Tema 1.

Variaciones en el color Los suelos están divididos según su textura:

Es el principal medio en el que crecen las plantas. Cantidad de materia orgánica viva o muerta (incluye Arenoso arcillosos: 35% o más de arcilla y 45% o más de arena
Es el soporte físico que continuamente les proporciona: microorganismos) Limo-arcillosos: 40% de arcilla y 40% o más de limo
– Los nutrientes inorgánicos Porosidad Margosos o francos: contienen igual proporción de arena, limo y
– El agua Estructura arcilla. Ideales para la agricultura.
– El entorno gaseoso adecuado para Grado de meteorización. La textura del suelo influye en las comunidades de
los sistemas radicales. Horizontes del suelo microorganismos porque de ella depende la aireación y la
Los nutrientes inorgánicos que utilizan las plantas provienen de la Horizonte A: disponibilidad de agua
atmósfera y de la meteorización de las rocas de la corteza Capa superior del suelo Intercambio de catiónico
terrestre. La región más superficial y de mayor actividad física química y Los nutrientes inorgánicos para microorganismos y plantas están
Meteorización de la corteza terrestre biológica. presentes en la solución del suelo como iones.
Los minerales son compuestos inorgánicos que normalmente Contiene la mayor parte del material orgánico del suelo, vivo o
están formados por dos o más elementos en proporciones de peso muerto: Intercambio catiónico:
determinadas >Grandes cantidades de partes de plantas y hojas muertas Los cationes apresados por las partículas de arcilla pueden:
Ejemplo: >Insectos y otros artrópodos pequeños Ser reemplazados por otros cationes
– El cuarzo( SiO2 ) >Lombrices de tierra Ser liberados a la solución del suelo para ser tomados por plantas
– La calcita (CaCO3). >Organismos descomponedores y microorganismos.
>Nemátodos Partículas de arcilla: componentes esenciales de los suelos
Las rocas se dividen en tres grupos según su origen y formación: productivos
Ígneas • Inorgánicos granulados Los aniones (NO3-, SO4-2, HCO3-, y OH-) son lixiviados del suelo más
Granito, basalto, cuarzo, feldespato • Residuos orgánicos, humus rápidamente que los cationes ya que no pueden fijarse a las
Sedimentarias • Agua (inundado, mojado) partículas de arcilla.
esquistos, areniscas, piedra caliza • Gases (disueltos y difusos) El fosfato, no puede ser arrastrado, ya que:
Metamórficas • Sistemas biológicos (raíces, insectos, microobios)  Forma precipitados insolubles
Areniscascuarcita, Es absorbido o adsorbidoen la superficie de compuestos que
Esquisto  pizarra contienen hierro, aluminio y calcio.
Piedra caliza  mármol
La acidez o basicidad del suelo está relacionada con la
Procesos de meteorización disponibilidad de nutrientes inorgánicos para el crecimiento de
 plantas y microbios
desintegración física y descomposición química de los minerales y Los suelos varían mucho en su pH, y muchos microorganismos
las rocas superficiales tienen un estrecho margen de tolerancia.
 Una muestra de suelo contiene:
producen los materiales inorgánicos que formarán los suelos Insectos ápteros
Los suelos tienen diferente origen y composición Arácnidos
Por lo tanto la micro fauna asociada a ellos también Sobretodo filamentos de hongos y de bacterias.
La meteorización implica procesos: Papel de la microfauna del suelo:
Mecánicos : congelamiento y descongelación Disgregación de la materia orgánica
calentamiento y enfriamiento, Diseminación de la microflora
Químicos : El agua se introduce entre las partículas, y los
materiales solubles se disuelven en ella. Plantas y microflora: organismos complementarios, en la
Biológicos: CO2 de la respiración y otras sustancias descomponen En un gramo de suelo del horizante A pueden haber: mineralización de la materia orgánica
las rocas 2500 millones de bacterias+ medio millón de hongos+50 000 algas Los residuos orgánicos no consumidos van a ser degradados por la
Meteorización mecánica + 30 000 protozoos
El agua y el viento transportan fragmentos de roca a grandes
distancias desgaste que las fracciona en partículas más Horizonte B:
pequeñas
Meteorización químia (corrosión)
H2O + SO2 

microflora. Son los hongos, en primer lugar, los que van a atacar a
la materia orgánica fresca, y en el siguiente orden

Mineralización de la materia orgánica

H2O + NO2 (NO3) Ácidos 
Disuelven materiales menos solubles
Meteorización orgánica-biológica
Los ácidos producidos por plantas y las bacterias pueden afectar
las rocas.
La formación del suelo puede ocurrir en:
El mismo sitio donde la roca es meteorizada
Pueden ser transportados a otros sitios por
La gravedad, El viento., El agua, Los glaciares.
Materia orgánica del suelo
Origen de la materia orgánica del suelo:
-Bacterias, hongos, algas, líquenes, musgos y plantas que crecen
sobre o entre los minerales y las rocas erosionadas
-Plantas y animales muertos
Los microbios en el suelo
.Contribuyen a la formación de materia orgánica
 Los fragmentos de roca y minerales en el suelo varían en tamaño:
la convierten en ácido carbónico o ácidos orgánicos
 La superficie de bacterias y arcillas tienen cargas eléctricas
disuelven rocas
.Controlan la disponibilidad de muchos nutrientes importantes
para las plantas
Sección vertical del suelo:
Protección de los microorganismos ante desequilibrios
ambientales
Cuando se añade materia orgánica a los suelos agrícolas, las
El horizonte B:
bacterias consumen todo el carbono disponible.
Contiene mucho menos material orgánico y está menos
Consecuencia: rarefacción, e incluso desaparición, de los
meteorizado que el horizonte superior.
microorganismos.
Hay pocos microorganismos
Estructuras de protección de los hongos
Algunos materiales del horizonte A, llegan al B por filtración del
Clamidospora: célula latente, con pared gruesa y cuyo contenido
agua a través del suelo:
es rico en reservas
Óxido de hierro,Partículas arcillosas, Pequeñas cantidades de
Esclerote: esfera cuyo envoltorio externo está constituido de hifas
material orgánico
muertas de pared gruesa, y el centro de filamentos vivos ricos en
reservas, en estado latente.
Horizonte C:
Compuesto por rocas y minerales fragmentados y meteorizados
Las (Gram+) forman endosporas.
de los cuales se ha formado el suelo verdadero de los horizontes
Susceptibles de sobrevivir muchos años en condiciones
superiores.
desfavorables
Los microorganismos son escasos.
Las Gram- están desprovistas de mecanismos de resistencia
Composición del suelo
Forman agregados biológicos cuando las condiciones son
Los suelos están formados de materia sólida y espacio poroso
desfavorables
El espacio poroso es ocupado por diferentes proporciones de aire
La actividad celular y las divisiones, se hacen más lentas.
y agua, dependiendo de las condiciones de humedad.
Los polisacáridos tienen varias funciones
Partícula Diámetro en micrómetros Arena gruesa >200
- 2000
negativas, mientras que los azúcares son neutros, tienen por
Arena fina >20 - 200
tanto un papel aislante.
Limo 2 - 20
Los azúcares tienen tendencia a retener agua, evitan evaporación
Arcilla <2
en períodos secos.
Constituyen reservas. En ausencia de alimentos, las bacterias Thiobacillus, Acetobacter y la bacteria fijadora de nitrógeno Requerimientos de temperatura
toman el carbono necesario para el mantenimiento de las Beijerinckia, son capaces de crecer y multiplicarse a pH entre 2.5
funciones vitales esenciales. y 3.5. Psicrófilas = 0 - 20ºC, Pseudomonas, Listeria
>El pH óptimo para las levaduras y los hongos varía entre 3.1 y
En el espacio interagregado las condiciones son drásticas: 6.0, mientras sus pH extremos de crecimiento son 1.6 y 9.5. Mesófilas = 20 - 45ºC,Staphylococcus, Streptococcus
La humedad y la aireación varían muy rápidamente  Ños hongos son resistentes a los ácidos
Este es el microhabitat colonizado por las bacterias Gram+, que  Algunas especies de hongos crecen a pH entre 1.6 Termófilas = 55ºC o más,No patógenas
poseen la facultad de producir endosporas. y 2.0
Las esporas de los hongos y las de los actinomicetos, son muy En suelos con pH mayores a 7 predominan las bacterias, en Estenotérmicos = 35 - 36ºC,Neisseria
resistentes a la desecación. especial los actinomicetos, y en menor proporción los hongos.
Por el contrario, el agregado mismo es recorrido sólo por finos micorrizas. Euritérmicos = 0- 44ºC Enterococcus
capilares de alrededor 2 mm de diámetro, que sólo permiten una El efecto del pH afecta el desarrollo de los microorganismos:
circulación lenta de aire y de agua.  Cuando el pH baja: Metabolismo
Aparecerán rápidamente condiciones de anaerobiosis. Declina el número de bacterias Es el conjunto de reacciones químicas que se producen en las
En este medio tan estable viven o sobreviven las bacterias Gram-. Mientras sube el de levaduras, hongos y bacterias resistentes a células vivas.
la acidez. Criterios de división del metabolismo
La composición química y física de los agregados es variable.  A pH extremadamente bajos la proporción de • Según los cambios de energía libre
El suelo es un medio muy heterogéneo bacterias puede disminuir hasta el 60%. • Según la fuente principal de carbono
Está constituido de un mosaico de microhabitats cuya La acidez del suelo influencia las bacterias de los nódulos de la • Según la utilización del oxígeno molecular
composición biológica varía cualitativa y cuantitativamente en raíz de las leguminosas • Según el sustrato
función del tiempo, y de la fuente trófica disponible. En suelos ácidos suele envolverse la semilla en una capa de cal,
Unos agregados pueden formarse alrededor de citina, que neutraliza la acidez circundante, promueve la multiplicación Clasificación metabólica
desarrrollándose en su seno los llamados citinolíticos. de Rhizobium y permite buena nodulación de la leguminosa
Otros encerrarán residuos de lignina permitiendo el crecimiento huésped.
de los ligninolíticos. AGUA
Influencia del ambiente del suelo en las poblaciones de Las formas vegetativas de las bacterias son menos resistentes a
microorganismos la desecación que los hongos o los actinomicetos.
>Aunque los microorganismos son ubicuos, en pocas situaciones >Las endosporas termoestables producidas por las bacterias,
existen poblaciones iguales. como Bacillus y Clostridium, son resistentes a la desecación.
>Nunca se dan condiciones ambientales idénticas: En los materiales de potencial osmótico alto el agua es poco
Las que favorecen la reproducción de un microorganismo, o asequible a los microorganismos.
permiten la sobrevivencia de otro, pueden ser desfavorables para Los suelos salinizados suelen tener presiones osmóticas altas que
la existencia continuada de un tercero. inhiben el crecimiento de la mayoría de los microorganismos y
Para comprender la influencia de los factores que afectan la raíces, exceptuando los halófilos.
microflora del suelo es necesario: FACTORES LIMITANTES DE LA MICROBIOTA DEL SUELO
>Conocer las condiciones normales de crecimiento de los Erosión y baja disponibilidad de nutrientes
microorganismos Fertilización mineral y correctivos
>Los efectos que las condiciones extremas ejercen sobre los Presencia de antagonistas, parásitos y depredadores
distintos grupos Temperatura y pH extremos
Temperatura (Psicrófilos, Mesófilos y Termófilos). Extremos en los contenidos de aire y humedad
 Catabolismo
TEMA2 Es la descomposición de las sustancias nutritivas en compuestos
Metabolismo y crecimiento bacterianos más sencillos con liberación de energía, que la bacteria utiliza para
Fisiología bacteriana su biosíntesis.
Crecimiento: es el aumento ordenado de todos los componentes Bacterias heterótrofas energía por descomposición de
celulares → Duplicación celular sustancias orgánicas.
Metabolismo: son los pasos intermedios entre la captación de  Oxidación biológica
nutrientes y la división celular. Finalidad: obtener energía (ATP) para el crecimiento y la obtención
Anabolismo Catabolismo de productos intermedios que se pueden utilizar como punto de
(Síntesis) (Destrucción) partida para la biosíntesis.
Nutrición bacteriana Procesos:
Exigentes (Haemophilus, Neisseria) Fosforilación a nivel de sustrato o Fermentación
No exigentes (Pseudomonas, Escherichia) Fosforilación oxidativa o Respiración
Energéticamente exigentes (Chlamydias) Respiración aeróbica
Nutrientes necesarios: Ocurre en presencia de oxígeno (Oxidación)
Fermentación del estiércol: Glucosa + O2 CO2 + H2 O + 38 ATP
Inorgánicos: H2O - C - N - S - Fe - P
>La temperatura puede elevarse hasta 65 o C, destruyendo todos Pasos :Glucólisis
Orgánicos: Azúcares - Ácidos - Aminoácidos - Purinas y
los microorganismos, excepto a los termófilos, como el Bacillus Decarboxilación oxidativa
Pirimidinas - Vitaminas
calfactor , Thermoactinomyces spp y los hongos termófilos. Ciclo de Krebs
Absorción de nutrientes
>En suelos del piso térmico tropical y premontano son más Transporte de electrones
Difusión pasiva: glicerol, agua, O2, CO2
frecuentes: Fusarium, Aspergillus y Rhizopus Productos tóxicos: O2- y H2 O2
Difusión facilitada: Permeasas
>Penicillium crece mejor en suelos más fríos. Bacterias aerobias y anaerobias facultativas en aerobiosis
Transporte activo:. Con gasto de energía
>Opionibacterium actúa como barrendero de medios nutritivos
Translocación de grupo: alteración molecular
parcialmente degradados por microorganismos. Respiración anaeróbica
Captación de hierro: sideróforos
En el rumen utiliza ácido láctico y glucosas producidas por las Ocurre en ausencia de oxígeno
Oligoelementos: difusión pasiva o facilitada
bacterias celulíticas y las del ácido láctico. Aceptores finales de electrones: iones inorgánicos
Gases: difusión pasiva
>Lactobacillus compite eficazmente cuando existen Glucosa + S CO2 + SH2 + 34 ATP
Moléculas pequeñas: difusión simple o facilitada
carbohidratos simples pero es incapaz de metabolizar sustancias Pasos
Grandes moléculas: digestión previa
como lignina. Glucólisis
Almidón: amilasas, Proteínas: proteasas
Crece bien en la leche y en el rumen pero no en el suelo Decarboxilación oxidativa
DNA: Desoxirribonucleasas
>En una población mixta solo unos pocos microorganismos son Transporte de electrones
Gelatina: gelatinasas
capaces de metabolizar una sustancia determinada, como No se liberan productos tóxicos
Grasas. Lipasas, fosfolipasas
insecticidas y herbicidas, estos microbios se ven libres de Bacterias anaerobias obligadas y anaerobias facultativas en
Requerimientos de O2 y CO2
competencia. anaerobiosis
Aerobios estrictos: 21% de oxígeno Pseudomonas,
>Los autótrofos no compiten por nutrientes orgánicos con otros
Mycobacterium
microorganismos. Fermentación anaeróbica
Microaerófilos: 5% de oxígeno Campylobacter, Helycobacter
Sólo compiten por luz. Ocurre en ausencia de oxígeno
Anaerobios obligados: 0% de oxígeno Fusobacterium, Clostridium
Desarrollo de Nitrosomonas y Nitrosobacter es limitado por Los aceptores de electrones son moléculas orgánicas
Anaerobios aerotolerantes: 0,5% de oxígeno Actinomyces,
compuestos nitrogenados apropiados. Glucosa + NADH Piruvato + NAD+ +
Propionibacterium
OXÍGENO ATP
Anaerobios facultativos: crecen con o sin oxígeno Streptococcus,
Los requerimientos de oxígeno de los microorganismos varían: Pasos
Enterobacteriaceae
Aerobios,Anaerobios,Microanaerobios,Anaerobios facultativos. Glucólisis
Capnófilos: necesitan o crecen mejor con 5-10% de CO2 Neisseria,
pH Degradación del piruvato
Haemophilus
>El pH óptimo para la mayoría de las bacterias, algas y protozoos Productos con alta energía: ácido láctico, propiónico, butírico,
Requerimientos de pH
está alrededor de 7. acético, alcohol etílico, etc.
• Neutrófilas = 5,5 - 8,0
Con pocas excepciones estos microorganismos no crecen por Bacterias anaerobias y anaerobias facultativas en anaerobiosis
– Staphylococcus
debajo de un pH de 4 o por encima de un pH 9.
• Acidófilas = 0,0 - 5,5
>Los actinomicetos y las algas son sensibles a los ácidos y su pH  Anabolismo
– Lactobacillus
óptimo está entre 7.5 y 8. Polisacáridos capsulares
• Alcalófilas = 8,0 - 11,5
– Vibrio Exotoxinas
Exoenzimas
Antibióticos
Vitaminas (complejo B y vit K)
Pigmentos
Bacteriocinas

Medios de Cultivo
Los microorganismos deben ser obtenidos en forma de cultivos
puros a partir de la muestra del paciente (2do. postulado de Koch).
Conjunto de sustancias que permiten el crecimiento de los
microorganismos bajo determinadas condiciones de incubación
(Tiempo, temperatura y oxígeno)
Según su consistencia
Líquidos (Caldos):Enriquecimiento,Tubos,Identificación
Sólidos (Agares) :Aislamiento ,Identificación,Placas de Petri o
tubos
Según su composición
Medios sintéticos o simples:Poseen composición exactamente
conocida.
Sólo contienen sustancias orgánicas e inorgánicas
Medios complejos o enriquecidos: Su composición se conoce
parcialmente.
Contienen huevo, sangre, suero, carne, etc.
Líneas celulares :Formadas por células vivas

Según su aplicación

Medios generales: Permiten el crecimiento de la mayoría de las

bacterias presentes en la muestra
Medios selectivos: Permiten el crecimiento de sólo determinado
tipo de bacteria. Contienen sustancias que inhiben el desarrollo de
ciertas bacterias (antibióticos, colorantes, sales, etc.)
Medios diferenciales: Poseen sustancias que permiten diferenciar
entre grupos bacterianos según determinadas características
biológicas y permiten realizar una identificación presuntiva
(hemólisis, fermentación de azúcares, precipitación de sales, etc).

 División Bacteriana
Célula bacteriana 1 colonia
Escherichia coli: División: 20 minutos Colonias: 1 día
Clostridium botulinum: División: 35 minutos Colonias: 2 días
Mycobacterium tuberculosis: División: 12 horas Colonias: 30 días

 Recuento bacteriano
1 colonia > 1 Unidad formadora de colonias (UFC)
Cámara de Petroff-Hausser
Recuento en placa
Turbidimetría
Dilución en tubos