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2. Materiales y métodos
La actividad de Pfk se determinó
espectrofotométricamente acoplando la producción
de fructosa-1,6-bisP a la oxidación de NADH como se
2.1. Mutagénesis dirigida al sitio
describió previamente [8]. En los experimentos de
desplegamiento inducido por hidrocloruro de Los experimentos se realizaron a 18 ± 0.1 LC
guanidina (GdnHCl) de mutantes de tipo silvestre utilizando un DLS DynaPro MSTC014 (Protein
Pfk-2, Cys-238 y Cys-295, se midió la actividad Solutions Inc. - Bucks, Inglaterra). Las muestras para
enzimática diluyendo 700 veces, en el medio como mediciones dinámicas de dispersión de luz contenían
se dice, las muestras de enzimas que tenían 0,5 mg / ml de proteína en tampón Tris-HCl 25 mM,
previamente incubado en diferentes concentraciones pH 8,2, MgCl2 5 mM y DTT 5 mM y
de GdnHCl. En estas condiciones, la concentración
máxima de agente desnaturalizante alcanzada en el
ensayo era inferior a 4 mM y, por lo tanto, puede En este trabajo, presentamos evidencia sobre la
despreciarse. Además, la actividad de la enzima se importancia de las interacciones entre subunidades
midió durante los primeros 5 minutos, donde el para la actividad y la estabilidad de Pfk-2 dimérica, y
proceso de renaturalización es negligible (M. Baez, sobre la contribución del residuo Cys-238 a esta
observaciones no publicadas). interacción. Además, se evaluó la participación de
Cys-295 en las interacciones dímero-dímero y en la
regulación alostérica por MgATP. Los resultados
2.4. Cromatografía de exclusión por tamaño informados aquí muestran que la actividad de Pfk-2
está asociada a su estado dimérico y que Cys-238 no
es crítica para el mantenimiento del estado
Se realizaron experimentos de cromatografía de oligomérico o para la estabilidad del dímero Pfk-2.
exclusión por tamaño con un sistema de bomba Sin embargo, la introducción de fenilalanina en la
binaria Waters 1525 HPLC, con una columna Bio-Sil posición 295 aumenta la estabilidad del estado
SEC-250 (7,8 mm · 30 cm) (BioRad, Hercules, CA, EE. tetramérico de la enzima y la fructosa-6-P.
UU.) Equilibrada en un tampón que contiene Tris-HCl
40 mM , pH 7,6, MgCl _ {2} 5 mM, KCl 200 mM, DTT 2
mM en ausencia o en presencia de MgATP 0,5 mM, a
un caudal de 0,8 ml / min. La columna se calificó con
0014-5793 / $ 30.00 2005 Federación de Sociedades
los siguientes marcadores de masa molecular:
Europeas de Bioquímica. Publicado por Elsevier B.V.
anhidrasa carbónica (29 kDa), alcohol
Todos los derechos reservados. doi: 10.1016 /
deshidrogenasa (150 kDa), b-amilasa (200 kDa) y
j.febslet.2005.02.078
tiroglobulina (669 kDa). La elución de proteína se
registró con el uso de un detector dual Waters 2487
UV en línea que mide la absorbancia a 280 nm.
Cys- Cys-
3. Resultados y discusión Wild type 238 295
substitu substitute
ted d
by by
3.1. Caracterización estructural y cinética de las
enzimas mutantes Cys-238 y Cys-295 Ph
Ala e Ala Phe
kcat, s 1 90 70 70 39 13
Como se informó anteriormente, la modificación Km fructose-6-
química de Pfk-2 con PM y EM sugiere que Cys-238 P, lM 31 31 47 88 81
10
es importante para el mantenimiento del estado Km MgATP, lM 17 17 21 61 7
A. Caniuguir et al. / FEBS Letters 579 (2005) 2313-2318
Dimeric Pfk-2 [15] apoya esta observación. Los experimentos de cromatografía de exclusión
por tamaño demuestran que las enzimas mutantes Cys-295 y Cys-238 eluyen como dímeros en
ausencia de ligandos, mientras que en presencia de MgATP el tetrámero es la especie
dominante para ambos mutantes, mostrando el mismo comportamiento de la enzima de tipo
salvaje bajo las mismas condiciones (Fig. 1). Además, los espectros de dicroísmo circular de los
mutantes fueron idénticos a los de la enzima de tipo salvaje, lo que indica que no hay
alteraciones significativas en la estructura secundaria de la enzima debido a la sustitución de
los residuos (no se muestra).
Hemos demostrado previamente que la modificación de Cys-238 con PM produce una enzima
activa con un volumen de elución similar al esperado para la forma monomérica globular de
Pfk-2, lo que indica que la sonda química está de alguna manera afectando las interacciones de
los monómeros. Sin embargo, la enzima modificada con PM eluye como el dímero nativo en
presencia de fructosa-6-P y ATP 4, lo que indica que interrumpir las interacciones monómero-
monómero no previene la dimerización y no puede usarse para la evaluación de la actividad
catalítica del monómero . La monomerización observada tras la modificación química sugiere
que la sonda PM puede inducir un cambio conformacional que afecta a la interfaz del dímero.
Se ha descrito una situación análoga para la enzima luciferasa de Vibrio harveyi, donde las
mutaciones en la interfaz de la subunidad del dímero alteran la estabilidad de una región en
una de las subunidades que está distante de la interfaz [16]. Se pueden extraer ideas sobre la
relación entre la forma dimérica y la actividad catalítica a partir del modelo de homología de
Pfk-2 dimérico. En cada monómero, el dominio de hoja doble está involucrado en la formación
de ambas, la interfaz de la subunidad y la hendidura que contiene el sitio activo [15]. Por lo
tanto, la interrupción de la interfaz monómero-monómero debería afectar la estructura del
sitio activo, y por lo tanto, la actividad catalítica. Con el fin de explorar la relevancia de las
interacciones de subunidades para la estabilidad y actividad catalítica de Pfk-2, y para evaluar
la contribución de Cys-238 y Cys-295 a estas interacciones, usamos GdnHCl y experimentos de
dilución de proteínas para inducir el despliegue de proteínas. y disociación de subunidades.
Para cada condición utilizada, se evaluaron los cambios resultantes en la actividad catalítica y
la estructura oligomérica.
Fig. 1. Efecto de MgATP sobre el estado de agregación de las enzimas mutantes Pfk-2, Cys-238-
Phe y Cys-295-Phe de tipo salvaje. La cromatografía de exclusión por tamaño se realizó en una
columna Bio Rad Bio Sil SEC-250 en ausencia de ligandos (línea continua) y en presencia de
MgATP 0,5 mM (línea discontinua). Las muestras de proteína se preincubaron en las mismas
condiciones. Los paneles A, B y C representan mutantes de tipo salvaje, Cys-238-Phe y Cys-295-
Phe, respectivamente. T y D denotan tetrámero y dímero, respectivamente
2 [15] estos resultados no son fáciles de explicar, a menos que se reclamen los efectos
estructurales de largo alcance causados por la mutación. Por otro lado, los resultados de los
estudios cinéticos y estructurales obtenidos con los mutantes Cys-238 son compatibles con el
modelo molecular de Pfk-2, que predice una ubicación para este residuo lejos del sitio activo y
de la interfaz monómero-monómero .
3.3. La inhibición inducida por MgATP de la actividad de la enzima está modulada por la
estabilidad de las interacciones dímero-dímero
Se ha demostrado que la inhibición de la actividad de Pfk-2 mediante la unión de MgATP a un
sitio alostérico es una característica reguladora importante para el metabolismo de
carbohidratos in vivo de E. coli en condiciones gluconeogénicas [17]. La modificación química
de Cys-295 sugiere un papel de este residuo en la unión de MgATP al sitio alostérico y también
en la formación de tetrámero inducido por MgATP. Sin embargo, su importancia para la
inhibición inducida por MgATP de la actividad de la enzima no pudo ser evaluada porque la
enzima modificada químicamente estaba inactiva.
Para determinar el efecto de las mutaciones de este residuo por Ala o Phe sobre la regulación
de la actividad de Pfk-2, estudiamos la inhibición inducida por MgATP de la actividad
enzimática a baja (0.1 mM) y alta (1 mM) de fructosa-6- Concentraciones de P La Fig. 4B
muestra que la enzima mutante Cys-295-Ala mostró el mismo comportamiento que la enzima
de tipo salvaje (Fig. 4A) y los mutantes Cys-238 (no mostrados), es decir, la inhibición de la
actividad enzimática a baja fructosa-6 -P y la reversión de esta inhibición a mayores
concentraciones de fructosa-6-P. Sin embargo, aunque el mutante Cys-295-Phe se inhibe a 0.1
mM de fructosa-6-P, la reversión de la inhibición requiere mayores concentraciones de
fructosa-6-P (> 5 mM) en comparación con la enzima de tipo salvaje. Dado que la inhibición
alostérica de Pfk-2 por MgATP se ha relacionado con la asociación de dímeros para formar
tetrámeros [10,11] la rever-sal de esta inhibición por altas concentraciones de fructosa-6-P
podría explicarse por la disociación de tetrámeros en dímeros activos debido a la unión del
azúcar-fosfato al sitio activo. El resultado observado con Cys-295-Phe podría
Una segunda posibilidad es que la sustitución de Cys por Phe podría afectar la fuerza de las
interacciones dímero-dímero en el tetrámero. Esta alternativa se probó comparando la
estabilidad de los tetrámeros de tipo salvaje y Cys-295-Phe con el despliegue inducido por
GdnHCl en presencia de MgATP. La Fig. 6 muestra que el mutante Cys-295-Phe requiere una
mayor concentración del agente desnaturalizante (Cm1 / 2 0.63 M) para desplegar la proteína,
en comparación con las enzimas de tipo salvaje y Cys-295-Ala (Cm1 / 2 0.42 y 0.40 M,
respectivamente). Por lo tanto, existe una correlación entre el grado de inhibición de MgATP
de la actividad de la enzima y la estabilidad de las interacciones entre los dímeros en el
tetrámero. Debido a que el dímero Cys-295-Phe es menos estable que el dímero de tipo
salvaje, la mayor estabilidad de la forma tetramérica mutante podría estar asociada a un
efecto sobre la interfaz dímero-dímero.
4. Conclusión
Los resultados presentados aquí muestran que el estado dimérico de Pfk-2 es crítico para la
estabilidad y la actividad de la enzima, como se demuestra por la correlación entre la
disociación enzimática y la actividad enzimática en desplegamiento inducido por GdnHCl y
experimentos de dilución de proteínas. Cys-238 no tiene un papel aparente en las
interacciones monómero-monómero, como lo muestran la actividad enzimática, la inhibición
alostérica, la estabilidad del dímero y los experimentos de estructura oligomérica usando los
mutantes Ala y Phe. Por otro lado, la mutación del residuo Cys-295 produjo una disminución
en el valor de kcat y un incremento en los valores de Km para ambos sustratos, más
marcadamente en el caso de la sustitución de Phe. Esto probablemente ocurre a través de un
cambio condicional que afecta el sitio activo en lugar de un cambio directo
Inhibition and
tetramer Catalytic process
formation (K2)
(K1)
D-fructose-6- Ternary
T-MgATP D P complex
T=
tetram
MgAT fructose- MgAT er
P 6-P P D=
(allosteric (active (active dimer
site) site) site)
El lado izquierdo del esquema muestra la formación de tetrámeros (unión alostérico de MgATP
y asociación del dímero) controlada por K1. El lado derecho muestra el proceso catalítico
(unión de fruc-tose-6-P y formación de complejo ternario sobre la unión de MgATP) controlado
por K2. Por lo tanto, el equilibrio entre K1 y K2 determinará la modulación de la inhibición de
Pfk-2. Aquí postulamos que la mutación Cys-295-Phe produce cambios estructurales que
favorecen la inhibición alostérica al aumentar la estabilidad de tet-ramer.
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