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ESCUELA DE POSGRADO
Maestra en Ingeniera Ambiental
BIOTECNOLOGA AMBIENTAL
(IA-603)
06.- ORGANISMOS
EXTREMFILOS
Otros tipos de
extremfilos
Condiciones ambientales
Karl Stetter
(Science, 24 November 2003)
2D-electroforesis
Determin la filogenia de
Bacteria y Archaea
Thermophiles Hyperthermophiles
Tolerancia a la temperatura
El enrojecimiento en las
rocas es producido por
Sulfolobus solfataricus,
cerca de Npoles, Italia
Algunos hipertermfilos
Habitan
frecuentemente en
emanaciones
volcanicas y aguas
termales
Pyrococcus abyssi
1m
Thermus aquaticus 1m
Archaea termfilas
Thermophilic Heavyweights
Los cuatro phyla contienen gneros
termfilos:
Euryarchaeota
Crenarchaeota
Korarchaeota
Nanoarchaeota
Sulfolobus acidocaldarius
Organismo modelo de Crenarchaeota
75 a 80C y pH 2 a 3
Fcil de cultivar
Heterotrfico aerobio
Completamente secuenciado
Genome 2.3 Mb
Fue empleado para demostrar la
similitud del aparato
transcripcional de Archaea y
Eucarya
Sulfolobus acidocaldarius
Extremfilos de respiraderos
hidrotermales
0.2m
1m
Psicrfilos
Algunos microorganismos
crecen en temperaturas muy
por debajo del punto de
congelacin del agua, como
ocurre en la Antartida
Halfilos
Se dividen en:
Halfilos ligeros
(1-6%NaCl)
Halfilos moderados
(6-15%NaCl)
Halfilos extremos
(15-30%NaCl)
Los halfilos mayormente
son arqueas aerobias
obligadas.
Halfilos
Taxonomic profiles
using 16S rRNA
sequences across the
salinity gradient.
Relative growth rate is plotted against both percentage salinity and NaCl concentration. The five
microorganisms are Agmenellum quadraplicatum (PR-6), a slightly halotolerant cyanobacterium, Fabrea salina
(Fs), a moderately halophilic protozoan, Dunaliella salina (Ds), a halophilic green alga, Aphanothece
halophytica (Ah), an extremely halophilic cyanobacterium, and Halobacterium sp. (H), an extremely halophilic
archaeon. The salinity of sea water and the hatch range for brine shrimp are noted.
ARCHAEA
Principales caractersticas de las arqueas
Diversidad morfolgica:
- Bacilos, cocos, espirilos, formas irregulares, pleomrficos
clulas nicas a filamentos o agregados.
- Tamao de 0.1 a ms de 15 m (filamentos de 200 m).
- Gram positivos y Gram negativos.
- Replicacin por fisin binaria, gemacin, fragmentacin, etc.
Diversidad fisiolgica:
- Aerbicos a anaerobios facultativos.
- Mesfilos a hipertermfilos (crecen a 100C).
- Recientemente hallados en aguas de las costas Antrticas.
Estructura celular
Las membranas celulares contienen lpidos unidos por
enlaces ETER (ms estables que los ester):
Hidrocarburos con 20-40 C de longitud.
Hidrocarburos basados con 5 compuestos de isopreno.
Anillos de ciclopropano pueden estar presentes.
La estructura
comprende una
monocapa lipdica en
vez de bicapa lipdica.
Pared celular
Thermoplasma
citosol
Gram Positivo
Methanobacterium
regula ingreso/salida
Gram Negativo
Thermoproteus
Clasificacin
Basado en datos de rRNA, fisiologa, morfologa.
Bergeys 1era ed: cinco grupos (tipos fisiolgicos)
Bergeys 2da ed: dos filos (2004)
Euryarchaeota: eurus amplio, archaios anciano
- Ampliamente distribudo.
- Metablicamente diverso.
Crenarchaeota: crene manantial o fuente, archaios.
-Ms termfilos o hipertermfilos.
-Ms acidfilos y sulfuro dependientes.
usan S como fuente de e- en algunos casos y
aceptor en otros.
-Ms anaerobios estrictos.
se piensa que se parecen a antecesores de
Arqueas.
Euryarchaeota
Ferroglobus
Aguas hidrotermales poco profundas alrededor de 80 C.
Reducen nitrato y oxidan hierro.
Pueden ser las responsables de la formacin de bandas de
hierro previamente atribuidas a cianobacteria.
Crenarchaeota
Korarchaeota
Nanoarchaeota
ms pequeo conocido.
3,000 Mb tiene el genoma humano.
No tiene genes para la biosntesis de lpidos,
cofactores, aminocidos, o nucletidos.
Metabolismo
Anaerbio facultativo, anaerobio obligado y aerobio
Modo de nutricin
Fuente de energa
Fuente de carbono
Fotoautotrfico
Luz
CO2
Quimioautotrfico
Compuestos
Inorgnico
CO2
Fotoheterotrfico
Luz
Quimioheterotrficos
Compuestos
Orgnicos
Compuestos
Orgnicos
Compuestos
Orgnicos
Enzimas
Ms estables.
Pocas diferencias entre protenas de hipertermfilos y
mesfilos.
Sustituciones de aminocidos en uno o muy pocos sitios
Permite el plegamiento de la protena en forma ms densa,
de manera estable.
Incremento del nmero de enlaces disulfuro , lo que incrementa
la estabilidad, resistencia a la desnaturalizacin.
Menos aminocidos glicina , lo que incrementa la flexibilidad y
disminuye la estabilidad.
Tambin son sintetizadas Chaperonas:
Protenas que ayudan en el plegamiento ms denso de otras
protenas.
Pueden volver a plegar a las protenas desnaturalizadas.
Otros factores intracelulares como coenzimas, sustratos,
estabilizadores en general como la termamina que ayuda a
resistir el desplegamiento.
Pocos plsmidos.
Methanococcus jannaschii:
Su genoma tiene ms de 50% de sus 1738 genes
diferentes que bacteria y eucariotes.
Histonas
Diagrama de las
relaciones
entre las de
transcripcin basal
y regulatorias e los
tres dominios de las
vida
Eucarya (E)
Archaea (A)
Bacteria (B)
The Last Common Ancestor
(LUCA)
Bell & Jackson, 2001
Curr Op in Microbiol 4:20813
The EmbdenMeyerhof (EM) pathway, or glycolysis, is the general route for glucose
degradation in all domains of life.
Some micro-organisms use an alternative pathway for glucose degradation, i.e. the
EntnerDoudoroff (ED) pathway.
In addition, some organisms are capable of alternative routes and bypasses in sugar
degradation, include the oxidative pentose phosphate (PP) pathway (also referred to
as the hexosemonophosphate pathway).
Established pathways for biosynthetic purposes include gluconeogenesis and the
nonoxidative PP pathway.
Abbreviated metabolites in (A)(C) are: GA, glyceraldehyde; Fructose 1,6P2, fructose
1,6-bisphosphate; PGP, 2,3-bisphosphoglycerate; 2PG, 2-phosphoglycerate; 3PG, 3phosphoglycerate; fdox, oxidized ferredoxin; fdred, reduced ferredoxin.
Key to enzymes: (1) GLK; (2) PGI; (3) PFK; (4) FBA; (5) TIM; (6) GAPDH; (7) PGK;
(6/7) GAPOR and GAPN; (8) PGM; (9) enolase; (10) PYK; (11) Glc DH/Glc-lac; glucose
dehydrogenase/gluconolactonase; (12) G-hydr, gluconate dehydratase; (13) KDG ald,
KDG aldolase; (14) Ald DH, glyceraldehyde dehydrogenase; (15) Gly kin, glycerate
kinase; (16) KDG kin, KDG kinase; (17) KDPG ald, KDPG aldolase; (18) G6P DH/6PGlac; glucose-6-phosphate dehydrogenase/6-phosphogluconolactonase; (19) GlcA-kin,
gluconate kinase; (20) PG-hydr, 6-phosphogluconate kinase; (21) PG DHDC, 6phosphogluconate dehydrogenase (decarboxylase); (22) RP epi, ribulose-5-phosphate
3-epimerase; (23) Tr.ketolase, transketolase; (24) PPS; (25) FBP.
2-keto-3-deoxy-gluconate kinase (KDGK), which catalyzes the phosphorylation of 2keto-3-deoxygluconate (KDG) to 2-keto-3-deoxy-6-phophogluconate (KDPG).
Taq polimerasa
Fue aislada a partir
de la bacteria
hipertermfila
Thermus aquaticus
Es muy estable a
altas temperaturas
Alcohol Deshidrogenasa
Bacteriorodopsina
Protena transmembranal de
Halobacterium salinarium,
funciona como una bomba
de protones dependiente de
luz.
Biorremediacin
Psicrfilos como
biorremediadores
-
El fn de la polucin?
CONCLUSIONES
Estos organismos:
Revelan mucho acerca de la historia y el origen
de la vida.
Poseen inmensas capacidades para sobrevivir en
condiciones extremas.
Proveen beneficios para el hombre y el medio
ambiente.
Posiblemente existen fuera de la tierra.
Preguntas?