La expresin de los genes estructurales no solamente se ve influenciada por la
presencia o ausencia del co-represor, es tambin controlada por un gen regulador especfico. El gen regulador puede estar cercano o lejano a los genes que estn siendo regulados. Los genes reguladores codifican para un producto protico especfico llamado el REPRESOR (a veces tambin se le conoce como el apo-represor). Cuando el represor se sintetiza es inactivo. Sin embargo, se puede activar al formar un complejo con el co-represor (por ejemplo: el triptofano). En muchos operones reprimibles la transcripcin que se inicia en el promotor puede terminarse prematuramente en la region lder, que es la que precede al primer gen estructural.Este fenmeno se conoce como atenuacin; la terminacin prematura de la transcripcin. Aunque la atenuacin se observa en un nmero de operones, el mecanismo se conoce y se entiende mejor en aquellos operones que son reprimibles y que estn involucrados en la sntesis de los aminocidos. En estos casos la atenuacin se regula mediante la disponibilidad del tRNA aminoacilado correspondiente al aminocido en cuestin. Aunque la transcripcin se inicia al nivel del promotor, realmente esta empieza antes del inicio del marco de lectura del primer gen estructural y en esta regin previa se forma un transcrito corto y se conoce como regin lder. Esta regin lder contiene una seal de inicio y otra de alto (paro) para la sntesis de protenas. Ya que las bacterias no tienen membrana nuclear, la transcripcin y la transduccin pueden ocurrir simultneamente. Por tanto se puede estar formando un pptido corto, al mismo tiempo que la RNA polimerasa est transcribiendo la regin lder. Este pptido de prueba contiene varios residuos de triptofano a la mitad del mismo. Por lo tanto, si existe suficiente cantidad de triptofanil-t-RNA para traducir el pptido de prueba, el pptido entero estar formado y el ribosoma alcanzar la seal de alto. Por otra parte, si no hay suficiente triptofanil-t-RNA para traducir el pptido, el ribosoma se arrestar en los dos codones para el triptofano antes de alcanzar la seal de alto.
GENES DEL OPERON TRIPTOFANO
La ruta biosintetica para la sntesis del triptfano esta regulada por mecanismos que afecta tanto a la sntesis como a la actividad de las enzimas que catalizan la ruta. Por ejemplo la antranilato sintetasa, que cataliza el primero de los pasos, est codificada por los genes trpE y trpD del opern triptfano. El numero de molculas de esta enzima presentes en la clula esta determinado por la regulacin transcripcional del opern triptfano. Sin embargo la actividad de la enzima esta regulada por retro inhibicin. El opern trp contiene elementos reguladores adicionales que imponen un control suplementario sobre su nivel de transcripcin. Uno de estos sitios adicionales de control es un promotor secundario denominado trpP2, localizado dentro de la secuencia codificadora del gen trpD. El producto resultante de la transcripcin a partir de trpP2 es un mRNA que que contiene las secuencias codificadoras para trpCBA, los tres ltimos genes del opern. No esta clara la necesidad de un segundo promotor interno. Es posibles que la explicacin provenga de que tres de las cinco protenas no contienen triptfano, solamente los genes trpB y trpC contienen el nico codn que especifica el triptfano. Por ello en condiciones de privacin extrema de triptfano, estas dos protenas no se sintetizaran, lo que impedir que se active la ruta metablica. Dado que los genes estn situados mas abajo del segundo promotor no regulado, sus productos proteicos estarn siempre presentes a un nivel basal, necesario para mantener abierta la ruta.