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BIODIVERSIDAD DE MICROORGANISMOS BENFICOS EN SISTEMAS

AGROECOLGICOS

Morfologa bacteriana:Las bacterias presentan una amplia variedad de tamaos y


formas. La mayora presentan un tamao diez veces menor que el de las clulas eucariotas, es
decir, entre 0,5 y 5 m. Sin embargo, algunas especies como Thiomargarita namibiensis y
Epulopiscium fishelsoni llegan a alcanzar los 0,5 mm, lo cual las hace visibles al ojo desnudo.44 En
el otro extremo se encuentran bacterias ms pequeas conocidas, entre las que cabe destacar las
pertenecientes al gnero Mycoplasma, las cuales llegan a medir solo 0,3 m, es decir, tan
pequeas como los virus ms grandes.45La forma de las bacterias es muy variada y, a menudo,
una misma especie adopta distintos tipos morfolgicos, lo que se conoce como pleomorfismo. De
todas formas, podemos distinguir tres tipos fundamentales de bacterias:
Coco (del griego kkkos, grano): de forma esfrica
Diplococo: cocos en grupos de dos.
Tetracoco: cocos en grupos de cuatro.
Estreptococo: cocos en cadenas.
Estafilococo: cocos en agrupaciones irregulares o en racimo.
Bacilo (del latn baculus, varilla): en forma de bastoncillo.
Formas helicoidales:
Vibrio: ligeramente curvados y en forma de coma, juda o cacahuete.
Espirilo: en forma helicoidal rgida o en forma de tirabuzn.
Espiroqueta: en forma de tirabuzn (helicoidal flexible).
Algunas especies presentan incluso formas tetradricas o cbicas.46 Esta amplia variedad
de formas es determinada en ltima instancia por la composicin de la pared celular y el
citoesqueleto, siendo de vital importancia, ya que puede influir en la capacidad de la bacteria para
adquirir nutrientes, unirse a superficies o moverse en presencia de estmulos.47 48
A continuacin se citan diferentes especies con diversos patrones de asociacin:
Neisseria gonorrhoeae en forma diploide (por pares).
Streptococcus en forma de cadenas.
Staphylococcus en forma de racimos.
Actinobacteria en forma de filamentos. Dichos filamentos suelen rodearse de una vaina que
contiene multitud de clulas individuales, pudiendo llegar a ramificarse, como el gnero Nocardia,
adquiriendo as el aspecto del micelio de un hongo.49
Rango de tamaos que presentan las clulas procariotas en relacin a otros organismos y
biomolculas.
Las bacterias presentan la capacidad de anclarse a determinadas superficies y formar un agregado
celular en forma de capa denominado biopelcula o biofilme, los cuales pueden tener un grosor
que va desde unos pocos micrmetros hasta medio metro. Estas biopelculas pueden congregar
diversas especies bacterianas, adems de protistas y arqueas, y se caracterizan por formar un
conglomerado de clulas y componentes extracelulares, alcanzando as un nivel mayor de
organizacin o estructura secundaria denominada microcolonia, a travs de la cual existen
multitud de canales que facilitan la difusin de nutrientes.50 51 En ambientes naturales tales
como el suelo o la superficie de las plantas, la mayor parte de las bacterias se encuentran ancladas

a las superficies en forma de biopelculas.52 Dichas biopelculas deben ser tenidas en cuenta en las
infecciones bacterianas crnicas y en los implantes mdicos, ya que las bacterias que forman estas
estructuras son mucho ms difciles de erradicar que las bacterias individuales.53
Por ltimo, cabe destacar un tipo de morfologa ms compleja an, observable en algunos
microorganismos del grupo de las mixobacterias. Cuando estas bacterias se encuentran en un
medio escaso en aminocidos son capaces de detectar a las clulas de alrededor, en un proceso
conocido como percepcin de qurum, en el cual todas las clulas migran hacia las dems y se
agregan, dando lugar a cuerpos fructferos que pueden alcanzar los 0,5 mm de longitud y contener
unas 100.000 clulas.54 Una vez formada dicha estructura las bacterias son capaces de llevar a
cabo diferentes funciones, es decir, se diferencian, alcanzando as un cierto nivel de organizacin
pluricelular. Por ejemplo, entre una y diez clulas migran a la parte superior del cuerpo fructfero
y, una vez all, se diferencian para dar lugar a un tipo de clulas latentes denominadas mixosporas,
las cuales son ms resistentes a la desecacin y, en general, a condiciones ambientales
adversas.55

Las Actinobacterias o actinomicetos son un grupo de bacterias Gram positivas. La


mayora de ellas se encuentran en la tierra, e incluyen algunas de las ms tpicas formas de vida
terrestre, jugando un importante rol en la descomposicin de materia orgnica, tales como la
celulosa y quitina. Estas bacterias renuevan las reservas de nutrientes en la tierra y son
fundamentales en la formacin de humus. La adaptacin al hbitat terrestre es muy antigua, en el
suelo son los seres ms abundantes, promediando un 64% de la biomasa bacteriana.1
Otras Actinobacterias habitan en las plantas y animales, incluyendo algunos patgenos, tales como
las Mycobacterium.
Algunas actinobacterias forman filamentos ramificados que se asemejan en cierta forma a los
micelios de los no relacionados fungi, entre los cuales fueron clasificados originalmente con el
antiguo nombre de Actinomycetes. La mayora son aerobias, pero algunas, tales como
Actinomyces israelii, pueden crecer bajo condiciones anaerobias. Al contrario que Firmicutes, el
otro grupo principal de bacterias Gram positivas, tienen GC alto y las especies de algunos
Actinomycetes producen esporas externas.
Muchas actinobacterias se destacan por su capacidad para producir compuestos que tienen
caractersticas tiles en farmacologa. En 1940 Selman Waksman descubri en el suelo las
bacterias que producen actinomicina, un descubrimiento que le vali el premio Nobel. Se han
descubierto desde entonces centenares de antibiticos naturales en estos microorganismos
terrestres, especialmente en el gnero Streptomyces.
Representantes de este grupo:
Actinomyces
Arthrobacter
Corynebacterium
Frankia
Micrococcus
Micromonospora
Mycobacterium
Nocardia
Propionibacterium
Streptomyces

Filogenia:Actinobacteria podra estar relacionado con otros filos monodrmicos como


Firmicutes y Chloroflexi, adems parece haber cercana con Cyanobacteria y DeinococcusThermus. Sin embargo, los rboles filogenticos no son concluyentes.

Segn el anlisis filogentico de genes codificadores de protenas,2 los subgrupos se relacionan del
siguiente modo:
Actinobacteria
Rubrobacteridae,Coriobacteridae, Acidimicrobidae,Nitriliruptoridae, Actinobacteridae
Actinomycetales, Bifidobacteriales
Por otro lado, el anlisis filogentico del ARNr 16S presenta similares resultados, pero mostrando a
Rubrobacteridae y Actinomycetales como grupos parafilticos.3
Antes del desarrollo de los anlisis moleculares de ARN y su aplicacin en la dilucidacin de la
filogenia del grupo, los taxnomos clasificaban a los hongos en el grupo de las plantas debido a la
semejanza entre sus formas de vida (fundamentalmente, la ausencia de locomocin y una
morfologa y ecologa similares). Como ellas, los hongos crecen en el suelo y, en el caso de las
setas, forman cuerpos fructferos que en algunos casos guardan parecido con ejemplares de
plantas, como los musgos. No obstante, los estudios filogenticos indicaron que forman parte de
un reino separado del de los animales y plantas, de los cuales se separ hace aproximadamente
mil millones de aos.6 7
Algunas de las caractersticas morfolgicas, bioqumicas y genticas de los hongos son comunes a
otros organismos; no obstante, otras son exclusivas, lo que permite su separacin de otros seres
vivos.
Como otros eucariotas, los hongos poseen clulas delimitadas por una membrana plasmtica rica
en esteroles y que contienen un ncleo que alberga el material gentico en forma de
cromosomas. Este material gentico contiene genes y otros elementos codificantes as como
elementos no codificantes, como los intrones. Poseen orgnulos celulares, como las mitocondrias
y los ribosomas de tipo 80S. Como compuestos de reserva y glcidos solubles poseen polialcoholes
(p.e. el manitol), disacridos (como la trehalosa) y polisacridos (como el glucgeno, que, adems,
se encuentra presente en animales). Al igual que los animales, los hongos carecen de cloroplastos.
Esto se debe a su carcter heterotrfico, que exige que obtengan como fuente de carbono,
energa y poder reductor compuestos orgnicos.
A semejanza de las plantas, los hongos poseen pared celular8 y vacuolas.9 Se reproducen de
forma sexual y asexual, y, como los helechos y musgos, producen esporas. Debido a su ciclo vital,
poseen ncleos haploides habitualmente, al igual que los musgos y las algas.10
Los hongos guardan parecido con euglenoides y bacterias. Todos ellos producen el aminocido Llisina mediante la va de biosntesis del cido alfa-aminoadpico.11 12
Las clulas de los hongos suelen poseer un aspecto filamentoso, siendo tubulares y alargadas. En
su interior, es comn que se encuentren varios ncleos; en sus extremos, zonas de crecimiento, se
da una agregacin de vesculas que contienen protenas, lpidos y molculas orgnicas llamadas
Spitzenkrper.13 Hongos y oomicetos poseen un tipo de crecimiento basado en hifas.14 Este
hecho es distintivo porque otros organismos filamentosos, las algas verdes, forman cadenas de
clulas uninucleadas mediante procesos de divisin celular continuados.15
Al igual que otras especies de bacterias, animales y plantas, ms de sesenta especies de hongos
son bioluminiscentes (es decir, que producen luz).16
Omphalotus nidiformis, un hongo bioluminiscente.
Caractersticas diferenciales
Las levaduras, un grupo de hongos, presentan al menos una fase de su ciclo vital en forma
unicelular; durante sta, se reproducen por gemacin o biparticin. Se denominan hongos
dimrficos a las especies que alternan una fase unicelular (de levadura) con otra miceliar (con
hifas)17
La pared celular de los hongos se compone de glucanos y quitina; los primeros se presentan
tambin en plantas, y los segundos, en el exoesqueleto de artrpodos;18 19 esta combinacin es

nica. Adems, y a diferencia de las plantas y oomicetos, las paredes celulares de los hongos
carecen de celulosa.20
La mayora de los hongos carecen de un sistema eficiente de transporte a distancia de sustancias
(estructuras que en plantas conforman el xilema y floema). Algunas especies, como Armillaria,
desarrollan rizomorfos,21 estructuras que guardan una relacin funcional con las races de las
plantas.
En cuanto a rutas metablicas, los hongos poseen algunas vas biosintticas comunes a las plantas,
como la ruta de sntesis de terpenos a travs del cido mevalnico y el pirofosfato.22 No obstante,
las plantas poseen una segunda va metablica para la produccin de estos isoprenoides que no se
presenta en los hongos.23 Los metabolitos secundarios de los hongos son idnticos o muy
semejantes a los vegetales.22 La secuencia de aminocidos de los pptidos que conforman las
enzimas involucradas en estas rutas biosintticas difieren no obstante de las de las plantas,
sugiriendo un origen y evolucin distintos.22 24
Carecen de fases mviles, tales como formas flageladas, con la excepcin de los gametos
masculinos y las esporas de algunas formas filogenticamente primitivas (los Chytridiomycota).
No poseen plasmodesmos.
La mayora de los hongos crecen como hifas, estructuras cilndricas y filiformes de 2 a 10
micrmetros de dimetro y hasta varios centmetros de longitud. Las hifas crecen en sus pices;
las hifas nuevas se forman tpicamente por la aparicin de nuevos pices a lo largo de hifas
preexistentes por un proceso llamado de ramificacin, o en ocasiones el extremo apical de las
hifas se bifurca, dando lugar a dos hifas con crecimiento paralelo.

Caractersticas de los hongos :


Antes del desarrollo de los anlisis moleculares de ARN y su aplicacin en la dilucidacin de la
filogenia del grupo, los taxnomos clasificaban a los hongos en el grupo de las plantas debido a la
semejanza entre sus formas de vida (fundamentalmente, la ausencia de locomocin y una
morfologa y ecologa similares). Como ellas, los hongos crecen en el suelo y, en el caso de las
setas, forman cuerpos fructferos que en algunos casos guardan parecido con ejemplares de
plantas, como los musgos. No obstante, los estudios filogenticos indicaron que forman parte de
un reino separado del de los animales y plantas, de los cuales se separ hace aproximadamente
mil millones de aos.6 7
Algunas de las caractersticas morfolgicas, bioqumicas y genticas de los hongos son comunes a
otros organismos; no obstante, otras son exclusivas, lo que permite su separacin de otros seres
vivos.
Como otros eucariotas, los hongos poseen clulas delimitadas por una membrana plasmtica rica
en esteroles y que contienen un ncleo que alberga el material gentico en forma de
cromosomas. Este material gentico contiene genes y otros elementos codificantes as como
elementos no codificantes, como los intrones. Poseen orgnulos celulares, como las mitocondrias
y los ribosomas de tipo 80S. Como compuestos de reserva y glcidos solubles poseen polialcoholes
(p.e. el manitol), disacridos (como la trehalosa) y polisacridos (como el glucgeno, que, adems,
se encuentra presente en animales). Al igual que los animales, los hongos carecen de cloroplastos.
Esto se debe a su carcter heterotrfico, que exige que obtengan como fuente de carbono,
energa y poder reductor compuestos orgnicos.
A semejanza de las plantas, los hongos poseen pared celular8 y vacuolas.9 Se reproducen de
forma sexual y asexual, y, como los helechos y musgos, producen esporas. Debido a su ciclo vital,
poseen ncleos haploides habitualmente, al igual que los musgos y las algas.10

Los hongos guardan parecido con euglenoides y bacterias. Todos ellos producen el aminocido Llisina mediante la va de biosntesis del cido alfa-aminoadpico.11 12
Las clulas de los hongos suelen poseer un aspecto filamentoso, siendo tubulares y alargadas. En
su interior, es comn que se encuentren varios ncleos; en sus extremos, zonas de crecimiento, se
da una agregacin de vesculas que contienen protenas, lpidos y molculas orgnicas llamadas
Spitzenkrper.13 Hongos y oomicetos poseen un tipo de crecimiento basado en hifas.14 Este
hecho es distintivo porque otros organismos filamentosos, las algas verdes, forman cadenas de
clulas uninucleadas mediante procesos de divisin celular continuados.1
Al igual que otras especies de bacterias, animales y plantas, ms de sesenta especies de hongos
son bioluminiscentes (es decir, que producen luz).16
Omphalotus nidiformis, un hongo bioluminiscente.
Caractersticas diferenciales
Las levaduras, un grupo de hongos, presentan al menos una fase de su ciclo vital en forma
unicelular; durante sta, se reproducen por gemacin o biparticin. Se denominan hongos
dimrficos a las especies que alternan una fase unicelular (de levadura) con otra miceliar (con
hifas)17
La pared celular de los hongos se compone de glucanos y quitina; los primeros se presentan
tambin en plantas, y los segundos, en el exoesqueleto de artrpodos;18 19 esta combinacin es
nica. Adems, y a diferencia de las plantas y oomicetos, las paredes celulares de los hongos
carecen de celulosa.20
La mayora de los hongos carecen de un sistema eficiente de transporte a distancia de sustancias
(estructuras que en plantas conforman el xilema y floema). Algunas especies, como Armillaria,
desarrollan rizomorfos,21 estructuras que guardan una relacin funcional con las races de las
plantas.
En cuanto a rutas metablicas, los hongos poseen algunas vas biosintticas comunes a las plantas,
como la ruta de sntesis de terpenos a travs del cido mevalnico y el pirofosfato.22 No obstante,
las plantas poseen una segunda va metablica para la produccin de estos isoprenoides que no se
presenta en los hongos.23 Los metabolitos secundarios de los hongos son idnticos o muy
semejantes a los vegetales.22 La secuencia de aminocidos de los pptidos que conforman las
enzimas involucradas en estas rutas biosintticas difieren no obstante de las de las plantas,
sugiriendo un origen y evolucin distintos.22 24
Carecen de fases mviles, tales como formas flageladas, con la excepcin de los gametos
masculinos y las esporas de algunas formas filogenticamente primitivas (los Chytridiomycota).
No poseen plasmodesmos.
La mayora de los hongos crecen como hifas, estructuras cilndricas y filiformes de 2 a 10
micrmetros de dimetro y hasta varios centmetros de longitud. Las hifas crecen en sus pices;
las hifas nuevas se forman tpicamente por la aparicin de nuevos pices a lo largo de hifas
preexistentes por un proceso llamado de ramificacin, o en ocasiones el extremo apical de las
hifas se bifurca, dando lugar a dos hifas con crecimiento paralelo.

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