Recombinacin

1.- Tipos de recombinacin.

RECOMBINACIN HOMLOGA:
Intercambio gentico entre dos molculas de DNA o entre segmentos de la
misma molcula de DNA que compartan una extensa regin de secuencia
igual o muy similar (homologa). Las secuencias nucleotdicas en s mismas
no son importantes; slo se requiere que sean iguales o muy similares en
ambos segmentos de DNA.

RECOMBINACIN SITIO ESPECFICO: Involucra el intercambio gentico

en secuencias definidas de DNA (Ej. Integracin del DNA de fago al
genoma de E. coli).
 TRANSPOSICIN DE DNA: La insercin elementos de DNA que se
mueven de un lugar a otro, usualmente tienen poca similaridad en su
secuencia (transposn).

2.- Ruptura y reunin heteroduplex.

El proceso de rotura y reunin implica la formacin de DNA heteroduplex

En contraste con el desconocimiento de cmo se produce el encuentro entre
secuencias homologas de DNA, sabemos que hay un mecanismo altamente
preciso para que dos moleculas complementarias de DNA de cadena simple se
reconozcan; el emparejamineto de bases. Este es el proceso utilizado para formar
los intermediarios de la recombinacin.
El proceso comienza con el corte de las cadenas homologas de dos dplex de
DNA emparejados. La rotura permite que los extremos libres generados puedan
moverse libremente. Cada cadena abandona a su compaera y se empareja con
su complementaria en el otro dplex.
El intercambio reciproco crea una conexin entre los dos dplex de DNA.
Inicialmente esta unin solo es mantenida por puentes de hidrogeno, pero en
algn punto se hace covalente al sellarse las incisiones en los sitios de
intercambio.
El par de dplex conectados se denomina una molcula enlazada. El punto en que
cada cadena simple de DNA cruza de un dplex a otro se denomina una junta de
recombinacin.
El sitio de recombinacin, cada dplex tiene una regin formada por una cadena
de cada una de las moleculas parentales. Esta regin se denomina DNA hibrido o
heteroduplex.
 3.- Migracin de los cortes.

La recombinacin tambin es importante para la replicacin y la reparacin del

DNA. Hay tres modelos principales de recombinacin homloga. Tienen muchos
aspectos en comn y comparten un intermediario, denominado Unin de Holliday.
El modelo de Holliday es el ms sencillo, y su comprensin facilita el anlisis de
los dems.

Modelo de Holliday
Las caractersticas fundamentales del modelo de Holliday son homologa, simetra
de los dos cortes y la invasin de las hebras, y presencia de una unin de Holliday
de cuatro cadenas como intermediario clave. En este modelo, la recombinacin
comienza con cortes de cadena sencilla en posiciones homologas los dos dplex
de DNA alineados. Las hebras de cada dplex se desenrollan parcialmente y cada
una de ellas invade el dplex opuesto.
Es decir, una porcin de una de las hebras de cada uno de los dplex se aparea
con el dplex opuesto de forma recproca y simtrica. Ests hebras pueden unirse
covalentemente al dplex opuesto, creando una molcula hibrida en la cual dos
hebras entrecruzan las moleculas de DNA.
A continuacin, se produce la migracin de las ramas. La migracin de las ramas
exige el desenrollamiento y el enrollamiento simultaneo de los dplex, de forma
que el nmero total de puentes de hidrogeno permanezca constante, aunque la
posicin del entrecruzamiento vari. este proceso requiere poca energa, pues el
nmero de puentes de hidrogeno permanece constante.
Modelo De Holliday de recombinacin homologa

4.- Error de apareamiento de bases y su resolucin.

Siempre que el mecanismo de replicacin produce el copiado de un error, deja por

detrs un nucletido malo apareado (comnmente denominado base mal
apareada o error de apareamiento). Si queda sin corregir, la base mal apareada
dar lugar a una mutacin permanente en la prxima ronda de replicacin del
DNA. Un complejo proteico que repara los errores de apareamiento reconoce a
estas bases mala apareadas, corta una de las dos cadenas de DNA involucradas
en el apareamiento errneo y resintetiza la cadena faltante. Para ser efectivo en la
correccin de los errores de replicacin, este sistema de reparacin de los
apareamientos errneos debe eliminar solamente la cadena de DNA recin
sintetizada; escindir la otra cadena (cadena vieja) mantendra el error en lugar de
corregirlo.
En los eucariotas, no se conoce todava con seguridad como el mecanismo que
repara a las bases mal apareadas distingue las dos cadenas de DNA. Sin
embargo, hay pruebas de que las cadenas de DNA recin replicadas-la
adelantada y la retrasada-son las que se cortan preferentemente; es decir que
estas fracturas (roturas de cadenas simples) que aparecen proporcionan la seal
que dirige al mecanismo de reparacin de las bases mal apareadas a la cadena
correspondiente.

5.- Apareamiento de molculas de DNA.

La RecA es la protena central de la recombinacin Homloga. Es el miembro

fundador de una familia de enzimas llamadas protenas de intercambio de
cadenas. Estas catalizan el apareamiento de moleculas de DNA homologas. El
apareamiento comprende tanto la bsqueda de coincidencias de secuencia entre
dos moleculas como la generacin de regiones de apareamiento de bases entre
estas moleculas.
Las actividades de apareamiento de DNA e intercambio de cadenas de la RecA
pueden observarse mediante el uso de sustratos de DN simples in vitro. Las
caractersticas importantes de estas moleculas de DNA son: 1)
complementariedad de secuencias entre las dos moleculas de DNA de la pareja,
2) una regin de DNA monocatenario en por lo menos una molcula para permitir
la congregacin de la RecA y 3) la presencia de un extremo de DNA dentro de la
regin de complementariedad, lo que permite que las cadenas del DNA en el
dplex neofomado se entrelacen.
La forma activa de la RecA es un filamento de DNA-protena, A diferencia de lo
que ocurre con la mayora de las protenas de la biologa molecular, que funcionan
en la forma de subunidades pequeas y bien definidas, como los monmeros, los
dmeros o los hexmeros, el filamento de RecA es enorme y de tamao variable;
son comunes los filamentos que contienen alrededor de q00 subunidades de RecA
y 300 nucletidos del DNA. En el filamento caben una, dos, tres o incluso cuatro
cadenas de DNA.
La estructura del DNA dentro del filamento est muy extendida en comparacin
con el ssDNA no cubierto o la hlice de la forma B estndar.

Sustratos para el intercambio de cadenas por la RecA