código genético y

síntesis de proteínas
Introduccion |
El descubrimiento de la síntesis de proteínas y el
código genético es producto de un proceso complejo
donde intervinieron varias disciplinas

La figura final de cómo ocurre la sintesis de proteinas

se logro a mediados de 1960

Ese proceso implico

1. Determinar la naturaleza del material

hereditario (1944 – 1953; Avery, Hershey y Chase)

2. Concepto de que un gen codifica para una

enzima (1941 – 1955, Beadle y Tatum, Lederberg)

3. Rol de los acidos nucleicos en la sintesis de

proteinas (1939 – 1955; Brachet, Sonneborn,

4. Estructura de los acidos nucleicos (1938 -

1953; Atsbury, Watson y Crick)
Introduccion |
Introduccion |
Introduccion |
Introduccion |
Elucidación del código genético
elucidacion |

Alexander Dounce, 1952

elucidacion | Podemos pensar el mensaje
genético como un largo
número escrito con 4
caracteres que hay que
traducir a otro escrito con 20

Gamow 1954
elucidacion |
elucidacion |
Dipeptidos
20 x 20 = 400

Secuencia
44 = 256
elucidacion |
elucidacion |

Codigo combinatorio

Crep(4,3)=20
elucidacion |
Codigo sin comas

Esta asignacion
permite 20 tripletes
con sentido
elucidacion |
Sistema rII
elucidacion |
Benzer y la estructura fina del gen y la
genetica molecular
elucidacion |
elucidacion |
Crick y su sentido de la publicidad (Jacob, 1988)

Hipotesis de la secuencia

Una secuencia de nucleotidos (gen) se

corresponde con una secuencia de
aminoacidos (proteina)

Dogma central de la biologia molecular

Una vez que la informacion fluye a la

proteina no puede salir de`ella.
elucidacion | Crick las fases o marcos de lectura y la mutagénesis 1961
elucidacion |
elucidacion |
elucidacion | Hasta aquí llegamos con la teoria y la genetica

La quimica habia estado presente en los trabajos de estas

lineas desde siempre.

En general eran practicadas por grupos diferentes. Pero en

los 50s fue cambiando.

Se empiezan hacer experimentos de quimica tradicionales

(purificaciones, ensayos enzimaticos, identificacion de
compuestos) y el uso de marcadores radiactivos.

Se comienzan a integrar los resultados y a compartir los

trabajos por los diferentes investigadores.
elucidacion | Un ejemplo lindo: Crick,
Holley, la molécula
adaptadora, el sARN y el
nacimiento del tARN
elucidacion | En los cincuenta se desarrollaron varias tecnicas
bioquimicas

Ensayos enzimaticos con nucleotido fosforilasas

Sistemas libres de celulas

Aislamiento e identificacion de polimerasas

Marcado con isotopos radiactivos

elucidacion | Llega la bioquímica pesada de la
mano de Marshall Nirenberg
elucidacion |
Variando la concentración de nucleótidos

RELATIVE
CODON FREQUENCY
FREQUENCY
AAA 0.579 100
AAU 0.116 20
AUA 0.116 20
UAA 0.116 20
AUU 0.023 4
UAU 0.023 4
UUA 0.023 4
UUU 0.00463 1
elucidacion |
Ensayo de ligamiento del triplete
elucidacion | Así cualquiera: síntesis de ARN de sequencia conocida
por Gobind Khorana
elucidacion |
Charles Yanofsky y la colinearidad
elucidacion |

El código es:

-degenerado
-no ambiguo
-casi universal
-tripletes, no
solapado y sin
comas
El codigo genetico hoy

-Variaciones del codigo genetico

-Origen del codigo genetico

-Nuevos aminoacidos geneticamente codificados

hoy |
Variaciones en el código estándar

- Hipótesis del ‘codon capture’

- Hipotesis de ‘codon competition’
hoy |
Origen del codigo genetico

-Accidente congelado ‘frozen accident’ (Crick,

1971)

-Hipotesis de co-evolucion del codigo genetico, la

sintesis bioquimica de los aminoacidos acompano
la asignacion de codones (Wong, 1975)

-Aminoacidos fisicoquimicamente similares tienen

codones similares. (Woese, 1967)
hoy | Que relacion hay entre las mutaciones y los
cambios de aas?

-Diferencia media de los cuadrados:

-polaridad de los aas.

-sustituciones puntuales
hoy | El código genético es 1
en un millón (Freeland y
Hurst, 1998)
hoy |
Optimo para estabilidad de proteinas
y frecuencias de aminoacidos
hoy |
NUEVOS AAS

Selenocisteina y pirrolisina

MODIFICACIONES ARTIFICIALES

Introduccion de nuevos aas

hoy |
Selenocisteina

O O

HO SeH HO SH
NH2 NH2
Selenocisteína Cisteína
pKa = 5.2 pKa = 8.0
O O

O Se O SH
NH3 NH3
Utiliza UGA y una maquinaria de decodificacion
especifica
Se encuentra en los tres dominios aunque en un juego
de proteinas reducido (selenoproteinas)
El elemento SECIS reprograma traduccionalmente el
codón UGA

Sec elemento SECIS

ACU
UGA
5´ 3´
La descodificación requiere un factor de elongación
específico para Sec

EF-Sec (selB)
 La síntesis de Sec ocurre sobre el tRNASec

Ser Sec

Seril tRNA sintasa Sec sintasa (selA)

Ser selenofosfato

ACU ACU ACU

tRNASec Selenofosfato
sintetasa
(selC)
(selD)

ATP selenuro
 Genes involucrados en la incorporación de Sec

. selA: Sec sintasa

. selB: Factor de elongación específico

. selC: tRNASec

. selD: Selenofosfato sintetasa

hoy | Pirrolisina (Pyl)

Codificado por UAG

Mecanismo todavia por resolver.

Se encuentra en Archaea y una

sola bacteria, en un conjunto de
proteinas bastante especifico