Identificacin de

de Genes
Genes Anlogos
Anlogos de
de
Identificacin
Resistencia y
y QTLs
QTLs Asociados
Asociados con
con
Resistencia

Centro Internacional de Agricultura Tropical

International Center for Tropical Agriculture

Resistencia aa Enfermedades
Enfermedades de
de Yuca
Yuca
Resistencia
Llano GA
GA11,, Alvarez
Alvarez E
E11,, Loke
Loke JB
JB11,, Fregene
Fregene M
M11,, Muoz
Muoz JE
JE22
Llano
11Centro
Centro Internacional
Internacional de
de Agricultura
Agricultura Tropical
Tropical (CIAT),
(CIAT), Cali;
Cali;22Universidad
Universidad Nacional
Nacional de
de Colombia-Palmira
Colombia-Palmira

La pudricin de races causada por varias

especies de Phytophthora, y el Aublo Bacterial,
causado por Xanthomonas axonopodis pv.
manihotis (Xam), son dos enfermedades que
causan prdidas superiores a 80% de la
produccin de yuca (Manihot esculenta Crantz).
Los marcadores moleculares son una
herramienta importante para el mejoramiento de
la resistencia de yuca a estas enfermedades.

rGY156

rF19b
rS2

GLU

GY217
50

rNS74

rGY220

rNS260
rNS319
rNS217

rNS347

rSSRY319
100

rNS10

rGY176

50

CBB4

SSRY90

2= 7.3%

rSSRY19

Identificacin de QTLs. Se identificaron 15

QTLs asociados a la resistencia a P. tropicalis, 2
asociados a P. palmivora y 2 a P. melonis,
ubicados en diferentes grupos de ligamiento, que
explicaron hasta 11.0% de varianza fenotpica
(Tabla 1; Figura 1).

GY8

SSRY13

GY16
rNS92
SSRY23

50

SSRY4

K16d

rGY170
rGY104
GY12
rGY211
rSSRY32
SSRY17
SSRY63

100

NS189
100

NS995

GY137

Grupo de
ligamiento

Marcador

O1
O1
G1
H1
C1
E1
H1
J1
J1
N1
Q1
V1
V1

rP1a
SSRy 19
CPY 79
rGY 170
rGY 172
rNS 217
SSRy 178
CDY 76
K2a
SSRy 13
SSRy 911
NS 911
GY 153

P. palmivora
P. melonis
P. tropicalis

A2
D2
I2
I2
M2

N
1

Mapa de la madre;

rGY 32

% Varianza
fenotpica3
8.3
0.1
0.2
1.6
5.4
7.3
1.3
4.0
8.6
4.2
5.7
9.0
4.5
11.0

SSRy 313
SSRy 51

3.4
5.7

GY 88

3.3

SSRy 299
SSRy 105

3.4
4.8

Mapa del padre;

Varianza explicada.

Significancia (P)
< 0.0010
< 0.0050
< 0.0100
< 0.0500

No significativo

SSRY16
SSRY191
GY14

Efecto adicional del

padre

rGY3
rGY135

rAB9a

Figure 1.

2= 0.2%

2= 1.6%

Figura 1. Mapa de algunos QTLs identificados en

varios grupos de ligamiento y asociados con
resistencia de la familia K de yuca a P.tropicalis (44), P.
palmivora (P4) y P. melonis (P12).

Identificacin de RGAs. Mediante PCR se

obtuvieron 28 clones NBS y 2 Pto kinasa, de los
cuales 4 (N33, N37, N38 y K1) mostraron regiones
codificantes y secuencia homloga con genes NBSLRR (repeticiones ricas en leucina) de varios cultivos
por lo que se consideraron como RGAs. Los RGAs se
agruparon en tres clases (Figura 3). El clon N-37
tuvo homologa con los genes no TIR, RPS2
(Arabidopsis) y Mi (tomate), mientras que los clones
K-1 y N-38 mostraron homologa con los genes TIR
L6 (lino) y RPP5 (Arabidopsis). El clon N-33 fue
diferente a los dems (Figura 2). Los cebadores
especficos diseados N-37 y N-38, permitieron
separar individuos resistentes a Xam, mientras que
ninguno mostr asociacin con resistencia a
Phytophthora.
0.05

GR: gen de resistencia

RGA: gen anlogo de resistencia
NBSDH1 (RGA de soya)

48

N 37
83

98

AF402735 1 (NBS/LRR de cacao)

51

Mi (NBS/LRR, GR a Meloidogyne spp. en tomate)

RPS2 (GR a Pseudomonas syringae en Arabidopsis)
L6 (GR a Melampsora lini en lino)
100

N 38
K1

99
95

AF515627-1 (NBS/LRR de Malus domestica)

RPP5 (GR a Peronospora parasitica - Arabidopsis)
AF487946-1 (NBS/LRR/Toll Medicago sativa)

100
77

Especie

150

CPY79(15)

150

OJ1
SSRY2
NS340

rAM18

NS384

99

Tabla 1. QTLs que explican valores significativos

de varianza fenotpica para resistencia a tres
especies de Phytophthora.

P4

44

rSSRY3

P12

P12

P4

44

cM

rSSRY22

RESULTADOS

2= 8.3%

O
cM

MATERIALES Y METODOS

Identificacin de genes anlogos de resistencia

(RGA). Se amplificaron regiones conservadas de
ADN, mediante PCR con cebadores degenerados
NBS y Pto-kinasa, a partir de genotipos
resistentes a Xam y Phytophthora spp. Los
fragmentos secuenciados se homologaron con
genes de resistencia, mediante la herramienta
Blastx del GenBank. Se disearon cebadores
especficos con base en las secuencias de mayor
homologa, para amplificar regiones de ADN de
individuos resistentes y susceptibles.

P4

44

rHRGP
rGY118

50

Identificacin de QTLs. Se evalu la resistencia

de 126 individuos de la familia K de yuca,
inoculados en races con 3 especies de
Phytophthora. Con esta informacin y con el mapa
gentico de la misma familia (Fregene et al. 1997),
se identificaron QTLs asociados con la resistencia
a P. tropicalis, P. melonis y P. palmivora, por medio
del anlisis y mapeo con el programa Q-gene
3.06V (Nelson 1997). Se gener un mapa de QTLs
y se estim la varianza fenotpica explicada por
cada QTL, mediante el coeficiente de regresin (r2).

rP1a

P12

cM

P12

44

cM

P4

INTRODUCCION
INTRODUCCION

AF516642-1 (NBS/LRR de Malus prunifolia)

N 33

Figura 2. Arbol filogentico de RGAs (N-33, N-37, N38 y K-1) identificados en yuca, obtenido mediante
anlisis de parsimonia y bootstrap (5000 rplicas).
Se muestran secuencias homlogas reportadas en
GenBank y genes de resistencia de otras especies.

CONCLUSIONES
Existen varios QTLs, asociados con resistencia
a Phytophthora spp.
Se encontr asosciacin de 2 RGAs con resistencia
a Xam, mas no a Phytophthora spp. en yuca.

REFERENCIAS
Fregene M; Angel F; Gmez R; Rodrguez F; Chavarriaga P; Roca
W; Tohme J; Bonierbale M. 1997. A molecular genetic map of cassava
(Manihot esculenta Crantz). Theor Appl Genet 95(3):431441.
Nelson JC. 1997. Q-gene: software for marker-based genome
analysis and breeding. Mol Breed 3:229235.