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PRESENTADO POR
Chavez Marcos Sayuri
Espejo Moncada Jairo
Hurtado Huincho Edith
Hurtado Huincho lucero
Pizan Estrada Rommy
CURSO:
BIOLOGIA
PROFESORA:
Cribillero Huaman Rosa
DEDICTORIA
Las proteínas son compuestos químicos muy complejos que se encuentran en todas
las células vivas: en la sangre, en la leche, en los huevos y en toda clase de semillas
y pólenes. Hay ciertos elementos químicos que todas ellas poseen, pero los diversos
tipos de proteínas los contienen en diferentes cantidades. En todas se encuentran un
alto porcentaje de nitrógeno, así como de oxígeno, hidrógeno y carbono. En la
mayor parte de ellas existe azufre, y en algunas fósforo y hierro. Las proteínas son
sustancias complejas, formadas por la unión de ciertas sustancias más simples
llamadas aminoácidos, que los vegetales sintetizan a partir de los nitratos y las sales
amoniacales del suelo.
Como sabemos, para que la síntesis proteica se lleve a cabo es necesario que esté
presente una molécula de ARNm que proviene del núcleo, que lleva la información
necesaria para decidir qué proteína se va a sintetizar. Este ARNm deberá asociarse a
un ribosoma que le brindará el ambiente necesario para la traducción y finalmente
será necesario que aparezca el primer aminoácido codificado por el primer codón
del ARNm. Lo cierto es que el aminoácido no puede unirse solo sino que necesita
una molécula adaptadora que lo porte. Esta molécula es el ARNt que posee en un
extremo el aminoácido correcto y en otro extremo tiene un triplete de bases llamado
ANTICODON que se aparea por complementariedad de bases con el codón
presente en el ARNm.
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2. DEFINICIÓN.
Síntesis de proteínas es el proceso anabólico mediante el cual se forman
las proteínas. El proceso consta de dos etapas, la traducción del ARN mensajero,
mediante el cual los aminoácidos del polipéptido son ordenados de manera precisa a
partir de la información contenida en la secuencia de nucleótidos del ADN, y las
modificaciones pos traducción que sufren los polipéptidos así formados hasta
alcanzar su estado funcional. La traducción es la fase más importante la síntesis de
proteínas se considera sinónimo de traducción.
3. REPLICACIÓN
Las propiedades de la replicación son básicamente iguales en todos los seres vivos,
y siendo así que la mayoría de los estudios se han realizado en Escherichia coli, se
describirá el proceso a nivel del organismo bacteriano; y a continuación, se
indicarán algunas características propias de organismos eucariotas.
3.1. PRINCIPALES CARACTERÍSTICAS DE LA REPLICACIÓN
3.1.2. La replicación es un proceso semiconservador
Cada cadena de la molécula de ADN parental actúa de molde para la síntesis
de una nueva cadena produciéndose dos nuevas moléculas de ADN, cada
molécula nueva posee una cadena vieja y una nueva.
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3.1.5. La síntesis de ADN se desarrolla en dirección 5' → 3'.
La dirección en que actúan las enzimas es fija y única de 5' a 3'. Esto
determina que la cadena molde ha de tener la dirección 3'→5', para que la
nueva cadena en formación, complementaria y antiparalela tenga la
dirección 5' →3' coincidente con el sistema de trabajo de la enzima. Al ser la
horquilla de replicación bidireccional, el sistema descrito implicaría que la
otra cadena parental 5'→3' debería estar siendo copiada en dirección 3'→5',
situación imposible debido a la limitación de las enzimas sintéticas. Este
problema es obviado debido a que
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incorporan han de hacerlo en su forma activada o un cleótido trifosfatados
(dNTP). La reacción que tiene lugar es la siguiente: ADN (n nucleótidos) +
dNTP → ADN (n+1 nucleótidos) + PPi La reacción de polimerización es
termodinámicamente favorable por la hidrólisis del pirofosfato; pero no sólo
por el desdoblamiento del pirofosfato, sino también por las interacciones no
covalentes que se establecen entre las bases. Esta reacción es catalizada por
varias enzimas, las ADN polimerasas, cada una con un tipo de actividad
muy específica pero con una serie de requisitos de funcionamiento comunes,
que son:
Necesitan un cebador, la
polimerización que realizan estas
enzimas requiere que exista una
cadena previa inicial (cebador) ya
que son incapaces de coger sobre
su centro activo dos nucleótidos
individuales y comenzar la
síntesis. Uno de los sustratos
necesarios de la reacción es, por
tanto, una cadena preexistente, y
ninguna de estas enzimas es
capaz de iniciar la síntesis de una
cadena nueva desde su primer
nucleótido.
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A) La velocidad con que
adicionan nucleótidos, o
procesividad, se mide
como el número de
nucleótidos
incorporados en la
unidad de tiempo y es
una característica propia
de cada polimerasa. Una
cualidad de todas las
ADN-polimerasas es la
precisión con que
realizan la replicación,
estimándose en
Escherichia coli que se
comete un error en uno
de cada 109 a 1010
nucleótidos, lo cual en el cromosoma de Escherichia coli supone un error cada
1.000 a 10.000 replicaciones. Estos errores son corregidos por las mismas
polimerasas mediante una actividad enzimática independiente, la actividad
exonucleasa 3'5'; esta actividad les permite eliminar el último nucleótido
incorporado si éste es erróneo, para a continuación, seguir con la
polimerización. Esta capacidad de corrección, mediante la discriminación entre
bases correctas e incorrectas, mejora la precisión de la replicación. Si se añade
el hecho de que, además, existen otros sistemas de corrección que actúan
después de acabada la replicación, puede observarse la fidelidad y garantía del
proceso. Existen tres polimerasas denominadas ADN polimerasa I (la primera
que se describió), ADN polimerasa II y ADN polimerasa III. Si se comparan
algunas características diferenciales entre ellas, se puede observar que la ADN
polimerasa III es la más compleja. Está formada por diez subunidades diferentes
y tiene una capacidad de polimerización infinitamente superior a cualquiera de
las otras dos, siendo, por tanto, la principal enzima de la replicación. La ADN
polimerasa I es importante por su tarea de corrección, capaz de realizarla tanto
en la dirección descrita como en la dirección contraria, debido a que posee la
actividad exonucleasa 5'→3', careciendo de la misma el resto de polimerasas.
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eliminan los enlaces entre las cadenas consumiendo en el proceso
ATP.
Se pueden distinguir tres fases según las enzimas que participan en las mismas:
1. Fase de inicio
El origen de la replicación es una porción de ADN que contiene una secuencia
característica de bases. Este segmento es reconocido por una proteína denominada
ADN-A.
2. Fase de elongación
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En el caso de Escherichia coli con un cromosoma circular, las dos horquillas de la
replicación se encuentran en el extremo contrario al origen terminando así la
replicación y necesitando, únicamente, la presencia de una topoisomerasa para la
separación de las dos moléculas.
4. TRANSCRIPCIÓN
4.1.CONCEPTO DE TRANSCRIPCIÓN
La transcripción es un proceso en el que la información genética del ADN pasa al
ARN mensajero (ARNm). Es el primer paso de la síntesis de proteínas. El ARNm
transporta la información desde el núcleo, donde está codificada en el ADN, hasta el
citoplasma, donde se encuentran los ribosomas. El paso de ADN a ARNm se hace
construyendo una copia complementaria nucleótido a nucleótido teniendo en cuenta
que en el ARNm el uracilo es el complementario a la adenina. Esta copia la realiza la
enzima ARN polimerasa II en tres etapas: iniciación, elongación y terminación. La
ARN polimerasa II se une a un sitio específico del ADN llamado promotor para
comenzar la transcripción. No todos los genes se expresan, sino que en cada tipo
celular y en cada momento funcional hay un perfil de expresión génica que
proporciona a cada célula su identidad y le permite adaptarse a las funciones que debe
realizar. Los procesos de regulación de la transcripción dirigen esta expresión
diferencial de genes en los distintos tipos celulares y en los distintos estados
funcionales.
4.2.CARACTERÍSTICAS DE LA TRANSCRIPCIÓN
La síntesis de ARN dependiente de ADN es un proceso muy parecido al de la
replicación,
existiendo una serie de similitudes que establecen un estrecho modo de operación por
parte de la célula a la hora de procesar el material genético. Así puede observarse el
hecho de que la reacción es igualmente de polimerización, se necesita también un
molde para realizarla, y, por último, la dirección de síntesis es fija al igual que en la
replicación. Sin embargo, la transcripción presenta una serie de características que la
diferencian de la replicación, como son:
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4.2.1. Proceso numero 1
El proceso se limita a una porción de ADN, se dice que es un proceso selectivo,
ya que ha de reconocerse un punto de inicio y uno de terminación en la molécula
de ADN.
*El promotor de un gen es una región del ADN con unas características especiales
que determina el punto en el que la ARN polimerasa comienza a transcribir un gen.
Las características del promotor también influyen en la eficiencia de la transcripción.
Esta región incluye las secuencias de unión a factores de transcripción y a otros
elementos que participan en la transcripción.
*Un factor de transcripción es, por definición, cualquier proteína necesaria para
iniciar el proceso de transcripción. Muchos de los factores de transcripción actúan
mediante el reconocimiento de posiciones en sic que forman parte de los promotores
o intensificadores de los genes.
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ADN se encuentra a unas 25 o 30 pares de bases corriente arriba del sitio de inicio de
la transcripción en el promotor de los genes procariotas y de algunos genes eucariotas
*La helicasa es una enzima vital en los seres vivos ya que participa en los procesos
de duplicación y reproducción celular de este, transcripción, recombinación y
reparación del ADN, y de biogénesis de ribosomas.
4.5.FASES DE LA TRANSCRIPCIÓN
Se puede dividir el proceso en tres fases:
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1) Fase de inicio
La ARN polimerasa debe reconocer el punto de inicio de la síntesis. Esta zona del ADN,
descrita
como promotor, consiste en dos secuencias cortas de bases situadas 10 y 35 pares de bases
del punto inicial de la síntesis. Por convenio, para describir la región del ADN dónde se sitúa
el gen a transcribir, se da el número +1 al par de bases (ADN) dónde comienza la síntesis del
ARN, hasta +n que será el último par de bases dónde acaba la síntesis. Tal y como copia la
ARN polimerasa, este último par de bases estará situado hacia el extremo 3' de la cadena
molde (ADN) describiéndose el desplazamiento de la ARN polimerasa en esta región como
“aguas abajo”. La secuencia promotora, que está en la cadena molde situada hacia el extremo
5', se denomina secuencia “aguas arriba”, y se expresa -1 a - n. De ahí el hecho de que los
promotores se sitúen a -10 y a -35 del punto de aparición del ARN.
2) Fase de elongación
Durante esta fase se produce el crecimiento de la cadena por incorporación de ribonucleótidos
con bases complementarias, que forman el híbrido ADN-ARN en una secuencia de unos 12
pares de bases. A medida que la ARN polimerasa avanza por la cadena molde de ADN los
dos componentes del híbrido se van separando, volviendo la cadena de ADN a su
configuración primitiva de doble hélice. La ARN polimerasa mantiene rotos los enlaces entre
las cadenas en un segmento de 17 pares de bases, desenrollando el ADN por delante y
enrollándolo por detrás.
3) Fase de terminación
La ARN polimerasa continúa la copia de ADN hasta la presencia de una secuencia concreta
de terminación que provoca su disociación. La secuencia de terminación suele estar formada
por una repetición de bases de adenina que se transcribe como una secuencia de uracilos en
el ARN sintetizado.
Uno de los procedimientos para terminar la transcripción depende de la presencia de un factor
proteico denominado factor ρ (Rho). Esta proteína funciona como una helicasa respecto al
híbrido ADN-ARN, y con gasto energético provoca la rotura de los enlaces que mantienen
al ARN recién sintetizado unido al ADN y causa la separación de la ARN polimerasa de la
cadena de ADN.
Otra forma de terminación de la transcripción, independiente del factor ρ, consiste en la
formación de una estructura en horquilla, formada por 15 ó 20 nucleótidos del ARN, que
rompe los enlaces de parte del híbrido ya que en la secuencia final contiene una serie de bases
inestables (A y U) que facilitan la disociación del complejo.
En el caso de células procariotas la secuencia que se transcribe suele estar formada por más
de un gen por lo que el ARN se denomina policistrónico, y si es ARN mensajero llevará
información para varias cadenas polipeptídicas distintas.
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5. LA TRADUCCIÓN
¿Qué es lo que se traduce? En realidad se traduce el lenguaje del ADN, que se lee de a
bases, tanto en el ADN como en el ARN, a un nuevo lenguaje que es el de los aminoácidos
que formarán un polipéptido. Por eso se dice que un gen codifica un polipéptido.
Como sabemos, para que la síntesis proteica se lleve a cabo es necesario que esté presente
una molécula de ARNm que proviene del núcleo, que lleva la información necesaria para
decidir qué proteína se va a sintetizar. Este ARNm deberá asociarse a un ribosoma que le
brindará el ambiente necesario para la traducción y finalmente será necesario que aparezca
el primer aminoácido codificado por el primer codón del ARNm. Lo cierto es que el
aminoácido no puede unirse solo sino que necesita una molécula adaptadora que lo porte.
Esta molécula es el ARNt que posee en un extremo el aminoácido correcto y en otro
extremo tiene un triplete de bases llamado ANTICODON que se aparea por
complementariedad de bases con el codón presente en el ARNm Como cualquier ARN,
está formado por una secuencia de bases (75 a 85 aprox.), que se representa en la clásica
forma de hoja de trébol debido al apareamiento de bases que ocurre en cortas secuencias de
su cadena (Estructura secundaria).
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Cada ARNt está codificado en el ADN y hay uno para cada tipo de aminoácido, y la
aminoacil sintetiza lo reconoce por esta estructura tridimensional en forma de L. O sea que
hay ARNt de leucinas , de argininas, de serinas etc. La estructura tridimensional también le
sirve para para poder asociarse a los ribosomas en el proceso de la traducción de proteínas.
En este proceso entonces participan tres tipos de ARN, el de transferencia, el ribosomal
que se asocia a proteínas formando los ribosomas y el ARNm que será leído para sintetizar
un polipéptido.
La estructura de los ARN mensajeros ya ha sido descrita y sabemos que la traducción
comienza en un triplete de bases (AUG) llamado el codón de inicio. Este codón
determinará entonces como se leerá el ARNm, o sea de a tripletes o codones que le siguen
al AUG, por eso se dice que determina el marco de lectura del ARNm.
Este tipo de estructura terciaria le brinda a la molécula la posibilidad de, por un lado, poder
aparear su anti codón con el codón del ARNm de una forma poco habitual, es decir que
permite que se apareen G con U por ejemplo, además del clásico A-U y C-G; y esta
configuración en forma de L le permite tener lo más alejado posible al anticodón del
extremo aceptor, esto es necesario porque el anti codón se asocia con el codón sobre la
subunidad pequeña del ribosoma y el aminoácido que está en el extremo aceptor se une con
otro aminoácido sobre la subunidad grande del ribosoma.
El enlace entre un determinado aminoácido y su correspondiente ARNt es catalizado por
la Aminoacil sintetaza, que es específica para cada aminoácido, y por lo tanto para todos
los ARNt que lo puedan portar. A los ARNt diferentes que puedan portar el mismo
aminoácido, se los llama iso-aceptores.
La enzima produce la reacción de carga del ARNt con su correspondiente aminoácido en
dos pasos:
Los ribosomas son partículas ribo-nucleo-proteicas compuestas por dos subunidades. Cada
subunidad esta formada por varias proteínas asociadas a moléculas de ARNr
En el caso de los procariotas el ribosoma es de 70 S de coefi-ciente de sedimentación y las
subunidades son de 30 S y 50 S. La subunidad pequeña 30 S está compuesta por el ARNr
16 S asociado a 21 proteínas (S de small: S1 a S21) en cambio la subunidad grande (50 S)
está formada por los ARNr 5S y 23 S, ambos asociados a 34 proteínas denominadas L de
large (L1 a L34)
De hecho, no solo hay un ribosoma que se asocia al ARNm sino que puede haber varios, a
los que se llama polirribosomas o polisomas, que van trabajando en distintos sectores del
ARNm.
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Siempre los ribosomas se desplazan sobre el ARNm en dirección 5’‑ 3′, traduciendo codón
a codón el marco de lectura.
El ribosoma contiene el sitio P en el que aloja al peptidil-ARNt, o sea al que porta la
cadena peptídica en crecimiento, y el sitio A en que aloja al aminoacil-ARNt, o sea al que
trae al próximo aminoácido que será añadido. La energía necesaria para la unión entre los
aminoácidos la proporciona el mismo ribosoma y la enzima que cataliza la reacción es la
peptidil transferasa, que se encarga de unir siempre el extremo carboxilo del aminoácido
del peptidil-ARNt y el grupo amino del aminoácido que lleva el aminoacil-ARNt. Así se
rompe el enlace que tenía el peptidil-ARNt con la cadena polipeptídica y queda libre o
desacilado, quedando así la cadena polipeptídica con el nuevo aminoácido unida al
aminoacil-ARNt en el sitio A, hasta que el ribosoma se traslade un codón sobre el ARNm,
quedando así el ahora llamado peptidil-ARNt con la cadena en el sitio P y el sitio A vacío.
El único aminoacil-ARNt que puede entrar directamente al Sitio P, sin pasar por el sitio A
previamente es el ARNt iniciador, o sea aquel que porta el aminoácido que se corresponde
con el codón de inicio (AUG), es decir Metionina (Met) o Formil Metionina (fMet) según
se trate de eucariotas o procariotas respectivamente.
A pesar de que solo hay 20 aminoácidos, Francis Crick descubrió que el código genético se
lee de a tres bases.
Se conoce la existencia de 20 aminoácidos diferentes. Sabemos también que en el ARNm
hay 4 tipos de bases diferentes (A, G, C y U); por lo tanto, si la información se leyera de a
una sola base sólo habría 4 tipos de aminoácidos distintos, por otro lado si se tomara la
información de a dos bases, la combinación de 4 bases elevado al cuadrado, nos daría 16
tipos de aminoácidos, lo que tampoco alcanza; finalmente si las 4 bases se toman de a tres,
tendríamos 64 posibles aminoácidos, o mejor dicho tenemos 64 distintos tripletes de bases,
también llamados codones. Como vemos, existen muchos más codones que aminoácidos.
Con el tiempo se descubrió que algunos aminoácidos están codificados por varios codones
o sea que hay codones redundantes. A esto se lo llama REDUNDANCIA DEL CODIGO, o
se dice que el código genético es DEGENERADO.
Obsérvese que la mayoría de los aminoácidos están representados por más de un codón y
que la variación entre esos codones para el mismo Aa, en general es en la tercera base.
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Por todo esto se descubrió luego que no era necesario que hubiera 64 ARNt para cada
triplete sino que existen muchos menos ya que como la tercera base del codón del
mensajero es redundante, la primera base del anticodón puede aparearse de forma no usual
aceptando que algunas bases se apareen en forma anormal o se cambia quimicamente
permitiendo que reconozcan a más de una tercera base. A esto se le llama apareamiento tipo
Wobble.
Cada mRNA tiene una secuencia de bases precedente al codón de inicio que es
complementaria a una secuencia de consenso que se en-cuentra en el rRNA 16 S, la cuál se
denomina secuencia de Shine Dalgarno y que permite el apareamiento entre los dos RNA
(mRNA y rRNA) por complementariedad de bases, formando el complejo de iniciación.
Este complejo está integrado también por proteínas indispensables para el inicio y que son
llamadas Factores de iniciación, que intervienen en la disociación de los ribosomas, la
unión al mRNA, la unión al tRNA iniciador y alguna otra función desconocida aún. En
procariotas se conocen 3 de estos factores, y en eucariotas 11 factores.
En el caso de los eucariotas hay muchos más factores que intervienen en la iniciación,
además de existir algunas diferencias con respecto al ARNt iniciador que porta metionina
normal, la subunidad pequeña es 40 S y primero ésta debe reconocer el extremo 5′ del
mRNA y desde allí se desplaza sobre el mismo hasta encontrar el codón de inicio (Teoría
de scanning). Estas diferencias las realiza gracias a la gran cantidad de factores asociados al
ribosoma.
Las diferencias encontradas hasta el momento serían por un lado que la base 5′ terminal no
tiene puente de H con la base opuesta en el extremo aceptor. Por otro lado existe un puente
de H entre un U adyacente al anticodón y una ribosa del anticodón en todos los ARNt que
no aparece en el ARNt iniciador, lo que le da una estructura más abierta al loop anticodón.
También se describen diferencias en el extremo aceptor y en el loop DHU.
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Otra diferencia encontrada es la interacción codón anticodón del tRNA-fMet que podría ser
un Wobble en la primera posición del anticodón ya que este tRNA iniciador procariota no
sólo puede aparearse con el codón AUG sino también con el codón para Val (GUG) y con
los de Leu (UUG y CUG) que ocasionalmente pueden ser usados como codones de paro o
stop también. Este efecto Wobble puede ser explicado por la estructura más abierta del loop
anticodón ya mencionada
Algunas de las bases son más conservadas que otras y por lo tanto mas importantes para
que la traducción se produzca. Mayormente las más conservadas son AccAUGG.
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El ejemplo más estudiado de la
inciación cap independiente es el de la
entrada al sitio interno del Ribosoma
(Internal Ribosome Entry Site IRES).
En estos casos no es necesario el
scannig o barrido. El ribosoma es
llevado por factores llamados trans
actin (ITAFs derivado de IRES trans
actin factors) sorteando el barrido. Este
modo de inciio es recientemente
conocido y es usado en células que
requieren una traducción particular
debido a factores de stress o
incapacidad de traducir a la mayoría de
los mensajeros. Por ejemplo en
factores que responden a la apoptosis o respuestas inducidas frente a stress.
El sitio A será ocupado entonces por un ARNt determinado por el siguiente codón del
ARNm y se le unirá el aminoácido que está en el sitio P (Metionina) por un enlace
covalente que realiza la peptidil transferasa, produciéndose de esta forma un enlace entre el
grupo amino del aminoácido que ingresa y el grupo carboxilo del aminoácido anterior (o la
cadena en crecimiento). De esta forma queda el ARNt iniciador sin aminoácido o sea
desacilado y el sitio P libre.
Así cada vez que ingresa un ARNt cargado al sitio A y se produce la unión entre el grupo
COOH del aminoácido de la cadena en crecimiento y el grupo NH2 del aminoácido del
sitio A, se cumple la fase de elongación.
Este proceso también esta regido por proteínas llamadas factores de elongación, que
colaboran con la unión de los aminoacil-ARNt. Se descubrió en procariotas que este Factor
de elongación tiene dos componentes, el EF‑Tu y EF‑Ts (Uno termolábil y otro
termoestable).
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5.7.FASE DE TRANSLOCACIÓN
Ahora el ribosoma se desplaza un codón o tres bases, de modo que por un lado libera al
ARNt que estaba en sitio P e introduce en el mismo al que estaba en el A (que es un
peptidil ARNt ya que porta dos aminoácidos) y de esta forma queda nuevamente el sitio A
libre para aceptar un nuevo Aminoacil ARNt. Este movimiento se realiza en dirección 5’‑3′
de la cadena de ARNm.
El proceso continúa hasta que en el sitio A queda expuesto un codón de terminación, que
no codifica para ningún aminoácido y que será reconocido por un factor de liberación.
5.8.FASE DE TERMINACIÓN
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6. CONCLUSIONES.
En definitiva, esperamos haberte sido de ayuda para que hayas comprendido mejor en qué consiste
el proceso de síntesis por el cual tu cuerpo es capaz de transformar las proteínas que ingieres
mediante los alimentos en elementos vitales para su propio funcionamiento. Piensa, a este respecto,
que una vez llevado a cabo este mecanismo, tu organismo empleará las proteínas resultantes para
regenerar tus tejidos o defenderte de microorganismos externos.
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