FLORA BACTERIANA HABITUAL

El cuerpo humano normalmente alberga varios cientos de especies bacterianas y un nmero ms pequeo
de virus, hongos y protozoos. La mayora de ellos son comensales, ya que viven con nosotros sin causar
dao. Su nmero, as como la variedad de especies, cambia permanentemente. En cada momento cada uno
de nosotros posee un espectro particular e individualizado de microorganismos. El trmino "flora" se debe a
que la gran mayora de los microorganismos aislados de nuestro cuerpo son bacterias y estas pertenecen al
reino vegetal El dilema del microbilogo clnico es decidir cul de los microorganismos aislados de una
muestra clnica son causantes de la enfermedad. Para el clnico, por otra parte, el conocimiento de los
microorganismos de la flora normal es indispensable en la interpretacin de los hallazgos de los exmenes
microbiolgicos.

Flora bacteriana normal

Hablamos de flora normal para referirnos a aquellos microorganismos que habitualmente encontramos sobre
la superficie o en el interior del cuerpo de las personas sanas. La flora normal se adquiere con rapidez
durante y poco despus del nacimiento y cambia de constitucin en forma permanente a lo largo de la vida.
Muchos de estos microorganismos tambin coexisten en algunos animales o bien pueden desarrollar una
vida libre.Es por lo tanto bastante difcil definir la flora normal, puesto que depende en gran parte del medio
en que nos desenvolvemos. Como ejemplo podemos citar el de los astronautas de la NASA , que antes de los
vuelos espaciales fueron convertidos en seres prcticamente estriles desde el punto de vista microbiolgico,
mediante el uso de antibiticos. Despus de su regreso a la tierra se necesitaron ms de seis semanas para
repoblar su organismo con una flora bacteriana, la que fue exactamente idntica a la de sus vecinos
inmediatos. De manera similar, los lactantes alimentados con pecho materno tienen estreptococos y
lactobacilos en su tracto gastrointestinal, mientras que los alimentados en forma artificial muestran una
variedad mayor de microorganismos.
Con cierta frecuencia, la zona de demarcacin de lo que consideramos flora normal no es muy clara. Como
un ejemplo podemos citar a los meningococos o neumococos, ambos patgenos, capaces de producir
meningitis, septicemia o neumona. Sin embargo cada uno de ellos se puede encontrar en la faringe de un
10% de personas normales y sanas; podran incluirse dentro de la flora de estos sujetos, pero no en el otro
90% de la poblacin. Estos microorganismos debieran considerarse como transitorios en estos individuos. Por
esto, quizs sea ms adecuado hablar de flora habitual.
Localizacin de la flora
Los microorganismos se encuentran en aquellas partes del cuerpo expuestas al medio ambiente o que
comunican con l como piel, nariz y boca, intestino y tracto urogenital. Los rganos y tejidos internos son
habitualmente estriles. Las reas colonizadas con el mayor nmero de microorganismos se muestran en la
Tabla 1.
Tabla 1
AREAS MAS COLONIZADAS DEL ORGANISMO
Ubicacin Sitio anatmico especfico
reas hmedas: regin inguinal, regin axilar, espacio
Piel
interdigital de los pies.
Tracto respiratorio fosas nasales, faringe
Tracto digestivo boca, intestino grueso
Tracto genitourinario tercio anterior, uretra, vagina
Las bacterias, y en menor escala los hongos y protozoos, residen y proliferan activamente en estos sitios. Las
otras partes del cuerpo humano, como el resto del tracto respiratorio y del tracto digestivo, la vejiga y el
tero, tienen microorganismos en menor nmero y slo estn de paso El hallazgo de microorganismos
patgenos en estos sitios es altamente sugerente de enfermedad, pero no lo certifica. Por otra parte, existen
otros tejidos y rganos en que no existen microorganismos, son territorios estriles. La presencia de
microorganismos en estos lugares es generalmente considerada de significado diagnstico. Incluidos entre
stos estn la sangre, el lquido cefalorraqudeo, los lquidos articulares (sinovial) y los tejidos profundos en
general. La densidad de la poblacin bacteriana oscila de un sitio a otro como se puede apreciar en la Tabla
2.
Tabla 2.
NUMERO DE BACTERIAS POR SITIO ANATOMICO Y RELACION ENTRE BACTERIAS AEROBIAS Y ANAEROBIAS
Sitio anatmico Nmero bacterias/ml Relacin aerobios/anaerobios
Cisura gingival 1011 - 1012 1/1.000
2 5
Estmago 10 - 10 1/1
Colon 1011 - 1012 1/1000
Piel superficie 104 - 105 1/100
5 6
Piel intrafolicular 10 - 10 1/100
Importancia de la Flora
La flora habitual juega un importante papel tanto en la salud como en la enfermedad. La manifestacin ms
fcilmente perceptible es la produccin de variados olores en las superficies epiteliales del sujeto.
Rol en la nutricin y metabolismo humano. Se sabe que la flora intestinal del hombre juega un papel en la
nutricin y metabolismo, pero poco se sabe cunta es la importancia de esta funcin. Dado que el hombre no
puede llegar a ser absolutamente libre de microorganismos, los datos obtenidos son extrados de los
experimentos hechos en animales. Se sabe que algunas especies de Bacteroides y de Escherichia coli
sintetizan vitamina K, lo que puede ser una importante fuente de esta vitamina tanto para el hombre como
para los animales. El metabolismo de varios compuestos clave comprende la excrecin desde el hgado hacia
el intestino y su vuelta al hgado. Este circuito enteroheptico es importante en el metabolismo de las
hormonas esteroidales sexuales y de las sales biliares, sustancias que son excretadas a travs de la bilis en
forma conjugada con glucurnidos o sulfatos, pero no pueden ser reabsorbidas de esta manera. Algunos
integrantes de la flora intestinal son capaces de desconjugar estos compuestos mediante glucuronidasas y
sulfatasas.
Rol de la formacin de carcingenos. Los elementos que ingerimos pueden ser modificados por la variada
actividad metablica de la flora intestinal. Algunas de las modificaciones conocidas son efectuadas por las
enzimas bacterianas. Entre las reacciones conocidas podemos dar como ejemplo la modificacin que
introduce una sulfatasa bacteriana sobre el edulcorante ciclamato (sulfato de ciclohexamina),
transformndolo en un activo carcingeno para la vejiga, la ciclohexamina.
Estimulacin inmune. Nuestro abundante repertorio de inmunoglobulinas refleja, en parte, la estimulacin
antignica de la flora intestinal. En general, no existen ttulos muy altos de anticuerpos contra las bacterias,
virus y hongos que habitan en nuestro cuerpo. Sin embargo este bajo contenido de anticuerpos es suficiente
para mantener una vigilancia suficiente contra la posible invasin de los integrantes de la flora. Este es un
claro beneficio que presenta la flora intestinal. Entre los anticuerpos formados se cuentan las
inmunoglobulinas de la clase IgA, que son secretadas a travs de las membranas mucosas.
Los anticuerpos formados por el estmulo de los antgenos de la flora intestinal a veces presentan reacciones
cruzadas con los antgenos normales de los propios tejidos del individuo. Un buen ejemplo de esto lo
presentan los anticuerpos frente a los grupos sanguneos ABO. Las bacterias del tracto digestivo poseen
antgenos que reaccionan en forma cruzada con las sustancias propias de los grupos A y B. Los antgenos
bacterianos estimulan la formacin de anticuerpos, ya que son ajenos; pero no se producen anticuerpos
frente a los sanguneos porque son inmunolgicamente tolerantes a los propios. Este tipo de reactividad
cruzada generalmente no produce enfermedades. En otras circunstancias, como es el caso del lupus
erimatoso, se forman anticuerpos contra el ADN. Se tiene claro que estos anticuerpos no se han formado
contra el propio ADN, sino por estmulo antignico de lipopolisacridos de las bacterias de la flora intestinal.
Eliminacin de invasores. En algunos sitios del cuerpo, la flora habitual se encarga de mantener el nicho
ecolgico ocupado, impidiendo de esta manera la colonizacin por parte de otras bacterias.Algunas de las
bacterias son capaces de producir sustancias que inhiben el desarrollo de otras que tratan de colonizar, a
travs de la produccin de antibiticos o protenas letales, llamadas bacteriocinas. Cuando la flora habitual
es barrida por el uso masivo de antibiticos, se est dando la oportunidad de una colonizacin con bacterias
diferentes a las habituales, o bien la chance de que los microorganismos exgenos o endgenos produzcan
enfermedad. Los pacientes tratados con antibiticos de amplio espectro tienen ms oportunidades de
desarrollar diarrea asociada a antibiticos, incluyendo una forma ms grave de patologa del intestino
grueso, la "colitis pseudomembranosa". El antibitico en este caso barre la flora intestinal y deja que el
Clostridium difficile, que estaba en muy baja concentracin, se desarrolle, produciendo la citotoxina
responsable del cuadro.
MIEMBROS DE LA FLORA HABITUAL
La flora nativa o autctona y los micros organismos de diferentes reas del cuerpo han sido descritos,
aunque su lista est permanentemente en crecimiento.Estos mismos microorganismos tambin han sido
aislados de lesiones, aunque muchas veces la relacin causal es tenue. Los microorganismos no incluidos
como patgenos ni nativos, habitualmente son ignorados totalmente, de lo que se puede concluir que estas
listas no son exhaustivas;la omisin o inclusin de una especie bacteriana en cualquiera de las categoras no
implica que no pueda ser aislada de otra ubicacin anatmica o que no pueda causar enfermedad, complicar
una enfermedad subyacente, o colonizar anormalidades anatmicas de origen congnito,trau-mtico o
iatrognico. En los hospitales, especialmente, se produce una presin ejercida por los antibiticos que
permite la entrada de microorganismos resistentes en la bisfera humana ntima.
Las reas por describir se dividen en dos categoras: aquellas que generalmente albergan microorganismos y
aquellas que son generalmente estriles.
MICROORGANISMOS DEL TRACTO RESPIRATORIO
Microorganismo Ubicacin Enfermedad
Acinetobacter spp. Nasofrinx Meningitis, neumona bacteriana
Actinomyces spp. Boca, amgdalas Actinomicosis, clculos salivales
Arachnia propionica Boca Actinomicosis
Bacterionema matruchotii Sup. dentaria gingival No determinada
Absceso pulmonar grangrena
Bacteroides spp. Boca, amgdalas
pulmonar
Enfermedad crnica de las
Bacteroides pneuosintes Faringe
meninges (rara).
Bifidobacterium spp. Boca Actinomicosis.

Campylobacter sputorum
Candida albicans
Corynebacterium spp.
Enterobacteriaceae
Enterococcus
Eubacterium spp.
Fusobacterium spp.
Haemophilus spp
Lactobacillus spp.
Leptotrichia buccalis
Micrococcus spp.
Moraxella spp.
Neisseria spp.
Peptostreptococcus spp.
Propionibacterium acnes
Rothia dentocariosa
Selenomonas sputigena
Staphylococcus aureus
Staphylococcus epidermis
Streptococcus pneumoniae
Torulopsis glabrata
Treponema denticola
Treponema refringens
Veillonella spp.
Vibrio sputorum
Streptococcus grupo viridans
MICROORGANISMOS DEL TRACTO GASTROINTESTINAL
Microorganismo
Achromobacter spp.
Acidaminococcus
frementans
Acinetobacter calcoaceticus Intestino grueso, leon
Aeromonas spp.
Alcaligenes faecalis
Bacillus spp.
Bacteroides spp.
Bifidobacterium spp.
Nasofrinx, encas, superficie
No determinada
dentaria, saliva
Boca, faringe Algorra, neumonitis
Endocarditis bacteriana
Boca, nariz
subaguda, absceso pulmonar
Boca, faringe Neumona, absceso pulmonar
Bacteremia, meningitis,
Boca, amgdalas, nariz
neumona, endocarditis
Boca No determinada
Angina de Vincent?, Absceso
Boca, amgdalas
pulmonar
Laringotraqueobronquitis,
Boca , nasofrinx meningitis, neumonitis,
bacteremia, conjuntivitis.
Endocarditis bacteriana (muy
Boca, saliva
rara)
Boca, sup.dentaria No determinada
Boca, amgadalas No determinada
Nasofrinx Conjuntivitis
Boca, nasofrinx Meningitis
Gangrena pulmonar, faringe
Boca, amgdalas
absceso pulmonar
Nariz Acn, endocarditis
Boca Absceso
Nasofrinx No determinada
Boca, nasofrinx, nariz Neumona, otitis absceso
Endocarditis bacteriana
Boca, nasofrinx, nariz
subaguda
Neumona, conjuntivitis,
Boca, amgdalas, nariz
meningitis, otitis
Boca Infecciones tracto urinario
Boca No determinada
Boca Angina de Vincent?
Boca, amgdalas Endocarditis bacteriana
Boca No determinada
Endocarditis bacteriana
Boca, faringe
subaguda
Ubicacin Enfermedad
Infecciones post-operatorias, post-
Intestino grueso, leon bajo
traumticas
Intestino grueso No determinada
Infecciones post-operatorias
Diarrea (rara), septicemia (rara),
Intestino grueso, leon bajo
osteomielitis
Intestino grueso, leon bajo Gastroenteritis (rara), bacteremia
Intoxicacin alimentaria, infeccin
Intestino grueso
herida
Peritonitis, absceso, colecistitis,
Intestino grueso, leon bajo
enteritis
Intestino grueso Diverticulitis, peritonitis
Butyriviberio fibrosolvens
Campylobacter spp.
Candida albicans
Clostridium spp.
Corynebacterium spp.
Enterobacteriaceae
Enterococcus
Eubacterium spp.
Flavobacterium spp.
Fusobacterium spp.
Lactobacillus spp,
Mycobacteria spp.
Mycoplasma spp.
Peptostreptococcus spp.
Propionibacterium spp.
Pseudomonas aeruginosa
Ruminococcus bromii
Sarcina spp.
Staphylococcus aureus
Veillonella spp.
Streptococcus grupo
viridans
Vibrio spp.
Intestino grueso
Intestino grueso
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso
Intestino grueso
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso
Intestino grueso, leon bajo
Intestino grueso, leon bajo
No determinada
Diarrea
Complicaciones post-operatorias
Intoxicacin alimentaria, coledocistis,
colecistitis, enterocolitis
pseudomembranosa
No conocida
Absceso, peritonitis, bacteremia,
diarrea, fiebres entricas,
fiebretifoidea complicaciones post-
operatorias y post-traumticas,
meningitis, endocarditis, intoxicacin
alimentaria
Peritonitis, colecistitis, complicaciones
, post-operatorias
Diverticulitis, peritonitis
Meningitis, peritonitis
Absceso, bacteremia
No conocida
No por bacterias habituales
No determinada
Colecistitis, absceso, peritonitis,
mionecrosis
Endocarditis
Gastroenteritis, meningitis,
bacteremia, complicaciones
postoperatorias
No determinada
No determinada
Absceso pancretico, enteritis,
intoxicacin alimentaria,
complicaciones de enterocolitis,
pseudomembranosa
No determinada
No conocida
No por bacterias habituales

FRECUENCIA RELATIVA DE ESPECIES BACTERIANAS EN LA FLORA FECAL

Rango Porcentaje Microorganismo(s)
1 12.0 Bacteroides vulgatus
2 7.0 Fusobacterium prausnitzi
3 6.5 Bacteroides adolescentia
4 6.0 Ebacterium aerofaciens
6 4.5 Bacteroides thetaiotaomicron
7 3.6 Eubacterium eligens
9 3.2 Eubacteriumbioforme
11 2.3 Bacteroides distasonis
28 0.7 Bacteroides ovatus
29 0.6 Bacteroides fragilis
59 - 75 0.13 Enterococus faecalis
76 - 113 0.06 Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae y otras 37 especies
 bacterianas
MICROORGANISMOS DEL TRACTO GENITOURINARIO
Microorganismo Ubicacin Enfermedad
Uretritis, complicaciones de la
Acinetobacter spp. Uretra anterior, vagina
instrumentacin y de la ciruga
Bacteroides sp. Genitales externos Complicaciones de la ciruga (mujeres)
Bifidobacterium sp. Vagina No conocida
Genitales externos, vagina,
Candida albicans Candidiasis
uretra anterior
Uretritis, cervicitis, enfermedad recin
Chlamydia spp. Uretra, vagina
nacido, linfogranuloma venreo
Clostridium sp. Vagina Complicaciones de la ciruga, aborto
Genitales externos,vagina, uretra
Corynebacterium spp. No determinada
anterior
Genitales externos, vagina,
Enterobacteriaceae Pielonefritis, cistitis, Bacteriuria
uretra anterior
Genitales externos, vagina,
Enterococcus Pielonefritis, cistitis, bacteriuria
uretra anterior
Fusobacterium spp. Genitales externos, vagina No determinada
Gardnerella vaginalis Uretra anterior, vagina Vaginitis
Lactobacilus spp. Vagina Ninguna
Complicaciones post-parto,post-
Moraxella spp. Vagina
operatorias y del recin nacido (raro)
Genitales externos, vagina,
Mycobacterium spp. No por bacterias habituales
uretra anterior
Genitales externos, vagina,
Mycoplasma spp. Uretritis inespecfica?
uretra anterior
Genitales externos, vagina,
Neisseria spp. No por bacterias habituales
uretra anterior
Complicaciones post-parto, post-
Peptostreptococcus spp. Genitales externos, vagina
operatorias fiebre puerperal
Complicaciones post-parto, post-
Sarcina spp. Genitales externos, vagina
operatorias (raras)
Genitales externos(raro), vagina,
Staphylococcus aureus Uretritis, furunculosis
uretra anterior
Staphylococcus Genitales externos (raro) No claramente establecida
produce infeccin urinaria (mujeres
S. saprophyticus coagulasa negativa
jvenes)
Enf. del recin nacido, endocarditis,
Streptococcus
Vagina absceso, meningitis miocarditis,
agalactiae
osteomielitis, septicemia
Trichomonas vaginalis Uretra anterior, vagina Vaginitis
Streptococcus grupo Genitales externos(raro), vagina,
Ninguna
viridans uretra anterior
Microorganismos de la piel, odo y ojo
Microorganismo Ubicacin Enfermedad
Complicaciones en pacientes
Acinetobacter sup. Piel
inmunocomprometidos
Iridociclitis, panoftalmitis, meningitis y
Bacillus spp Piel
bacteremia pacientes inmunocomprometidos
Candida albicans Piel Paroniquia (rara)
Chlamydia trachomatis Incierta Tracoma, conjuntivitis por inclusin
Corynebacterium spp Piel, odo, ojo Endocarditis bacteriana, complicaciones de la
 cirga cardaca
Epidermophyton floccosum Piel Infecciones de piel, pie de atleta
Haemophilus aegyptius Ojo Enfermedades del ojo
Haemophilus influenzae Ojo Enfermedades del ojo
Micrococcus spp Piel No determinada
Moraxella spp Ojo Enfermedad del ojo
Mycobacterium spp Piel Micobacteriosis (Piel)
Neisseria spp Ojo, piel No por bacterias habituales
Peptostreptococcus spp Piel No conocida
Pityrosporum ovale Piel Caspa?
Propionibacterium spp Piel Acn, endicarditis bacteriana
Sarcina spp Piel Complicaciones pacientes inmunodeprimidos
Piel, odo, ojo
Staphylococcus aureus Antrax, furnculos, imptigo, mastitis
(raro)
Acn, endocarditis, complicaciones de la
Staphylococcus epidermidis Piel, odo, ojo
ciruga cardaca, tromboflebitis.