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CAPITULO

Introduccin a
la Microbiologa
1.1 Microbiologa
1.2 Los microorganismos
como clulas
1.3 Los virus, entes
microscpicos no
celulares
1.4 Clulas eucariotas y
procariotas

Louis Pasteur (1822 1895)


Qumico y Bilogo Francs que
fund la ciencia de la
Microbiologa, demostr la teora
de los grmenes como causantes
de enfermedades (patgenos),
invent el proceso que lleva su
nombre y desarroll vacunas
contra varias enfermedades
incluida la rabia.

1.5 Posicin de los


microorganismos en la
naturaleza
1.6 Taxonoma y filogenia
1.7 Algunos trabajos claves
en microbiologa
1.8 El inicio de la genmica
microbiana y la
post-genmica
1.9 Referencias
bibliogrficas

Captulo 1. Introduccin a la Microbiologa

1.1 Microbiologa
La Microbiologa es el estudio de un grupo amplio y diverso de organismos microscpicos
que existen como clulas aisladas o asociadas. Los microorganismos incluyen bacterias, hongos,
protozoarios y virus que aunque son microscpicos no son celulares. La Microbiologa analiza la
diversidad microbiana y su evolucin as como el rol de los microorganismos en el mundo en general,
en la sociedad humana, en el cuerpo humano y en animales y plantas.
La Microbiologa gira en torno a dos temas fundamentales, uno bsico y otro aplicado. Como
ciencia bsica, la Microbiologa suministra algunas de las herramientas de investigacin ms verstiles
para determinar la naturaleza de los procesos caractersticos de la vida. Los sofisticados conocimientos
que poseemos sobre los principios fsicos y qumicos que gobiernan los procesos vitales han surgido de
estudios con microorganismos. Esto se debe a que los microorganismos comparten con las clulas de
los organismos pluricelulares muchas propiedades bioqumicas. Adems, las clulas microbianas
pueden alcanzar elevadas densidades de poblacin en cultivo y son fcilmente manipulables para
estudios genticos. Ejemplo el conocimiento del ADN surgi de un estudio de transferencia gentica en
bacterias.
Como ciencia biolgica aplicada, la Microbiologa se ocupa del rol de los microorganismos en
diferentes sectores como la industria de alimentos. Los productos agrcolas o los animales en
explotaciones ganaderas deben llegar a los consumidores con calidad sanitaria. Los microorganismos
tienen gran importancia en la industria alimentaria porque pueden ocasionar el deterioro de los
alimentos y ocasionar prdidas econmicas inmensas. Las industrias de enlatado, congelado, desecado
de alimentos y otras, tienen como finalidad acondicionar los alimentos de tal modo que no sufran
deterioro. Los microorganismos causantes de enfermedades y transmitidos por alimentos tambin son
dignos de consideracin. Los alimentos deben estar adecuadamente preparados y controlados para
evitar la transmisin de enfermedades, ya que el alimento apto para el consumo humano puede servir
tambin para sustentar el crecimiento de muchos microorganismos.
No todos los microorganismos tienen efectos indeseables sobre los alimentos o sobre los
consumidores. Por ejemplo, los productos lcteos, como queso, yogurt, mantequilla, que se
manufacturan en gran medida por la actividad microbiana, son de gran valor econmico. De modo
similar, productos de importancia en la industria alimentaria como encurtidos, bebidas alcohlicas,
cido ctrico, actico, enzimas y otros son obtenidos por actividad microbiana.
1.2 Los microorganismos como clulas
Microorganismo es un organismo que no se puede observar a simple vista (microscpico),
constituido por una clula o varias, incluyendo los virus. La clula es la unidad fundamental de toda
materia viva. La clula es una entidad aislada de otras clulas por una membrana celular y en algunos
casos por una pared celular. Contiene una variedad de estructuras (ncleo o nucleoide, citoplasma) y
componentes qumicos (protenas, cidos nucleicos, lpidos, polisacridos), que hacen posible su
funcionamiento.
Todos los organismos celulares son estructuras altamente organizadas que muestran alguna
forma de metabolismo. Esto es, las clulas toman sustancias qumicas del medio y las transforman,
conservan parte de la energa liberada, de modo que las clulas pueden usarla y luego eliminan los
productos de desecho. Todas las clulas poseen reproduccin, es decir, son capaces de dirigir una serie
de reacciones bioqumicas que conducen a su propia sntesis. Como resultado de los procesos
metablicos, una clula crece y se divide para formas dos clulas. Muchas clulas sufren
diferenciacin, un proceso por el que se transforman nuevas sustancias o estructuras. A menudo, la

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diferenciacin celular es parte de un ciclo vital en el que las clulas forman estructuras especiales
relacionadas con la reproduccin, la dispersin o la supervivencia.
Las clulas responden a seales qumicas en su medio ambiente, tales como las producidas
por otras clulas. Por tanto pueden comunicarse e incluso estimar su propio nmero en el ambiente
circundante por medio de pequeas molculas que se difunden y pasan entre clulas vecinas. Con
frecuencia los organismos vivos tienen movimiento por autopropulsin, y en el mundo microbiano
existen diferentes mecanismos responsables de la movilidad. Finalmente, a diferencia de las estructuras
inertes, las clulas pueden evolucionar, cambiando permanentemente sus caractersticas y
transmitiendo las nuevas propiedades a su descendencia. De alguna forma, la primera clula debi
originarse a partir de una estructura no celular hace ms de 3 800 millones de aos. Despus se
produjeron una serie de sucesos altamente probables, tales como el crecimiento y divisin,
originndose poblaciones de clulas a partir de las cuales tuvo lugar la evolucin mediante la seleccin
de nuevas caractersticas y mayor diversidad.

1.3 Los virus, entes microscpicos no celulares


Los virus no son clulas. Carecen de muchos de los atributos de las clulas y no son sistemas
dinmicos abiertos. Una partcula vrica aislada es una estructura esttica muy estable e incapaz de
cambiar o reemplazar sus partes constituyentes. Slo cuando se asocia con una clula el virus es capaz
de replicarse y adquirir algunos de los atributos de un sistema vivo. As, a diferencia de las clulas, los
virus no tienen metabolismo propio. Aunque poseen informacin gentica (ADN o ARN) los virus
carecen de un sistema de traduccin y usan la maquinaria de la clula para la sntesis de protena. Los
virus infectan diversos organismos incluyendo a los microorganismos.

1.4 Clulas eucariotas y procariotas


Las clulas eucariotas son por lo general ms grandes y estructuralmente ms complejas que las
procariotas. Su caracterstica diferencial es la presencia de estructuras limitadas por membranas
denominadas orgnulos que corresponden al ncleo, mitocondrias y cloroplastos. Los microorganismos
eucariotas son las algas, los hongos y los protozoos. Las clulas procariotas tienen una estructura
interna ms simple y carecen de orgnulos o estructuras rodeadas por membranas (Tabla 1.1). Los
procariotas corresponden a las Bacteria y Archaea.
Los genomas presentan una organizacin diferente en clulas procariotas y eucariotas. En los
procariotas, el ADN se encuentra como una larga molcula de dos cadenas formando el cromosoma que
se condensa para originar una masa visible llamada nucleoide. En la mayora de los organismos
procariotas el ADN es circular y en general poseen un cromosoma. Por esta razn la mayora de los
procariotas contiene una copia de cada gen y son genticamente haploides. Asimismo la mayora de los
procariotas contienen ADN extracromosmico dispuesto de manera circular constituyendo los
plsmidos (que confieren propiedades especiales a las clulas pero no requeridas para la supervivencia).
En los eucariotas, el ADN se presenta dentro del ncleo en molculas lineales empaquetadas en
un estado muy organizado formando los cromosomas. El nmero depende del organismo, por ejemplo
Saccharomyces cerevisiae contiene 16 cromosomas (ocho pares). El humano contiene 46 (23 pares).
Los cromosomas eucariotas adems de ADN contienen tambin protenas que favorecen el plegamiento
y empaquetamiento del ADN, as como otras protenas necesarias para la expresin gnica. Una
diferencia fundamental es que los eucariotas contienen dos copias de cada gen y son, por tanto
genticamente diploides.

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Un procariota tpico como la bacteria Escherichia coli contiene un cromosoma con ADN de
alrededor de 4,6 millones de pares de bases y cerca de 4 300 genes. Una clula eucariota como la de los
humanos contiene mil veces ms ADN que E. coli y alrededor de siete veces su nmero de genes.
Tabla 1.1 Caractersticas diferenciales entre Procariotas y Eucariotas
Caracterstica
Procariotas
Eucariotas
Organizacin del material gentico
Membrana nuclear
Ausente
Presente
ADN con histonas
No
Si
Nmero de cromosomas
Uno*
Ms de uno
Intrones en los genes
Raro
Comn
Nucleolo
Ausente
Presente
Desarrollo de mitosis
No
Si
Recombinacin gentica
Parcial transferencia unidireccional Meiosis y fusin gametos
Mitocondrias
Ausentes
Presentes
Cloroplastos
Ausentes
Presentes
Membrana plasmtica con esteroles No**
Si
Flagelos
Submicroscpicos,
Microscpicos,
una fibra
20 microtbulos
Retculo endoplasmtico
Ausente
Presente
Peptidoglicano
Presente***
Ausente
Ribosomas
70 S
80 S
Lisosomas y peroxisomas
Ausentes
Presentes
Microtbulos
Ausentes o raros
Presentes
Citoesqueleto
Ausente
Presente
Diferenciacin
Rudimentaria
Tejidos y rganos
*Algunas excepciones
** Excepcin micoplasmas y metantrofos
*** Excepcin micopolasmas y arqueobacterias
Fuente: Prescott et al. 1999
1.5 Posicin de los microorganismos en la naturaleza
Existen millones de organismos vivos en la naturaleza. El hombre en su afn de ordenarlos cre
la taxonoma Ciencia de la clasificacin, nomenclatura e identificacin.
Carlos Linneaus, a mediados del siglo XVIII, orden a todos los seres vivos en dos reinos bien
definidos (segn tipo de nutricin; fotosntesis, absorcin y ingestin).
Reino animalia: Organismos mviles, hetertrofos (absorcin, ingestin)
Reino plantae: Organismos inmviles, auttrofos (fotosntesis).
Ernest Haeckel, en 1866 propuso un tercer reino, denominado Protista, conformado por
organismos unicelulares o multicelulares pero carentes de especializacin tisular (sin tejidos).
Los Protistas inferiores incluan clulas procariotas: bacterias, cianobacterias (algas verdes
azules) y los Protistas superiores clulas eucariotas: algas, hongos y protozoos.
Chatton, en 1937 dividi a los seres vivos en dos grupos segn presentaran o no membrana
(organizacin celular). Aparecieron los trminos:
Eucariota: Organismos cuyas clulas tienen membrana nuclear: protozoos, algas, hongos.
Procariota: Organismos cuyas clulas carecen de membrana nuclear: bacterias.

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Whittaker, en 1969 propuso un sistema de clasificacin basado en dos niveles de


organizacin celular y tres formas de nutricin.
a) Reino Monera: Procariotas, bacterias y algas azul verdosas. Predominantemente absorcin,
algunas fotosntesis.
b) Reino Protista: Eucariotas, unicelulares, microalgas, protozoos, hongos sencillos.
Eucariotas sin tejidos verdaderos. Absorcin, ingestin, fotosntesis.
c) Reino Fungi: Eucariotas osmtrofos, Hongos filamentosos y levaduras. Eucariotas
pluricelulares multinucleados con ncleos dispersos en su micelio con pared y a menudo
tabicado. Absorcin.
d) Reino Plantae: Eucariotas fotosintticos, multicelulares con clulas eucariotas, pared
celular rgida y nutricin fotoautotrfica.
e) Reino Animalia: Eucariotas fagtrofos, multicelulares con clulas eucariotas sin pared
celular y nutricin principalmente ingestiva.
1.6 Taxonoma y filogenia
La taxonoma es la ciencia de la clasificacin. Se apoya en propiedades fsicas observables que
constituyen el fenotipo de una clula e incluyen su apariencia (morfologa), la forma en la que
interaccionan con colorantes o tintes y su capacidad de convertir en producto qumico determinado en
otro.
Un mtodo diferente y nuevo de clasificacin es la filogenia, que detecta diferencias en
microorganismos basadas en caractersticas genticas codificadas en el ADN y en el ARN que est
implicado en la sntesis de protenas. Particular importancia tienen las secuencias de base par en el
ARN ribosmico (16 Svedberg). En 1987 Carlos Woese a travs de la secuenciacin del ARNr 16S
determin que los procariotas estn divididos en dos grupos:
Arqueobacterias: Bacterias que producen metano y otros que viven en medios ambientes muy cidos,
muy calientes o muy salinos (ambientes extremos).
Eubacterias: Bacterias comnmente aisladas del cuerpo, suelo y agua.
En 1990, Carlos Woese propuso un nuevo Taxon superior al reino que denomin Dominio.
Todos los seres vivos se agruparan en tres dominios: Bacteria, Archaea y Eukarya. De estos dominios
dos son exclusivamente microbianos y estn formados por clulas procariotas del reino Monera. y el
tercero Eukarya incluye a los reinos Protista, Fungi, Plantae y Animalia.

a.

Dominio
Reino
Phylum
Clase
Orden
Familia
Gnero
Especie

:
:
:
:
:
:
:
:

Bacteria
Monera
Proteobacteria
Alphaproteobacteria
Rhodosprillaes
Acetobacteriaceae
Acetobacter
Acetobacter aceti

Captulo 1. Introduccin a la Microbiologa

b.

Dominio
Reino
Phylum
Clase
Orden
Familia
Gnero
Especie

:
:
:
:
:
:
:
:

Archaea
Monera
Euryarchaeota
Methanobacteria
Methanobacteriales
Methanobacteriaceae
Methanobacterium
Methanobacterium thermoautotroplicum

c.

Dominio
Reino
Divisin
Clase
Orden
Familia
Gnero
Especie

:
:
:
:
:
:
:
:

Eukarya
Fungi
Ascomycota
Plectomycetes
Eurotiales
Tricomaceae
Aspergillus
Aspergillus niger

La unidad bsica taxonmica es la especie. Los grupos de especies con mayores similitudes se
agrupan en conjuntos denominados gneros y a su vez grupos de gneros con similitudes suficientes se
agrupan en familias. Una vez que el organismo ha sido definido, recibe un nombre segn el sistema
binomial de nomenclatura establecida por Linneo. El nombre del gnero se escribe con mayscula y se
coloca delante de la especie que nunca se escribe con mayscula. El gnero y la especie se imprimen
en cursiva. Ejm: Escherichia coli. Una vez mencionado el nombre del gnero, se puede abreviar
usando slo la mayscula pero nunca se abrevia el nombre de la especie ejemplo E. coli.
La filogenia se refiere a organismos segn su evolucin histrica, mientras que la taxonoma se
refiere a organismos segn caractersticas observables de las clulas. Ambos son mtodos de
clasificacin y suministran diferentes clases de informacin. Un rbol filogentico (Figura 1.1) muestra
las relaciones evolutivas entre varias especies u otras entidades que se cree tuvieron una descendencia
comn. Cada rama representa un descendente del nodo o antecesor. Cada nodo se denomina unidad
taxonmica. Adems de las diferencias filogenticas, algunas caractersticas fenotpicas separan
consistentemente tres categoras de organismos vivos: Bacteria, Archaea y Eukarya (Tabla 1.2).

Captulo 1. Introduccin a la Microbiologa

Figura 1.1 Arbol de vida filogentico establecido de una secuencia de RNA ribosmico.

Tabla 1.2 Caractersticas diferenciales entre Bacteria, Archaea y Eukarya

Caracterstica

Bacteria

Archaea

Eukarya

Ncleo incluido en membrana


Pared de clula (cido murmico)
Membrana plasmtica

Ausente
Presente
Bicapa
Enlaces
ster
S
No
S
S
S
S

Ausente
Ausente
Monocapa
Enlaces
ter
No
S
S
No
S
S

Presente
Ausente
Bicapa
Enlaces
ster
S
No
No
No
No
No

No

No
S

No
S

Fotosntesis basada en clorofila


Metanognesis
Reduccin de S a H2S
Nitrificacin
Desnitrificacin
Fijacin de nitrgeno
Sntesis y almacenamiento de poli hidroxi
alcanoato
S
Sensibilidad a cloranfenicol, estreptomicina y
kanamicina
S
Sensibilidad de ribosomas a la toxina de difteria
No
Fuente: Rittman y McCarty, 2001

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1.7 Algunos trabajos claves en Microbiologa


1664: Robert Hooke describi cuerpos fructferos de mohos creciendo sobre objetos de
cuero.
1684: Antonie van Leeuwenhoek observ por primera vez a los microorganismos con
detalles (microscopios muy simples).
1864: Louis Pasteur finaliz la controversia sobre la generacin espontnea (hiptesis
de que los organismos vivos pueden originarse a partir de la materia inerte).
1866: Ferdinand Cohn, estudi la bactera oxidante del azufre Beggiatoa y el bacilo
esporulante Bacillus.
1876: Roberto Koch enunci la teora microbiana del origen de las enfermedades
infecciosas.
1882: Roberto Koch, etiologa de la tuberculosis.
1884: Postulados de Koch, demostraron que un determinado microorganismo causa una
determinada enfermedad (Figura 2).
1. El microorganismo patgeno sospechoso debe estar presente en todos los casos de la
enfermedad y ausente en animales sanos.
2. El microorganismo sospechoso debe ser cultivado en forma pura fuera del cuerpo del
animal (en laboratorio).
3. El microorganismo obtenido por cultivo en el laboratorio el ser inoculado en animales
sano debe causar enfermedad.
4. El microorganismo debe ser reaislado de los animales inoculados experimentalmente
y al ser cultivado en el laboratorio debe tener las mismas caractersticas que el
microorganismo original.
1884: Christian Gram, tincin de Gram.
1887: Richard Petri, placas de Petri.
1889: Martinus Beijerinck, concepto de virus.
1929: Alexander Fleming, penicilina.
1953: James Watson, Francis Crick y Rosalind Franklin, estructura del ADN.
1966: Marshall Nirenberg y Gobind Khorana, descubrimiento del cdigo gentico.
1967: Thomas Brock, descubrimiento de bacterias capaces de crecer en fuentes termales
con agua en ebullicin.
1973: Stanley Cohen, Annie Chang, Robert Helling, Herbert Boyer, DNA
recombinante.
1979: Sntesis de insulina por tcnica de ADN recombinante.
1983: Luis Montagnier, VIH como causa del Sida.
1988: Kary Mullis, reaccin en cadena de la polimerasa (PCR).
1995: Craig Venter y Hamilton Smith, secuenciacin del genoma de Haemophylus
influenzae.
1999: The Institute for Genomic Research (TIGR) y otros, ms de 100 genomas
secuenciados total o parcialmente.

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Figura 1.2

Los postulados de Koch (Fuente: Madigan et al., 2004).

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1.8 El inicio de la genmica microbiana y la postgenmica


En julio de 1995, J. Craig Venter y Hamilton O. Smith, de la compaa Celera Genomics, y
Claire M. Fraser del Institut for Genomic Research (TIRG), publicaron la primera secuencia
completa del cromosoma de un microorganismo: Haemophilus influenzae cepa Rd. Este hecho
marc un hito en la historia del estudio de los microorganismos. El grupo de Fraser continu
con la secuencia del genoma de Mycoplasma genitalium, bacteria que tiene el genoma ms
pequeo de las especies conocidas. Les interesaba conocer el nmero y calidad de genes
esenciales de la clula. Posteriormente continuaron con el genoma de Methanococcus
jannaschii, una extraordinaria arqueobacteria aislada de las costas de Mxico a 2 600 metros de
profundidad, a 200 atmsferas de presin, que crece a 85 C, y es capaz de transformar el
dixido de carbono0, CO2, a metano y generar la energa para su metabolismo. La secuencia
revel que alrededor del 50 % de genes no se relacionan con secuencias previas, sugiriendo
que codifican para mecanismos fisiolgicos inexplorados. Ese mismo ao la secuencia del
genoma de Saccharomyces cerevisiae, el primer eucariota se complet, encontrndose
aproximadamente 6 000 genes y al menos 2 000 de funcin desconocida.
A raz de la consolidacin del programa gentico en los ltimos aos (genmica o estudio
del genoma), la postgenmica es el punto de partida para las investigaciones en el futuro. Al
estudio del transcriptoma (el repertorio de las molculas de RNA mensajero que se expresan) y
el proteoma (el anlisis de las protenas y su condicin, ya sea normal o patolgica), se le ha
llamado comnmente postgenmica. El conocimiento de los genomas de los microorganismos
facilitar la tarea de su estudio; sin embargo, su conocimiento no reemplaza la necesidad de
conocer las funciones que realizan en la clula. El nmero de genes importantes sin caracterizar
subraya el hecho de que contar con el genoma de un microorganismo es justo el punto de inicio
para su comprensin y estudio. Por lo tanto, el gran reto para el futuro es definir las funciones
de las protenas del genoma y descifrar las redes funcionales de regulacin.
Los datos aportados actualmente indican que un microorganismo puede contener alrededor
de 1 000 a 5 000 genes, de los cuales 20-70% son consideradas protenas putativas que son
descritas como de funcin desconocida. Algunas de la protenas reguladoras pueden tener una
docena de funciones celulares que pueden variar de una clula microbiana a otra; adems, una
protena puede contener varios dominios funcionales lo cual complica el anlisis estructurafuncin. Desde luego, la genmica es slo el primer paso para discernir los procesos
fundamentales que gobiernan la vida. El gran reto en el futuro es definir la funcin de las
protenas codificadas por el genoma, incluyendo el gran nmero de nuevas protenas de funcin
desconocida, y descifrar las redes funcionales de los genomas. Integrar los resultados de los
esfuerzos de secuenciacin con la informacin existente y con una base de datos bien
desarrollada producir un panorama amplio del metabolismo celular y de la funcin gentica.
La tecnologa, por s misma, no proporciona un entendimiento sustantivo del universo
microbiano. Vivimos la edad de la informacin, con excesivos genes, secuencias, reacciones,
y datos, los cuales debemos de integrar para lo cual es necesario desarrollar rpidamente la
bioinformtica necesaria para organizarla. La ecologa microbiana necesita de proyectos para
cultivar nuevos microorganismos, describir la composicin y dinmica de las comunidades
microbianas, hacer la metagenmica a gran escala y sin fines comerciales; estudiar la expresin
de los genes y las interacciones in situ, crear las bases de datos y herramientas informticas
necesarias para poder interpretar el enorme flujo de datos que se est generando; por lo que ser
indispensable incorporar cientficos en computacin y bioinformtica, con amplios

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Captulo 1. Introduccin a la Microbiologa

conocimientos en biologa molecular. Este es el reto al que se enfrentan los microbilogos del
siglo XXI.
1.9 Referencias bibliogrficas
Baca, E. (2010). La Microbiologa. De sus inicios a la genmica. Recuperado de
http://www.elementos.buap.mx/num49/htm/3.htm
Madigan, M.; Martinko, J. & Parker, J. (2004). Brock. Biologa de los Microorganismos
(10 ed.) Madrid, Espaa: Pearson Educacin, S.A.
Rittman, B. & McCarty. P. (2001). Biotecnologa del Medioambiente, Principios y
Aplicaciones. Espaa: McGraw Hill Interamericana.
Prescott, L, Harley J., & Klein, D. (1999). Microbiologa. Espaa: McGraw Hill
Interamericana.

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