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Enfermedades cromosmicas
Nancy B. Spinner, Laura K. Conlin
ENFERMEDADES CROMOSMICAS
telmero
p22.3
p2
p21.3
p1
p11.2
brazo p
centrmero
q1
q21.1
brazo q
q2
telmero
q23
q28
Enfermedades cromosmicas
CITOGENTICA MOLECULAR
La citogentica molecular proporciona un vnculo entre el anlisis cromosmico y molecular, y supera algunas de las limitaciones de la citogentica
83e-1
CAPTULO 83e
Despus de cultivarlas, las clulas se tratan con un inhibidor del huso mittico, que evita la separacin de las cromtidas durante la metafase. Detener
la mitosis en la metafase es esencial, porque los cromosomas estn en su
estado ms condensado durante esta etapa de la mitosis. El patrn de bandeo de un cromosoma en metafase es fcilmente reconocible y es ideal para
el cariotipado. Existen varios tipos diferentes de tcnicas de tincin cromosmica, incluyendo a las bandas R, las bandas C y la tincin con quinacrina,
sin embargo la utilizada con mayor frecuencia es la tincin con bandas G.
Esta ltima se logra con el tratamiento de los cromosomas con una enzima
proteoltica, como la tripsina, que digiere a algunas de las protenas que
mantienen al DNA en una estructura tridimensional, seguido de la tincin
con un colorante (Giemsa) que se une al DNA. Los patrones resultantes
tienen bandas oscuras y claras; en general, las bandas claras se presentan en
regiones de los cromosomas en las cuales los genes se estn transcribiendo
activamente y las bandas oscuras se localizan en regiones de menor actividad transcripcional.
El cariotipo humano bandeado se ha estandarizado con base en un
sistema acordado internacionalmente para designar no slo los cromosomas individuales sino tambin las regiones cromosmicas, proporcionando una manera en la que los reordenamientos estructurales y las variantes
se pueden describir en trminos de su composicin. El cariotipo femenino
humano normal se refiere como 46,XX (46 cromosomas, con 22 pares de
autosomas y dos cromosomas sexuales del mismo tipo [dos X], lo que indica que es femenino); y el cariotipo masculino humano normal se refiere
como 46,XY (46 cromosomas, con 22 pares de autosomas y un cromosoma sexual de cada tipo [un X y un Y], lo que indica que es masculino). La
anatoma de un cromosoma incluye la constriccin central, conocida
como el centrmero, que es crtica para el movimiento de los cromosomas
durante la mitosis y la meiosis; los dos brazos cromosmicos (p para el
ms pequeo o brazo petite, y q para el brazo largo); y los extremos de los
cromosomas, que contienen los telmeros. Los telmeros estn constituidos de una repeticin de hexanuclotidos (TTAGGG)n, y a diferencia del
centrmero, no son visibles a nivel del microscopio ptico. Los telmeros
son funcionalmente importantes porque confieren estabilidad a los extremos de los cromosomas. Los cromosomas rotos tienden a fusionarse extremo con extremo, mientras que un cromosoma normal con la estructura
del telmero intacta es estable. Para crear el mapa de bandeo cromosmico estndar, cada cromosoma se divide en segmentos que son numerados,
y posteriormente subdivididos. Los nombres precisos de las bandas se registran en un documento internacional de tal manera que cada banda tiene un nmero distinto. La figura 83e-1 muestra un ideograma (un mapa
cromosmico con bandas) del cromosoma X y un cromosoma X con bandas G. Este sistema proporciona una manera de escribir una anomala cromosmica, sealando qu banda est eliminada, duplicada o reordenada.
15
con sondas que se unen a secuencias repetidas, como el DNA que se encuentra en los centrmeros o telmeros, o con sondas que se unen a un cromosoma completo (sondas de pintado) para determinar la composicin
cromosmica de un cromosoma anormal. Los estudios de FISH en interfase tambin ayudan a identificar alteraciones estructurales cuando las sondas se utilizan para mapear ambos extremos de un sitio de ruptura de una
traslocacin. Cada extremo de un sitio de ruptura se marca con un color
diferente, y cuando no hay traslocacin ambas sondas parecen estar superpuestas. Cuando hay una traslocacin, las dos sondas parecen separarse
una de la otra. El conjunto de sondas de separacin (tambin llamado
break-apart) se utiliza con frecuencia para detectar traslocaciones recurrentes en clulas cancerosas.
METODOLOGAS BASADAS EN MATRICES CITOGENTICA
En 2003, se introdujeron al laboratorio clnico los mtodos basados en
matrices y rpidamente revolucionaron el campo de la citogentica. Estas
tcnicas utilizan matrices (colecciones de segmentos de DNA del genoma
completo) que se pueden utilizar para determinar el nmero de copias.
Con la citogentica estndar las piezas de DNA faltante o extra tienen que
ser lo suficientemente grandes para poderse visualizar en el microscopio
en cromosomas bandeados (por lo general mayores de 5 Mb). La FISH
necesita la preseleccin de una sonda molecular informativa antes del anlisis. En contraste, las tcnicas basadas en matrices permiten el estudio de
muchas regiones del genoma en un solo anlisis, con el aumento considerable en la resolucin comparada con la citogentica estndar. Las tcnicas
basadas en matrices permiten escanear con rapidez y precisin el genoma
en bsqueda de deleciones o duplicaciones pequeas. La resolucin de la
prueba es una funcin del nmero de sondas o secuencias de DNA presentes en la matriz. Las matrices pueden utilizar sondas de diferentes tamaos
(oscilan de 50 a 200 000 pares de bases de DNA) y las diferentes densidades de las sondas dependen de las necesidades de la aplicacin. Las plataformas de baja resolucin tienen cientos de sondas, dirigidas a regiones de
enfermedades conocidas, mientras que las plataformas de alta resolucin
C
(1pxl = 127KB)
ndice Log R
PARTE 3
pares de bases no son detectables por tcnicas estndar de bandas G realizadas sistemticamente, y las anomalas cromosmicas con patrones de
bandeo borrosos o novedosos pueden ser difciles o imposibles de interpretar. Para llevar a cabo el anlisis citogentico, las clulas se deben estar
dividiendo, lo cual no siempre es posible de obtener (p. ej., en material de
autopsia o de tumor que ya ha sido fijado). Finalmente, la seleccin de crecimiento o sesgo puede causar de manera ocasional que los resultados de
los estudios citogenticos sean engaosos porque las clulas que proliferan
in vitro pueden no ser representativas de la poblacin original, como sucede a menudo con los especmenes tumorales.
La hibridacin fluorescente in situ (FISH, fluorescence in situ hybridization) es una tcnica de citogentica-molecular combinada que resuelve
muchos de los problemas mencionados. La FISH permite determinar el
nmero y la localizacin de secuencias especficas de DNA en clulas humanas. La FISH puede realizarse en cromosomas metafsicos, como sucede con las bandas G, pero tambin se puede llevar a cabo en clulas que no
progresan activamente mediante mitosis. La FISH que se realiza en clulas
que no se estn dividiendo, se denomina FISH en interfase o nuclear (fig.
83e-2). El procedimiento de FISH se basa en que se complementen dos
cadenas de DNA de doble hlice y utiliza una sonda molecular, que puede
ser un grupo de secuencias a lo largo de un cromosoma completo, una
secuencia de DNA para una parte repetitiva del genoma (p. ej., centrmeros o telmeros), o una secuencia especfica de DNA que se identifica slo
una vez en el genoma (p. ej., un gen asociado a una enfermedad). La eleccin de sondas para los estudios con FISH es importante y vara con la
informacin necesaria para el diagnstico de un trastorno particular. El
tipo ms frecuente de sondas son las sondas especficas para el locus, que
se utilizan para determinar si un gen crtico o una regin est ausente (lo
que indica una delecin) o presente en el nmero normal de copias, o si
existen copias extra de la regin. La FISH en cromosomas metafsicos
brinda informacin adicional de la localizacin de la copia extra, que es
informacin necesaria para determinar si est presente un reordenamiento estructural, como una traslocacin. La FISH tambin se puede realizar
Duplicacin
1.00
0.75
0.50
0.25
0.00
0.25
0.50
0.75
1.00
15
p13
p12
p11.2
q11.2
q14
q21.1
q21.3
q22.2
q23
FIGURA 83e2. Bandas G, hibridacin fluorescente in situ (FISH) y matriz de polimorfismo de un solo nucletido (SNP) que demuestran un cromosoma 15
anormal. A. Las bandas G muestran un cromosoma 15 anormal, con material irreconocible en el brazo p del cromosoma de la derecha (flecha en la parte superior).
B. FISH en metafase (solamente se muestran los cromosomas 15) usando una sonda de la regin telomrica de 15q (rojo) y una sonda control que mapea por fuera
de la regin duplicada (verde). C. La FISH en interfase demuestra tres copias de la sonda 15q tel en rojo y dos copias de la sonda 15q control (verde). D. La matriz de
SNP para genoma completo demuestra el aumento del nmero de copias de una porcin de 15q. Observe que las bandas G slo indican el cromosoma 15 anormal,
pero el origen del material extra slo se puede demostrar mediante FISH o una matriz. El anlisis de FISH necesita informacin adicional sobre posibles causas genticas para seleccionar la sonda correcta. La matriz identifica con exactitud el origen del material extra, pero por s misma no proporciona informacin sobre la posicin.
83e-3
Necesita clulas
en crecimiento
Detecta deleciones
y duplicaciones
Detecta reordenamientos
estructurales balanceados
Detecta disoma
uniparental
Bandas G
FISH en metafase
FISH en interfase
Matriz de CGH
Matriz de SNP
S
S
No
No
No
S
S
S
S
S
S
S
Algunos
No
No
No
No
No
No
Algunas
tienen millones de sondas dispersas a lo largo del genoma completo. Dependiendo del tamao de las sondas y la localizacin de la sonda a lo largo
del genoma, las pruebas basadas en matrices pueden ser capaces de detectar deleciones o duplicaciones de un solo exn.
Enfermedades cromosmicas
CAPTULO 83e
Anlisis por hibridacin genmica comparativa (CGH, comparative genome hybridization) y polimorsmos de un solo nucletido (SNP, single nucleotide polymorphism) Las matrices de genotipificacin basadas en SNP y CGH se utilizan
para el anlisis de deleciones y duplicaciones genmicas. En ambas tcnicas, las sondas de oligonucletidos se colocan en una laminilla o en un
genochip en formato de rejilla. Cada una de estas sondas es especfica para
una regin genmica en particular. En la matriz de CGH, la cantidad de
DNA de un paciente es comparada con la de un control clnicamente normal, o con un grupo de controles, para cada una de las sondas presentes en
la matriz. El DNA de un paciente se marca con fluorescencia con un colorante de un color, y el DNA de un individuo control se marca con otro
color. Posteriormente, estas muestras de DNA se hibridan al mismo tiempo en la matriz. La seal fluorescente resultante vara dependiendo de si el
DNA del control y del paciente estn presentes en cantidades iguales o si
uno tiene un nmero diferente de copias que el otro. Las plataformas de
SNP utilizan matrices dirigidas a SNP que estn distribuidos a lo largo del
genoma. Las matrices de SNP varan en densidad de marcadores y en la
tecnologa utilizada para la genotipificacin, dependiendo del fabricante
de la matriz. Las matrices de SNP al inicio fueron diseadas para determinar genotipos a nivel biallico de base polimrfica (p. ej., CC, CT o TT), y
se han utilizado cada vez ms en estudios de asociacin del genoma completo para identificar genes de susceptibilidad a enfermedad. Las matrices
de SNP posteriormente se adaptaron para identificar deleciones y duplicaciones genmicas (fig. 83e-2). Las matrices de SNP adems de identificar
cambios en el nmero de copias, tambin detectan regiones del genoma
que tienen un exceso de genotipos homocigotos y ausencia de genotipos
heterocigotos (p. ej., solamente genotipos CC y TT, sin genotipos CT). La
ausencia de heterocigosidad en ocasiones se asocia con disoma uniparental (expuesta ms adelante en este captulo), pero tambin se observa
cuando los progenitores de un individuo estn relacionados entre s (identidad por descendencia). Las regiones de homocigosidad se han utilizado
para ayudar a identificar genes en los cuales las mutaciones homocigotas
condicionan fenotipos de enfermedad en familias con consanguinidad conocida.
Se demostr que las tcnicas basadas en matrices (a las que nos referiremos como anlisis citogentico) son superiores al anlisis cromosmico
en la identificacin de deleciones o duplicaciones clnicamente importantes. Se estima que para visualizar una delecin o duplicacin mediante
citogentica estndar, sta debe tener un tamao entre cinco a 10 millones
de pares de bases. En casi todos los casos, las deleciones y duplicaciones de
este tamao contienen mltiples genes y estos dos tipos de alteraciones
ocasionan enfermedad. Sin embargo, la utilizacin de pruebas citogenmicas basadas en matrices, que de manera rutinaria identifican deleciones
y duplicaciones menores de 50 000 pares de bases, muestra que todos los
individuos clnicamente normales tienen algunas deleciones y duplicaciones. Esto representa un dilema para el analista que debe distinguir cules
variaciones pequeas del nmero de copias (CNV, copy number variations)
ocasionan enfermedad (patognicas) y cules son probablemente polimorfismos benignos. Aunque al inicio fue difcil, la comunidad de citogentica
ha estudiado a estas CNV por cerca de una dcada, y se han creado bases
de datos de las CNV que se observan en forma rutinaria en sujetos clnicamente normales y en aquellos con anormalidades clnicas. Sin embargo,
cada variante del nmero de copias que es identificada en un individuo
que recibe una prueba genmica, debe ser evaluada para el contenido gentico y coincidencia con CNV en otros pacientes y controles.
Las tecnologas de matrices se basan en el DNA, a diferencia de las tecnologas citogenticas que se basan en clulas. A pesar de que la resolucin
83e-4
Prenatal
Neonatal y en la infancia
Etapa adulta
PARTE 3
Genes, el medio ambiente y las enfermedades
sangre del cordn umbilical, [PUBS], percutaneous umbilical blood sampling) es un procedimiento riesgoso que se realiza en el segundo o tercer
trimestre del embarazo, por lo general en seguimiento de un hallazgo poco
claro de una amniocentesis (como el mosaicismo) o de una anomala por
ultrasonido detectada ms tarde en el embarazo. Uno de los avances recientes de gran impacto en el diagnstico prenatal de enfermedades cromosmicas y genticas es la utilizacin de DNA fetal de clulas libres que
se puede identificar en el suero materno. Las ventajas obvias de utilizar
DNA fetal obtenido de suero materno es que el DNA se puede conseguir
con un mnimo riesgo para el embarazo, porque se necesita una muestra
de sangre materna, en lugar de lquido amnitico que se obtiene al puncionar las membranas uterinas lo que conlleva un riesgo de aborto o infeccin. Aunque el estudio del DNA fetal de clulas libres, tambin llamado
deteccin prenatal no invasiva, ha empezado a ofertarse en la clnica, requiere una confirmacin de tejidos fetales cuando se identifica un resultado anormal. Adems, se han generado preocupaciones ticas, porque se
teme que la facilidad de realizar esta prueba motive al estudio de individuos que no estn verdaderamente preparados para afrontar las decisiones
que acompaan al diagnstico de una enfermedad gentica y esta prueba
puede cambiar las implicaciones ticas del diagnstico prenatal. Sin embargo, sta es un rea activa de investigacin, en trminos de la tecnologa
y su utilizacin, as como sus implicaciones.
Indicaciones comunes Las indicaciones comunes para el diagnstico prenatal por anlisis citogentico o citogenmico son 1) edad materna avanzada, 2) presencia de una anormalidad del feto en el estudio de ultrasonido,
y 3) anormalidades en el tamizaje materno en suero que revelen un riesgo
aumentado para anomalas cromosmicas.
Es bien sabido que la edad materna es un factor importante de riesgo
para tener un feto con trisoma. A una edad materna menor de 25 aos,
2% de todos los embarazos reconocidos clnicamente son trismicos, sin
embargo a una edad materna de 36 aos, esta cifra incrementa a 10%, y a
la edad materna de 42 aos, la cifra aumenta a >33%. La recomendacin es
que las mujeres mayores de 35 aos de edad consideren el diagnstico
prenatal si desean conocer el estado cromosmico de sus fetos, basados en
el riesgo de tener un feto cromosmicamente anormal en comparacin
con el riesgo de un evento adverso de amniocentesis o de muestra de vellosidades corinicas. Se desconoce el mecanismo preciso del efecto de la
edad materna, pero se cree que involucra una alteracin en el proceso de
la segregacin cromosmica. No se observa un efecto similar para la trisoma y la edad paterna. Esta diferencia puede reflejar el hecho de que los
ovocitos se originan en una etapa temprana en el desarrollo ovrico de la
mujer, mientras que las espermatogonias son generadas continuamente
despus de la pubertad en el varn.
Las anormalidades en el ultrasonido prenatal son la segunda indicacin
ms frecuente para la deteccin gentica prenatal. La deteccin por ultrasonido puede revelar anomalas estructurales o funcionales en el feto, que
pueden estar asociadas con enfermedades cromosmicas o genmicas Por
tanto, se pueden recomendar estudios cromosmicos de seguimiento.
ticas incluyen ginecomastia, azoospermia, testculos pequeos e hipogonadismo. El cariotipo 47,XYY es el que se encuentra con mayor frecuencia
en varones con retraso del desarrollo o problemas de comportamiento, o
ambas caractersticas; sin embargo, los estudios basados en poblaciones
han mostrado que la inteligencia de sujetos con este cariotipo por lo general se encuentra en el rango normal, aunque ligeramente menor que la
identificada en sus familiares.
Enfermedades cromosmicas
FIGURA 83e3. Segregacin de una traslocacin balanceada en una madre, con herencia de una forma desbalanceada en su hija. Observe que la madre tiene
dos cromosomas reordenados, pero su hija solamente recibi uno de stos, lo que resulta en copias extras de una regin del cromosoma azul, con prdida de algo de
material del cromosoma rojo.
83e-5
CAPTULO 83e
ciones recprocas, aparentemente balanceadas, ocurre en sujetos fenotpicamente normales. El riesgo de una anormalidad clnica cuando se
identifica una traslocacin recproca nueva (por lo general durante estudios de diagnstico prenatal) es de 7%. El anlisis de traslocaciones citogenticamente recprocas utilizando matrices ha demostrado que es ms
probable que las traslocaciones en sujetos clnicamente normales no presenten deleciones o duplicaciones en el punto de ruptura, mientras que las
traslocaciones en individuos clnicamente afectados tienen mayor probabilidad de presentar deleciones o duplicaciones asociadas a los puntos de
ruptura. La mayora de las traslocaciones recprocas ocurre una sola vez,
en posiciones aparentemente aleatorias a lo largo del genoma; sin embargo,
hay pocas excepciones con casos mltiples de traslocaciones recurrentes.
Estas traslocaciones recurrentes incluyen a la t(11;22), que resulta en el
sndrome de Emmanuel en la forma balanceada, y varias traslocaciones
que involucran una regin en 4p, 8p y 12p. Estas traslocaciones recurrentes ocurren en regiones del genoma que contienen tipos especficos de repeticiones abundantes en AT, u otras secuencias repetidas, que son susceptibles
al reordenamiento. Una categora especial de traslocaciones son las traslocaciones robertsonianas, que involucran a los cromosomas acrocntricos.
Un cromosoma acrocntrico tiene material gentico slo en el brazo largo
de los cromosomas, mientras que el brazo corto contiene DNA repetitivo.
Los cromosomas acrocntricos son 13, 14, 15, 21 y 22. Las traslocaciones
robertsonianas ocurren cuando un brazo largo completo de un cromosoma
acrocntrico es traslocado al brazo corto de otro cromosoma acrocntrico.
Los portadores de traslocaciones robertsonianas balanceadas contienen
solamente 45 cromosomas con un cromosoma que consiste de dos brazos
largos de un cromosoma acrocntrico. Tcnicamente, sta es una traslocacin desbalanceada, debido a que los dos brazos cortos de los cromosomas acrocntricos estn ausentes; sin embargo, a causa de que los brazos
cortos son repetitivos, no existen consecuencias fenotpicas. Los portadores
robertsonianos desbalanceados tienen 46 cromosomas, pero con tres copias
del brazo largo de un cromosoma acrocntrico. La traslocacin robertsoniana ms frecuente involucra a los cromosomas 13 y 14. Las traslocaciones robertsonianas desbalanceadas involucran a los cromosomas 13 y 21,
y ocasionan trisomas 13 y sndrome de Down, respectivamente. Aproximadamente 4% de los pacientes con sndrome de Down tiene una traslocacin y debido a que los riesgos de recurrencia son diferentes para las familias
de estos individuos, todos los pacientes con sndrome de Down identificado
clnicamente deben tener un cariotipo para investigar estas traslocaciones.
83e-6
PARTE 3
Genes, el medio ambiente y las enfermedades
12p). Los isocromosomas consisten de dos copias de un brazo cromosmico (p o q), en lugar de una copia de cada brazo. Por lo general, este
isocromosoma no se observa en linfocitos de sangre perifrica que son
analizados por bandas G, pero es identificado en fibroblastos. Se ha reportado que la tecnologa de matrices detecta los isocromosomas en sangre
perifrica no cultivada en algunos pacientes, y se ha hipotetizado que un
sesgo de crecimiento en contra de las clulas con el isocromosoma, previene su identificacin en estudios citogenticos.
Las anomalas numricas, traslocaciones y deleciones son las alteraciones cromosmicas ms frecuentes observadas en el laboratorio diagnstico, pero adems de las inversiones y las duplicaciones, se han reportado
otros tipos de cromosomas anormales, incluyendo anillos cromosmicos,
donde los dos extremos de un cromosoma se fusionan para formar un crculo, y las inserciones, donde una pieza de un cromosoma es insertada en otro
cromosoma o en otro lugar dentro del mismo cromosoma.
La disoma uniparental (UPD, uniparental disomy) es la herencia de un
par de cromosomas (o parte de un cromosoma) de un solo progenitor. Por
lo general, esto ocurre como resultado de la falta de disyuncin durante la
meiosis, generando un gameto que no tiene o presenta una copia extra de
un cromosoma. El huevo fertilizado resultante tendr slo una contribucin parental de un par cromosmico determinado, o una trisoma para
un cromosoma determinado. Si la monosoma o la trisoma no es compatible con la vida, el embrin puede experimentar un rescate hacia un
nmero normal de copias. Si una monosoma es rescatada, el cromosoma
nico puede estar duplicado, lo que produce una clula con dos cromosomas idnticos (rescate monosmico) (fig. 83e-4). En el caso de las trisomas, una falta de disyuncin posterior puede dar como resultado clulas
donde uno de los cromosomas extras se pierde (rescate trismico) (fig.
83e-4). Para el rescate trismico, existe una posibilidad de 33% de que el
cromosoma que se pierde sea el nico cromosoma de un progenitor, lo que
resulta en una clula con dos cromosomas del mismo progenitor. La disoma uniparental en ocasiones se asocia con anormalidades clnicas, y esto
puede ocurrir por dos mecanismos. La disoma uniparental puede ocasionar enfermedad cuando hay un gen sellado en el cromosoma involucrado,
lo que condiciona expresin gnica alterada. El sellado es la marca qumica
del origen parental de un cromosoma, y los genes que estn improntados
solamente se expresan del cromosoma materno o paterno (cap. 82). Por
tanto, el sellado da como resultado la expresin diferencial de los genes
afectados, basado en el origen parental. Por lo general, el sellado ocurre a
travs de la modificacin diferencial del cromosoma de uno de los progenitores, y la metilacin es uno de los diversos mecanismos epigenticos
(otros incluyen la acetilacin, ubicuitinacin y fosforilacin de histonas).
83e-7
CAPTULO 83e
Enfermedades cromosmicas