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Classification of diabetic retinopathy based on hard

exudates patterns, using images processing and


SVM.
Fernanda Cisneros-Guzmán, Saúl Tovar-Arriaga, IEEE Senior Member , Carlos Pedraza, IEEE Senior Member, Arturo González-Gutierrez
Facultad de Ingeniería
Universidad Autónoma de
Querétaro Querétaro, México.
mfcg_14@hotmail.com

Abstract— Diabetic retinopathy (DR) is an ocular disease


very common on diabetic patients. It is developed when the TABLA I. CLASIFICACIÓN ESCOCESA DE RETINOPATÍA DIABÉTICA[3]
patient present a high level of glucose in blood which in Grado de retinopatía Hallazgos oftalmológicos
diabética observables
consequence results in damage on the retina bloods vessels.
RD Ausente •No hay anomalías
The diagnostic of DR consists on the detection of different RD No proliferativa leve •Microaneurismas
characteristics presented on the back of the eyeball, like •Microaneurismas
RD No proliferativa moderada •Hemorragias
microaneurysms, exudates, retina hemorrhages and thickness
of veins. On this article we propose the detection of hard •Hemorragias intrarretinianas
•Cuentas venosas definidas
exudates and the segmentation of blood vessels through image RD No proliferativa severa •Anomalías microvasculares
processing for retinopathy detection. The main goal is the intrarretinianas.
automatic classification images that present exudates or not. •Exudados
On an early step, the isolated characteristics by means of the RD no proliferativa severa y 1 o más
de los siguientes:
image segmentation can be used for a support vector machine RD Prolifertativa
•Neovascularización
to determine the exudates presence. This proposal has been •Hemorragia vítrea/preretiniana
tested on a database of 130 images and the results obtained a
maximum sensitivity of the 87.3% and a specificity 84.6%. Se han realizado varios esfuerzos en la detección
Although the proposal is focuses on detected diabetic automática de RD. Sin embargo, en este artículo se
retinopathy it has been found that it could be used for the
progression and diagnosis of macular edema.
presentan ejemplos significativos más recientes basados en
Aprendizaje Automático (ML), sin tomar en cuenta las
Keywords— retinopatía diabética, máquina de vectores de contribuciones realizadas con Aprendizaje Profundo (DL).
soporte, diagnostico automatizado, procesamiento de imágenes. A pesar de que los avances en DL han sido muy
importantes, este tipo de aprendizaje requiere de bases de
datos muy amplias que deben estar etiquetadas de manera
I. INTRODUCCIÓN adecuada. Las bases de datos públicas disponibles[5][6]
presentan varios problemas para el uso de DL: la mayoría de
La Academia Nacional de Medicina de México ha
declarado que en México la Diabetes Mellitus (DM) es la las imágenes no presentan RD (o solo presentan de un tipo
segunda causa de muerte en hombres y la primera en de RD), algunas imágenes están mal etiquetadas, hay
mujeres, esta enfermedad causó cerca de 83,000 muertes en presentes otro tipo de enfermedades, etc. Esto afecta en el
el país, de acuerdo con cifras recolectadas desde el año entrenamiento de la red neuronal, y puede llevar a sobre-
2015[1]. La Retinopatía Diabética (RD) es una entrenamiento.
complicación visual, crónica y especifica de la diabetes, En este trabajo de investigación se emplean técnicas de
tiene una prevalencia del 43.6% a nivel internacional, y en Aprendizaje Automático en las cuales no es necesario contar
México se estima una prevalencia del 31.5% de acuerdo con un gran número de imágenes y que al mismo tiempo pueden
la Federación Mexicana de Diabetes A.C.[2]. La RD sigue ofrecer un excelente grado de reconocimiento[7][8] . Así
siendo la causa principal de pérdida de visión en mismo, las bases de datos disponibles son suficientes para
poblaciones de adultos en edad laboral, se desarrolla con el realizar un buen entrenamiento. Una comparación entre ML
tiempo y se asocia a la deficiencia en el control de lípidos y DL se puede observar en la tabla II.
sanguíneos, presión arterial y glucosa en sangre. La RD de
acuerdo con la clasificación escocesa se divide de acuerdo TABLA II. CARACTERÍTICAS DEL APRENDIZAJE AUTOMÁTICO Y EL
APRENDIJZAJE PROFUNDO[9]
con el tipo de afección que tenga el paciente, como se
muestra en la tabla I[3]. Los exudados duros son lesiones en
forma de depósitos blancos o amarillentos, que cuando se
presentan en la mácula son un signo de edema macular
actual o anterior. El edema macular más frecuente es el
asociado a la RD[4]. Se le llama edema macular al acúmulo
de líquido y la inflamación en la mácula, la parte del ojo
encargada de la visión fina de los detalles y la visión central,
y se desarrolla cuando los vasos sanguíneos de la retina
tienen fugas de fluidos.

978-1-7281-1614-3/19/$31.00 ©2019 IEEE


Aprendizaje automático Aprendizaje profundo
Buenos resultados con Requieren grandes
pocos datos cantidades de datos
+ -
Rápido entrenamiento Carga computacional
intensa
+ -
Se necesitan diferentes
Las características y
características y
clasificadores aprenden
clasificadores para automaticamente
alcanzar buenos resultados
- +
La exactitud no mejora La exactitud no tiene un
después de un punto límite de mejora
- +
En [10] se aplicó clasificadores para la detección imágenes de fondo a través de un método de preparación de
automática de la enfermedad, utilizando métodos de imagen adecuado. A la luz de la proximidad de este tipo y su
extracción de datos donde por medio del procesamiento de suma en las imágenes de fondo, se decide el nivel de RD en
imágenes se resaltan los micro-aneurismas en la imagen los sujetos de estudio, reportando como resultado una
como característica principal, ocupando el método de exactitud de 85%.
validación cruzada y obteniendo una exactitud del 76.67%
en la predicción de la enfermedad. Mahendran[11] consigue
una exactitud de 88.10% en la detección automática de RD
mediante la segmentación de exudados en las imágenes de
retina del fondo de color y también clasifica el rigor de las
lesiones. La toma de decisiones del nivel de gravedad de la
enfermedad fue realizada por el clasificador SVM.

TABLA III. ESTADO DEL ARTE


Autor Lesión Validación Exactitud
Ramani, et al. Validación
(2012)[10] Microaneurismas cruzada 76.67%.
Gandhi et al.
(2013)[11] Exudados No reporta 88.10%
Swati Gupta, et 70%
al. Microaneurismas entrenamiento y 85.60%
(2015)[12] 30% de validación
Sahana Shetty, et
al. Microaneurismas No reporta 96.90%
(2016)[13]
Microaneurismas
Enrique V.
, Exudados,
Carrera, et al. No reporta 94%
Vasos
(2017)[14]
sanguineos
Ramya Exudados y
(2018)[15] Hemorragias 70-30 86%

Swati en 2015[12] mostró una exactitud del 85.60% en la


clasificación del grado de RD. Para detectar
microaneurismas retinales y exudados, las imágenes de los
fondos retinianos se toman del conjunto de datos de
Messidor. Después del preprocesamiento, se realizan
operaciones morfológicas para encontrar la característica y
luego se extraen las características, como GLCM y Splat
para la clasificación.
Sahana en 2016, obtiene como resultado una exactitud
del 94% en la predicción de RD[13]. Comienza su estudio
con el procesamiento previo de las imágenes del fondo de
ojo, eliminando el disco óptico del fondo del ojo y luego
separando el tejido vascular del área dañada de la retina. Las
áreas dañadas de la retina consisten en lesiones oscuras y
brillantes. Morfología matemática se utiliza para detectar la
presencia de lesiones oscuras.
En 2017, en una etapa inicial de procesamiento de
imágenes Carrera aísla vasos sanguíneos, micro aneurismas
y exudados duros para extraer características que pueden ser
utilizadas por SVMs para determinar el grado de retinopatía
de cada imagen[14]. Esta propuesta se ha probado en una
base de datos de 400 imágenes retinales etiquetadas según
una escala de retinopatía diabética no proliferativa de 4
clases. Como resultado, se obtuvo una sensibilidad máxima
del 95% y una capacidad predictiva del 94%.
En 2018, Ramya propone una técnica para el
descubrimiento del nivel de afección de la RD, se acentúa en
la presencia de dos tipos de RD, hemorragias y
exudados[15]. Estos tipos pueden eliminarse utilizando
imágenes de fondo de ojo de pacientes y manejando estas
Máquina de Vectores de Soporte (SVM) es un
algoritmo de aprendizaje supervisado perteneciente a
Aprendizaje Automático, que es denominado como método
de kernel o máquina de kernel.
Para clasificación o regresión es posible la aplicación de
SVM. Es muy utilizado en el procesamiento de lenguaje
natural, habla, visión artificial y el reconocimiento de
imágenes. SVM se construye a partir de un hiperplano
óptimo que se toma como superficie de decisión, de manera
que las clases se separan en un margen máximo. Los
vectores de soporte hacen referencia a un pequeño
subconjunto de las observaciones de entrenamiento que se
utilizan como soporte para la ubicación óptima de la
superficie de decisión[16].
Por su naturaleza SVM tiene la ventaja de obtener
buenos resultados, utilizando pocos datos a diferencia de
otras técnicas de inteligencia artificial. En nuestro caso la
base de datos cuenta con 130 imágenes adecuadamente
etiquetadas las cuales son suficientes para tener datos de
entrenamiento y datos de validación. En este trabajo de
investigación se propone realizar un informe asistido por
computadora basado en el procesamiento digital de
imágenes de retina. Nos concentramos en la detección de
exudados en la mácula, ya que es un factor importante
para el diagnóstico de RD proliferativa, la cual si se
desarrolla puede tener consecuencias más severas, como la
pérdida de la visión. En una etapa inicial, se realiza el
procesamiento de la imagen, en la cual se aíslan exudados
duros, para extraer características que pueden ser
utilizadas por SVM para determinar su
presencia. Posteriormente, se realiza el
aislamiento de vasos sanguíneos, los cuales pueden
contribuir a la detección de otras anomalías que se pueden
utilizar para realizar el informe.

II. TIPOS DE LESIONES


En la Tabla IV se muestra los 3 principales tipos de
lesiones que se pueden tomar en cuenta en la clasificación
de la RD de según el grado de afección.

TABLA IV. LESIONES EN RETINA[17]


Nombre Descripción Descripción gráfica

Pequeñas protuberancias
en los vasos sanguíneos
Micro-
de la retina que con
aneurismas
frecuencia dejan escapar
líquidos[8].

Pequeñas manchas de
Hemorragias
sangre que entran a la
de la retina
retina[10].

Es la inflamación o
engrosamiento de la
Exudados
mácula a causa de escapes
duros
de líquido de los vasos
sanguíneos de la retina[3].

III. SISTEMAS DE DETECCIÓN ACTUALES IV. METODOLOGÍA

A pesar de que la mácula es una pequeña mancha En este estudio se usó una base de datos disponible a
amarillenta en la retina, tiene funciones imprescindibles en miembros del IEEE llamada Indian Diabetic Retinopathy
la visión del ser humano, tales como conseguir que la visión Image Dataset (IDRID)[20] la cual consta de un paquete de
central del ojo se encuentre en las mejores condiciones 130 imágenes de fondo de ojo de 45 grados de 1152X4500
posibles, permitir los pequeños detalles (es la encargada de pixeles. En la Figura 1, se describe de manera general los
que podamos distinguir rostros y rasgos) así como pasos mínimos necesarios para realizar la clasificación de
diferenciar los colores[18]. patrones a partir de las imágenes implementando el
clasificador basado en SVM.
A. Métodos de obtención de imágenes
El oftalmoscopio directo es un método de examen
realizado por el especialista en una habitación. A través de
la pupila del oftalmoscopio se ilumina un haz de luz, esto
ayuda a que el especialista pueda ver la parte posterior del
globo ocular. Otro método utilizado es la angiografía con
fluorescencia que permite fotografiar los vasos sanguíneos
en la parte posterior del ojo con inyección de tinte para
contraste al torrente sanguíneo[13].
La fotografía de fondo de ojo es tomada mediante
cámaras digitales midriáticas o no midriáticas, que permiten
obtener imágenes nítidas del área macular de la retina, la
periferia y el disco óptico. Puede o no necesitar la dilatación
de la pupila, dependiendo del ángulo de la foto. En caso de
no existir dilatación se pueden tomar fotografías de hasta
45°, las cuales pueden ser suficientes para realizar un
informe de las enfermedades más significativas. Un ejemplo
de este tipo de cámaras es la Volk Pictor Camera[13].

B. Métodos automatizados
La mayoría de los sistemas automáticos abordan la
detección utilizando directamente la forma, el color y el
conocimiento del dominio de la diabetes. Las anomalías
también pueden detectarse indirectamente al detectar
cambios entre dos imágenes de fondo de ojo tomadas del
mismo ojo en un momento diferente[13].
El enfoque directo contribuye a la detección de la
enfermedad, mientras que el enfoque indirecto contribuye
tanto a la detección como a la monitorización de la
retinopatía diabética.
Un ejemplo de software automatizado para la detección
de retinopatía aprobado recientemente por la FDA diabética
(Food and Drug Administration) es un sistema
computarizado de lectura de imágenes (IDx-DR) este
software mediante un algoritmo analiza imágenes de fondo
de ojo tomadas con una cámara Topcon NW400, y permite
estadificar estadios de la Retinopatía Diabética por arriba
del 85% sin necesidad de un médico evaluador[19].
Fig. 1. Metodología Propuesta. Se tiene una imgen de entrada a la que
se le aplica la segmentación y procesamiento(1), se aplica el
clasificador SVM(2) y el resultado es RD o SRD(3). Fig. 2. Detección de exudados duros: (a) Imagen original, (b) Canal verde,
(c) Imagen binarizada, (d) Máscara de disco, (e) Procesamiento
1. Pre-procesamiento y segmentación: En primera morfológico, (f) Diferencia de las imágens d y e.
instancia, la imagen tomada de la base de datos es
procesada para resaltar los patrones en las zonas de A. Exudados duros
interés. En la Fig. 2 se muestra la detección de exudados duros.
2. Detección de patrones: Una vez que se tenga la imagen Para obtener los exudados, que es la zona de interés deseada,
con el procesamiento adecuado, así como con la se descompone la imagen original Fig. 2(a) en los canales
segmentación en las zonas de interés, pasará por el RGB para así tomar únicamente la componente en G Fig. 2
algoritmo de aprendizaje (SVM) previamente entrenado (b), esto debido a que este canal es el que nos ofrece una
para la detección de los patrones. En este paso se elige mayor información de la imagen para segmentar los
una función de kernel. exudados. El canal verde se binariza Fig. 2(c) y
3. Evaluación de resultados: Al tener los resultados, el posteriormente se aplica una ‘Máscara del disco óptico’ Fig.
algoritmo arroja si se tiene (RD) o no (SRD), a partir de 2(d) (Esta máscara es explicada en el inciso B), ya que el
la evaluación en los exudados. Al interpretarse los disco óptico posee un color similar al de los exudados, como
resultados se realiza un informe de estos. se puede ver en la Fig 2(a), por lo que al aplicar esta
máscara se borra de la imagen dicho disco. Prosiguiendo con
la segmentación se utilizan operaciones morfológicas Fig. 2
V. PRE PROCESAMIENTO Y SEGMENTACIÓN (e) (dilatación, erosión, abrir) que ayuden a la reducción del
ruido en la imagen. Finalmente se hace una diferencia de la
imagen
del disco o nervio óptico. Para realizar esta máscara, la
imagen original Fig. 3(a) se descompone en los canales RGB
y solo se aísla el canal verde Fig. 3 (b) que es el canal que
resalta de mejor manera la parte del disco óptico. La imagen
original RGB se cambia a la paleta CMY y de esta se toma
solo el canal cyan Fig. 3 (c) que oscurece la parte del disco
óptico. Se realiza una diferencia de los canales verde y cyan
Fig. 3 (d), por lo que obtenemos una imagen casi en dos
tonalidades donde se puede percibir que resalta la
característica buscada. Se binariza la imagen obtenida de la
diferencia Fig. 3 (e) y por último se realiza el complemento
Fig. 3(f) de la binarización, resultando una máscara del
tamaño del disco óptico, que nos permitirá cubrirlo por
completo para que en la segmentación de exudados duros no
se confunda.

Fig. 4. Vasos Sanguíneos: (a) Imagen original, (b) Componente cyan, (c)
Procesamiento morfológico , (d) ) Diferencia de las imágenes b y c, (e)
Binarización, (f) Reducción de ruido.

C. Vasos Sanguíneos
La Fig. 4, muestra el proceso que se lleva para resaltar los
vasos sanguíneos del ojo en un fondo negro. La imagen Fig.
4(a) es la imagen original tomada directamente de la base de

Fig. 3. Disco óptico: (a) Imagen original, (b) Canal verde (c) Canal cyan,
(d) ) Diferencia de las imágenes b y c, (e) Binarización, (f)
Complemento de la imagen e.

B. Máscara del Disco Óptico


En la Fig. 3 se describen los pasos para realizar la máscara
datos, esta imagen se pasa de RGB a los componentes SVM consiste en que, a partir de las imágenes de
CMY para aislar únicamente la componente cyan Fig. 4(b). entrenamiento, para localizar un enfoque idóneo, se agrupan
Se aplican operaciones morfológicas para el tratamiento de las imágenes en las clases existentes, SRD y RD. Los
la imagen (erosión, abrir, dilatación) Fig. 4(c), a parámetros de disposición se determinan mediante el
continuación, se realiza una diferencia entre las imágenes aprendizaje automático por vectores de soporte.
Fig. 4(b) y Fig. 4(c). El resultado es una imagen un tanto Para ajustar las curvas no lineales a la información, el
obscura Fig. 4(d) en la que con dificultad se pueden notar SVM hace uso de la capacidad de una parte para delinear la
las venas oculares a simple viste, por lo que se binariza con información en un espacio alternativo donde un hiperplano
el objetivo de resaltarlas en blanco Fig. 4(e). Y por último podría ser usado para hacer la partición. En este trabajo se
para reducir el ruido en la imagen se aplica un filtro realiza un primer entrenamiento con un SVM lineal [23] y
gaussiano Fig. 4(f). para fines de comparación usamos un kernel gaussiano [23]
Es así como mediante el procesamiento y segmentación en un segundo entrenamiento.
de las imágenes podemos resaltar las características que se El clasificador SVM se prepara con 104 imágenes de
ocupan para el estudio en curso. fondo de ojo (80% de los datos), para el entrenamiento que
muestran exudados evidentes o ausentes, y 26 imágenes
(20% de los datos) se utilizan para la validación.
VI. CLASIFICADOR
Para obtener los mejores resultados en el entrenamiento
se deben resaltar las características relevantes en las
imágenes, es por eso que el procesamiento y la VII. RESULTADOS
segmentación se llevaron a cabo en las imágenes de fondo Los resultados obtenidos en este estudio bajo las
de ojo aislando solo los exudados presentes. Para esta etapa condiciones antes explicadas se muestran a continuación.
se aplica un clasificador SVM, este clasificador es usado De las 130 imágenes con que cuenta la base de datos, 73 de
para evaluar los datos de entrenamiento y dividir en casos ellas están etiquetadas como ‘ojos sanos’ o sin exudados y
como Sin Retinopatía Diabética (SRD) y con Retinopatía los 57 restantes son ‘lesiones presentes’ o exudados
Diabética (RD), es decir hay exudados presentes o están evidentes. En la Tabla V, se muestra un resumen de los
ausentes en las imágenes. resultados para cada método aplicado, un SVM de función
SVM es un clasificador discriminativo que se lineal y un SVM aplicando con un kernel gaussiano. El
caracteriza formalmente por el uso de un hiperplano de mejor desempeño fue adquirido usando una clasificación
separación o aislamiento [22]. El proceso de preparación de binaria de SVM con función de núcleo lineal.
[2] “La Retinopatía Diabética se convertirá en la
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de procesamiento y segmentación de imágenes. Las [5] Q. Dong, S. Gong, and X. Zhu, “Imbalanced Deep
características propuestas muestran un gran potencial para la Learning by Minority Class Incremental
detección y clasificación de RD. SVM puede detectar la RD Rectification,” IEEE Trans. Pattern Anal. Mach.
con una sensibilidad de casi el 90%, mientras que se puede Intell., pp. 1–14, 2018.
clasificar con una exactitud del 92%. SVM constantemente
muestra mejores resultados que otros algoritmos de
aprendizaje automático. Podemos concluir que el
procesamiento de imágenes retina tiene el potencial de
desempeñar un papel importante en el diagnóstico de la
retinopatía diabética. Los resultados son alentadores y una
futura evaluación clínica integrará los algoritmos
presentados en una herramienta realizar informes de la
retinopatía. Otros trabajos futuros son la detección de micro-
aneurismas y hemorragias, además de los exudados duros y
los vasos sanguíneos, para mejorar la precisión y la
sensibilidad de nuestro detector de retinopatía.

IX. REFERENCIAS
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