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PROTEINAS COMO

CATALIZADORES

ENZIMAS
1Aminocidos y Protenas

ENZIMAS
son protenas que catalizan
reacciones qumicas en los seres vivos.
son catalizadores: sustancias que,
sin consumirse en una reaccin,
aumentan notablemente su velocidad.
No hacen factibles las reacciones
imposibles, sino que slamente
aceleran las que espontneamente
podran producirse.

Los enzimas son catalizadores


especficos: cada enzima cataliza un
solo tipo de reaccin, y casi siempre
acta sobre un nico sustrato o sobre
un grupo muy reducido de ellos.

ENZIMAS

En una reaccin catalizada por un enzima:


La sustancia sobre la que acta el enzima se llama
sustrato.
El sustrato se une a una regin concreta del enzima,
llamada centro activo.
3Aminocidos y Protenas

Una vez formados los productos la enzima puede


comenzar un nuevo ciclo de reaccin
Los factores que influyen de manera ms directa
sobre la actividad de un enzima son:
pH
Temperatura
Cofactores

Efecto del pH
Segn el pH del medio, los grupos R de las enz pueden

tener carga elctrica positiva, negativa o neutra.


Hay un pH en el cual la conformacin ser la ms
adecuada para la actividad cataltica. Este es el llamado
pH ptimo.

La mayora de los enzimas son

muy sensibles a los cambios de


pH. (amortiguadores fisiologicos)

Efecto de la T
los aumentos de
temperatura aceleran
las reacciones qumicas
La temperatura a la
cual la actividad
cataltica es mxima se llama
temperatura ptima

5Aminocidos y Protenas

Efecto de los cofactores

Casi un tercio de los enzimas conocidos requieren

cofactores para su funcin.


Los cofactores pueden ser iones inorgnicos como el
Fe++, Mg++, Mn++, Zn++ etc.
Cuando el cofactor es una molcula orgnica se
llama coenzima.

Muchos de estos coenzimas se sintetizan a partir de

vitaminas

Funcin de los Cofactores


Alterar la estructura tridimensional de la enzima
Intervenir como otro sustrato

7Aminocidos y Protenas

10Aminocidos y
Protenas

Coenzimas y sus vitaminas de procedencia


COENZIMA

VIT DE PROCEDENCIA

NAD (nicotinamida adenin


dinucleotido)
CoA

Vit B3 (ac. nicotinico)

FMN (flavin adenin


mononucleotido)

Vit B2 (riboflavina)

FAD (flavin adenin


dinucleotido)
TPP (tiamina pirofosfato)

Vit B2 (riboflavina)

Ac. Pantotenico

Vit B1 (tiamina)

9Aminocidos y Protenas

Clasificacin
En funcin de su accin cataltica
especfica, los enzimas se clasifican en 6
grandes grupos o clases:
Clase 1: OXIDORREDUCTASAS

Clase 2: TRANSFERASAS

Clase 3: HIDROLASAS

Clase 4: LIASAS

Clase 5: ISOMERASAS

Clase 6: LIGASAS

Clase 1:
OXIDORREDUCTASAS
Reacciones de oxidacin- reduccin .

Ejm: oxidasas

11Aminocidos y Protenas

Clase 2: TRANSFERASAS
Catalizan la transferencia de un grupo

qumico (distinto del hidrgeno) de un


sustrato a otro. Ejm: Quinasas

13Aminocidos y Protenas

Clase 3: HIDROLASAS
Catalizan las reacciones de hidrlisis:

(rupturas hidroliticas. Ejm proteinasas


lactosa + agua glucosa + galactosa

Clase 4: LIASAS
Formacin de dobles enlaces por

eliminacin de un grupo qq o adicin de


grupos a dobles enlaces. Ejem: aldehido
liasas

15Aminocidos y Protenas

Clase 5: ISOMERASAS
Catalizan la interconversin de ismeros:

rearreglos de tomos dentro de una


molcula. Son ejemplos la fosfotriosa
isomerasa y la fosfoglucosa isomerasa

Clase 6: LIGASAS

Reacciones en las que se unen dos molculas

Formacin de enlaces qq, utilizando ATP u


otros nucletidos como fuente de energa. Ejem:
polimerasas

17Aminocidos y Protenas

Nomenclatura
Nombres particulares
Cuando la accin tpica del enzima es la hidrlisis del
sustrato, el
segundo componente del nombre se
omite, por ejemplo: lactasa.
Nombre sistemtico:

Consta actualmente de 3 partes:


el sustrato preferente
el tipo de reaccin realizado
terminacin "asa
Ejm: glucosa fosfato isomerasa
-

Nomenclatura
Cdigo de la comisin enzimtica:
El nombre de cada enzima puede ser identificado por
un cdigo numrico, encabezado por las letras EC
(enzyme commission), seguidas de 4 nmeros
separados por puntos. El 1 nmero indica a cual de
las seis clases pertenece el enzima, el 2 se refiere a
19Aminocidos y Protenas

distintas subclases dentro de cada grupo, el 3 y el 4


se refieren a los grupos qumicos especficos que
intervienen en la reaccin.

. Ejem:

Regulacin de la actividad enzimtica

Homeostasis: eq dinmico del


medio interno.
1. Modificacin de la [S]
2. Modificacin de la [E]
3. Adicion covalente
4. Regulacin alosterica
5. Activacin por proteolisis (zimgeno)
6. Cambios en el pH
7. Cambios en la temperatura
21Aminocidos y Protenas

Modificacin de la
[S]
Es la menos compleja.
Ocurre al o la [S]
Bajas [S] es indicador de

disminucin de la actividad enzimtica


Fig sup: velocidad de rx enzimatica a 6

diferentes [S]

Modificacin de la [E]
Es mas compleja: requiere la sntesis de novo de

enzimas
(induccin enzimtica)
La sntesis proteica requiere tiempo y mucha energa
Cuando la [S] aumenta por encima de ciertos valores
y si aparecen nuevos sustratos (antes ausentes) se
deben sintetizar nuevas enzimas.
La induccin enzimtica es estimulada por hormonas
(larga duracin)
Represin enzimtica: disminucin de la sntesis de
enzimas
** de acuerdo a las necesidades celulares
23Aminocidos y Protenas

Regulacin enzimtica
Mantenimiento de un estado

ordenado
Conservacin de energa
Respuesta a las variaciones

ambientales

El control se realiza por:


Control gentico
24Aminocidos y Protenas

Modificacin covalente
Regulacin alostrica
Activacin de zimgenos

Control gentico

Induccin enzimtica

Represin enzimtica

25Aminocidos y Protenas

INHIBICIN ENZIMATICA
Medio importante para regular las rutas
metablicas

Tx clnicos se fundamentan en la
inhibicin enzimtica

Permite disear tcnicas bioqumicas

Adicin covalente
la actividad enz puede o por a adicin covalente

de un grupo qumico a la enzima

26Aminocidos y Protenas

Es transitoria y reversible
Con mayor frecuencia: g. fosfatos, g. metilo y la

adenosina
Adicin o remocin de g. qq funcionan como mxs de
control

Elementos de la Enzima no fosforilada es Enzima fosforilada es


reaccin inactiva activa

Regulacin alosterica
27Aminocidos y Protenas

Las

enz reguladas por


alosterismo existen en
dos estados:
T o tenso
L o laxo
Hay 2 tipos de
reguladores alostericos:
Efectores o activadores
alostericos
Inhibidores alostericos
Ciertas sust se unen en
sitios diferentes del sitio
activo
(sitio alosterico)
28Aminocidos y Protenas

Ejm: ATP, NADH, citrato, etc.

Clases de inhibidores
Inhibicin reversible:

Competitivos
Acompetitivos
No competitivos
Inhibicin Irreversible: venenos

enzimticos

29Aminocidos y Protenas

Inhibidores competitivos

Se unen de forma reversible a la enzima libre para formar

complejo EI
El S y el I compiten por el mismo lugar en la enzima

La actividad de la enzima

El efecto puede invertirse: la [ S ]

Reducen la afinidad de la enzima por el S

Tienen una estructura semejante al S

30Aminocidos y Protenas

30Aminocidos y
Protenas

Inhibidores competitivo
Succinato deshidrogenasa

31Aminocidos y Protenas

Inhibidores acompetitivos

Se unen al complejo ES
32Aminocidos y Protenas

La adicin de mas S a la rx= a la velocidad de rx

Se observa en las rxs en las que se unen mas de un

sustrato

32Aminocidos y
Protenas
33Aminocidos y Protenas

Inhibidores No
competitivos

Se unen tanto a la E como al complejo ES

Se unen a un sitio diferente del lugar activo de


la E

Modificacin de la conformacin de la E (impide


la formacin del producto)

No afectan a la unin del sustrato

Se invierte parcialmente= la [ S ]

34Aminocidos y Protenas

Inhibicin no competitiva

35Aminocidos y Protenas

34Aminocidos y Protenas

36Aminocidos y Protenas

Inhibicin irreversible
Se unen covalentemente a la

enzima
Inhibicin con metales
pesados como Hg y Pb
Anemia por envenenamiento
por Pb: unin del Pb a los
grupos SH de la
ferroquelatasa (insercin de
Fe+2 en el hemo)

35Aminocidos y
Protenas

Inhibicin irreversible

36Aminocidos y Protenas

Modo de accin de las enzimas:


conceptos importantes
Energa libre de Gibbs (G): cantidad de
energia capaz de realizar un trabajo durante
una reaccion a T` y P` cte.

Energa de activacin (Ea): barrera


energtica por encima de la cual una
molcula de un producto intermedio debe
pasar para que se lleve a cabo una reaccin.
Estado de transicin: es un estado que
posee mayor cantidad de E libre que los
reactantes y que los productos.

Perfil energtico de una reaccin


espontnea

Perfil energtico de una reaccin


catalizada

La accion de los catalizadores consiste en disminuir la Ea

Las enzimas disminuyen la Ea aun mas que los catalizadores inorganicos.

El aumento en la velocidad de rx se debe a que las enzimas favorecen la


interaccion de los reactantes

Para que una reaccin qumica tenga lugar, las molculas de los
reactantes deben chocar con una energa y una orientacin adecuadas

La actuacin de la enzima permite:

1. que los sustratos se unan a su centro activo con una orientacin ptima
para que la reaccin se produzca.
2. modifica las propiedades qumicas del sustrato unido a su centro activo,
debilitando los enlaces existentes y facilitando la formacin de otros
nuevos

Sitio o centro activo de una


enzima
Lugar de la estructura proteica donde se da la
interaccion con el sustrato (3 lugares).
Es una estructura dinamica y transitoria.
Hay dos modelos sobre la forma en que el sustrato
se une al centro activo de la enzima:

Modelo llave cerradura


Modelo del ajuste inducido

Modelo llave cerradura


Propuesto por el bioqq
alemn E. Fisher 1884

Plantea una interaccin


relativamente rgida entre los 2
componentes.

La enzima permanece sin


transformaciones estructurales
ni funcionales

Supone que la estructura del sustrato y la del sitio


activo son complementarias

Modelo del ajuste inducido


Propuesto por D. Koschland en 1958
La enzima sufre un cambio conformacional (al interactuar con

el S) que permite una relacin mas


estrecha entre ambos
Es el mas aceptado actualmente
Cuando se logra la interaccin E-S en
por lo menos 3 puntos se ve favorecida
la rx
La E y el S sufren cambios conformacionales
Al final de la rx la E recupera su estructura original

Cintica enzimtica

Cinetica enzimatica
Estudio cuantitativo de la

catlisis enzimtica parte de la


bioqq que se encarga de
estudiar las velocidades de rx
de las enzimas y como estas se
modifican al variar ciertas
condiciones

Velocidad de reaccin: cambio

en la concentracin de sustratos
o productos por unidad de
tiempo.
Cintica enzimtica
Los principios generales de las reacciones
qumicas se aplican tambin a las reacciones
enzimticas
En una reaccin de orden cero, la velocidad
de formacin del producto es independiente de
la concentracin de sustrato.

En una reaccin de primer orden la velocidad


de formacin de los productos es directamente
proporcional a la concentracin del sustrato.
Una reaccin de segundo orden es aquella
en la que la velocidad de formacin del producto
depende:
1. de la concentracin de dos sustratos (como
en una reaccin de condensacin)
2. del cuadrado de la concentracin de un nico
sustrato (reaccin de dimerizacin)

Cinetica enzimatica
Las enzimas son catalizadores
biolgicos , Cintica enzimtica:.

Teora general de la accin


enzimtica: la E se combina con su S para
formar el complejo E-S (unin reversible)
luego este se rompe: por un lado se libera
la E y por el otro se origina el Producto

Factorlimitante

Enzimas alostricas
Son protenas con varias subunidades
Su actividad es afectada por molculas efectoras que se unen

a otros lugares alostricos o reguladores

Catalizan pasos reguladores claves de las rutas bioqumicas


Representacin de la velocidad de rx son sigmoideas

46 Aminocidos y Protenas

Catlisis
Efectos de
proximidad y
tensin

Efectos
electrostticos

Catlisis
acidobsica

Catlisis
covalente

La actividad
optima de la
enzima depende
de:

Temperatura

pH

Presencia de
cofactores

[S]

[E]

47Aminocidos y Protenas

Tarea:
Sistema buffer bicarbonato en la
respiracion y torrente sanguineo

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