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2006
Víctor M. Riojas Valdés / Juan Carlos Gómez de la Fuente / José A. Salinas
Meléndez / Roberto Montes de Oca Luna / Alfredo Wong González
CONFIABILIDAD DEL ANÁLISIS DE ADN EN PRUEBAS DE PATERNIDAD PARA
BOVINOS BRAHMAN Y BRANGUS EN MÉXICO
Ciencia UANL, enero-marzo, año/vol. IX, número 001
Universidad Autónoma de Nuevo León
Monterrey, México
pp. 41-50
L
os sistemas de mejoramiento animal han mente la composición genética de la población, debi-
aplicado métodos de selección de indivi- do a que este tipo de animales son generalmente uti-
duos con características sobresalientes, lizados en el mejoramiento genético del hato.
destinándolos a actuar como reproduc- En genética animal, el análisis del ADN se ha
tores a fin de generar, dentro de una población, perfeccionado mediante la técnica de reacción en
una progenie con características productivas desea- cadena de la polimerasa (PCR), al considerar se-
das. La implementación de técnicas de identifica- cuencias repetitivas cortas llamadas microsatélites
ción individual de los miembros de cada hato fue o repeticiones cortas en tándem (STR), las cuales
imprescindible para establecer la referencia se encuentran en todo el genoma y presentan un
genealógica que determinara un mejoramiento gran polimorfismo por tamaño en pares de bases,
animal confiable. Las técnicas más comunes de dando con ello mayor utilidad en análisis genéticos,
identificación que se utilizan consisten en descrip- lo que permite disminuir considerablemente la
ciones de fenotipo que incluyen la presencia de probabilidad de error en la identificación de indi-
remolinos de pelo, manchas y color del pelaje, así viduos.1
como el empleo de tatuajes y marcas. Considerando el alto grado de exactitud y el
A partir de la inseminación artificial y la trans- corto tiempo en la obtención de resultados, esta
ferencia de embriones se logró una mayor preci- nueva técnica se podría catalogar como la panacea
sión en las pruebas de progenie; sin embargo, se en el esclarecimiento de paternidad en animales
requería de registros genealógicos confiables, es de alto valor económico y zootécnico, además de
decir, para el establecimiento de la genealogía en el tener una gran cantidad de aplicaciones de tipo
ganado de registro es de gran importancia conside- productivo y de investigación.2-5
rar un alto nivel de seguridad en la asignación exacta
del parentesco, ya que al ocurrir errores en el pedigrí * Facultad de Medicina Veterinaria y Zootecnia, UANL
de animales registrados se puede afectar desfavorable- ** Facultad de Biología, UANL
En este estudio se analizaron ocho loci de Una vez amplificados los microsatélites, se pro-
microsatélites en tres reacciones de PCR múltiple cedió a verificar los resultados por comparación con
con diferenciación por tamaño molecular de pares un marcador de peso molecular con fragmentos de
de bases, los cuales se clasificaron como se muestra 100 a 1000 pb, visualizándolo mediante
en la tabla II, de acuerdo a lo propuesto por la transiluminación ultravioleta de los fragmentos
ISAG.6 teñidos con bromuro de etidio en el aparato
fotodocumentador Fluor S Multi Imager y la utili-
zación del programa computacional Multianalyst
Tabla II. Ordenamiento de los marcadores por PCR múltiple. de Bio-Rad.
Al confirmar las bandas de amplificación ob-
tenidas en cada PCR múltiple por comparación con
el marcador de peso molecular (figuras 1, 2, 3, 4),
se procedió a efectuar la resolución de los fragmen-
tos amplificados mediante electroforesis vertical en
el secuenciador automático ABI PRISM 373A de
Perkin Elmer, en el laboratorio de Biopatología
La reacción se llevó a cabo en un termociclador Veterinaria de la Universidad de Texas A&M, Co-
automático MJ Research, con tapa térmica, llege Station, Texas, EUA.
estandarizando las concentraciones de los elemen-
tos de cada reacción como se muestra en la tabla Resultados y discusión
III, así como las condiciones óptimas de amplifica-
ción, como se menciona en la tabla IV. Concentrado de resultados
Considerando que en esta raza se procedió a un Por otra parte, el rango en pares de bases de
muestreo aleatorio, sin estimar una supuesta rela- los alelos encontrados en los marcadores del múlti-
ción de parentesco, se procedió a concentrar los ple 2 en la raza Brangus se muestran en la tabla V,
50 genotipos en un solo cuadro. siendo aproximado su rango a lo reportado en otras
investigaciones8,9 en Bos taurus.
Análisis de resultados
Frecuencia de alelos
Para determinar las diferencias en las frecuencias
génicas entre las razas, considerando las condicio- La frecuencia alélica en cada marcador se obtuvo
nes del tamaño y tipo de muestreo, los resultados dividiendo el número de observaciones de cada
obtenidos se analizaron mediante la inferencia es- alelo entre el número total de observaciones de
tadística, la cual arrojó los siguientes parámetros: todos los alelos, la fórmula utilizada fue:
• Número y frecuencia de alelos
• Heterocigosidad (H) Fi = ki/n
• Probabilidad de exclusión (P.E.)
• Contenido de información de polimorfismo donde Fi es la frecuencia del alelo i, ki es el número
(PIC) de observaciones para el alelo i y n el número total
Estos parámetros son considerados debido a de observaciones
que la capacidad promedio de un sistema de mar- Se observó una frecuencia alélica más homo-
cadores para excluir y establecer la relación está génea en la raza Brahman, en comparación con la
condicionada por los genotipos de los parientes raza Brangus.
reportados; por la frecuencia de lindeza de los mar-
cadores alelomorfos en la raza particular y por el Heterocigosidad
número de sistemas de marcadores independien-
tes probados.7 La heterocigosidad indicó el grado de polimorfis-
mo existente en cada par alélico, dado que cada
Número de alelos uno proviene de un precursor, esta inferencia ori-
gina un criterio de valoración en la proporción de
El número de alelos se determinó mediante el material genético existente en un individuo por
conteo directo de las variantes observadas. herencia de sus progenitores.9
Los resultados obtenidos indican que el nú- La heterocigosidad se calculó mediante la si-
mero de alelos por marcador genético fue mayor guiente fórmula:
en la raza Brangus en comparación con la raza
Brahman, observándose una acentuada variación H=1-ΣPi²
entre el número de alelos por marcador en cada
raza, siendo en orden ascendente de cuatro en ETH, donde Pi es la frecuencia del alelo i.
tres a doce en el BM 2113 para la raza Brahman, El coeficiente de heterocigosidad en los mar-
mientras que en la raza Brangus fue de diez en el cadores genéticos analizados fue superior en la raza
BM 1824 a 21 en el ETH 225 (tabla XII). Brangus en comparación con la raza Brahman, con
excepción del TGLA 122 (tablas VI y VII). raza Brahman, a excepción del marcador TGLA
122.
Los marcadores con un valor de probabilidad
Tabla VI. Heterocigosidad de ocho microsatélites
en la raza Brahman. de exclusión menor en la raza Brahman son el ETH
3 y el BM 1824, mientras que en la raza Brangus
son el TGLA 122 y el BM 1824.
La probabilidad de exclusión combinada que
se obtuvo, 0.996 en la raza Brahman y 0.999 en la
Tabla VII. Heterocigosidad de ocho microsatélites raza Brangus, indica el grado de confiabilidad de
en la raza Brangus. este tipo de análisis en pruebas genealógicas, por
lo que se alcanza el objetivo principal del presente
trabajo de investigación.
Probabilidad de exclusión
Tabla XII. Comparativa de los parámetros génicos entre las dos razas.
Fig. 1. Verificación de amplificación del múltiple 1 en gel de Fig. 3. Verificación de amplificación del marcador ETH 3 en gel
agarosa al 2%. M= Marcador de peso molecular de 100 a 1000 de agarosa al 2%. M= Marcador de peso molecular de 100 a
pb. 1= Muestra 1, 2= Muestra 2, 3= Control negativo. 1000 pb. 1 = Muestra, 2 = Control negativo.
Fig. 2. Verificación de amplificación del múltiple 2 en gel de Fig. 4. Verificación de amplificación del múltiple 3 en gel de
agarosa al 2%. M= Marcador de peso molecular de 100 a 1000 agarosa al 2%. M= Marcador de peso molecular de 100 a 1000
pb, 1 – 19 = Muestras analizadas, 20= Control negativo. pb. 1 – 2 = Muestras analizadas, 3 = Control negativo.
raza Brangus y BM 1824 para ambas, indica que no ciones en animales domésticos; sin embargo, se hace
son informativos, por lo que se recomienda su necesario determinar los marcadores de tipo
remplazo por otros STR´s de mayor polimorfismo. microsatélites más informativos dentro del panel
7.- La estimación de la frecuencia alélica, la recomendado por la ISAG para facilitar su utiliza-
heterocigosidad y la probabilidad de exclusión fue ción con seguridad en análisis genealógicos, dado
más alta en la raza Brangus comparado con la raza que los valores de probabilidad de exclusión defi-
Brahman, probablemente es debido a la interac- nen esta herramienta de identificación de indivi-
ción alélica más intensa existente en los híbridos. duos como la mejor alternativa en el control
Con los resultados obtenidos se confirma lo genealógico de una población de bovinos, en susti-
propuesto por las investigaciones de Usha et al.;9 tución del método tradicional de tipificación san-
Heyen et al.;10 Mommens et al.16 y Vankan et al.,17 guínea; por lo tanto, se recomienda continuar la
en el sentido que los microsatélites se han consti- investigación de otros loci de microsatélites que re-
tuido actualmente como herramientas útiles para sulten de mayor aplicación para sustituir los me-
el control del pedigrí y estudios genéticos de pobla- nos polimórficos obtenidos en este estudio.