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Dot. Nm 0702006

Cmo hacer paso a paso un Anlisis de Supervivencia con

SPSS para Windows.
Aguayo Canela M, Lora Monge E
Servicio de Medicina Interna. Hospital Universitario Virgen Macarena. Sevilla

Resumen
Se describe, en el programa SPSS para Windows, los procedimientos para llevar a cabo un
anlisis de supervivencia con el mtodo de Kaplan-Meier, construir grficas de
supervivencia y compararlas mediante el test del Log-Rank.

0. Introduccin terica.
Para realizar un estudio de este tipo es necesario definir la fecha de comienzo y la fecha de
finalizacin del seguimiento, con la que se calcularn posteriormente los tiempos de
supervivencia de los pacientes. As, dependiendo del tipo de estudio y diseo, la fecha de
comienzo del seguimiento suele ser la del diagnstico de enfermedad, ingreso en el hospital,
inicio de tratamiento, etc. La fecha de finalizacin est predeterminada por el investigador
dependiendo del tipo de datos analizados.
Durante este perodo de tiempo, el seguimiento de los pacientes es individual, pudiendo
ocurrir que ste fallezca, contine con vida en la fecha de finalizacin del estudio o se pierda el
contacto con l en un instante determinado. Las dos ltimas situaciones representan lo que se
denominan datos censurados.
El tiempo de supervivencia se define entonces como el transcurrido desde la fecha de
comienzo del seguimiento hasta la fecha de ltimo contacto con el paciente, bien por haber
fallecido bien por haber sido censurado.
Existen distintos procedimientos que permiten estimar curvas de supervivencia, aunque quizs
uno de los ms populares en la investigacin clnica sea el mtodo de Kaplan-Meier. Es un
mtodo no paramtrico, con muy pocas restricciones; de hecho, lo nico que supone
es que los sujetos censurados se habran comportado del mismo modo que los
seguidos hasta que se produjo el evento (lo que se conoce por censura no
informativa).
Para aplicar este mtodo se ordenan de menor a mayor todos los tiempos de supervivencia
observados, anotando para cada uno de ellos el nmero de muertes y censuras
producidas. Para cada periodo de tiempo se calcula la probabilidad de sobrevivir, y la
funcin de Kaplan-Meier es la probabilidad de supervivencia individual acumulada a
lo largo del tiempo. Como veremos enseguida, estos pasos los hace automticamente el
programa estadstico.

Correspondencia: marianoaguayo@telefonica.net

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Aguayo Canela, Mariano

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Trabajaremos con una base de datos (Anexo 1) que recoge informacin sobre 56 pacientes
con cncer colorectal, incluidos en el seguimiento (fecha de entrada o inicial) en el momento
de ser sometidos a radioterapia pre-operatoria, y seguidos hasta su fallecimiento.

1. Pasos a dar para obtener una curva de supervivencia por el

mtodo de Kaplan-Meier.
1.1. En la tabla de datos es necesario disponer, al menos, de dos variables:

El tiempo de seguimiento (que puede ser a su vez una variable calculada como la
diferencia entre dos fechas, la de ingreso y la de finalizacin, que sern diferentes en
cada individuo). Es una variable cuantitativa y estar expresada en das, meses,
aos, etc.
El estado del paciente al final del seguimiento. Es una variable categrica
dicotmica, soliendo asignarse la categora 1 a quienes tuvieron el evento evaluado
(muerte, recada, etc.) y la categora 0 a los llamados casos censurados, ya sea
porque se perdieron durante el seguimiento o porque no haban tenido el evento final
al culminar el estudio.

Por tanto, lo primero que haremos ser comprobar que estas dos variables con sus
correspondientes escalas (escala y nominal en el programa SPSS) estn as definidas en
la base de datos. Es tambin muy importante comprobar cmo est codificada la variable
estado del paciente y confirmar con qu cdigo se identifica a los sujetos que tuvieron el
desenlace final evaluado, puesto que el programa nos lo va a pedir.
1.2. Para llevar a cabo el procedimiento, en la opcin Analizar elegimos Supervivencia y
luego Kaplan-Meier
Cuando se abre la nueva ventana de
dilogo, debemos seleccionar la variable
que mide el tiempo de seguimiento y
colocarla en la casilla correspondiente
(Tiempo).
Y en la celdilla Estado debe colocarse la
variable categrica dicotmica que
establece el estado individual durante el
seguimiento; esta variable tiene dos
opciones: valor censurado / valor muerte
(o evento que se evala).
De hecho el programa
nos pide Definir evento
(mientras tanto aparece
un parntesis con un
signo de interrogacin
tras el nombre de la
variable) y debe pulsarse
dicha
pestaa
y
especificar el valor que
tiene asignado el resultado que se evala (en
nuestro caso el valor 1 = muerte).
Antes de continuar debemos especificar algunas cosas en el anlisis de supervivencia,
oprimiendo la pestaa de la parte inferior de esta ventana Opciones

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Cmo hacer paso a paso un Anlisis de Supervivencia con SPSS para Windows.

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Podemos sealar Tablas de supervivencia y otros estadsticos, como la Media y

mediana de supervivencia y los Cuartiles. Tambin podemos obtener diferentes grficas,
como puede verse en la imagen, siendo lo habitual sealar Supervivencia.
El resultado que se obtiene -en nuestro ejemplo- es la siguiente salida de SPSS:

Kaplan-Meier
Survival Analysis for TSuperviv (Tiempo de supervivencia en meses)
Time

Status

7
9
9
12
12
12
12
13
14
16
18
19
19
23
23
24
24
24
24
24
25
26
27
29
29
30
32
33
33
34
35
35
35
35
35
36
38
41
51
54
54
57
60
67
70
72
78
80
83
87
89

muerte
muerte
muerte
muerte
muerte
muerte
censura
censura
censura
muerte
censura
muerte
muerte
muerte
censura
muerte
muerte
muerte
muerte
censura
censura
censura
muerte
censura
censura
censura
censura
censura
censura
muerte
muerte
muerte
censura
censura
censura
muerte
censura
muerte
censura
muerte
censura
muerte
censura
muerte
muerte
censura
muerte
censura
censura
censura
censura

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Cumulative
Survival
,9821

Standard
Error
,0177

,9464

,0301

,8929

,0413

,8739

,0446

,8350
,8156

,0504
,0528

,7360

,0608

,7144

,0628

,6879

,0658

,6350

,0706

,6048

,0734

,5729

,0761

,5392

,0788

,5033

,0813

,4646
,4259

,0838
,0853

,3833

,0867

Cumulative
Events
1
2
3
4
5
6
6
6
6
7
7
8
9
10
10
11
12
13
14
14
14
14
15
15
15
15
15
15
15
16
17
18
18
18
18
19
19
20
20
21
21
22
22
23
24
24
25
25
25
25
25

Number
Remaining
55
54
53
52
51
50
49
48
47
46
45
44
43
42
41
40
39
38
37
36
35
34
33
32
31
30
29
28
27
26
25
24
23
22
21
20
19
18
17
16
15
14
13
12
11
10
9
8
7
6
5

3 de 11

Aguayo Canela, Mariano

92
98
120
139
139

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censura
censura
censura
censura
censura

25
25
25
25
25

4
3
2
1
0

En esta primera tabla la columna de la izquierda (Time) es el tiempo durante el

cual los diferentes individuos estn en seguimiento, ordenados por tiempos
crecientes. La segunda columna (Status) nos indica si se ha producido el efecto
o desenlace evaluado o no, en nuestro caso etiquetados como muerte (en
caso contrario aparece el valor censura, que corresponde a los perdidos o
retirados durante el seguimiento y a los que al final del periodo de estudio
segua sin tener el evento, esto es, estaban vivos). La siguiente columna
(Cumulative survival) es la supervivencia acumulada, o proporcin de casos
para los que no ha tenido lugar el evento en cada tiempo. La siguiente columna
(Estndar error) es el error estndar correspondiente a la estimacin puntual de
Kaplan-Meier en cada tiempo. La quinta columna (Cumulative events) son los
desenlaces acumulados, esto es, los que han muerto hasta ese tiempo. La
ltima columna (Number remaining) es el nmero de sujetos que quedan en
cada momento sin que haya ocurrido en ellos el evento final o desenlace
evaluado, y representan los individuos que estn a riesgo en el siguiente
periodo.
Seguidamente el programa SPSS nos informa del nmero total de sujetos
evaluados (Number of cases), del nmero de censurados (Censored) y el
nmero de desenlaces (Events). Si se lo hemos marcado nos dar los valores
del tiempo medio de supervivencia y de la mediana de supervivencia (el
tiempo en el que el 50% de los sujetos siguen sin haber desarrollado el evento),
con sus correspondientes errores estndar y los intervalos de confianza al
95%, sealndonos que el estudio est limitado por el periodo mximo de
seguimiento (en nuestro ejemplo 139 meses).
Number of Cases:

56

Survival Time
Mean:
76
(Limited to 139)
Median:
67

Value
Standard Error

25,00
.
.

Censored:
Events:

31
25

Standard Error
9

(55,36%)

95% Confidence Interval

(59 ; 93)

17
Percentiles
50,00
67,00
16,51

(35 ; 99)

75,00
24,00
5,24

Y luego nos muestra la Curva de Supervivencia, un grfico que puede

modificarse situndonos sobre el con el botn izquierdo del ratn (editar). En l
se sita en la ordenada la supervivencia acumulada en trminos de
probabilidad (entre 0 y 1), y el tiempo de supervivencia en el eje de abscisas,
permitindonos responder a preguntas como
- Cuntos sujetos con cncer colorectal sobreviven ms de dos aos?
Trazaramos una lnea vertical desde el tiempo 24 meses y en el punto donde

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corte a la curva leeramos en horizontal el valor que le corresponde en el eje de

ordenadas (dara aproximadamente el 74%).

Funcin de supervivencia

1,0

Supervivencia acum

0,8

0,6

0,4

Funcin de supervivencia

0,2

Censurado

0,0
0

20

40

60

80

100

120

140

Tiempo de supervivencia en meses

2. Pasos a dar para comparar dos o ms curvas de supervivencia.

Para comparar dos o ms curvas de supervivencia se emplean diversos test de
hiptesis que plantean como hiptesis nula que los grupos que se comparan tienen
igual supervivencia, siendo la ms empleada la del Log-Rank, que tiene en cuenta las
diferencias de supervivencia entre los grupos en todos los puntos que dura el
seguimiento.

Para mostrar el procedimiento en el programa SPSS emplearemos la misma base de

datos anterior y usaremos la variable categrica Dosis radioterapia pre-operatoria
para definir dos grupos (los pacientes que recibieron menos de 5.000 rads y los que
recibieron 5.000 ms rads, codificados con 0 y 1 respectivamente). Intentaremos
responder a la pregunta fueron diferentes las supervivencias de ambos grupos? O lo
que es lo mismo: influy significativamente la dosis de radioterapia pre-operatoria en
la supervivencia de los sujetos con cncer colorectal?

Igual que en el paso anterior, se

activa la secuencia Analizar >
Supervivencia > Kaplan-Meier y
se colocan las dos variables
fundamentales en sus respectivas
ventanas de seleccin (Tiempo y
Estado).
Ahora
hay
que
seleccionar la variable que separar
dos grupos de pacientes y colocarla
en la ventana Factor. En nuestro
ejemplo la variable Dosis de
radioterapia pre-operatoria.

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Aguayo Canela, Mariano

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Debemos asegurarnos de que la variable que hemos establecido como factor de

comparacin es categrica.
En la pestaa Comparar factor seleccionamos el estadstico de contraste Log
rango (y por defecto se activar la opcin Combinada sobre los estratos.

La salida del programa es la siguiente:

Survival Analysis for TSuperviv Tiempo de supervivencia en

meses

Factor DosisRadiot = Menos de 5.000 rads

Time
Remaining
7
20
9
19
12
18
12
17
19
16
23
15
24
14
24
13
24
12
24
11
29
10
34
9
41
8
54
7
72
6
78
5

Status

Cumulative
Survival

Standard
Error

Cumulative
Events

muerte

,9524

,0465

muerte

,9048

,0641

muerte

muerte

,8095

,0857

muerte

,7619

,0929

muerte

,7143

,0986

muerte

muerte

muerte

muerte

,5238

,1090

censura

10
10

muerte

,4714

,1100

11

muerte

,4190

,1095

12

muerte

,3667

,1076

13

censura
muerte

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Number

13
,3056

,1056

14

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80

censura

14

83

censura

14

92

censura

14

139

censura

14

139

censura

14

4
3
2
1
0

Number of Cases:

21

Survival Time
Mean:
62
(Limited to 139)
Median:
34

Censored:

Standard Error
12

(33,33%)

Events: 14

95% Confidence Interval

(39 ; 86)

(21 ; 47)

Primero aporta datos del grupo establecido por la categora 0 de la variable Dosis
de Radioterapia Pre-operatoria, y enseguida los del grupo definido por la categora
1.
Survival Analysis for TSuperviv Tiempo de supervivencia en
meses

Factor DosisRadiot = Igual o superior a 5.000 rads

Time
Remaining
9
34
12
33
12
32
13
31
14
30
16
29
18
28
19
27
23
26
24
25
25
24
26
23

Status

Cumulative
Survival

Standard
Error

Cumulative
Events

muerte

,9714

,0282

muerte

,9429

,0392

censura

censura

censura

muerte

,9114

,0489

censura
muerte

3
3

,8789

,0570

censura

censura

censura

censura

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Number

7 de 11

Aguayo Canela, Mariano

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27

muerte

,8407

,0661

29

censura

30

censura

32

censura

33

censura

33

censura

35

muerte

35

muerte

35

censura

35

censura

35

censura

36

muerte

38

censura

51

censura

54

censura

57

muerte

60

censura

67

muerte

,4958

,1338

10

70

muerte

,3966

,1390

11

87

censura

11

89

censura

11

98

censura

11

120

censura

11

22
21
20
19
18
17
16
,7418

,0878

15
14
13
12
,6800

,0999

11
10
9
8
,5950

,1182

7
9

6
5
4
3
2
1
0

Number of Cases:

35

Survival Time
Mean:
(Limited to
Median:

74
120)
67

Censored:

24

Standard Error
10
9

(68,57%)

Events: 11

95% Confidence Interval

(55 ; 94)
(50;

84)

A continuacin, el programa ofrece el resultado del contraste de hiptesis Log Rank:

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Survival Analysis for TSuperviv Tiempo de supervivencia en

meses

Total
Number

Number

Percent
Events

Censored

Censored

DosisRad
33,33
DosisRad
68,57

Menos de 5.000 rads

21

14

Igual o superior a 5.000 rads

35

11

24

56

25

31

Overall
55,36

Test Statistics for Equality of Survival Distributions for

DosisRadiot
Statistic
2,68

Log Rank

df
1

Funciones de supervivencia

Dosis de
radioterapia preoperatoria

1,0

Igual o superior
a 5.000 rads

Supervivencia acum

0,8

Menos de
5.000 rads
Igual o superior
a 5.000 radscensurado

0,6

Menos de
5.000 radscensurado
0,4

0,2

0,0
0

20

40

60

80

100

120

Tiempo de supervivencia en meses

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140

Significance
0,1018

Como podemos ver, el

programa nos ofrece
primero una tabla de
distribucin
con
el
nmero total de sujetos,
fallecidos
(eventos),
censurados
y
su
correspondiente
porcentaje respecto al
total en cada grupo de
DosisRad y en la
muestra
total,
para
seguidamente aportar el
contraste estadstico Log
Rank, con el valor del
estadstico (2,68), los
grados de libertad (1, en
nuestro caso, al ser dos
grupos
los
que
se
comparan) y el valor p
asociado al contraste
(0,1018),
que
corresponde
a
una

9 de 11

Aguayo Canela, Mariano

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probabilidad que no nos permite rechazar la hiptesis nula, esto es,

concluiramos diciendo que no hay diferencias estadsticamente significativas
en la supervivencia de ambos grupos.
A continuacin el programa nos ofrece el grfico con las curvas de
supervivencia de ambos grupos.
Como puede apreciarse hay una separacin entre ambas curvas de
supervivencia, a favor del grupo de mayor dosis de radioterapia (parecen
sobrevivir ms), pero el test estadstico Log Rank ya hemos visto que no
alcanza el valor crtico para rechazar la H0 de no hay diferencias en la
supervivencia globalmente considerada.
Si miramos con ms detalle el grfico, comprobaremos como al principio (entre
el primero y el quinto ao) si parecen separarse las curvas de supervivencia,
pero no hay demasiada diferencia a partir de los 60 meses de seguimiento.

Anexo 1.
Tabla de datos de pacientes ca colorectal
N
paciente
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31

T
Supervivencia
(meses)
9
12
12
13
14
16
18
19
23
24
25
26
27
29
30
32
33
33
35
35
35
35
35
36
38
51
54
57
60
67
70

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Estado
1
1
0
0
0
1
0
1
0
0
0
0
1
0
0
0
0
0
1
1
0
0
0
1
0
0
0
1
0
1
1

Dosis
Radioterapia preoperatoria
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1

10 de 11

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32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56

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87
89
98
120
7
9
12
12
19
23
24
24
24
24
29
34
41
54
72
78
80
83
92
139
139

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1
1
1
1
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0
0

0
0
0
0
1
1
1
1
1
1
1
1
1
1
0
1
1
1
0
1
0
0
0
0
0
0 = censura

0 = menos de 5000
rads

1 = muerte

1 = 5000 rads ms

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