Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
APLICADAS A LA ECOLOGÍA
MICROBIANA
Áreas de estudio tradicionales en la Ecología Microbiana:
SÓLO EL 1% DE LOS
MICROORGANISMOS
PUEDE AISLARSE CON LOS
ACTUALES MEDIOS DE
CULTIVO
Muestra ambiental
METAGENÓMICA
Generación de
librerías genómicas Extracción DNA Hibridación DNA/RNAm
con fragmentos de
DNA de todos los Amplificación del
microorganismos de fragmento de DNA
la muestra requerido
PCR FISH Mi A
MicroArrays
Permite ver si hay Permite ver que genes
alguien que nosotros se están EXPRESANDO
CLONAJE DGGE buscamos
CUANTOS hay
Separación de las distintas Separación en gel de DONDE están
secuencias las distintas
secuencias. Patrón de ARISA
bandas comparable con
SECUENCIACIÓN otros
ot os sistemas
s ste as o
temporalmente
Comparación de secuencias e
identificación.
Filogenia
Corte de bandas
PCR
PCR (Polymerase chain reaction)
Mezcla de secuencias
diferentes del mismo gen,
por ejemplo del 16S rDNA
CLONAJE
Colonias azules:
contienen el vector
sin el inserto, son
resistentes a la
ampicilina e
hidrolizan el x-gal
Colonias blancas:
contienen el vector
con el inserto, son
resistentes a la
ampicilina pero no
hidrolizan el x-gal
SECUENCIACIÓN
EL ÁRBOL DE LA VIDA
ARNr 16S/18S
Champignons E kar a
Eukarya
Animaux
Plantes
A h
Archaea
Halobactériaceae
Bacteria Cianobactéries
Nuevos linajes eucariotas en los oceanos
Plankton <5 μm
250 - 3,000 m depth
18S rRNA
Euglena terricola
DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis)
Salinibacter ruber
El misterio del metano
Distribución de genes
Densidad génica
Intrones
Contenido
Co te do en
e GC
DNA Lib i genómica
Libreria ó i EXPRESSED GENES
Clusters / operones
Secuencias repetitivas
Secuenciación de los genes
Clonaje directo
Biotecnología para mejorar la
fosmidos/cosmidos
expresión
BACs SCREENING:
GENES
SCREENING:
Búsqueda de actividades
16/18S
de interés rDNA
(ej: enzimas) M
Marcadores
d filogenéticos
fil éti
Genes transferidos
horizontalmente
Genes relacionados con el
metabolismo
Diversidad
Un nouveau type de phototrophie
Rhodopsin-based
Rhodopsin based
Phototrophy