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ESTs, Expressed Sequence Tags

"Secuencias que se expresan etiquetadas."


A partir de un gen se produce un transcrito que despus es procesado y al final resulta en un
mRNA maduro que codifica para la protena. En los proyectos de secuenciacin, al margen del
genoma, para llevar a cabo la anotacin es fundamental disponer de informacin adicional. En
este caso, los ESTs seran colecciones de cDNAs que se han secuenciados. No tiene porqu ser
en su totalidad sino al menos los extremos (los ESTs son secuencias parciales derivadas de la
secuenciacin de parte de un cDNA)
A partir de distintos tejidos, se aisla mRNA total y
se establecen libreras de cDNA, que despus son
secuenciadas obteniendo colecciones de EST, es
decir, genes que se expresan particularmente en
esos tejidos. Actualmente se puede secuenciar
masivamente la poblacin de RNA sin realizar
genotecas como tal. Por comparacin de la
secuencia del RNA y de secuencias del genoma a
anotar, pueden identificarse genes y asociarlo
con un determinado tejido, etc...
Combinando toda esta informacin, permite
anotar genes y en muchos casos identificarlos,
orientado a una posible funcionalidad.

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