.
Y luego tenemos por ejemplo ya la formación del último nivel de compactación es el
cromosoma metafasico. ¿Y cómo
se forma el cromosoma? Bueno la
eucromatina, la heterocromatina
fíjense, su condensación mayor se
llevó a cabo en metafase, adquiere
un aspecto típico. 2 cromatidas
separadas entre sí. Entonces la
fibra de la heterocromatina se
forman espirales, por 2 veces
primeramente 1 espiración y luego
nuevamente una segunda
espiración.
Y eso no es que aumente el tamaño ni mucho menos, pero si disminuye el tamaño del
cromosoma. Y entonces lógicamente eso le permite adaptarse al procesamiento donde
interviene.
Está claro lo que son los nucleosomas, Como se utilizan, las células y la función que tienen? Yo
quiero que ustedes analicen esta parte lo que habíamos visto inicialmente esto, la importancia
dentro del cromosoma tiene estas cadenas laterales. No es solamente la descripción del
nuecleosoma es entender para que sirve, como se mueve, como se procesa etc.
ESTABILIDAD DEL GENOMA Y MUTACIONES
¿Qué son las mutaciones? Alteración en la secuencia de ADN del
genoma de un individuo que se transmite a sus descendientes.
¿Por qué se producen? Se pueden producir por errores en la replicación,
alteración de los nucleótidos, alteración de los nucleótidos por agentes físicos
o químicos externos.
¿Dónde se presentan? Pueden presentarse en cualquier parte del
genoma, en secuencias codificantes y no codificantes, tanto del genoma
nuclear como del genoma mitocondrial. En ciertas partes tienen más influencia que en otras. Las
mutaciones mitocondriales son mucho más frecuentes y más graves que las mutaciones del
genoma nuclear.
Pueden presentarse en celular germinales y ser heredadas, también pueden presentarse
en células somáticas y no ser heredadas.
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código genético se mantiene, los codones se mantienen en este caso son 3 pero ¿en el caso
anterior que eran 4 que paso? La proteína cambió totalmente.
secuencia micro satélite donde se repite una secuencia de 3 mil veces, se vuelve loca y se
equivoca.
Entonces cuando hay la replicación lógicamente hay 2 cosas que controlan:
1) La selección de lo nucleótidos (esto no es al azar) hay la unión de un nucleótido a la ADN
polimerasa, luego ella lo coloca en el sitio de unión.
2) La unión del nucleótido al extremo 3’ del poli nucleótido que se está formando.
Yo tengo esto, aquí ha habido el deslizamiento de la ADN polimerasa, estas células se van
a replicar, esto se separa entonces por ejemplo se replica esta entonces me da esto, esto es
normal, pero cuando esta se arregla y se replica la secuencia.
¿En este caso cual enzima arreglaría la secuencia? La DESOXINUCLEASA, la revisión de prueba
(como digo yo), eso es un término de
imprenta.
Entonces fíjense, esto es muy
interesante porque las mutaciones son
muy muy profundas muy graves. Fíjense
aquí tenemos lo mismo que les acabo de
decir pero aquí formo como una
horquilla, un lazo, pero cuando esto se
replica, fíjense que es lo que pasa con lo
normal, pero fíjense que es lo que pasa
con la otra hebra. Fíjense que aquí debía
haber sido igual, pero aquí aparecieron
muchísimas más repeticiones en la
proteína o en lo que se está formando.
Vean ustedes aquí esto es una proteína
normal que tiene ciertas y determinadas secuencias de micro satélite repetitivas GAG, GAG, GAG,
entonces esto es normal, la proteína pone 10, 20, 30, pero es normal, pero cuando hay ese
deslizamiento fíjense ahora que en vez de 10 hay 80, entonces fíjense en como varia la proteína,
eso es una mutación bastante grave.
Eso es lo que pasa en la enfermedad el baile del Sambito, Huntington ustedes saben que
nosotros tenemos en Venezuela una región en el sur del lago donde la enfermedad de Huntington
viene de hace muchos años, y han venido investigadores tanto zulianos como del extranjero a
estudiar la enfermedad sobretodo la parte hereditaria de la enfermedad.
¿Ese bucle en si se hizo es porque la secuencia de la polimerasa es muy repetitiva
entonces recreo más? Yo le voy a poner un ejemplo muy claro, hagamos la semejanza, si yo tengo
una cuenta corriente y tiene 78920 que hay un 1, un 0, yo lo leo muy claro, pero cuando me ponen
en una mismas secuencia diez 2, o diez 0 me cuesta muchísimo, porque me tengo que parar y
decir 1, 2, 3… y eso no solo me pasa a mi porque sea mayor a todos nos pasa, porque la visión no
da para eso, habrá gente que sí, pero la gran mayoría no. Tenemos un deslizamiento es lo mismo
que la ADN polimerasa, le ponen 1000 veces CAG, CAG, CAG, y para contar eso, para que lo haga
con exactitud la replicación de eso hay que tener guáramo, entonces se puede confundir también,
eso es lo que pasa aquí, fíjense que aquí ha habido un deslizamiento y ha quedado toda esta parte
de esta hebra sin replicar y por eso se forma esta estructura.
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Cuando esto se replica, ¿Qué sucede? Que esto se estira y en lugar de tener 3 o 4 aparecen
20 y es lo que da origen a una mutacion. Esto es lo que sucede en la enfermedad de Huntington,
teníamos inicialmente de 10 a 26 repeticiones y ahora aparecen de 37 a 80 y eso no es normal, y
conlleva a una transformación de la proteína resultante que pudiera tener efecto o no.
Les muestro las enfermedades por
repetición de nucleótidos y vean que son muy
comunes, las repeticiones son de diferente
naturaleza, generalmente son microsatelites
de 3 o 4 nucleotidos
Para evitar esto en las células deben existir mecanismos de reparación que puedan
detectar y corregir estas anormalidades.
Les voy a dar un ejemplo general, si lo entendemos, vamos a poder entender todos los
mecanismos de la reparación:
Supongamos que tenemos un
emparejamiento anormal T-G, ¿Qué hace la celula
primero? Reconoce el sitio donde esta la mutacion o
la pro-mutacion. Hay un complejo reparador que se
encarga de reconocer el sitio donde esta la mutacion,
luego hay que eliminarlo, ese complejo reparador y
de reconocimiento se debe transformar en un
complejo de corte que al cortar el ADN elimine ese
emparejamiento anormal.
El complejo de reconocimiento acepta ciertas
proteínas y ciertas actividades enzimáticas que van a
permitir que el ADN se separe, el corte de la hebra
con la mutacion… estas enzimas anexadas tienen
actividad de escindonucleasas que son capaces de cortar el ADN en ambos extremos, dejando
libre el extremo 3’ porque sino la ADN polimerasa no puede actuar.
Una vez eliminada la parte que debe ser modificada,
entra en funcionamiento la ADN polimerasa utilizando esto
como primer ya que tiene el extremo 3’ libre puede alargar la
hebra y rellenar el espacio libre y al final es una enzima Ligasa
la que cierra. Estos son los pasos generales que luego pueden
ser utilizados para reparar y eliminar los errores.
Hay una pregunta que debemos hacernos y es ¿Cómo
las enzimas del complejo reparador reconocen que hebra es
la que debe ser modificada? Generalmente la que se debe
modificar es la que esta recién sintetizada. Pero ¿Cómo
reconoce la maquinaria enzimática de la celula cual de las 2
es? Pues ahí intervine otro proceso de transformación del
ADN que es la metilación; el ADN tiene ciertas secuencias en
sus nucleótidos que permiten a las Enzimas Metilasas metilen
al ADN en esa secuencia. Si pasa mucho tiempo al final las 2
hebras pueden ser metiladas, pero hay un desfase y la que se metila inicialmente es la parental,
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