El objetivo central de este trabajo es comprender y analizar el entorno de la

bioinformtica, as como su desarrollo, la relacin que tiene con la farmacutica y

la biotecnologa y las implicaciones que trae consigo. Nos interesa, en particular,
identificar y hacer una revisin de ciertos actores que se encargan de la
generacin, procesamiento, almacenamiento y anlisis de datos genticos.
Introduccin
A lo largo del tiempo se ha visto que las herramientas cuantitativas son
indispensables en la biologa moderna, actualmente la mayora de la investigacin
biolgica implica la aplicacin de algn tipo de matemticas, estadstica, o de
herramientas computacionales, esto con el fin de ayudar a sintetizar los datos
registrados e integrar diversos tipos de informacin en el proceso de responder a
una pregunta biolgica.
Por ejemplo, la enumeracin y la estadstica son necesarias para evaluar los
experimentos cotidianos de laboratorio, como contar colonias de bacterias.
Como un ejemplo clsico en la historia de la gentica es el de Gregor Mendel
(Austria, 1866) y Thomas Morgan (USA, 1910) quienes al contar variaciones
genticas de plantas y moscas de la fruta, fueron capaces de descubrir los
principios de la herencia gentica.
Un uso ms elaborado de instrumentos cuantitativos puede implicar el empleo de
clculo diferencial, por ejemplo para establecer un modelo cintico de la catlisis
enzimtica o el uso de un gran nmero de ecuaciones diferenciales parciales no
lineales para modelar el flujo sanguneo cardaco.
Evidentemente las herramientas matemticas y computacionales hoy en da se
han convertido en parte integral de la investigacin biolgica Sin embargo,
ninguno de los ejemplos mencionados del uso de herramientas cuantitativas en
biologa pueden ser considerados como parte de la bioinformtica.
Historia de la bioinformtica
La creacin y desarrollo de la bioinformtica es el resultado de los avances tanto
en biologa molecular como en ciencias computacionales a lo largo de los ltimos
30-40 aos.
Tiene su origen en los aos 1950s cuando se logr comprender la estructura
tridimensional del ADN, la molcula responsable de transmitir la herencia gentica
Mayo de 1952, Rosalind Franklin obtiene la famosa fotografa 51, una
imagen del ADN obtenida mediante difraccin de rayos X
Abril de 1953, James D. Watson y Francis Crick reportan la estructura
tridimensional del ADN (modelo de doble hlice)
Probablemente el primer proyecto Bioinformtica fue llevado a cabo por Margaret
Dayhoff en 1965, quien desarroll la primera BD de secuencias de protenas.
Al inicio de los aos 1970, el Laboratorio Nacional de Brookhaven (USA)
estableci el Banco de Datos de Protenas para almacenar estructuras de
protenas en 3D (12 al inicio, 90,611 al da de hoy).
El primer algoritmo para alineamiento de secuencias fue desarrollado por
Needleman y Wunsch en 1970, este fue un paso fundamental en el desarrollo del
campo de la bioinformtica, que abri el camino para las comparaciones de
secuencias y bsquedas en BD de rutina realizadas por los bilogos modernos. El
primer algoritmo para prediccin de estructuras de protenas fue desarrollado por
Chou y Fasman en 1974. Los aos 1980 vieron el establecimiento del GenBank y
el desarrollo de rpidos algoritmos para bsquedas en BD como FASTA de William
Pearson y BLAST de Stephen Altschul et al.
El inicio del proyecto del genoma humano a finales de los aos 1980 propici un
rpido desarrollo de la bioinformtica. Por su parte el uso masivo de Internet en los
aos 1990 hizo posible el acceso inmediato, intercambio y diseminacin de datos
biolgicos. En trminos generales la bioinformtica gan prominencia como una
disciplina debido al avance en los estudios sobre el genoma que produjeron
grandes cantidades de datos biolgicos.
La explosin de informacin sobre secuencias genmicas generaron una
demanda de herramientas computacionales eficientes para manejar y analizar los
datos. El desarrollo de estas herramientas dependi del conocimiento generado en
disciplinas tan diversas como las matemticas, la estadstica, las ciencias
computacionales, las tecnologas de la informacin y la biologa molecular. La
mezcla de estas disciplinas cre un campo orientado a la informacin en la
biologa, el cual es conocido como bioinformtica.
Qu es la bioinformtica?
La bioinformtica se define como un rea de investigacin interdisciplinaria:
matemtica aplicada, estadstica, ciencias computacionales, inteligencia artificial,
qumica y bioqumica. Estudia el desarrollo de mtodos computacionales y
tcnicas estadsticas para resolver problemas prcticos y tericos derivados del
almacenamiento, extraccin, manipulacin y distribucin de informacin
relacionada con datos biolgicos (principalmente de macromolculas).
El objetivo principal de esta disciplina es lograr entender mejor las clulas y la
manera en que funcionan a nivel molecular. Esto es realizado mediante el anlisis
de secuencias moleculares en bruto y datos estructurales. De esta manera la
investigacin en bioinformtica puede generar nuevas ideas y ofrecer una
perspectiva global de las funciones celulares.
La Bioinformtica abarca tres importantes subespecialidades:
1. Bioinformtica aplicada: la investigacin y desarrollo de la infraestructura y
sistemas de informacin y comunicaciones que requiere la biologa. (Redes y
bases de datos para el genoma, estaciones de trabajo para procesamiento de
imgenes).
2. Biologa Molecular Computacional: la computacin que se aplica al
entendimiento de cuestiones biolgicas bsicas, mediante la modelizacin y
simulacin. (Sistemas de Vida Artificial, algoritmos genticos, redes de neuronas
artificiales).
3. Biocomputacin: el desarrollo y utilizacin de sistemas computacionales
basados en modelos y materiales biolgicos. (Biochips, biosensores, computacin
basada en ADN). Los computadores basados en DNA se estn empleando para la
secuenciacin masiva y la deteccin de diversas enfermedades.
La bioinformtica se ha convertido en algo esencial para la investigacin en
genmica y biologa molecular. Adems tambin est teniendo un gran impacto en
muchas reas de la biotecnologa y de las ciencias biomdicas

Las principales aplicaciones de la bioinformtica son:

Secuenciacin de genomas:

La bioinformtica ha tenido un peso fundamental para el desarrollo de la

secuenciacin del genoma; la gran cantidad de informacin producida y su
necesidad de anlisis slo ha sido posible gracias a las tcnicas robotizadas de
secuenciacin masiva.

Estructura de las protenas: La bioinformtica tambin ha tenido en este campo de

estudio un papel protagonista dado que ha permitido analizar las estructuras
tridimensionales de las protenas. En este sentido, las compaas farmacuticas
realizan considerables esfuerzos para disponer de la estructura de las protenas
con las que trabajan, puesto que de ese modo pueden acelerar significativamente
el proceso de modificacin y mejora de los correspondientes frmacos. La
tcnicas bioinformticas ha permitido producir modelos tiles de las estructuras de
muchas protenas utilizando procesos de aprendizaje que utilizan la informacin
de las secuencias y estructuras conocidas para predecir la estructura de las
nuevas protenas.

Los tratamientos personalizados:

El estudio de las diferencias en el genoma entre individuos y su respuesta a

diferencias terapias requiere complejos estudios estadsticos que permita
encontrar una relacin estadstica entre enfermedades y polimorfismo gentico La
meta de una medicina a la carta o personalizada, requiere en los prximos aos
una metodologa computacional adecuada, que permita identificar, analizar e
integrar, las complejas relaciones entre genotipo (caractersticas moleculares del
individuo) y fenotipo (caractersticas observables del individuo).
Limitantes de la bioinformtica

Hemos visto el gran potencial de la bioinformtica, pero es tambin importante

reconocer sus limitaciones para evitar sobreestimar esta disciplina. La
bioinformtica y la biologa experimental son actividades independientes, pero
complementarias. La bioinformtica depende de la ciencia experimental para
producir datos primarios para el anlisis.

A su vez la bioinformtica, proporciona la interpretacin de los datos

experimentales e importantes pistas para seguir la investigacin experimental. Las
predicciones hechas en bioinformtica no son pruebas formales de cualquier
concepto, no sustituyen a los mtodos tradicionales de investigacin experimental
que prueban en realidad las hiptesis. Adems, la calidad de las predicciones de
bioinformtica depende de la calidad de los datos y la sofisticacin de los
algoritmos utilizados.

Bibliografa

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