II.

 BIOCONTROL  DE  FITOPATÓGENOS  

 
TEMA  6.    AGENTES  DE  BIOCONTROL  I  
6.0.    Introducción.  Suelos  supresores.  
6.1.  Caracterís8cas  deseables  en  un  buen  agente  de  biocontrol  
6.2.  Mecanismos  de  biocontrol:  
 6.2.1.  Antagonismo:  an8biosis,  sideróforos,  enzimas  lí8cos.  
 6.2.2.  Interferencia  de  moléculas  señalizadoras  
 6.2.3.  Predación  y  parasi8smo  
6.3.  Presentación  de  la  Prác8ca  de  Laboratorio  -­‐  II  
   
TEMA  7.    AGENTES  DE  BIOCONTROL  II  
7.1.  Mecanismos  de  biocontrol  (con8nuación)  
 7.1.1.  Resistencia  sistémica  inducida  (ISR)  
 7.1.2.  Competencia  por  nutrientes  y  nichos  (CNN)  
 7.1.3.  Interferencia  con  otras  ac8vidades  del  patógeno  (germinación,  esporulación)  
7.2.  Cepas  de  biocontrol  de  interés  comercial  
 7.2.1.  Selección  de  cepas  para  Biocontrol  
 7.2.2.  Biocontrol  en  post-­‐cosecha  
 7.2.3.  Productos  para  Biocontrol    
 
7.3.    Perspec8vas  de  futuro  
 7.3.1.  Microbioma  y  biocontrol  
 7.3.2.  Biocontrol  de  nematodos  fitopatógenos  
 Biocontrol  of  phytopathogens:  Future  prospects  

Well  selected,  single-­‐strain  inoculants    

 -­‐  might  be  studied  for  mechanisms  involved  
 -­‐  can  provide  efficient  biocontrol  under  “in  vitro”  condiHons,  BUT  
 
OJen  fail  to  control  pathogens  under  real  soil  condiHons  because  of  
   -­‐  competence  with  other  microbes  
   -­‐  plant  response  to  high  numbers  of  a  single  species  
   -­‐  requirement  for  consorHa  of    well  adapted    microorganisms  
   -­‐  plants  manipulate  their  microbiome  
Biocontrol  of  Phytopathogens:  Future  prospects  

HolisHc  approach  to  biocontrol  strategies:  integraHng  the  microbiome  

 
Plant  responses  and  enhancement  of  acHvity  of  biocontrol  agents  
 

106 S. Massart et al. / Biological Control 89 (2015) 98–108

Fig. 3. Evolution of biocontrol research toward the integration of microbial communities into the current research triangle.
 RHIZOSPHERE  MICROBIOME  AND  BIOCONTROL  

Ø  Rhizosphere  microbiota  consist  of  a  subset  of  the  total  diversity  of  the  bulk  soil  in  which  
plants  are  grown  
Ø  Soil  type  is  an  important  factor  in  determining  rhizosphere  microbial  community  composiHon  
Ø  Different  plant  species  select  disHnct  microbial  communiHes  (root  exudates?)  
Ø  overlap  in  the  bacterial  species  selected  by  similar  plants  across  different  soils  
Ø  Plants  can  specifically  select  and  enrich  certain  bacterial  groups  through  compounds  that  
selecHvely  sHmulate  or  repress  microbial  growth  
 Leaf  infecHon-­‐dependent  expression  
of  malic  acid  transporter  

Leaf  infecHon-­‐
dependent  
Bacillus  
colonizaHon  

Mutants  in  malic  acid  

transporter  do  not  
a[act  Bacillus  upon  
infecHon    
CommonaliHes  in  the  life  support  funcHons  of  the  microbiomes  of  the  
human  gut  and  the  plant  rhizosphere.  

Mendes  and  Raaijmakers,  2015  

Berg  et  al.,  2015  
SelecHon   of   a   Bacillus   strain   with  
good   biocontrol   acHvity   against  
Fusariom  

Bacillus  amyloliquefaciens  NJN-­‐6  

SelecHon  and  use  of  biocontrol  agent    
Bacillus  NJN-­‐6  
 Biocontrol  of  phytopathogenic  nematodes  

Meloidogyne   Meloidogyne   Heterodera  

 Biocontrol  of  phytoptahogenic  nematodes  
Nematodes  are  abundant  inhabitants  of  soils  (up  to  107  individuals/m3)  
 

Crop  diseases  >  value  than  virus  and  bacteria  (10-­‐100  x  109  US$/year)    
 
SHll,  poor  biocontrol:  nemaHcides,  crop  rotaHon,  plant  resistance  
 

 
Two  main  groups  of  plant  parasiHc  nematodes:  
   Root  knot  nematodes  (Meloidogyne)    
     10-­‐20%  crop  failure  /year  
     decrease  producHon  and  debilitates  plant  
   Cyst  nematodes  (Heterodera)  
Nematode-­‐  suppressive  soils    described  (hard-­‐to  describe  causes)  
 
Microorganisms  antagonizing  phytopathogenic  nematodes  
 Fungi:  over  700  sp.  of  different  orders  and  families  
   types  of  acHon:            endoparasiHc  
               nematode  trapping  
               opportunisHc  
               toxic  
 Bacteria:  different  genera:  acHnomycetes,  Agrobacterium,  Bacillus,  Pseudomonas,    
   types  of  acHon:  Obligate  parasiHc  
         Parasporal  crystal  protein  forming  
         opportunisHc  parasiHc      
Biocontrol  of  phytoptahogenic  nematodes  

Fungi:  over  700  sp.  Of  different  orders  and  families  

   types  of  acHon:  endoparasiHc  
               nematode  trapping  
               opportunisHc  
               toxic  
 
EndoparasiLc  fungi  controlling  nematodes  
 obligate  parasites    
 over  120  sp  reported.  Drechmeria,  MyzocyHum,  …  
 difficult  to  study  for  obligate  parasiHsm  
 
Nematode-­‐fungi  trapping  
 Physical  traps  of    different  types  
 
OpportunisLc:  can  affect  reproducHve  organs  of  nematodes  
     development  enhanced  in  the  rhizosphere  
 
ProducLon  of  toxic  compounds:  Alkaloids,  pepHdes  and  terpenoids  
   
Nematode  parasiHc  and  antagonisHc  fungi  

Moosavi  and  Zare,    2011  

 Nematode-­‐endoparasiHc  fungi  

Ø   obligate  parasites  and  poor  saprotrophic  compeHtors  in  soil  

Ø   infect  vermiform  plant-­‐parasiHc  nematodes  using  their  spores  (ingested  or  adhered)  
Ø  Some  fungi  produce  zoospores  that  are  a[racted  by  nematodes  
Ø  Internal  mycellium  develops,  and  exits  from  corpse  
Ø  Collagenases  and  proteases  involved  in  infecHon  
Ø  Genera:  Haptocillium,  Hirsutella,  Dechmeria  

Moosavi  and  Zare,    2011  

 Nematode  trapping  fungi  
Fossil  evidence  of  ancient  fungi    
Specfic  adhesion  mediated  by  receptors  from  both  sides  
Exoenzymes  (chiHnase,  protease)  involved  
Six  types  of  traps  described  

In  the  fungus:    
-­‐  AcHve  cytoskeleton  assembling  
-­‐  Enhanced  cell  wall  synthesis  
-­‐  Increased  glycerol  synthesis  
-­‐  Peroxisome  biogenesis  
 Egg-­‐  and  Female-­‐ParasiHc  Fungi  

 uses  appressoria  or  zoospores  to  infect  their  hosts  

can  saprotrophically  survive  well  in  rhizosphere,  
Mode  of  infecHon:  
 mechanical  (appresoria)  and  enzymaHc  mechanisms  
 ChiHnases  and  proteases  to  penetrate  eggshell  
SomeHmes  more  effecHve  in  combinaHon  with  nemaHcide  
(Aldicarb)  or  with  rotaHons  of  VAM  fungi  
Some  produce  anHbioHcs  and  chiHnolyHc  enzymes  
relaHvely  easy  to  mass-­‐culture  
 
Relevant  genera:      Pochonia,    Paecilomyces,    Haptocillium,  
and    Hirsutella  

Moosavi  and  Zare,    2011  

 Toxin-­‐Producing  Fungi  

Ø  Fungi  secreted  a  number  of  compounds  in  vitro    nemaHcidal  or  nematostaHc  
Ø  Pleurotus  and  Coprinus  secrete  a    trans-­‐2-­‐decenedioic  acid-­‐like  immobilizing    toxin  
Ø  NemaHcidal  anLbioLc  producLon  demonstrated  Drechmeria,Harposporium,    
   Paecilomyces,  and  Pochonia  
Ø  Oligosporin  producHon  in  Arthrobotrys  
 Bacterial  obligate  parasites  of  nematodes  
(Lavmosek  et  al.,  2013)  

Pasteuria:  Gram-­‐posiHve,  spore-­‐forming  

     obligate  parasites  from  Meloidogyne  
   infected  females  produce  less  eggs  
   104  spores/g  of  soil  required  for  effecHve  control  
   P.  penetrans  demonstrated  as  responsible  for  suppressive  soils  
 
   Pasteuria  Biosciences  LLC  produces  endospores  in  bioreactor  
 
Endosymbionts  of  enthomopathogenic  nematodes  
 Some  produce  exo-­‐  and  endometabolites:  
   suppressive  effect  on  Meloidogyne  spp  
   reduce  egg  hatch  and  juvenile’s  penetraHon    
   exhibit  repellent  acHvity  
   paralyse  juveniles  
 
Rhizobacterial  antagonists  
   Bacillus  
   AcHnomycetes:  producHon  of  avermecLns  
     Streptomyces  avermi8lis  
2011

Some  nematode  biocontrol  products  are  in  the  market  
 AnH-­‐nematode  biocontrol  agent  

Mycelium  of  Paecilomyces      lilacinus  growing  on  eggs  of  

Meliodogyne  spp.    
Bacillus  firmus