1

SINTESIS PROTEICA SINTESIS PROTEICA

cdigo gentico y traduccin cdigo gentico y traduccin
Cdigo Gentico
Caractersticas del Cdigo
Gentico
Sntesis proteica
El mecanismo de la
traduccin
Antibiticos y traduccin
2
SINTESIS DE PROTEINAS SINTESIS DE PROTEINAS
El orden de los ami nocidos en la cadena
protei ca (secuencia) est determi nado por la
secuenci a (orden) de nucleti dos
El orden de los ami nocidos en la cadena
protei ca (secuencia) determina la funcin de la
nueva protena
Es necesari o un cdi go bili nge para pasar la
informacin de la secuencia de bases a
aminoci dos (cdigo gentico)
La sntesis proteica ocurre de modo semejante
en todas las cl ulas
Tres ti pos de RNA desempean un papel
cooperati vo
mRNA transportador de l a informacin
rRNA asoci ado a protenas forma el
ribosoma
tRNA portadores de ami nocidos, l ectores
del mensaje
3
Reglas de sntesis de molculas informativas Reglas de sntesis de molculas informativas
Acidos nucleicos y protenas
Formados por un nmero
limitado de subunidades
Las uni dades son agregadas
secuenci almente formando
cadenas lineales
Cada cadena tiene un punto de
inici o, avanza en una nica
direccin y ti ene un punto de
finali zaci n
Los productos de l a sntesis
primaria son modificados
previamente a cumplir su
funcin
4
Elementos fundamentales a resolver en la sntesis proteica
1. Pasaje de la informacin
2. El mecanismo enzimtico
Informacin
(ADN)
4 bases
Efector
(protena)
20 Aminocidos
Grupos de bases pueden simbolizar cada aminocido
Intermediario
(ARN)
4 bases
El problema de la informacin El problema de la informacin
5
Hay 4 bases en el ARN (U, C, A, G) y deben especificar 20 aminocidos.
Cuantas
bases =1
Aa?
Un cdigo simple
implica slo 4
Aas.
Un cdigo en dobletes
especifica 4X4 =16 Aas.
Un cdigo en tripletesespecifica
4 x 4 x 4 =64 Aas.
1 Base? 2 Bases? 3 Bases? 4 Bases?...
4 <20: No alcanza
16 <20: No alcanza 64 >20: Msque suficiente
1 2 3 4
1 2 3 4
5 6 7 8
9 10 11 12
13 14 15 16
1 2 3 4
5 6 7 8
9 10 11 12
13 14 15
etc...
U G C A
U
G
C
A
U
G
C
A
U
G
C
A
U
G
C
A
U
G
C
A
U
G
C
A
U
G
C
A
U
C
A
U C A G
U C A G
U C A G
U C A G
U C A G
U C A G
U C A G
U C A
U
G
C
A
U
G
C
A
U
G
C
A
U
C
A
mRNA
G
C C A
C
C
G
AG A
A AA
AA A
AA
A U U
U
UU
U
U
U
U
C
C
C
CC
CC
C
CC C
C
G
G
G
G
G
G
G
G
El problema del pasaje de informacin El problema del pasaje de informacin
6
1968 1968
1960 1960- -1964 1964
Francis Crick Francis Crick
Robert Holley Robert Holley
H. G. H. G. Khorana Khorana, ,
Marshal Marshal Nirenberg Nirenberg. .
CODIGO GENETICO CODIGO GENETICO
UNIVERSAL UNIVERSAL
EN TRIPLETES EN TRIPLETES
NO SOLAPADO NO SOLAPADO
REDUNDANTE REDUNDANTE
NO AMBIGUO NO AMBIGUO
DEGENERADO DEGENERADO
El cdigo gentico El cdigo gentico
7
Cdigo Gentico Cdigo Gentico
En tripletes (codones)
No solapado
Sin puntuacin
8
El cdigo gentico no es solapado pero puede leerse
en tres marcos diferentes de lectura
Slo uno de estos marcos es el correcto para dar lugar
a una protena dada
Marcos de lectura Marcos de lectura
9
Universalidad y excepciones Universalidad y excepciones
10
Ambigedad y redundancia Ambigedad y redundancia
No ambiguo (cada codn especifica
slo un aminocido)
Redundante (distintos codones para
un aminocido)
existen codones sinnimos
familias de codones:
XYPur
XYPyr
tRNA como adapatador
reconocimiento codn-anticodn
hiptesis del balanceo
Degenerado (codones sinnimos
pueden ser ledos por un mismo
anticodn)
11
tRNA como adapatador
reconocimiento codn-
anticodn
hiptesis del balanceo
codonessinnimos pueden ser
ledos por un mismo anticodn
Reconocimiento Reconocimiento codn codn- -anticodn anticodn
12
Apareamientos de base
no standard ocurren entre
la tercera posicin del
codny la primera del
anticodn
El balanceo El balanceo
13
Cambios en una secuencia de ADN Cambios en una secuencia de ADN
que codifica para una protena... que codifica para una protena...
... ...CCGCGTCAGACCGAAATTAACGCG CCGCGTCAGACCGAAATTAACGCG... ...
CCGCGUCAGACCGAAAUUAACGCG CCGCGUCAGACCGAAAUUAACGCG
P R Q T E I N A P R Q T E I N A
14
Tienen diferentes efectos: Tienen diferentes efectos:
1. mutacin silenciosa 1. mutacin silenciosa
... ...CCGCGTCAGACCGA CCGCGTCAGACCGAG GATTAACGCG ATTAACGCG... ...
CCGCGUCAGACCGA CCGCGUCAGACCGAG GAUUAACGCG AUUAACGCG
P R Q T E I N A P R Q T E I N A
15
... ...CCGCGTCAGACCG CCGCGTCAGACCGC CAATTAACGCG AATTAACGCG... ...
CCGCGUCAGACCG CCGCGUCAGACCGC CAAUUAACGCG AAUUAACGCG
P R Q T P R Q T A A I N A I N A
Tienen diferentes efectos: Tienen diferentes efectos:
2. cambio de sentido 2. cambio de sentido
16
... ...CCGCGTCAGACC CCGCGTCAGACCT TAAATTAACGCG AAATTAACGCG... ...
CCGCGUCAGACC CCGCGUCAGACCU UAAAUUAACGCG AAAUUAACGCG
P R Q T * P R Q T *
Tienen diferentes efectos: Tienen diferentes efectos:
3. sin sentido 3. sin sentido
17
Tienen diferentes efectos: Tienen diferentes efectos:
4. Insercin y corrimiento del marco de lectura 4. Insercin y corrimiento del marco de lectura
... ...CCGCGTCAGACCGAA CCGCGTCAGACCGAAA ATT TTA AAACGCG AACGCG... ...
CCGCGUCAGACCGAA CCGCGUCAGACCGAAA AUU UUA AAACGCG AACGCG
P R Q T E I P R Q T E I K R K R
18
Tienen diferentes efectos: Tienen diferentes efectos:
5. 5. Deleccin Deleccin y corrimiento del marco de lectura y corrimiento del marco de lectura
... ...CCGCGTCAGACCGAA CCGCGTCAGACCGAAA ATTACGCG TTACGCG... ...
CCGCGUCAGACCGAA CCGCGUCAGACCGAAA AUUACGCG UUACGCG
P R Q T E I P R Q T E I T R T R
A A A
19
La traduccin es un proceso de decodificacin La traduccin es un proceso de decodificacin
en dos pasos: en dos pasos:
1 Cargado de los 1 Cargado de los ARNt ARNt
20
La traduccin es un proceso de decodificacin La traduccin es un proceso de decodificacin
en dos pasos: en dos pasos:
2 Reconocimiento 2 Reconocimiento codn codn- -anticodn anticodn
21
anticodn
El adaptador molecular : El adaptador molecular :
el ARNt el ARNt
brazo aceptor
22
Cada ARNt es reconocido por
una AMINOACIL-tRNA-SINTETASA
especfica
Estas enzimas reconocen el Aa
correcto y el ARNt correcto
GLn-tRNA
Aminoacil-tRNA-sintetasa
(tipo I)
Requerimientos
20 aminocidos
aminoacyl-tRNA synthetases
tRNAs
ATP, Mg 2+
Requerimientos
20 aminocidos
aminoacyl-tRNA synthetases
tRNAs
ATP, Mg 2+
Cargado de los Cargado de los ARNt ARNt
23
Requerimientos
20 aminocidos
aminoacyl-tRNA syntetasas
tRNAs
ATP, Mg 2+
Requerimientos
20 aminocidos
aminoacyl-tRNA syntetasas
tRNAs
ATP, Mg 2+
Cargado de los Cargado de los ARNt ARNt
Reaccin en dos pasos:
1. La enzima une al Aa
consumiendo 1 ATP
2. La enzima une al ARNt y le
transfiere el Aa
24
Requerimientos: mRNA
Aa-tRNA
ribosomas
Actividad
peptidil-
transferasa
Salida del pptido recin
sintetizado
Sntesis de protenas Sntesis de protenas
Ribosomas
Plataforma donde se realiza la sntesis
proteica
Subunidad mayor: 3 ARNry 49 protenas
Subunidad menor: 1 ARNry 33 protenas
25
Composicin del ribosoma Composicin del ribosoma
26
Estructura del ribosoma bacteriano Estructura del ribosoma bacteriano
Ribosoma de T.termophilus
27
Iniciacin Iniciacin traduccional traduccional
procariotas procariotas
Reunir los elementos necesarios
Reconocer el sitio de inicio (AUG)
Proveer sitios para que se inicie la elongacin
28
El primer aminocido El primer aminocido
29
Iniciacin Iniciacin traduccional traduccional
procariotas procariotas
Requerimientos
mRNA
tRNA met
codn de iniciacin
2 subunidades ribosomales
Factores de iniciacin (IF-1, IF-2, IF-3)
GTP, Mg 2+
Requerimientos
mRNA
tRNA met
codn de iniciacin
2 subunidades ribosomales
Factores de iniciacin (IF-1, IF-2, IF-3)
GTP, Mg 2+
30
Iniciacin Iniciacin traduccional traduccional
eucariota eucariota
31
Elongacin Elongacin
Requerimientos
Ribosoma completo (complejo de iniciacion)
Aa-tRNAs especificados por cada codon
Factores de elongacion (EF-Tu, EF-Ts, EF-G)
Actividad peptidil-transferasa (23s)
GTP, Mg 2+
Requerimientos
Ribosoma completo (complejo de iniciacion)
Aa-tRNAs especificados por cada codon
Factores de elongacion (EF-Tu, EF-Ts, EF-G)
Actividad peptidil-transferasa (23s)
GTP, Mg 2+
Agregado secuencial de Aa por una
actividad peptidil transferasa
Traslocacin
Durante la elongacin cada Aa-tRNA pasa por tres sitios en enl ribosoma
32
La elongacin eucariota es similar La elongacin eucariota es similar
a la bacteriana a la bacteriana
33
Enlace peptdico Enlace peptdico
Reaccin central de la sntesisproteica
La actividad peptidil-transferasa est en
el rRNA 23S
El centro cataltico esaltamente
conservado
La traslocacin ocurre luego de la
formacin del enlace peptdico
34
Requerimientos
codn de terminacin
factoresde liberacin
(RF 1 , RF 2 , RF 3 )
ATP
Requerimientos
codn de terminacin
factoresde liberacin
(RF 1 , RF 2 , RF 3 )
ATP
Terminacin Terminacin
Proceso similar en
procariotas y
eucariotas
Depende de
factoresque
reconocen codn
stop y de hidrlisisde
peptidil-tRNA
35
Acoplamiento Transcripcin Acoplamiento Transcripcin- -traduccin en procariotas traduccin en procariotas
La traduccinen bacteriasse inicia
sobre transcriptosque aunno
terminaronsusntesis. Esta
coordinacinentre ambos procesos
permite una regulacinmsprecisa
de la sntesisproteica bacteriana
36
La traduccinsimultnea por
mltiplesribosomasy surpido
reciclado incrementa la eficiencia
de la sntesisproteica.
Poliribosomas Poliribosomas
37
Destino celular de las protenas Destino celular de las protenas
38
Mayora son bacteriostticos
Selectividad debida a diferencias
entre ribosomasprocariotas y
eucariotas
Actan a diferente nivel en la
sntesisproteica
Inhibidoresde la iniciacin
Aminoglicsidos:
estreptomicina, kanamicina,
gentamicina, neomicina
Unin irreversible a rRNA16S,
bloqueo en complejo 30S-
mRNA-tRNA
Antibiticos y sntesis proteica Antibiticos y sntesis proteica
Inhibidores Inhibidoresde la de la Elongacin Elongacin
Tetraciclinas:
tetraciclina, minociclina
Unin reversible a la
subunidad 30S, inhibe la
unin del Aa-tRNA
Cloramfenicol:
Unin a subunidad 50s,
inhibe la actividad peptidi
transferasa.
Macrolidas: eritromicina, claritromicina
Inhibe la translocacin.
Acido
Fusdico
Unin a EF-G,
inhibe la
disociacin
EF-G/GDP
40
El El Papel Papel de la de la hidrlisis hidrlisisde GTP de GTP
se hidrolizan 2GTPs por cada aminocido incorporado
La hidrlisispromueve cambiosconformacionalesesenciales
Se gastan 4 enlaces fosfato de alta energa por aminocido
incorporado:
CARGADO del ARNt-Aa con su aminocido
1ATP (2 enlaces) / Aa 2N
TRADUCCION
a. Iniciacin 1GTP 1
b. Elongacin 2 GTP / Aa 2(N-1)
c. Terminacin 1 GTP 1
____
Gasto Total: 4 N *