Bioqumica - fisiologa parcial 1

1 CAPITULO MCKEE: introduccin

VIDA
Vida.- Movimiento, reproduccin, adaptacin a los estmulos externos.
Es:
1.- compleja: SV principalmente por C.
2.-jerarquizacion: partculas
subatmicasatomosbiomoleculasmacromoleculas.
Ejm: nucletidosacido nucleico
Aminocidoproteina
Azcarpolisacarido
Estructuras supramolecularescelula //
tejidoorganoss.organico

Propiedades emergentes: que se dan en conjunto

Homeostasis: capacidad de mantener los procesos
metablicos sin la variabilidad de su ambiente.
Es clulas:

3.- requiere de informacin

4.-adapta y evolucin

BIOMOLECULAS.

S.V formados por biomolculas orgnicas e inorgnicas.

inorganicas
o Agua50% al 95% del peso de una celula
o Na, k, mg, ca 1% de celula
Organicas.
o C, H,O, N, P, S.
o Elementos ms comunes comparten enlaces covalentes:
comparten
Carbono comparte posiblemente 4 sitios de
enlaces molecualas grandes y estables.

Mas simples: hidrocarburos (C, H) (hidrfobas)

Caracterstica por el grupo funcional (hidroxilo) (-OH)
o Metano-metanol (CH4) (CH3Oh)
Con peso molecular bajo la mayora que esta presente en al
celula de 10 mil daltons = 1/12 de la masa atmica de un C12
4 grupos principales: Aminoacidos, acidos grasos, nucletidos y
azucares
DESCRIPCION DE C/1
AMINOCIDOS, PROTEINAS:
o Aminocidos: grupo amino y carboxilo
Hay alfa, beta y gamma
Alfa.- grupo amino en el 1 de C
Beta.-2: B-alanina (Vit. Acido pantotnico, vit,
acido g butrico [gaba])
gamma.- 3
o Grupo R: caracterstica del aminocido
o Estructura :

o 20 aminocidos estndar alfa

Glicina y glutamina.- neurotransmisores
o Aminocidos no estndares que son productos de otros
Aminocidospolipeptidos
o Pptido: - de 50
o Proteinas: ms largas.
De transporte, estructurales, enzimas
Aminocidos estn unidos por el enlace peptdico: enlace
amida en una clase de reaccin sustitucin nucleofila con
participacin de un grupo carbonilo y un grupo carboxilo
y amino de los aminocidos con un carcter parcial de 2
enlace HN-CO la disposicin le da un carcter estable
El carbono Alfa le aporta flexibilidad debido a la rotacin libre
de los enlaces

AZUCARES E HIDRATOS DE CARBONO

Grupos funcionales: alcohol y aldehdo

Numero de C o al grupo que posean (aldosa/cetona)

o Ej. Glucosa- aldohexosa

Fructosa-cetohexosa
ACIDOS GRASOS

cidos monocarboxilicos (par de atomos carbono)

Con formula qumica R-COOH.
o R: grupo alquilo. Con C e H
Los cidos grasos saturados (sin enlaces doble carbono)
cidos grasos insaturados (con 2 enlace C)
A veces R-COOH~ (ionizado) sin embargo aunque atraen h2o no
se mezcla por las cadenas largas de HC apolares.
Raramente independientes. En clases de lpidos (miscibles en
disolventes organicos)
o Triacilgliceroles: (grasas y aceites) esteres con glicerol
(alcoho con 3 C+3 grupos hidroxilos) + 3 acidos grasos.
o Fosfogliceroles: 2 acidos grasos + glicerol (con un grupo
de hidroxilo fosfatado que se une a pequeas molculas)
importantes en la membrana celular

NUCLEOTIDOS Y AC. NUCLEICOS

Cont:
o Azcar
de 5 C (ribosa o desoxirribosa)
o Base nitrogenada
o 1 o + grupos fosfatos
Base anillos aromaticosheterociclicos 2 clases
o Purinas biciclicas (A Y G)
o Pirimidinas monociclicas (C, T, U)
Enlace fosfato de alta energa (Atp)

cidos nucleicos
Conformado por nucletidos.
Enlazados mediante enlaces fosfodiesteres
2 clases DNA y RNA

DNA:
Almacn de info gentica
2 cadenas polinucleotidicas antiparalelas que se enrollan entre
si2 helice dextrogira
Bases purinas, pirimidinas + fosfato unidas x enlaces de
hidrogeno:
H+ y O2 N

Secuencia de bases forman seales no

codificantes(reguladoras) y codificantes (genes) especifican
la estructura de pptidos y molculas de RNA

RNA
Polinucleotido con un azcar (ribosa) y en vez de timina
(uracilo).
Los nucletidos estn unidos por enlaces fosfodiesteres
En vez de una doble hlice tiene una cadena sencilla.
Pliegua en estrucutras 3D
Las molculas se sintetizan transcripcin.
3 tipos principales:
o mRNAmensajero
o rRNAribosomas
o tRNAtranferasa
otros que no producen proteinas: RNA no codificador
o siRNA de interferente pequeo - interferencia antiviral
o miRNA micro RNA- sincronizan la sntesis de RNA
o snRNARNA nuclear pequeo - mRNA en funcional
o snoRNARNA nucleolar pequeo - maduracin del RNA
EXPRESION GENICA
cuando y como se accede a la informacin codificada en un gen
#1 transcripcin ante un estimulo

TRMINOS TILES

Autopoyesis: entidad autnoma, auto organizada y

autosustentable.
Hidrolisis: sustitucin nucleofila (se cambia un tomo o grupo
por otro) el h2o es el nucleofilo (amante del nucleo anion) y el
electrfilo (amante de electrones positivo o neutros ) es el C de
grupo carbonilo , anhdrido, ester, amida, etc.
Reacciones de sustitucin nucleofilica.
Reacciones de eliminacin: se forman 2 enlace al eliminar
tomos de una molcula.
Reacciones de adicin: se combinan 2 molculas. (*hidratacin
muy comn)

Recciones de isomerizacin: cambios intramoleculares

(aldosa->cetosa)

Redacciones oxido reduccin: oxidante: acepta (reduce) reductor:

dona (oxida)

ENERGIA
Capacidad para mover materia, realizar un trabajo.

La clulas obtienen la energa de reaciones redox, ganando o

donando tomos de hidrogeno(+) e iones de hidruro (-)
Cuanto ms reducida este una molcula ms H+ tenga
mas tiene.
Ej. cidos grasos > azucares.
Cuando se oxidan los A.grasos y azucares, incorporan H+ a
FAD Y NAD FADH y NADH que son coenzimas transportadores
de grupos moleculares.
siempre que se transfiere un electrn se libera energia
Hay auttrofos, hetertrofos, fotoautotrofos, quimioautotrofos,
quimioheterotrofos, fotoheterotrofos.
Fuente principal es el sol
GENERALIDADES DEL METABOLISMO

Reacciones catalizadas por un ser vivo vas metablicas

Una molcula se trasforma en un producto para un fin
especfico.
Ej. La glucolisis 10 reacciones qumicas .
3 clases de rutas bioqumicas:
o Las metablicas: catabolismo y anabolismo (en
simbiosis)
o Transferencia de energa: captura y conversin de la
para su utilizacin (adsorcin de la lumnica).
o Transduccin de seales: permiten a las clulas recibir
informacin de su entorno y responder a ellas. Recepcin,
transduccin y respuesta

ORDEN BIOLOGICO
4 procesos vitales:
1. Sntesis de biomolculas.
2. Transporte a travs de la membrana celular

3. Movimiento celular.
4. Eliminacin de residuos. co2, h2o, urea. Y utilizacin de
vacuolas.

BIOLOGIA DE SISTEMAS
Organismos vivos como sistemas integrados.

Evolucin respuesta de las poblaciones biolgicas a las

presiones de la seleccin natural genera diversidad gentica.
3 principios centrales:
o 1) emergencia: no siempre es posible comprender a
partir de conocimientos muy pequeos- ej. Fe+ y
hemoglobina
o 2)robustez:
estabilidad mediante la degeneracin (trabajo de
otro por otro).
Mediante mecanismos tambin de control
retroalimentacin
Fragilidad
o 3) modularidad: composicin de modulos

CAPTULO 2: las clulas vivas, mckee

CONCEPTOS CLAVES.
AGUA.

Indispensable.
Interactua con muchas sustancias
Comportamiento de sustancias:
o Hidrfilas
o Hidrfobas

*vase cap.3
MEMBRANAS BIOLOGICAS

Estructuras laminares, flexibles, finas.

Rodean a una clula y sus orgnulos
Funcin: barrera fsica selectiva.
Membranas con una bicapa lipdica con cola y cabeza.
Tambin cont proteinas:
o Integrales.
o Perifricas
o Transportadoras
o Canales
o Receptores

AUTOENSAMBLAJE.

Partes funcionales son estructuras supramoleculares

Complejos destacados. Ej. Ribosomas, sarcmeros, proteosomas

Muchas molculas que forman macromolculas se juntan

espontneamente por la informacin esterica que se requiere.

TRANSDUCCION DE SEALES
1) Recepcin.
2) Transduccin
3) Seal

CAPITULO 3: el agua la matriz de la vida Mckee.

ESTRUCTURA
antes TEORIA ATOMICA Y MOLECULAR

La materia est compuesta de unidades discretas llamadas

tomos (indivisible)
o Conglomerados de partculas subatmicas (P, N, )
Para dalton hay partculas simples (1) compuestas (diferentes
atomos)
Postulados:
o 1) todos los elementos qumicos constituidos por partculas invisibles e
indivisibles llamadas tomos.
o 2) los tomos de un mismo elemento son idnticos en todas sus
propiedades, especialmente en tamao y peso (masa).
o 3) Los tomos de elementos diferentes son totalmente diferentes en
todas sus propiedades.
o 4) Durante las reacciones, se reordenan los tomos, sin que el tomo
se divida o destruya. La molcula resultante es la superposicin de
tomos de elementos diferentes.
o 5. Los tomos de dos elementos pueden combinarse en ms de una
relacin entera y sencilla para formar ms de un compuesto.

Conceptos:

Masa Atmica: El cociente entre la masa de un tomo y la 1/12

parte de la masa de un tomo de carbono 12
Nmero de Avogadro: Cantidad de tomos que hay en 12
gramos del istopo de carbono-12 6,022 x 1023 (602.200 trillones)
Mol: Cantidad de una sustancia que contiene tantas entidades
elementales (tomos, molculas, iones u otras partculas) como
tomos hay en exactamente 12 g de istopo de carbono-12 (6,022
x 1023 tomos)

*Istopo: los tomos de un mismo elemento, cuyos ncleos tienen una

cantidad diferente de neutrones, y por lo tanto, difieren en nmero
msico.

LOS ENLACES QUMICOS

Las prdidas, las ganancias y el compartir electrones tienen como
resultado fuerzas qumica enlaces qumicos.
IONICO: M (pierda + )+ NM (gane )La diferencia entre las
cargas de los iones provoca entonces una fuerza de interaccin
elctrica entre los tomos que los mantiene unidos
COVALENTE: entre carga pero mas ligero
*Electronegatividad: fuerza con que un tomo en una molcula
atrae los electrones en un enlace qumico. El elemento ms
electronegativo es el Flor (4)
*Polaridad: Desplazamiento de la nube de electrones hacia uno
de los tomos del enlace (ms electronegativo).
~H2 es enlace covalente no polar. Los dos tomos son iguales,
tienen una atraccin igual.
o Un enlace polar se forma cuando los electrones son
desigualmente compartidos entre dos tomos.
o Los enlaces polares covalentes ocurren porque un tomo
tiene una mayor afinidad hacia los electrones que el otro (no
tanta para formar un in). Enlace H- O2.

Fuerzas de Van der Waals y Puentes de Hidrgeno: no

involucran la prdida o ganancia de .
o Son interacciones ms dbiles que los inicos.
o Fuerzas de Van der Waals. Las nubes no estn
distribuidas uniformemente ya que estn en continuo
movimiento. Un lado de la molcula puede por casualidad,
tener un ligero exceso de electrones en relacin con el lado
opuesto, por lo cual tendr ms cargas negativas. Cuando
esto ocurre, se dice que la molcula posee un momento
dipolar. La regin - puede interaccionar con la regin + de
otra molcula.

Tambin la existencia de un dipolo en una molcula,

puede provocar que otra molcula cercana adopte
temporalmente un dipolo opuesto (dipolo inducido),
y se atraen.
o Puentes de Hidrgeno: Interaccin elctrica entre un H
unido a un elemento fuertemente electronegativo, como el
F, el N y el O,

LOS COMPUESTOS ORGNICOS

El carbono es el elemento principal de los compuestos orgnicos.

Estos compuestos unidos x enlaces covalentes son el principal
componente estructural de clulas y tejidos.
Un tomo de C tiene de 6 , 2 en el primer nivel de energa y 4 en
el 2.
o Puede formar 4 enlaces covalentes con otros tomos de
manera de completarla con 8 electrones.
o Tambin pueden compartir dos pares de electrones,
formando enlaces dobles (- C = C -). En algunos compuestos
se pueden formar triples enlaces ( C C ). Las cadenas de
carbono pueden ser ramificadas o no ramificadas. Los
tomos de carbono tambin pueden formar estructuras
cclicas. El tomo de carbono puede unirse con ms
elementos distintos que cualquier otro tomo. El hidrgeno,
el oxgeno y el nitrgeno son los tomos que con mayor
frecuencia se unen a l.