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Tratamiento de Imgenes Mdicas

UNIDAD I. INTRODUCCIN
Contenido

Qu es una imagen digital?


Qu es el Procesamiento Digital de Imgenes?
Historia y estado del arte
Etapas clave en el Procesamiento Digital de Imgenes
Componentes de un sistema de Procesamiento Digital de Imgenes
Elementos de la percepcin visual

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Qu es una imagen digital?
Es una representacin de una escena en dos dimensiones como un conjunto
finito de valores digitales, llamados elementos de imagen (picture elements o
pixels)

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Qu es una imagen digital? (2)
Tambin puede definirse como una funcin bidimensional (, ) donde y
son coordenadas espaciales (plano), y es llamada intensidad
Los valores de pixel tpicamente representan niveles de gris, colores, alturas,
opacidad, etc.
Digitalizacin implica una aproximacin a una escena real

1 pixel

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Qu es una imagen digital? (3)
Formatos comunes:
1 muestra por punto: B/N, escala de grises
3 muestras por punto: RGB
4 muestras por punto: RGB (opacidad)

Para la mayor parte del curso se utilizarn imgenes en escala de grises.

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Qu es el PDI?
Se enfoca en dos tareas principales:

Mejora de la informacin pictrica para interpretacin humana


Procesamiento de informacin de imagen para almacenamiento de informacin,
transmisin y representacin para percepcin autnoma de una mquina

Controversia:

PDI // Anlisis de imgenes // Visin por computadora

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Qu es el PDI? (2)
El continuo desde PDI hasta visin por computadora puede descomponerse
en procesos de bajo, medio, y alto nivel:

Bajo Nivel Nivel Medio Alto Nivel


Entrada: Imagen Entrada : Imagen Entrada : Atributos
Salida: Imagen Salida : Atributos Salida : Comprensin

Ejemplos: Eliminacin Ejemplos: Ejemplos:


de ruido, enfoque de Reconocimiento de Comprensin de una
imagen obtejos, segmentacin escena, navegacin
autnoma

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Historia del PDI
Inicio de los 1920s: Peridicos

Sistema Bartlane de transmisin de


imgenes por cable

Utilizaba un cable submarino entre


Londres y Nueva York
Imagen digital temprana

Las imgenes se codificaban en el


transmisor y el receptor utilizaba una
impresora de telgrafo con tipos de letra especiales

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Historia del PDI (2)
De mediados a finales de los 1920s:
Mejoras en el sistema Bartlane permitieron imgenes de mayor calidad

Nuevos procesos de
reproduccin basados en
tcnicas fotogrficas

Incremento del nmero


de tonos en las imgenes
reproducidas
Imagen digital mejorada
Imagen digital de 15 tonos

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Historia del PDI (3)
1960s: mejoras en las computadoras y el inicio de la carrera espacial
ocasionan una explosin de trabajo en PDI

1964: Uso de computadoras para


mejorar la calidad de imgenes de
la luna tomadas por la sonda
Ranger 7
Tales tcnicas fueron utilizadas en
otras misiones espaciales incluyendo
los aterrizajes de los Apolo
Imagen de la luna tomada por la sonda Ranger 7,
minutos antes de aterrizar

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Historia del PDI (4)
1970s: El PDI empieza a utilizarse en aplicaciones mdicas

1979: Sir Godfrey N. housefield y


el Prof. Allan M. Cormack comparten
el premio Nobel de Medicina por la
invencin de la tomografa, tecnologa
detrs de los estudios de Tomografa
Axial Computarizada (TAC).

Tpico corte de crneo de imagen TAC

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Historia del PDI (5)
1980s actualidad: El uso de tcnicas de PDI ha explotado y se utilizan para
todo tipo de tareas en una variedad de reas:

Mejora/restauracin de imgenes
Efectos artsticos
Inspeccin industrial
Aplicacin de la ley
Interfaces persona-mquina
Visualizacin mdica

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Ejemplo: Mejora de imgenes
Uno de los usos ms comunes de las tcnicas d PDI: mejorar la calidad, quitar
ruido, etc.

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Ejemplo: Telescopio Hubble
Lanzado en 1990, el telescopio
Hubble puede tomar fotografas
de objetos muy distantes
Sin embargo, un espejo incorrecto
hizo que muchas de estas imgenes
fueran intiles.

Se utiliz PDI para


arreglar esta
situacin.

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Ejemplo: Efectos artsticos

Se utilizan para hacer


ms atractivas las
imgenes, para aadir
efectos especiales,
y hacer imgenes
compuestas.

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Ejemplo: GIS
Sistemas de Informacin Geogrfica
Tcnicas de PDI se utilizan para manipular imgenes satelitales
Clasificacin de terrenos
Meteorologa

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Ejemplo: GIS (2)
Luces nocturnas en el mundo

Inventario global de asentamientos


humanos

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Ejemplo: Inspeccin industrial
Los operadores humanos
son costosos, lentos y poco
confiables

Entonces las mquinas hacen el trabajo

Se utilizan sistemas de visin industrial


en todo tipo de industrias

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Ejemplo: Inspeccin de PBC
PBC: Tarjetas de Circuitos Impresos
Mquinas de inspeccin determinan si todos los componentes estn presentes y que
todas las uniones de soldadura sean aceptables
Imgenes convencionales y de rayos x

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Ejemplo: Aplicacin de la ley
Utilizadas para:

Reconocimiento de placas para


sistemas automatizados de casetas o
cmaras de velocidad

Reconocimiento de huellas digitales

Mejora de imgenes de CCTV

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Ejemplo: Interfaces humano-mquina
Para hacer las HCI ms naturales

Reconocimiento facial

Reconocimiento de gestos

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Ejemplo: Medicina
La imagen muestra una prueba de MRI de un corazn canino, y los bordes
entre los tipos de tejido

La imagen con niveles de grises representa la densidad del tejido


Uso de un filtro adecuado para resaltar los bordes

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Ejemplo: Medicina

Rayos gamma

Tomografa por emisin de


positrones

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Ejemplo: Medicina
Rayos x de trax

Angiograma de aorta

Tomografa axial computarizada

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Ejemplo: Medicina
Resonancia magntica nuclear

De columna vertebral

De rodilla

25
Ejemplo: Medicina
Ultrasonido

De beb, dos vistas

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Etapas clave del PDI
Restauracin de Procesamiento
imagen morfolgico

Realce de
Segmentacin
imagen

Adquisicin de Reconocimiento
imagen de objeto

Representacin y
Dominio del problema
descripcin
Procesamiento de Compresin de
imagen a color imagen

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Etapas clave del PDI
Restauracin de Procesamiento
imagen morfolgico

Realce de
Segmentacin
imagen Base de datos de
conocimiento:
Simple
Adquisicin de Compleja Reconocimiento
imagen de objeto

Representacin y
Dominio del problema
descripcin
Procesamiento de Compresin de
imagen a color imagen

28
Etapas clave del PDI: Adquisicin
Restauracin de Procesamiento
imagen morfolgico

Realce de
Segmentacin
imagen

Adquisicin de Reconocimiento
imagen de objeto

Representacin y
Dominio del problema
descripcin
Procesamiento de Compresin de
imagen a color imagen

29
Etapas clave del PDI: Mejora
Restauracin de Procesamiento
imagen morfolgico

Realce de
Segmentacin
imagen

Adquisicin de Reconocimiento
imagen de objeto

Representacin y
Dominio del problema
descripcin
Procesamiento de Compresin de
imagen a color imagen

30
Etapas clave del PDI: Restauracin
Restauracin de Procesamiento
imagen morfolgico

Realce de
Segmentacin
imagen

Adquisicin de Original Reconocimiento


imagen de objeto
Filtro Inverso

Representacin y
Dominio del problema Filtro Wiener
descripcin
Procesamiento de Compresin de
imagen a color imagen

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Etapas clave del PDI: Proc. Morfolgico
Restauracin de Procesamiento
imagen morfolgico

Realce de
Segmentacin
imagen

Adquisicin de Reconocimiento
imagen de objeto

Original Permetros determinados

Representacin y
Dominio del problema
descripcin
Procesamiento de Compresin de
imagen a color imagen

32
Etapas clave del PDI: Segmentacin
Restauracin de Procesamiento
imagen morfolgico

Realce de
Segmentacin
imagen

Adquisicin de Reconocimiento
imagen de objeto
Fondo de ojo

Arterias Venas Representacin y


Dominio del problema
descripcin
Procesamiento de Compresin de
imagen a color imagen

33
Etapas clave del PDI: Reconocimiento
Restauracin de Procesamiento
imagen morfolgico

Realce de
Segmentacin
imagen

Adquisicin de Reconocimiento
imagen de objeto

Representacin y
Dominio del problema
descripcin
Procesamiento de Compresin de
imagen a color imagen

34
Etapas clave del PDI: Representacin
Restauracin de Procesamiento
imagen morfolgico

Realce de
Segmentacin
imagen

Adquisicin de Reconocimiento
imagen de objeto

Representacin y
Dominio del problema
descripcin
Procesamiento de Compresin de
imagen a color imagen

35
Etapas clave del PDI: Compresin
Restauracin de Procesamiento
imagen morfolgico

Realce de Original
Segmentacin
imagen

Reverberaciones
en los bordes por
Adquisicin de excesiva compresin Reconocimiento
imagen de objeto

Detalle de bloque
de 8x8 px Representacin y
Dominio del problema
descripcin
Procesamiento de Compresin de
imagen a color imagen

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Etapas clave del PDI: Color
Restauracin de Procesamiento
imagen morfolgico

Realce de
Segmentacin
imagen

Adquisicin de Reconocimiento
imagen de objeto

Representacin y
Dominio del problema
descripcin
Procesamiento de Compresin de
imagen a color imagen

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Etapas clave del PDI: Color
Realce a travs de la manipulacin de diferentes bandas de cierto modelo de
color:

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Comentarios

No todas las aplicaciones del PDI requieren de toda la complejidad de los


procesos descritos

En muchos casos ni siquiera son necesarios todos los mdulos

En general mientras la complejidad de una tarea de PDI crece, el nmero de


procesos requeridos para resolver el problema tambin crece

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Componentes de un sistema PDI
Sensores
Digitalizadores
Hardware especializado en PDI
Computadora
Software
Almacenamiento (memoria, discos)
Monitores (despliegue)
Hardcopy (impresin, diapositivas, fotografas)
Acceso a red (transmisin por cables pticos, etc.)

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Componentes de un sistema PDI

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Elementos de la percepcin visual
El sistema visual humano es el mejor modelo de visin que se tiene

Conocer cmo se forman las imgenes en el ojo ayuda a entender el PDI

Haremos un tour rpido del sistema visual humano

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Estructura del Ojo Humano
Dimetro: 20mm

Capas que forman el globo ocular:

Crnea y esclera
Coroide
Retina

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Crnea y esclera
Crnea
Tejido transparente que cubre la parte
frontal del ojo

Esclera:
Capa opaca que recubre el resto del
globo ocular

Capas externas el ojo

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Coroide

Capa intermedia
Vasos sanguneos

Divisin:
Cuerpo ciliar
Diafragma del iris

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Lente

Hecho de clulas fibrosas

Suspendido por fibras que lo


mantienen adherido al cuerpo ciliar

Ligeramente amarillento

Absorbe ~8% de la luz visible del


espectro

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Retina
Capa interna del globo ocular
Capa neuronal donde se forman las
imgenes
Receptores de luz discretos
distribuidos a todo lo largo de la
superficie de la capa
Conos: 6 7 x106 por ojo
Bastones: 75 150 x106 por ojo

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Conos Bastones
Localizados en la parte central de la Localizados a lo largo de la capa de
retina (fvea) la retina
Sensibles al color
Visin general del campo de vista
Cada uno se conecta a su propia
terminacin nerviosa Varios bastones estn conectados a
una terminacin nerviosa
Visin llamada fotpica
Sensibles a bajos niveles de
iluminacin
Visin scotopic
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Distribucin de receptores
Radialmente simtrica alrededor de la fvea
Excepto el punto ciego, donde se encuentra el disco ptico

Los conos son los ms densos en el centro de la fvea mientras que los
bastones incrementan en densidad del centro hacia la periferia
aproximadamente el 20% del eje visual y luego decrecen.

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Distribucin de receptores

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Experimento
Tomar una hoja en blanco y dibujar en ella un punto y una cruz como se
muestra:
El punto y la cruz estn a unos 15 cm el uno del otro

Cerrar el ojo derecho y enfocarse en la cruz con el ojo izquierdo


Sostener la imagen a unos 40 cm de la cara y moverla lentamente hacia la cara
Qu pasa con el punto?

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Fvea
Es circular (1.5 mm en dimetro) pero puede considerarse como un arreglo
de sensores cuadrado (1.5mm x 1.5mm)

Densidad de los conos: 150,000 elementos/mm2 ~ 337,000 para la fvea

Un chip CCD de imagen con resolucin mediana necesita 5mm x 5mm para
este nmero de elementos

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Formacin de la imagen en el ojo
El lente del ojo es flexible, en comparacin con un lente ptico
Se controla mediante las fibras del cuerpo ciliar
Para enfocar objetos a distancia se hace plano, y viceversa

La distancia focal vara de 17 a 14mm

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Adaptacin al brillo y discriminacin
Las imgenes digitales se conforman por un conjunto de intensidades discretas
(niveles)
El rango de niveles de intensidad de luz al cual el SVH (sistema visual humano)
puede adaptarse es muy grande, del orden de 1010 diferentes niveles de
intensidad de luz

Sin embargo, a un tiempo slo se puede discriminar entre un nmero mucho


menor de niveles
Nivel de adaptacin al brillo
De manera similar, la intensidad percibida de una regin est relacionada a las
intensidades de luz de las regiones que la rodean

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Adaptacin al brillo y discriminacin
El ojo tambin puede discriminar entre cambios de brillo para cualquier nivel
especfico de adaptacin:

=

Donde es el incremento de iluminacin discriminable el 50% de las veces,
e es la iluminacin del fondo

Pequeos valores de la relacin Weber significan que se necesitan pequeos


porcentajes de cambio en la intensidad para que halla discriminacin, es decir
hay una buena discriminacin del brillo

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Adaptacin al brillo y discriminacin
A niveles bajos de iluminacin la discriminacin del brillo es pobre (bastones),
y sta mejora significativamente con el incremento de la iluminacin del fondo
(conos)

Un observador tpico puede discernir entre una o dos decenas de cambios en


intensidades diferentes

Existen dos fenmenos que claramente demuestran que la brillantez percibida


no es simplemente una funcin de intensidad:

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Adaptacin al brillo y discriminacin
Efecto escalonado,
patrn de bandas Mach

Cmo se percibe el cambio entre las


bandas?

57
Adaptacin al brillo y discriminacin
Contraste simultneo

Cmo se ven los cuadros centrales

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Ilusiones pticas
Nuestro SVH juega con nosotros a
veces

59
Ilusiones pticas
Mirar el tache en el
centro de la imagen y pensar en
crculos

Ms ilusiones pticas:
http://web.mit.edu/persci/gaz/

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Luz y el espectro electromagntico
La luz es una parte particular del espectro electromagntico que puede ser
percibida por el ojo humano
El espectro electromagntico est dividido de acuerdo a la longitud de onda
de diferentes formas de energa

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Luz y el espectro electromagntico
El espectro electromagntico puede ser expresado en trminos de longitudes
de onda, frecuencia o energa. La longitud de onda () y la frecuencia () estn
relacionados con la expresin:

=

donde es la velocidad de la luz (2.998 x108 m/s)
La energa de varios componentes del espectro electromagntico est dada
por la expresin:
=
donde es la constante de Planck 6.626061034

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Luz y el espectro electromagntico
Las unidades de la longitud de onda son metros, con los trminos micro
(106 ) y nano (109 ) como prefijos
La frecuencia se mide en Hertz (Hz), donde un Hz es un ciclo de una onda
sinusoidal en un segundo
Una unidad comn utilizada para la energa es el electrn-volt

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Ondas electromagnticas
Se pueden ver como ondas sinusoidales que se propagan con frecuencia
Tambin pueden verse como partculas cada una viajando en un patrn de
onda a la velocidad de la luz
La energa es proporcional a la frecuencia, a mayor frecuencia, menor longitud
de onda y el fenmeno electromagntico lleva mayor energa
Las ondas de radio tienen baja energa, la microondas mayor energa y as
sucesivamente: infrarroja, visible, ultravioleta, rayos X, hasta las gamma, que son las ms
energticas de todas

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El espectro electrovisible
La luz es un tipo particular de radiacin electromagntica que puede ser vista
por el ojo humano
La luz visible del espectro se expande en 6 regiones: violeta, azul, verde,
amarillo, naranja y rojo
Los colores que un humano percibe de un objeto estn determinados por la
naturaleza de la luz que refleja ese objeto
Un objeto que refleja luz relativamente balanceada en las longitudes de onda
visibles se ve blanco, mientras que un objeto que refleja un rango limitado de
longitudes de onda del espectro visible exhibe algn color

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Tipos de luz
La luz que tiene color nulo se llama acromtica o monocromtica
El nico atributo que tiene es la intensidad
El trmino nivel de gris generalmente se utiliza para describir la intensidad
monocromtica que va desde el negro, pasando por los grises, hasta el blanco
La luz cromtica se extiende en las 6 regiones del espectro mencionado.
Existen 3 cantidades bsicas que se utilizan para describir la calidad de la
fuente de luz
Radianza (Radiance)
Luminosidad (Luminance)
Brillo (Brightness)

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Descripcin de la luz cromtica
Radianza
Cantidad total de energa que fluye de la fuente de luz; se mide en watts ()
Luminosidad
Da una medida de la cantidad de energa que un observador percibe de la fuente de
luz; se mide en lmenes ()
Luz emitida de una fuente infrarroja puede tener una cantidad significante de energa
(radianza) pero un observador no puede percibirla, su luminosidad ser casi cero
Brillo
Descriptor subjetivo de la percepcin del brillo y que es prcticamente imposible de
medir
Incluye la nocin acromtica de intensidad y es uno de los factores clave para
describir la sensacin del color
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Referencias

Imgenes y texto:

Gonzlez Rafael C., Woods Richard E.; Digital Image Processing.


Pearson/Prentice Hall (2008), 3 Edicin.

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